Sed0026479.1 (mRNA) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAGTTTTCAATTTGCCCGACAACGCGTTGGTGTAGGCTGTAAAGGGGTTATTCCTCGTTTTTTCCGCAACCCTACACCCTAAACATTGCCCGCCGGATCTTCCCTCTGAATGGAAGCTCCTGGCTTATGACTCTTCATTCTTACCTATCTGCCTCGCAATGCCTATCGTTGCGAGTTTTGGGGCGCCCTTTTCCGGAGACGCTGTTGTTTATTTGGCTGAGAGAAGCTCAAGGGTTCGATTCCATCGTCCTATTCTGGCCCCTTTCAACTTTCCTTTCCAGGTATCTCATTTCGAGTCTCCATCCCTATCTAATTTACCCACAACTTGATCTAACATTATATCCTTAGAAAAAAACCAGTTTGAATCATTCGTTTCGGTAGTTTCTTTTCACAGAGATTTCATTTTTTAAATTAGTTAAGGCTGCCAGATACTTCTTTATTATCTCAAGTTTTTTTGTACTGAACAAAAACAAAAAAAAGGGCTCAGTTTCTAAACCCACTAACCAAGCCTTCACACGGTACGGATCAACATTGGTTATTTATTTTCCTGACTTATGAGTACGACTCTTACAGCTGGTTTGATTTCTGTTTCTTCTATTTTGAGAAAAGACTTATTTGAAAACTGCTCCCCCTAAAATTAATAAAACGTTTTTTGTTCTTTTTTTTGGAATTTGGTGTTTGCCTTTACTATACATAAACTAACTTCTTAGTGTTAACAAAATGAGACAGTGACCCACTGGTTTTCAGGGCTGCCAAAGATTTGTATCTGCTACTTGGAGTTTTGTTCAAATCTTGATTTGTTTTTTTTTAATTATCTTGCAATATGTATTATTATTATTATTAAAAATATGATCAAATCAAAATTTTATATATGCATGCATATTCGACATCGAGCACTTCGAAGTAGATTAGACAGAATCGGTTTGAATTACAGACTCGAACTAGATCAACTTTGTGAACCAGATTGGGTTCAACTGACCGGTTTGATTCATCAGGAAAATATCCCCCTAGCCTCTTCCTTATTTTTCTTTGTATGTTTGGCTGCTCATTTTATTCTCCCTCTCCAATTTTTTCTAAATGACCTTAACCGTCAGAGATCTTCTTGGCATACAAGTCGTGTCTTCTGGATAATGTTGCACACGGGATAATGCAAATTTTCCTTTTATCTTATGTATCTTGACTCATTATGGCCTTCTACTCTCCCTTGAAACTTGTTCATTTAATCAACGAAATGATTTTTGTTTCTTATATAAAAGATTCTAGTGCGTCTTTCTCGTAGTTTCATATGCCTACCACCATTTCATCACACTTCCTCAACATCAACCATATCGTCTTTTAAAACGCGCCCAGAATCCCCCCTACACAACCTTCTTCATGCAATCCATCGATCGTTTCTCGTTTCCAACAATCTTATCTATGTGTGTCAACTCTATTGAAACTAAATAATCGTCGTGATTTTATTCATAAAGGCAATGCCTTTATATAGGAAATAAAACAGTAAACCTAGTCAGTGTTTTAAAAAGCACAAGGCGCAAAGTCCCTATGGAGCCTGAGGCGCACCTTAAGGCGAGGTTTTTTTTACTTAAGGCGCACTATATATATATATATGGTTTATATGCACAATAAAAGGAGTTTCATAGCAGTAAAAGGTTCAAACATATATGATATATAAATAACTGAAGTCAAATTTCAATACATGATTGCTTCAGGAATCAAAGCAACCTAAAAGATGCAACCAAAACTACAAAAGTATAAGAATCTAAAGTCCTAAAGATCAAAATCCTTATCTTCATTATCACTAAATACCTCATCACCCTCGGCCTCTACATCATTAGATTTATAAGCACTTGCATCTTCTTCTTCATCTTTTTTTTGAAAATAAGGTAACCACGCCCGTCCCTATTCTTCTTCATCAATGTCGGTATCCAAATCATGCAAAGCTAGTGGTATAGGTGCGGGTCGTGCTCGTGGTGAACATGGGACTCGAGATCATGATATTGGTTGTGTGGATGACGAACATGGTGGTTTATCCTTGTTTTTAGACGGGCTCTAGAATAATAAGCAAGTTCTTTTGAACCAGATGCTCTTGAAACATCACCCCATGTTAGTGGGTAGAGCGTCATCATCGTCGTTAAATACAACTTCTCTATCATCGTCAGTATCATCATCCAATCTTCCCACCAACCATTCGTTACTCTCATCAATATCCTTTAAAGCGATGGGGTCTGCAACATCTTTAATATTAAATTGACGTTTCAATGTTCAGTTGTATTTTATGAACACTAAATCATTGAGACGACGTTGATCAAGTCTATTCCTCCTTTTGCTATGAAGTTGCATAATTAAAGAACCATGACAATTCAATATTTTAAACCTTAAACAAGTTACTCTAGGAGTGGTGTATTTAATTAATTATCTAACCTATTCAAAAACACTCTAATTGCGCTCGAATCCAGAAGAACTACAGGTAAGACGTAAAACTCTTATTGCGAACTTTTGCAAGTTGGGACTAGATTTGCCAAAATCATCCCACCATTCCACTACGTAGATTAAGATTAAAAATGATGTTAATAACTTTCTAACCATAAAATACTTGTATTCAAGTTTAGAATATACCTGGAGATCTTTTGTTTCTTTGTCTAATAGCCATCGAGGTTCCAACAGTGTTTTCAAAGCGGAAGGCGCAACGCAAGGCGACACTCTCCTTGATCGCCTCAAGGCGACAAAAAGGCGAGGCCAGAGTGAAGTAAGATGCAACTTATAAATACATACCAATATATATATATATATATATATATAAGAAAAATTAATATAGAAATTATATTTTTAATAACATAAAATATCAAATCCTTACATATCAATATTAAATGGTAAAAGAATCCATAATAAATGTAAATATCAAATGTGAAAAATATTGAAGTTATAAACCATTTATATATACTTTATAGGTTATCTAAAAGTCAATAAATAATAAACAGTAATTAAAATTGTGAAAATATTAAGTCATCCACTTTAGATGCCTTTAAATTATAAATTACTAAGTATGGATGGGTAATTCAGACCTCAAACATAAAATAAGAATAAAAAAGTAAAATAGCAATTGAGGTTCTTAAGAAAAATGCCTAGACATAGTGGTTTTTTTTATACTATAGAAGCTATCAAAAAGAAAAGTAAAAAATAATAAAGATTGTGATTTGTGTGACTTAAAATTTAATCTTAGAGTTTAAATTGACAGGACAGGTCAGTGAGGGTGAGTAATTTGATAAGACTTCAGTCAAACTTTTAAGAAACTAAAAAATTAAAAAGTAAGAAGGCGAGCGCTTCATTGAAGTCGCTCGCCTGAGCTCTCTACGAGGCGAAGGTACCCCAGGTCGCGTCGCTCCTCGCCACAGGCGAGCGCCTGGGGTCGCCTTGAAAATACTGGGTTTCAAACGATTCTTCACTTCTCTTATATAGGCTGAGTTCTTCAAAAAATTTATTGTATTTCTATAGAAGGAGTCATTCTTTCTAAACAAGAATGAAACCCCTTTGAAATTTCAACACTACTTTCAATCTTAGGATTTGATAAATAAAATTCCAGCTGCATGTCATGGTCGATGCAACTAATGATCCCATCTCTTGTCAATGATGGCAAATACTTCTTCATATTTGTCTTTGTTACTGAAGTTGTTTTCTATGGTTTCCTTAGCCCTATCCATTGCTTCATAAATATACCCCATTGCCGACTTTTTTTCATTATCGACCAACCGAAGAACTTTAACCAGAGGACATGAGACTTTAAGAGCAAATGTGATGGTGTTCCAAAAGCTTGCCATCAAGATTGTTTGAACAACTCTTTTCCCCTGTTGTTATTTACTCCATTTGCTATTTTCCCAATCTTCTAATGTAAACATCGTCCTCAAATGAAGTTTAACTCTACACAAACTTGAAAATGTAATACAAGTTGTTGCAAAGCGAGTCTTGGCCGGTCTTATCAACTCTTGTCCATTAGTGTATTGCCTCATTATGTTCAATAATCCAGGATGACCGTAAATAAAATTGCTAACCTCTATTGCTCTTTTTAGTGTTCTTCGAATATTCGAGATCTTGAAGATATCCTTCAACATCAAATTCAAGCAATGAGCAGCACATGGTGACCAAAACAAGTGCGATCGTTTTGCTTATAATAATCTCCCTAATAGATAATAAACAAAGCACATGTTTATAAAATTGACAAATGTTAAATACATTAATCATCTTTCAAGAAGAGAAGAGTACGTTAGTCAAATTTTTACCTGCCATCACATTTGCAGAGGCACTATCTGTAACAACTTGTATCACATACTCTTCTCCAATCTGTTCAACAAAATCATCTCACAATTGTTACAACCCATCCTTTACATATGAAGATGCATCAATGGATTCAACGAACATTGTTCCTTTAGGACTATTAACTAAAAAGTTTAGCAAAGTCCTATTTCTTTGATCTGTTCATCCATTTGTCATGATGGTGCATCCAACTTTCTTCCATTCTTCCTTATGATCTTTCATCAAATCGTTTGTTATTTTTAACTCCTTTTTCAAGCATGGAACTCGTAGTTCATGATATGTAGGCGGCTTCAATCCAGGACCAAATTGGCCTATTGCTTCAATCATAGGTCCGAAACTACTACTATTACAAGCATTCAATGGTATTCAAGAATCATAAAACCATCTAGCAATTTTTTGGATGGTTTTCTCCCTCATTTCCTTGTTGTAAGCGACATTAATGTTGTTTGTTTTCCTTTTTCATCCTTTTTAGTCGCAGATTTTGGATTTCTAGCAAAAAAAGAATCCATCGGACCCTTTTGTTTTGCCTTCTTTACAGCGGTTGAACTTGTTGATGACGTCGACAATCTCTTGTTTCCAGAAGAACAATAAATACTATCCTCATCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCAAGTGTATAATCACTTTCAAGAATGATCAAATTTCTTTGTCCTTTCAACTCCTTTCTAT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ATGCCTATCGTTGCGAGTTTTGGGGCGCCCTTTTCCGGAGACGCTGTTGTTTATTTGGCTGAGAGAAGCTCAAGGGTTCGATTCCATCGTCCTATTCTGGCCCCTTTCAACTTTCCTTTCCAGAATGGTGTGTGCTTACCCCGATTTTCTTACGGTCATTCAAGCATTGTAGTTAAACGTTCATCTATCCCGGCGGCATTGTTAGATGAGACAGTTGCACATCAAAACCTTGGAAAAAAGGCCTCTGAAATTTTGGCTTTTGATCTAGTTCAAGGAGCACTTGTAAAGTGGAGTAATTTAATGGACAGAACGCCTGATCCACCAACCGCAGTCTTTCTTCATGGAATTCTTGGAAGTAGAAAGAACTGGGGAACCTTTGCTAGAAGATTGGCAAAAGAATTTCCAGCATGGCAGTTTCTTTTGGTAGATTTGCGATGTCATGGTGATTCAACCTTAACTAGGAAGATGAGCCCTCACACTGTTTCTGCTACTGCTCTTGATGTATTGAAGCTGATTCGACAGCTGAAAATAACACCTCGAGTTCTAGTAGGGCACAGCTTTGGAGGAAAAGTTGTCTTAAGTATGGTAGAACATGCTGCTAAACCTCTTGCCCGGCCAGTGAGAGTTTGGGTTTTGGATGCAACTCCTGGAATAGTTCGACCTGGTGGAGATGGAGAGGACCATCCTGAAAAATTAATATCTTTTCTAAGTACGTTGCAAAATGAGGTATCCTCGAAGCAGGTTGTGGTGAATGCCCTTGTTCAACATGGATTTTCTAAGGATGTAGCACAGTGGGTGGTCACTAACCTTCGACCTATTGGCCCTCATGGTTCATTATCCTCGGGCTTTTCATGGGCGTTTGATCTCAAGGGCATTGCTGAAATGTATCAGTCCTATGAAGAGACAAATTTATGGAAAATTGTGGAAGATGTTCCCCGTGGTGTGCACATCAATTTTTTGAAAGCTGAAAGAAGCTTGCATCGGTGGGCACTTGACGACATTCGGAGGATTCATGCTGCAGAGGAGCTGGCGGTTGAAGAGGGAGGTGGTGTTGAAATGCATGTACTTGAGGATGCCGGTCATTGGGTGCATGCTGATAACCCAGATGGACTATTTCGGATCTTGTCATCCTCTTTCAAAGGGATTAGAACTTGA MPIVASFGAPFSGDAVVYLAERSSRVRFHRPILAPFNFPFQNGVCLPRFSYGHSSIVVKRSSIPAALLDETVAHQNLGKKASEILAFDLVQGALVKWSNLMDRTPDPPTAVFLHGILGSRKNWGTFARRLAKEFPAWQFLLVDLRCHGDSTLTRKMSPHTVSATALDVLKLIRQLKITPRVLVGHSFGGKVVLSMVEHAAKPLARPVRVWVLDATPGIVRPGGDGEDHPEKLISFLSTLQNEVSSKQVVVNALVQHGFSKDVAQWVVTNLRPIGPHGSLSSGFSWAFDLKGIAEMYQSYEETNLWKIVEDVPRGVHINFLKAERSLHRWALDDIRRIHAAEELAVEEGGGVEMHVLEDAGHWVHADNPDGLFRILSSSFKGIRT Homology
BLAST of Sed0026479.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022939884.1 (uncharacterized protein LOC111445615 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 3.7e-194 Identity = 342/389 (87.92%), Postives = 357/389 (91.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031737177.1 (uncharacterized protein LOC101222550 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 688.0 bits (1774), Expect = 4.8e-194 Identity = 342/389 (87.92%), Postives = 358/389 (92.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023551617.1 (uncharacterized protein LOC111809397 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 687.2 bits (1772), Expect = 8.2e-194 Identity = 342/389 (87.92%), Postives = 356/389 (91.52%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031737176.1 (uncharacterized protein LOC101222550 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8652237.1 hypothetical protein Csa_022478 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 683.3 bits (1762), Expect = 1.2e-192 Identity = 342/390 (87.69%), Postives = 358/390 (91.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008441164.1 (PREDICTED: abhydrolase domain-containing protein C22H12.03 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 681.8 bits (1758), Expect = 3.4e-192 Identity = 338/389 (86.89%), Postives = 355/389 (91.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8K4F5 (Protein ABHD11 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Abhd11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 7.1e-15 Identity = 80/297 (26.94%), Postives = 125/297 (42.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q57427 (Putative esterase/lipase HI_0193 OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) OX=71421 GN=HI_0193 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 1.2e-14 Identity = 62/275 (22.55%), Postives = 119/275 (43.27%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3SZ73 (Protein ABHD11 OS=Bos taurus OX=9913 GN=ABHD11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 5.1e-13 Identity = 73/286 (25.52%), Postives = 118/286 (41.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DRD9 (Protein ABHD11 OS=Danio rerio OX=7955 GN=abhd11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 5.6e-12 Identity = 72/279 (25.81%), Postives = 126/279 (45.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0V9K2 (Protein ABHD11 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=abhd11 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 9.6e-12 Identity = 72/281 (25.62%), Postives = 121/281 (43.06%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FIG1 (uncharacterized protein LOC111445615 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445615 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 1.8e-194 Identity = 342/389 (87.92%), Postives = 357/389 (91.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3J2 (abhydrolase domain-containing protein C22H12.03 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 681.8 bits (1758), Expect = 1.7e-192 Identity = 338/389 (86.89%), Postives = 355/389 (91.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LST2 (AB hydrolase-1 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G401260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 679.9 bits (1753), Expect = 6.3e-192 Identity = 340/389 (87.40%), Postives = 356/389 (91.52%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSZ5 (uncharacterized protein LOC111489487 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489487 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 677.9 bits (1748), Expect = 2.4e-191 Identity = 338/389 (86.89%), Postives = 352/389 (90.49%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DG19 (protein ABHD11 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020178 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 672.5 bits (1734), Expect = 1.0e-189 Identity = 341/390 (87.44%), Postives = 349/390 (89.49%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G10030.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 8.9e-138 Identity = 238/340 (70.00%), Postives = 270/340 (79.41%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0026479.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G52570.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 5.0e-48 Identity = 105/285 (36.84%), Postives = 165/285 (57.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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