PI0008757.1 (mRNA) Melon (PI 482460) v1

Overview
NamePI0008757.1
TypemRNA
OrganismCucumis metuliferus (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 18612978 .. 18621297 (+)
Sequence length528
RNA-Seq ExpressionPI0008757.1
SyntenyPI0008757.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCGTTCAGCCATCTTCGTTCTACGTCAGCTGAGCGTTTTGTTGGGTCGCATTGTTCGTTCGTAGTTTTCCCCTTCATGTGCCAAGCATCCAGTCCTGTGAGTCATCTTTTCGAGTGAGCTCCATCTTGCGTTGCTCAGACCACGTTGCCAGTAGCCATCAAACAAGCCCATACGTGCCTGAACTGCTTCTCGTTTTGCCTTTTCAAACTAGTCCAAGTGGACGTCCGTTCGTGAGTCGTCTCTCTTTTGTTAGAGCCAACCTAAGCCGCGTGCGTTGTTCTCTATCCGGGCCAATTCCTTCCCCCAGCCAAGTCGAGTCACGCATGAGCCAAACCCTTTTCTGTCATTTTCCAGCCGATTCCAGCCAATTTTCTTGGTGAGTTTGGTTGAGTTTTGATGGGTTTTGGATATACCCATCAAGTGGTAATTTTGTTGGTCTTAAATAAATTAATTTTGGATTAAGTTCGATTTTTCTCCTTGAAGGTTCAGTTGGCAAATTTGACTAATCTTGGAATATTTTTTCCCCAAGGTTGAATTGGATTCAACCTCAATTGTTGGTAAGTTAACTTGAGAAAATTTAGAGGTTGACCATTATTATTTTATTAAAGTTACTAAAGTCTCCCTTACTATTTAGGAACCGTTTATTTGGGAAATTCTTGAATGTCAGCTAGGGAGCTAATTTTAAGCTAATGTCTCATGTAAGAGATTTTACTACTAGACCTCGAATGTTAATGAAATTAAAAGCTTGCATGTATTTTCCACTATGCATTGATATAGCTAAGGTGCATAATGTGTTGTAGTTGATGACTGATATGTTTATGATGCATGATATATTAATAACATGATTAAGGACTTTATGATTGATATTCATGTCATGTTTATGATGTTTATGATGTTGTTACATGCTATGGACTATGGCATTCGGTTAACTTTGACCATCATGGTTGTGCCTACATGTTCGATGTCCCTCGGGATCACCACTTTTTAGCAGATTTATGACTGTGTGCATCCAATGGGATCACCAGTCTGCCATGCCATGTTTATGAGTGGTCCGACGAGATTACTAACAGCCCGATACCATAGGTGTTCCTTTGGACTCAACGACAGATGAGAGTGTTCCTACGAGATCACTAGATTGCGTGTGTTCCATTGGGCACACGGTAGTTTTGAGTACCTCCTCACCGGATCCTAATGGGAAGTTAACAGAAACCTAGCGGGACTAATAGTGGGACCCTTACTGAGTATATGTTTATGCTCACTCTTTTCTATATTTAATATTTCAAGCAAAGGTAGAGGTAGAGGTAGAGAAAAGTTGGTGAATGATAAGAAGGGTCCATGACTTGCCATAGGGGAATTACGTTGCTTCCGCCATTCATATTTATAGTATTTTGATTTCTAGTATTTTATTGGAATTTATCGGAAATTCGTTAATTATTTTTATGTTATTTTCTTTAAAAGTTAGATAGGGCTCGAACTAGGACTATGTTTACCTAGCATTTATTTCTATTTCTCCAAATTATGATTTATGAATGAGTATTTGAAATTATTTATTTAAGAATTTAGTTTTCCTCTTTTTATTTCAAATGCAAAAATTGTTATTTATTTTAATAGTAACGACCTCAACTTTGTATAAGGAGTTGGGTTGTTGCAATACCATCATTCGGAATATCCCATACTGTTTCTCTGCAAAGGTCTATCTCTTGCCAGAGTAGAGAAAGTTTATTGAAGTGGGAGGTTACATCTAGATTTTCTTACTGGCAATCATGGATTTGTTTCCTCAATGTATACAAACGATAGGCGTTTTGACTCTTCGAATAAAGTTTCTGAGTCATGTTCCATAGATCATTTGCAGTTGCTGAATAAAGTAGGGACTTGCTTATTTGTCGTTCCATGCTATTAATCAACATGAACCGAATAAAGGAGTCCTCTTCTCTCTAGAAATGTTCATAAACATCACCGGGTGGGGGACAAAAAGTTTCTCCTATTAGAAAACTGAATTGGTGACATCCTTCGAGGAACGTTTTGATCGACTGGGACCAAGAAAATAATTCTGGCTATTCAGCATCTATCTTGGAAAGACACCTGTAGATGGTGCTAGAGAACTTGTTATATAATTTGAGAACAAAGTAAGCAGCGAAGTTATCAGGTTCTTGGAATACATGAACAAGTTGATTGGTTTGGATTGCGTCAAAGGTTGCCAACTTCAAACCTCAATCTATTATGAATTTTATCGATTCTGATACCATGGATGTACGACTGCTGTAAAGGATCAAAAGACAGCAGCGCGTAGATTGACAAAATTGATGACTGTCCGTAAATATAGAGTAGTGGTGGCATGTGGAGGTGCAGTTGGCCAAAAGGGTATTGCGGTTGGCTTTAGGAGGCTAAATGAGAGTTGATTTACTAAACAGTGGAGGAATTGGACGATGGTGCGTGGGAGACAGGTTGAAGCGCGTGCGACAAATTTTGACCACTAGGCTGCACGACTGACTCTGAGGGTAGGTTCATTGTGACTGCCTACGTCTTCTAAACCTAGTGGAGCAGCTTTTCCATGGCGATGGCGATGACAACTGTTTCATTTGTCTCTATTCGGGTTTCATCTATAATAAGGTATCGTTTTTACCTCTTTCTAATACCATGTTAAAAGCAGTAAAGAAAAATAGACACCAAGTTATGTGAAAATCTGAGTATCGAGAGAAAAATCACAATTCACTTTTCTTAGTAATTTCTAATAATTACACAATGATACAAGGGGAAGATAAAATAGGCTATAACTTATAATAAAAAAAGGAAAGGAAATTAGGTTAACTCCTTTCTTAGGCTTGGGCCAAGCCCACTAATTCTAATAGTTTGAACAAAAAAAGAAGAAGAAAAAGTTACTGGTTTGAAGTATAGGTGATGAAATAGCAAACTCCTTTAGAATATCTAGCTAAGTTGATGTCATTAAAGGAAGCCAAAATGGTTGGACATGAGTTTGGACTTGGAAAAGAAAAGGCAAAGTATAATTTCTTTAATTGAAGAATTATTTATAGGATACTTAAATTAATCCATAATCTTGTTGTGAGGAAGAGATCATATGCTTGATCAAGGAAAAAAAACTCATGGAGTTCTAAAGTAGGGGTAACTTGCGGAGAACACCATATTAATGTTTGAAGTTTGAAGTATGAAAATGAAATGTAGATTTTAAAGGATTGTGGATAGTCACATGTTTTGGATTATGAATTAAGTTTTACTCGAAAAGTGAAAAAAAAAGGAAATTTTTCTTGAATTTAGTGGTTTCATCCAATATAAGTTTGAAGGAAAGAAAAATATTTAAGAAAGGTTGCTATTTTAGAGATATAAAAGAAAAATGCGTAAAAAATCCTAAGTGCTTAAATATGGCTTGGTTGTTTTGGTGTAAAATAATTATTTCTCATTGTCATGTGAAACCTCGAAAAATATGTATAGTAGGAAAGATAGGCTACATAAATGATTGAGTATGAATCTTTGTGTTAACACAAGATTTTGTTCCTAAACTAAGAGGTTGAGAAGGGGTAATCTAAAGTGGATCTATTGGTCTTTCAAGAATTATTGACATGGAGGGTTGAGGCTTCAGTCAAACGGTAAATCATTTAAAGCATTAACAAGATTTAAGAGATTTTGACCTTTGTGTGTAGGCAGGTTGGAAACATGTACTAGCAAGACTATCAATTTGTGTGAGAAAAAAGGGAAAGTAATCCAACTTGAGGTAGACGTAAAAGTTATATAAGTGTTAAAGTAAGTAAGTTGGATTCCTAAAGATCACTACTGGCATGAGAAGTAGATTTGATGATAGAGTTAGAGTTGATAACAAACAGTTAGATGTGATGAATTAGCCCATGTCATAGAAACATAAGCTTTTAGTAAAGTTTTTGATGTGCTTTAATGTTTCGCCTTGGAGAACATCATTTTGTTTATTTGAGAAGAAAGTTAGATTCATGTAACTAAGTATCAACTGATACAAACTGAATATGATAGCGTAACCAGGTTGCAAGGGATTGCCGAGGCCATCAAATGTTGAATGAACTTAAATCCTGAACTTGAAATTTCATAAGATATATATTTTTCCTTGCATGGATGACATGATGATCAACTTTAATGAATATGAATATTCTCAATATTGAACGTATAAAGAACTATCTTTAGGAATCAATCACATTTATTATGAGGTTATGAAAATGTTTTTCTAATGACAAATGCTTTAGTATTGAAAGATTTTAGACACCTCATTTTAAAAAGGGATTTCAAGACTCGTTCGTAGCAGGATCTAACAGCCATATGTGATTATTTTAAGACTAAAGCATGATACGAAGTTTTGCTTGAGGAGGTTTATAGTTTTTAATGGTATAGATTTGTGTGTTGAGTTTTGAATGATTAGGAGGCTTAATGGGTTCTCAAACATATAACTACTACTAAAGACATCATCGTTGATGCTTCTAAATGGAAGTAGTGTCCAGTTGGGCAAAGTTTCTATGATATACACCTTCAAACTCTGTCGTATATAGTATGACTAGTTGCTCCGCCCACGTATTGGGATTCTTTTATGCACCAATATGACCAGTTCAAATGGATGTTTTTAATGCATATGACTTCTTAAGCTCATGACAATTTTCAGAATTCTTAGGGTAAATGTGTTGAAGTACTATTTATTTTTAGCATATGAAGTGTCATAGTTTTATGTGAAAGAGGTTCACACTTCTTGAGGAACCAATTCCAATTGTGCCAAATGCAACATACATTTTTTTAAAAACATTATCTCATTTTCACAAAAAGTGATTTGTGATCGGTTAGAGTATAGTGTAGCTTTTCACTGACATTTTGATGGTCAAACGGAGTGCTTGAACCAAACTGTAGAAGACATGTTATGTGCTTGCACGTTAGAATTGACAGGGAGTTGAGGTTCTCACTTGCTTCTTATGGAGGTTAGGTGTAAACACATTGGGTTTGAAGTGAAGGATAAGGTGTTCTTGAAAGTGACACCTATGAAAGGTGTCTTGAGGTTTGAAAGGAAGGGGTTGCTGAGTTTCTGCTTTATTGAGCCATTTGAGATTCTTGAGCAAATTGGCCTTGTGGCTTACCATTTAGCACTTATGCCATTCCTTTCTGTAGTTCATGATGTTTTTCATGTCTCGATGTTGAGAAAGTATATAGCAGATCCATCTCATGTTGTTGATTATGAGTCGTTGCAACTAATGAGAACTTGAGCTATGAGGAGCAACCTATTGCAATTTTGGTAAGAGAAGTGAAAGTGCTATACAACAGAGGAGTTATATTGGTGAAAGGTTTACGACGAAATCACCAAGTCGAGGAGGTGACATGGGAATGAGAGAATGACATGAGAGGATACCCAAAGTTGTTTGAGGACGAAAGTTCCTTACACTACAACAAATACCCTTTTTAATAACAGGTAAGGATAACATTTAATAAAAACTGTTATGGAAAGAATGAAAAAAAAGTGGGGAATTAAAGCTTTTTCGGCCGCCCAAATTTTCTATCACGCGCGTGTGTTAATCTCTCCCCCTCGGGTTACGCTTTTCCCAAATTTCCCCTTTCTCAATCTTGACTCCAAATTGTACCCTCGTCCCCTATTTTCTCAAAATCAATTTCTTGTCCATCACAAATTGCTCTTTTTTCTTCATTGACTTTGTCTTCTTTAAATCATTCGTGTTCCAACATTCATATTCTTCTCCATCTATTTGTGCTATTTTTCTTCTTCAAATCGATGTCTTCTCCATATGGTCCGTTTTGTTCCAAGATCCATTCACAAATCTGTCTCTTCTCCATCACAAATCTATCTCTTCTCCATCACAAATCATATGTGTTTCAGCATTCCATAGGCGTTCGTATACTCTGTCGTCTTCTCCGGTTAGTAATTTCTTTTATTTCTTCTTATTTTCTTTGTTTTTTGGTTCCCTTCTATTTTTGTCCGTCTACCCTTAAATATTTTTTTTTTTGTTATGGCTTTTTTTTGCCAATGTTTTAGGGTTTTACTTTTTCTTCCTTAAGTTCAAATTTTTAATCAAAATAGAGGGAAAAATAGGGACATTATTAGAGTTTTCTCTTGCCTTATCGATTAATCTTTTTGTCTTATCCTCTTCTTTTTCTATGTCGATATGTTCGATTAAATTCAATGTTAGGATTAGTGGTTTATGGCTTTCTGTTTGTGATTGTAGAATCTCTATATGTAAGTGTTTGTGGATTGAGAATGATGTTACACAACATAAACAAGTGATAGCTTACAAAACTTTAATTTGTTTGTATCTTCATGCAAAAAGGTTAGTAAATTGTTTGTTGTTTCTTCTAATAAAAAAACCACTTAGTTTAAAGCTCCAACATGCTATCATTTTAGTTGAATTGATGATAACCCTTTGCTAAAACAAACAAATAATGCATAACCTAATTCGGAGATTCCTAGCAAAATTGCATCAAGTTTTTGTGAATGTATGTTAACAAAAATAGTTTAGTAGTTCAGTTTGATTCTTTGAGTTAAATAATGGCATAAAAAAAGAACTTTTCATCTGGTTCAAATTGGTCTTCAAGATCCTCATAGCTTTGATCTATTCTCAAATCTTTACCCACTTTTAGAGCTTCCTGCTTTTCCACATATGCAGCAACAGTAGAGTTGATAACTTCCTTAATAACTTGTTTGTACGCCTTAGAAGGTCTCAATATCTCTAATAGAATGTCTTGGGGTATATTTGGCATCTTTCCTCCTTTCAGTCTTCTAAAACCTGGAATAGGTTGGGCTTCAGCAACCAAATCTGTCAAACACGTTGAAAATTGCTCTACTTTTGGCTCCTGACACCTCAACACGAATCATGTTTCATACCATTAGATTTTTATTCTCAGTTGTGTTGGGAACATTAGTGACGGTGAAGTCTTCAAACTGAGAAGATGAAACACTCACATCTTTTGATAACACAACACAAGCAGTTGAAAGATATCTGTTATTTTTACTCAAGGAAATTTTCCTGCTACTATATCTAATTTGACTGGGAAAAGATACACTTATAGCCTTGGGATTTATAGAAAGAAAGAAGTTGGCAGCGGTAATTTGCATTGTCTCTCTCTCATCGCTCTTATCCACTTCACCCAAACTCAACCTCCGTTTCTTTCAAAACAGTGATTTTCAAATTATTTGTTGTTTCTTGAACTTAGTCATGCAGGGATATATGACTGTGCATGATTTCAATATTATTCTCTATAATATTACAGTATTTTGTCATAAAGTGGAACTTTTTAGGGATAACTAATGTCTTTTGATAAGTTTTTATGTTTTGAGTCATTTAGAAATAATGATTTATGTGTGTGTGTTTTCAATGCGGTTACTTGTGAAAGTACTATTTCATTTTTTTTTTTGTTAAGTTTCTAATTGTTAGGTGATATTATAACAAATTTTCCTAGTTTATGTTAAGCATTGCTTGAATTATGTTAAGCTCTTATAATATGTTATAATTGTCATTTTTTCTCCTAGTTTATTCATAAAAAGTGCTTTGTGAATGGTCTGGACTTATGACTGATACTGAAATATACTTCTCATAATTGTAGATTGTTTGGCCGATAGTTCTGTCTTTTTGAAGCTCCTAGTTAAGGTAAGATCTTGTCTATTCTACCTAGTACTGAATAGTTTTAAAATTTGATTGCTGGATTGTGAAAAAATTTAGTAGTTGTATTGAGCCTCATGACTCTTAGGTAATTAGTGATAAATATCAAAAGAATAACAAAATGTTTTTTGTTCTCCATTTTGGTGATTATTTGGTTTCAAGTTCATGGATTTTAGTGGTGAAGTAGAACTTAGACTTTAATGGTTTTGTACTTCCAATATTGTTTAAAGTACGAACCATTATATTCTTTTACTTAATATTCTATTAAGTTATATTCTTTTTAGTAATATGAGGTTAGCTCTCTTTATATTAATTCTTGTTTGTATTTTTCTGGAAATTGAGTTGGATATGTATGTAGTTTTGGAATCTTGGTACTTGCACGTTTGAGGAGATATAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATGTCTTCTTAGGAATTCAAACACTTGGTTAACTCTCTCTTTATATTAACTACTTGTTCGTATTTTTTTGGAAATTGAGTTGTATATGTGTGTAGTTTTGGAATATTGGTATTTGCATTTGGGAGATATAACCTTAATGTGTTTTTGTGGACTTCCTTGGCTATGGGGCTCTCCAATTTTGTGTACAACTCACATTTTTCAATGAAGACTGTACTCCATGCTATATTTGTTTCGTAATTTATGTATAACCTGCCATGGTTTTGTTATAATAGGGATGA

mRNA sequence

ATGTCGTTCAGCCATCTTCGTTCTACGTCAGCTGAGCGTTTTGTTGGGTCGCATTGTTCGTTCGTAGTTTTCCCCTTCATGTGCCAAGCATCCAGTCCTAGCCAACCTAAGCCGCGTGCGTTGTTCTCTATCCGGGCCAATTCCTTCCCCCAGCCAAGTCGAGTCACGCATGAGCCAAACCCTTTTCTGTCATTTTCCAGCCGATTCCAGCCAATTTTCTTGGTTCAGTTGGCAAATTTGACTAATCTTGGAATATTTTTTCCCCAAGTAACGACCTCAACTTTGTATAAGGAGTTGGGTTGTTGCAATACCATCATTCGGAATATCCCATACTGTTTCTCTGCAAAGGATCAAAAGACAGCAGCGCGTAGATTGACAAAATTGATGACTGTCCGTAAATATAGAGTAGTGGTGGCATGTGGAGGTGCAGTTGGCCAAAAGGGTATTGCGGCGTTCGTATACTCTGTCGTCTTCTCCGATTGTTTGGCCGATAGTTCTGTCTTTTTGAAGCTCCTAGTTAAGGGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTTCAGCCATCTTCGTTCTACGTCAGCTGAGCGTTTTGTTGGGTCGCATTGTTCGTTCGTAGTTTTCCCCTTCATGTGCCAAGCATCCAGTCCTAGCCAACCTAAGCCGCGTGCGTTGTTCTCTATCCGGGCCAATTCCTTCCCCCAGCCAAGTCGAGTCACGCATGAGCCAAACCCTTTTCTGTCATTTTCCAGCCGATTCCAGCCAATTTTCTTGGTTCAGTTGGCAAATTTGACTAATCTTGGAATATTTTTTCCCCAAGTAACGACCTCAACTTTGTATAAGGAGTTGGGTTGTTGCAATACCATCATTCGGAATATCCCATACTGTTTCTCTGCAAAGGATCAAAAGACAGCAGCGCGTAGATTGACAAAATTGATGACTGTCCGTAAATATAGAGTAGTGGTGGCATGTGGAGGTGCAGTTGGCCAAAAGGGTATTGCGGCGTTCGTATACTCTGTCGTCTTCTCCGATTGTTTGGCCGATAGTTCTGTCTTTTTGAAGCTCCTAGTTAAGGGATGA

Protein sequence

MSFSHLRSTSAERFVGSHCSFVVFPFMCQASSPSQPKPRALFSIRANSFPQPSRVTHEPNPFLSFSSRFQPIFLVQLANLTNLGIFFPQVTTSTLYKELGCCNTIIRNIPYCFSAKDQKTAARRLTKLMTVRKYRVVVACGGAVGQKGIAAFVYSVVFSDCLADSSVFLKLLVKG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of PI0008757.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0008757.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0008757.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0008757.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
PI0008757PI0008757gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18612978..18613076exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18613234..18613356exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18613464..18613509exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18614592..18614671exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18615248..18615349exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18618836..18618863exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18620547..18620590exon
PI0008757.1-exonPI0008757.1-exon-chr06:18621292..18621297exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18612978..18613076CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18613234..18613356CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18613464..18613509CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18614592..18614671CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18615248..18615349CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18618836..18618863CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18620547..18620590CDS
PI0008757.1-cdsPI0008757.1-cds-chr06:18621292..18621297CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
PI0008757.1PI0008757.1-proteinpolypeptide