Pay0002446.1 (mRNA) Melon (Payzawat) v1

Overview
NamePay0002446.1
TypemRNA
OrganismCucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 3696588 .. 3709662 (+)
Sequence length354
RNA-Seq ExpressionPay0002446.1
SyntenyPay0002446.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCAGGTGGAACCGAATTTTTGGGGGGTGGGTGTGACGAAGCAATTACACCAACCGCAGACCCATTGTGGTTCTTCTTCTGTAATTTCTTTCTCCATCTGTTTATGTGCTGAGGATTAATTATTTGGTTCTTTTCCTCCTTTCTCTTTTCTTCTTTCTGTCTTACATTAATTATTGGCTACGAGGGTCCTTTTCTTTACATGAATTTTGGGGCACCCTGCATTATTGTCAAAAGGAAAAAGTAAAAGTCCCAATCGTCCTCCTAGAGATATATAATCGACCCAAACATTACCTCTATTTCTCTCGTACGCTACCATTTTGATATTCTATTACACACATTCTCCGCAATGTGTAAGCTCCTACTATGTGTTAGCTGATGAGTCACATTTATGTTAATGCCTCTACGTCACGTGTATGAAAAACTACATTCTTAGTTATATTCAATATTTTACTTTCGTATTTGGGCGTGTGACTCAACACCATACAGTAAAAGTTGTTTTAGGTCAATTTATCTACCTACGAAAAATACTAATTTATCAAGATTCACACGTTAAATCGTAAAATTGATTTAACTAAAATTTAAACTCAATCACTTGAAGATTCATACCACTTATGTATAGTAAAATTATTTAATATATATGAAATTAAAGAATAAATGAAATCATTCTAAATAAATAATTAACTACGTAGAAAGAAAGAAATTAAAATTAGGAATAAATGAAATGATTGTAAATAAATCTTTTATATACATAAGAACCAACAAGACAAAGAATCAAGTAAGTGTAACTTTATTATCAATCTTTGGTTAAGAGTTGTGGTTGTATATTTATTTGGCCTTGTTGGAATATTCTTTTTTACAAAAGAAAAATAATCTTTTAGTCATTATATAATTAGATCACAGGGTTTGACTATCACTTTAGTCATTATAATTTAATAATAATCTGATTATTGAGTAGGGGTTAACTCCAAAAAGATTATTGGTATGTACATACAATTATAAAACCATCTTTTTCAAGTTATATTAACAAATTAGTATTCAACATAAATTAATTAATGGACCTTCAACAACTTTTGGATTATTCTTTATCCCATTTAATTTTATTTTTTTTTACTATTTTTAAAATTAGAAAAAAACAATAAAAACAAACAAGTGGCCATGGCAAGAATATTCAAGTTGTAAACTTAGCTTGGAGGCATCTTTAAATATTACATATAATTCATATTTTATAATACCACCATATTCATCTTTTGATAGGATTTTGATTATAAAAGATTTGGAACTCTCCATTCTTTCTTCTCTCAAAGGAATATTATTAAACTAAAATATCATAGAGTAGGTACCGATGCTTCTTGAGAGATATTATAAGAATATACAATAAAATATCAATAATTAAGATATTCTTTTCTTCTATCAAAGTTTTAACATAATTTTTTTAACAAATACAATTGTCTCATATCAAAATAGTTTAAGAAAGTGATAGGCTCCAAGTACTTATAAGCAGCTTGAACGTTCGTATAGCTTCAAGTATTATTAGATTTTGTATTATTTTTCTTGTTGGTTTCAAGTTGTCTCGATCAAAAATCACTTTAAACTGAGTATGTTAGTTATACTTTAGGTTCCTTTTACGTACTCTCCTAGTTTGAGAGTTTGGAAAAGACGTGTGAGTAAATTTTAAAAATTTGAGAGAGTACTCTTGCATTTGGGAACAAAAGAGACGTATTCTTTGTGATTATAACCATTTTCCACGTAGTATATTGTTTTCACGATTGTGTTTTATCTATTATTTTTCTGCCTATTGTTAAGATAATTAACAGTGGAAAGTTTTGTGTAACACCTATGCCAATAATGTTGGCTTTCACATTACATATAGTATTTCAATAACATTGAATTTAATGAGAAGTAAAGAAAATGAATTTAATGAGATGTATAACGTTTGGAACAGAATGTATTAAAGTCAATGTTTGTAAATTAAAATGCACGATACCTTTATTAATTATTTTAGACAATGAATAGTATTGAATTTAATGGAAAAATAATGCATGGTTGACGATGATTTTTGAAAACATGTAGTTCAAACATCATGTTATTATTTTTTAAAAAAATTAATAATATTGGATTAATATATATTTATATTATATTTCATTTTGAAATTTTAGATTATTTTTTTTTAGTACAATTTGTATTTAGATAGATATAAAGTCGTTTTTATACCTTCCATAACTTCAAAAGCTCTAAAGTTCAATAAATTTGACTTGTAGGATGGAATCATGAATGTATATTCTTGTTTGATACTTTTTGCTCCACTATGTTTATTTATTTGAATTATCCACATATTATATTCTCTAATTTTGATATTATTTTTTAGAATAAAATCTAATTTTTTAACATTTTTATCCCTGAATTTAATTTGAAAAAATATTTTAAATGGTCCTCGAAGCTATTGAACTTTTAGATGACGACCGAAAAAATAGTTTTCAAAAAACTGAATCTATATTACTATATAAAAAAAGCCATAATAAAAAATACTTTTTTAAACAAGTTTTTCCTTCTCCATTTTTATTAATTACATTTATATCCTTTTTCTAATTTGAAATAAATAAATAAATGATTTTTAATTAAATATATTAAACTTAAAACTTATTACGTAAATATATTTTTTAAAAAGCCTCCTCAAGCTCTCCTTAGCATAATCGCGTAACATATAATTGAATAATTAGATTAATATGTAGAATTTAATTATTTACTGTTATAGATTGAACTTTAATTGAAATAAAAAACTGATTAATAATTAATTGAGTCCAAACTTAATATATAAACACAAAGTTATTTGATGGTTCTCACATTTTGTGTGAGGCCTTGATTGCGTTCCTCCTCACGAGATAAGAGTTCACGCGGCAAAAGTAGCCTATGTGATGAGATATTTACGCAAGGAAGGCTACGCAATGGACTGTTATGCGTTTTGAGTTTTACTTCATCGGAAGGTAGTGACATCATCTTCATGTAAGTAAGCTGGTGATTGATTTGACTTTGCTACCCAATTCAAATTCAGGATAAGGAAGCGGTAGTGACACGTGACATTTTGAAATTGGACCATTCTTACCGTCACACATAAGTCATTATTTTTGCATGGAAAATGTCGTCGGAAGGCTTATAAATTGGTGAAGTCCAACTATTTTGAAGCTACTTTTACCCTGAGCTTAACTTAAGAAAGGATTGAGAGAATTTGAAAATTTTCAAAGAGCTTGAATTCGAAAAGGAGTTTCAATAAAATATTTTTGAATCAGCTAAGGAGCTAGGCGAAGAAGCTAGCTGATTGTAATTGTGAGTGGTTCTTCTTTAAAATGTTTAAAAAACAAAAAAGATTTCCAATGTGTTTACATTCTTAAAGATATTTCCATTGAAACCTCGAGATATATGGTTTCTATTATGTTTTCCAAATGCATGTGATTTATAAATGAATAAAACTTTATATGAGTTGAAATAATGAAATGATGATTTCTTGTTACCCTATGCGATAAGAATGTCTCGTACTTGCTGTGTGATCTGTATGGGATGTCTTATCCTTGCTTTGTAATTACCTAAGATATGATACTCTATTGTTGTTGTATGATCTGGAATAGAATACCATATACTTATTGTGTGATCTGGTAAGAGATGACCTTTGCTTGCTGTATGATCTAGTATTAGAAGACGCGTTATGCATACTAGAATTGACGAAACTTGCTAAATGTGTTGAGACTACTCTGCATAGTTGCAACTTGGCAAAAGAGTGTGGTAAATGCTTGAGTTGTTGAAATGTGTTGATAAAAGATCCCACTTCGCTAGACATTTTCCTTTAATCTTTCAAATCTTTTGTTTTATTCCCCCTCCCCCAGATAGTGAAGGACATCTAGCGTCGAATTTGCAGTCTTGATTGCCTACTATGTCATCTATGTGAACGCATCATTTTGGTAGTTACCACAGTTAACTCGCATAGCATGTAGAAGTTAGGCAAGAAGAGTCCAATTGTCATTTTGAGTTGTGTATAGTTTGTATGAAGGGAACTTTGTACCAGGTATCAAATGTATTCTATTACTTAAAATATCAATGAAGTAGTCTTCTTATTTCATTTGAGTTCATATTCCATTTTTAAGCTCGTTGGCTGTATTTAGTCTGCTTACTAAGCGTTCTACATGTATCTCGCGGAGAAGCTCACATAGAATGTCTAGGCGGTCACATCGTCATTTAGTCGAATAAAGTGACATTTGGGATGGGGAGTAACATTATGTGTCAATTCTCACTTTTCAAAGATTGAAGATCGAAAGTTGAAGACTGTTCAAGATGAAGGTGAAGACTGAAATTGTTCACAAAAAAAATTATTTGTTAATTTCTATTTTTTGTCTGTTCATTATAATTTCTACCTTTTTAATAATTCAATAGTTCATAATATTTTTTGACCATTCAAGGTACACAACTTCCCTTTCTTAAACTTTTAGTTGAGGTACATTATTTTGATTTAATTTTTTTTTTTCATTTTCTATAATAGGATGACAAAAGTTGTAATTAATAAAGTTCAAAATTTTTTTAGGGAGGTCGATAAAAGTTACAATTGTTGACAAATTTATGCCACAACAAATCAAAAACAAAAATAGAGACCTCTTTTCATTCGAAATTTTATAGTTATTACATTTATTATAATGTGTTTGAAATTGTATTCAAATATAATTTGTAAGAGAAATATGTTCAAAATAACATTATGTTGAGAAAATTATTGGACGAAAATGTAAGAAGGGAAGAACAGTTTTATTTTATTCCAAAATTCCAATAAATCTAAGTTCTGCCCATGACGTTAATATATAAATTAATTGATATTTGTGAACAATTAGTTTTAAAAAAAATGAAGGAATGTTATGAAATAATATCAATTTGGATTATTGGAGTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATTATAATTTTTTTAGAGTAATGTTAAATTAGAATTAAGGATGAAGAGAGAGTGAG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mRNA sequence

ATGCAGGTGGAACCGAATTTTTGGGGGGTGGGTGTGACGAAGCAATTACACCAACCGCAGACCCATTGTGGTTCTTCTTCTATTTTTCTGAAGACGGAATGGAAGCCGGAGAAGCAAGAAGGCATCGGGACCTATTCTTCTGCACGACCATTGTTTTTTATGAATGTTTTTCCCGCTGAGGCTAAAACAGCTTGCTCGTTGGACACATTTGAACTTTTGTTTCTCTTAGAATTAACCTTAGTACATGGAAATGCACATAGAAAGTGTGTTGTGTATGTGGATTGGGGAGTGGGCATAAACAGCATCATGGAATACCGAGTTGGGTACAAGTTGGTTGGTGAGTCAACTCAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCAGGTGGAACCGAATTTTTGGGGGGTGGGTGTGACGAAGCAATTACACCAACCGCAGACCCATTGTGGTTCTTCTTCTATTTTTCTGAAGACGGAATGGAAGCCGGAGAAGCAAGAAGGCATCGGGACCTATTCTTCTGCACGACCATTGTTTTTTATGAATGTTTTTCCCGCTGAGGCTAAAACAGCTTGCTCGTTGGACACATTTGAACTTTTGTTTCTCTTAGAATTAACCTTAGTACATGGAAATGCACATAGAAAGTGTGTTGTGTATGTGGATTGGGGAGTGGGCATAAACAGCATCATGGAATACCGAGTTGGGTACAAGTTGGTTGGTGAGTCAACTCAATGA

Protein sequence

MQVEPNFWGVGVTKQLHQPQTHCGSSSIFLKTEWKPEKQEGIGTYSSARPLFFMNVFPAEAKTACSLDTFELLFLLELTLVHGNAHRKCVVYVDWGVGINSIMEYRVGYKLVGESTQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Pay0002446Pay0002446gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Pay0002446.1-exonPay0002446.1-exon-chr03:3696588..3696668exon
Pay0002446.1-exonPay0002446.1-exon-chr03:3702798..3702837exon
Pay0002446.1-exonPay0002446.1-exon-chr03:3705577..3705719exon
Pay0002446.1-exonPay0002446.1-exon-chr03:3709573..3709662exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Pay0002446.1-cdsPay0002446.1-cds-chr03:3696588..3696668CDS
Pay0002446.1-cdsPay0002446.1-cds-chr03:3702798..3702837CDS
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Pay0002446.1Pay0002446.1-proteinpolypeptide