PI0014222.1 (mRNA) Melon (PI 482460) v1

Overview
NamePI0014222.1
TypemRNA
OrganismCucumis metuliferus (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr05: 12650837 .. 12656283 (-)
Sequence length1282
RNA-Seq ExpressionPI0014222.1
SyntenyPI0014222.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGTTCCGACGAAGGGCTGAAACACTACATATATATCAATGTACGGTATTGTTTGTAATATATAAGGGTATATAATGATATATTTAATTCAAAAACATATTCTTGCCGTAAGAAATTTTTAAATTAACTTCCAATATATAGCACTGTATTATTTGAAATATGTAAGGGTATATAATGATGTATTTAATTTGAAAACAGATTCAGTCAGTAATAAATTTCCAATATGATATTATTGGAAATATATAAGGATATATAATGATGTATTTAATTGGAAAACAGATTCAGTTAGTAAGAACTTTAGAAATTCACCGAAAATATTCATTGGTATACCATAATTCACAATTGGAAAACAAAATTATTAATATGAATGCACTCACCAGAAAGCTCTTAAGAGATGAACGGAATAAATGAAAGAGCGAACGGAGGGAGGGAGATCGAACGGATAGAGAAATCGAATGAATTTTTTTTTTAGTAAAACGAAAAGAAAGGAAAAGAAATGGGGAATTTTTTTTATTAAAATCCTACCATAATTGTATTAAATACATACTGTATTTACATATGTTCTACAATAAATGACTATCTAAAAATTAAATAGAAATAATCTTATTAAATAATTATAAGACTAAATATGTAAGTTTTAATATAACTAATAAATGTAGAACAAATTATTTATGGAAAGAAAATATATATATATTCGAAAATATGTATTATTTAAATTAATGATAAGGTCAAATCGATCCATAAAATTAGTTAAATCTTATTAATGAAAATAAATGAGAATTTAAGACATTTGTGTAAAATCATAGTCATATTAGGTATTTTCTCTAAATATTTCTTTTTTAAATTTCAATCAGGCTTTGTTATATCGTAAATATTTTGGCCATATTTTCTATATCTAAAACAATGATAATAATAATTTATATTCAACCTGTTAACTACCATTAGTTTTATAATTTATAAATATAGCATTAAAAACATCTTAAATAATATTTTAAACACATATCTAAAAACATAAACACACTAACTTTATTTTTATTGATCCCTCAATTAGAGAGGATGGTCTTAGGAATTTGGGAAACTAAATTAACTTTATGAAAATAATACATGTGAATTACACTAAAATAAACTAGGTGGTTTGTTTATAAAATTATTGTGCTAAATTAATGTAAGGCGTCACAGTCCCCTTGACTTTACTATATCTGAAATCACGCATATACCCCCAAATGCCTAACTAATTAACACCATACCCTTCTTCCCACTGCACTCTCCTACTACGCCTCCTCTCTCTCTATACTCTTATCTCGCCGTCGCCTCATCGCCGTCGCCACCGCCGCCACCGCCGCCTCGTTCCTCCTCCTCCTTCCCAGGTATCTCTCTTCTTCTCTCTAATTTTAATTTTTCTTTTTTTTCTTATACCAACCGACATTAATTTCTTTTATCATATGTATTCTCTCCCTCGATTAACCCAATTTTTTGTTGGTCCGATCTCTGTTTTGAGGGCATGGTTTTTGTACTTTTTCGTTGTTTTCTGCAAATCTTTTCGCCTTCCACTGTTAATTTTGCTCTAAAACAATTCTTTATTTTATTTTTATAGTGTTGTTATCCTAAAAAAGGCATTCCGACATTAGAAGAAATTGAACTACTGTTGCGTTTTGTGGAAGGTGTTGGATTCTGCGTGCAAATCAACTACTTAGCTTTTGGGTAACTTCTATCTACTTCATTATGGGAGTTTTGCATTTTGGGATCTGTTTGAATGTCTGGAAAATTAAACTAGAGCATTTTAAACATCTCCATGGCCCCTTTAATGGACAATTTTTGCATAATCATTTAGGAATTTGTTATTTGTCTTAAATGAGAGTTGTTTGTGCATAGGCTGGCCGTTTATCAAATTTTCCTATTTGTGCTTCTTGATGCTACAAACAGAAGTTGAAATAGTTCTGGGTTTTTTTTTTATTTTTTTATTTATTTGTTGTTGTTGTGATCTCTCTACTTTCCTCATTAACTCTGAGCCGAGGGCATTCCTAATAATCCCTTATCTGGAGGTTGGGGTGATGTCTTTTCACTTGACCCTCTGCTTTTGGAGCCCTTTTCACTGCATCAAATCTGCAAAGAAAAAAAAACCCCAACATATAGGAGTGAGGTTCTTGAAATATTCGTGGTTGGGCAATAATATTTTTGCTAGTACAAAACTGAGGGGCTGAAATTCATTATCAGTGCTGAAGCTGCTGAGAATTGTTTCTGTAATAATGACTGGAGCAATTAGTGAGGTCTTTAAGGAGCGAAAATTTTGAACTGAGACTGATAGGAAGACTACACTAAGGTTGATATGGGAAAGTTCCTGAGTTTGTTACTTGGGTGTCTCAATTTTTAATCAACTTGGATTAGAAGAACTTGATTGTTCTTCAACAAGAAACAATTATTCACGGGGCCTTTTTGTTATGGCAAAATGCCTTTCTCCATTAAGTGGATTGCAGATGTAAAGCTAGTCCTGTTCAAGAACTTGTTCTCCTTCACGCTCCATTGGGACTTTGAATTGTGTAAAATTTTAACAACTCTTCTCTTAACCACAAATTCTTCATAGAGCACAAAATGTAGGACACGGCGACACGCCATTTTAAAAAAATGTAGGACATGACACGTCGGGGACACATCAATTTTTTAGTAAAAAAATTAAATATATGCATTCATATAAACATATTACATAACAAGGATTCCAATTAAAAACATCAAACTAACAAGTTTAGAGCCATAAAACATTAACAAGTTTTAGTAGAGTAGTTTGTTCAACCCAACAAAAGCCAAAAGGTAAAAACCTACAAAACTACAAAATAAAATCAAGAACATGTCTTCATTCTTCTCCAAAACCTAAATAATTAGGGTGGGAGAATCGGAGAAGACAGAAGAGAGCCGAGAGGGACAGAGGGTGAGATCGTGATGTTTCAGGATGAAAAGAGAAAATTAAAAAAAAAAACCTAAATAATTATGCCATTGGGCCGTTTCTAGGCTTCCCGTGTCCGTCGGTGTTTTGGCCGTGTCGGAGACGTGTCGGTGTCGGAAACGTGTCCGACACCGATACTCGGCCATGTTAGGAGTGTCAGTGCTTCTTAGATTAATGAAATTGTCTCTTAACAAAAAACTAAACGTTTCATCTTCTTCAATGGTTAATTAACTTGACATTTTATGCTTTTTTAAGTGGAGTGCATTTAGTATTTTATGTTAAATTTATATGCATCCTAAAAAAATAATTATAAAAAAGTGTAGCCCCAATGTGTCCATGTTCTAGTTTTCTTTAAATTGGCGTATGGTTGCATTGCATCATGTTGTGTCCCTGTCCATGCTTCTTAGGTCTCAATTCAAGGGAGTAACAAAAAGTTTTCCAAAAGTTGTTTTGAGTTGTGTGGATATTGACAAAGCTAAACCCTTCTATCATCAAGTTGGTTGGAACTCGGCAGAATGCGGGTCCATGTCAGCTGAATTTCGTGCCATGGAGTGAAAAAGACTTCTTTGCTCTCAAAGTTGTCACTACCTATTGGGGTTGGGTTAAATTTTAATACCTCCCTCTTAATCTGTGGACTCTTGACATGTTAACGTTCACTTGAGAGGTTTGTGTTGATTTTCTTTCTACGTGCTATAGAATCTCTTAGAAAGCTTGACCTCATAAAATTTTGCTGAAAAATCCAATTAAATTTCTATAGCTTCATCCTCGCTAATACTTTCATAATATAGCCAACCTTCAAAGGAAAAAGAGTTAAGTGGTGGAGATCCAAAATATGGGAAGGCAGAAGCTTGATCAGGGAGATTGAAATTGTTGAGGAGTTTGTCAGCTTTTTCAAGACTCTTTACGCAAAATGAAAAGACCCAAACTTTACCATTAACGGAGACCTATTCCTTCAAATATTTGTTTGGAGTTGGAAAATGCCTTTTATGAAAGAAGAATTAAAAATGCTATTGATGAGCTTGGTAATAGTAGATCCCCAGGACTAGATGGTTATACGGCGAGTTTATGAAAAAAGTTTGGCCCATTTTAAAGAACGATTGGTTGAAGACCTTTGAGGATTTTTATGAGAATGAGATCCTGAACAGATGTGTTAATGGGACTTATATCTGTCTAATTCCAAAGAAACTAGAAGGACGAATTATCAGACTATAATTCATGTGACAAGTGTTTATAAAGTCGTAGCTAATGAGTTGGTGGATGAGTGTCATTGGAAAAAGGGAACAGATTGGGTTATCAAGCTTGACTTTGAAAAAGCTTGTGACATAGTGGATTGGGACTTCCTTTTGAAGGTTCTTCGGTAAACACTTTGGAGAATTATGGATCAACTAGATTAAAGGATGGGTTAGAACATCTTCTCTGTCTTTCTTTGTTAATGGCAGATCAAGTGGGAATGTGGGATTATTCGCGCTGCGTTTGGGTTTCGAGTCTTCGACAAAGTTATTCATAAGCACCTTTTCTGTTTGGGATTGTGGATAATGTTCTGAGTGCTTTGTTAGATAAGGCCTATGAGAAAGATTGTATTAGAGGCTTCCTGGTGGGTGAGAGCATACCTGTTGCATACCTGTTTCATGTCAGTCATCTACAAATTGTTGATGATACCCTCTTTCCTGAATATAATGATGAGAAACTAAACTGCTTGATAATTGTTGACATTTATGAGCTTGTCATTCGTGTATGGTATGGAAATTCATTTTCAAAATGCCACCTTCTTGGTGGCACTCTTTTGGAAGGTGTCGAAGAGGATGAAGTCGTTGAGATTTGGGATCGTGAACCTCCTAGCATGTGTAAACAGAGGAAGGTATCATCAACAATTTGTGATCCTCTGTTTACACATTCAAGAGGGAGTAAGCTTACACATGCTAATGTCGTTCTATCAAGCATCCCTATTTACTATTCCTGAATTAGTGCATTGTACCCTCTATTAGCCCTTTAAGTTTATTCCCTATTTATTCAACTAGAGAGCCTCCTCTGTTTAGGGGTTGTCAATATTTTCTACCTTGAACTATGGTTGCCTTGACCTTGCTATTCAAAGGGTTGGATTTTTCCACACACTGGCTTTACAGAACCTTGGTAATTGGTTAAATCCATGGATGTATGCTGCATCATATTCATCCCTTACAAAAGGAAGGGCAGAAAAGACAAGTGCACAACTGAAGGTTTTGGTTTTGTATGACCGAAAATGGGATTTAAATCATGCTTGTATCTCAATCTCAAGGGAGAGTCAAGCTACTTGGAAGAGGCATACAGCAAGGAGATCCTCACTCTTTACTTTTTCATCATGATGGTAGATTGCCATGGTTAATCTTTTGGCCTTACCAAAGGCTTTAACATGGGAGTGAGGATTAAATATTGATGCCGATATTGGTATCAAAATATCCATTGATTGATATTTTATAAACACAAATGACAAATTTATATCAATTATTTGATTTCGTAGTTAAGTTATT

mRNA sequence

ATGAGTTCCGACGAAGGGCTGAAACACTACATATATATCAATTGTTGTTATCCTAAAAAAGGCATTCCGACATTAGAAGAAATTGAACTACTGTTGCGTTTTGTGGAAGGTGTTGGATTCTGCGTGCAAATCAACTACTTAGCTTTTGGGCTTCCCGTGTCCGTCGGTGTTTTGGCCGTGTCGGAGACGTGTCGGTGTCGGAAACGTGTCCGACACCGATACTCGGCCATGTTAGGAGTGTCTCAATTCAAGGGAGTAACAAAAAGTTTTCCAAAAGTTGTTTTGAGTTGTGTGGATATTGACAAAGCTAAACCCTTCTATCATCAAGTTGATAAGGCCTATGAGAAAGATTGTATTAGAGGCTTCCTGGTGGGTGAGAGCATACCTGTTGCATACCTGTTTCATGTCAGTCATCTACAAATTGTTGATGATACCCTCTTTCCTGAATATAATGATGAGAAACTAAACTGCTTGATAATTGTTGACATTTATGAGCTTGTCATTCGTGTATGGTATGGAAATTCATTTTCAAAATGCCACCTTCTTGGTGGCACTCTTTTGGAAGGTGTCGAAGAGGATGAAGTCGTTGAGATTTGGGATCGTGAACCTCCTAGCATGTGTAAACAGAGGAAGGTATCATCAACAATTTGTGATCCTCTGTTTACACATTCAAGAGGGAGTAAGCTTACACATGCTAATGTCGTTCTATCAAGCATCCCTATTTACTATTCCTGAATTAGTGCATTGTACCCTCTATTAGCCCTTTAAGTTTATTCCCTATTTATTCAACTAGAGAGCCTCCTCTGTTTAGGGGTTGTCAATATTTTCTACCTTGAACTATGGTTGCCTTGACCTTGCTATTCAAAGGGTTGGATTTTTCCACACACTGGCTTTACAGAACCTTGGTAATTGGTTAAATCCATGGATGTATGCTGCATCATATTCATCCCTTACAAAAGGAAGGGCAGAAAAGACAAGTGCACAACTGAAGGTTTTGGTTTTGTATGACCGAAAATGGGATTTAAATCATGCTTGTATCTCAATCTCAAGGGAGAGTCAAGCTACTTGGAAGAGGCATACAGCAAGGAGATCCTCACTCTTTACTTTTTCATCATGATGGTAGATTGCCATGGTTAATCTTTTGGCCTTACCAAAGGCTTTAACATGGGAGTGAGGATTAAATATTGATGCCGATATTGGTATCAAAATATCCATTGATTGATATTTTATAAACACAAATGACAAATTTATATCAATTATTTGATTTCGTAGTTAAGTTATT

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTCCGACGAAGGGCTGAAACACTACATATATATCAATTGTTGTTATCCTAAAAAAGGCATTCCGACATTAGAAGAAATTGAACTACTGTTGCGTTTTGTGGAAGGTGTTGGATTCTGCGTGCAAATCAACTACTTAGCTTTTGGGCTTCCCGTGTCCGTCGGTGTTTTGGCCGTGTCGGAGACGTGTCGGTGTCGGAAACGTGTCCGACACCGATACTCGGCCATGTTAGGAGTGTCTCAATTCAAGGGAGTAACAAAAAGTTTTCCAAAAGTTGTTTTGAGTTGTGTGGATATTGACAAAGCTAAACCCTTCTATCATCAAGTTGATAAGGCCTATGAGAAAGATTGTATTAGAGGCTTCCTGGTGGGTGAGAGCATACCTGTTGCATACCTGTTTCATGTCAGTCATCTACAAATTGTTGATGATACCCTCTTTCCTGAATATAATGATGAGAAACTAAACTGCTTGATAATTGTTGACATTTATGAGCTTGTCATTCGTGTATGGTATGGAAATTCATTTTCAAAATGCCACCTTCTTGGTGGCACTCTTTTGGAAGGTGTCGAAGAGGATGAAGTCGTTGAGATTTGGGATCGTGAACCTCCTAGCATGTGTAAACAGAGGAAGGTATCATCAACAATTTGTGATCCTCTGTTTACACATTCAAGAGGGAGTAAGCTTACACATGCTAATGTCGTTCTATCAAGCATCCCTATTTACTATTCCTGA

Protein sequence

MSSDEGLKHYIYINCCYPKKGIPTLEEIELLLRFVEGVGFCVQINYLAFGLPVSVGVLAVSETCRCRKRVRHRYSAMLGVSQFKGVTKSFPKVVLSCVDIDKAKPFYHQVDKAYEKDCIRGFLVGESIPVAYLFHVSHLQIVDDTLFPEYNDEKLNCLIIVDIYELVIRVWYGNSFSKCHLLGGTLLEGVEEDEVVEIWDREPPSMCKQRKVSSTICDPLFTHSRGSKLTHANVVLSSIPIYYS
Homology
[Close]
BLAST of PI0014222.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6598972.1 (hypothetical protein SDJN03_08750, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 6.9e-05
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 18  PKKGIPTLEEIELLLRFVEGVGFCVQINYLAF 50
           PKKGIPTLEEIEL  RF+EG+ FCVQINYLAF
Sbjct: 74  PKKGIPTLEEIELQSRFLEGLEFCVQINYLAF 105

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of PI0014222.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0014222.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0014222.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6598972.16.9e-0584.38hypothetical protein SDJN03_08750, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of PI0014222.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
PI0014222PI0014222gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0014222.1-exonPI0014222.1-exon-chr05:12650837..12651787exon
PI0014222.1-exonPI0014222.1-exon-chr05:12652845..12652936exon
PI0014222.1-exonPI0014222.1-exon-chr05:12653189..12653278exon
PI0014222.1-exonPI0014222.1-exon-chr05:12654581..12654687exon
PI0014222.1-exonPI0014222.1-exon-chr05:12656242..12656283exon


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0014222.1-three_prime_utrPI0014222.1-three_prime_utr-chr05:12650837..12651383three_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0014222.1-cdsPI0014222.1-cds-chr05:12651384..12651787CDS
PI0014222.1-cdsPI0014222.1-cds-chr05:12652845..12652936CDS
PI0014222.1-cdsPI0014222.1-cds-chr05:12653189..12653278CDS
PI0014222.1-cdsPI0014222.1-cds-chr05:12654581..12654687CDS
PI0014222.1-cdsPI0014222.1-cds-chr05:12656242..12656283CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0014222.1PI0014222.1-proteinpolypeptide