Moc10g15480.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc10g15480.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr10: 11756733 .. 11763217 (-)
Sequence length540
RNA-Seq ExpressionMoc10g15480.1
SyntenyMoc10g15480.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGTGAAAGGTCATTTGAAGATAGATTATTAGGTACTGAATTGAGATATGATGGTGTAAATGTAGGTACAGTATGTATGGTGATATGGAGGGTGTAGAATTGGGTACCTCTAGCAGAATAGGAATAGAAAGCCTGGCTGAAGAAGTAGCAGATGGAAAGGAAGAAATAATTGGTGGAGATAAGATAAAATCTATTGAGAAGATAATGAAGAATTTGAAAGGTTATTTTGTGGCTTGTATGGAAAAGATGTTTCATTGAAGATAACAAGGTGAGAGATGAATAATGGTTCATTTTGATCTAGGCATTTATAACCAAAATGAATGTTACTATATCCTAGAAATAGGCATGGTGAAGATCGAAGTTGGAGTTTGTGATTATTGAAGGGATGTAGATATAGGAAACAAAGGTAGTCAAAGACTTCGAGGAATTTATAGTTGGGTTTGATATAAAACAAATACTTCCATATGACATTTTCCATGAAGGACTTGTGTTGACAGTTTGTTAATAAGGTAGACTGAAGTTGAAAAATCATTAATCCAAAACATCAATGGTAGTGAAGCCATGAGATAAAAGAGCCAATCTCATCTTAACAATATTTCGATGTTTTCTTTCAACAATGCCATTTTGTTAAGATGTGTGTGGACAAGTTAGGCGATGAAGAATACCATGTTGATTTAGAAGAGTAAAGGAACGAAATTCATCCCCCCTCCCCCAATTTGTTTGAAGCATTTTAATAGGATGGTTAAGGAGTTTTTCAACTTGAAAGGTTATGAAGGTTTTTAAGACAACTAATTTGGAGTTTAAAAAATAAATCCAAGTATATCTTGAGAAGGCATCAACAAAGCTCATGTAATGTTTTGCTCCATTACGAGATGATATATGAGAAGGACCCTATAAGTTAGATTCTACAAGTTGTAATGGTGCTGTATAGACAGTTTGTGAGGAAGAAAAGGAAGTTTATGACTTTTACCCATTGCACAAGATTGACAAAACTGAGTACTTTTATTAGAGAATGAGATATTACAATATTTGAATGCTTGTTGAGTAATTGTAGGGGAGGGGTGACCTAGTTTATAGTACTACAAGGTAATATCAGAACAACAAGATGAACTATCAAAGGCTAATTCTAAAATAGACGGTTGGATTGGAATTTGAACTGAAAGAATTTGGATGTGATTTTATCATATTGAACCTGTAAAGTCCTTCATGTCAATGTCCTTTGAAGAAAAACAATCGTAGTGATTTGATCATTCACAAAACAAGTAAAGGGATGAAATTCAAAATAGCCATGATTATCCATGGCAAATGGGCTAACACTAATAAGACTTTTTGTCATATAAGGAACATGTAGCAGATTTTCAATGCGAAAAGTAGGCAGGTTATCAATATTAGAAGCAATAGAAGATTTTAAGGGTTGAAGTAAAGAACTACCATTGTGATGAATGTCCAATCTTACTCTATTGCCCACATGAATTTGGTTGCCACCTAAATACTCATGTCCAATTATGAAATTTTCTGATGAATTGGTGATGTGATTCGTAGAACTCGAGTCTAGATACTGGCAACTATCAGCGTTTGAATTTGGAGTGACCATTATGGCTTGCATTTGATTATTTTGAAACTGACCCTAAAATTGATTTTGGAATCGTGTACATCCACATGATTGAAGGTTTTGTCCCTACTGAACCAAAAATTATTTTGTCTTCATTCCTCTATTACTGCCCTTCAAATAAAAAATAACACCTTTGTGCAGTGTGACCAAATTTACCACAAATTTGGCATCACACTTTGTTGTTATCTTGCCACTGTCTGCATCTATTATAATTGTGATTTCCATTACCTTTGTTACCTTTCTAATTGTTTGAATTTTGATAACTCTTAGAAGAATTATCATTTTGCCTCTTATCAATGTTCTGAAACATAAGATTTACTAAGGTTATTGTGTGCCGTCTAGATTGATTGGTGAGTTTCTTTCAATTCTATTCTAATGTGTCATCAACAGTGGATACACTTCTTGAAGTGATTTTAGTTTTGATTTTGCAGATATAACTGAGACTATGGAATCAAATTCGATCCCTAGGCCAGCAAGAATGTATACTATCTGTTCTTGCATTGTTGCAGTACAACCAACAACATTTAGGGCATTAACTAAATTCTTTACCTTGGCAGTGTATCTTTGATATTCATATTCCCTTTTTAAAATTTTGCAATTCTCTTTTCAACTGCATAATCTTGGACGTATTTGCAGTCGTATACAATCTTTAAAGCGTATTCCATATTTCTTGGGTGGTTGTGCATTCTATCATATGAGCAAACACTTCTTCATTCATCGATCCCAATAGCCATAATGAAAGTAGTTTATCTTGTTGAATCCATGTCAAATAGGCTAGATTTTCTTTAGGTGTTGATACTGTACCATCTTCAACTTTGGTATTATGCAAGACCTAGGGAGGAGCTTTTTCTGTACCTTTTATGAATTTTTCGAATCTATTACCTTGGATTACTATCAAGATTTGGAACTTCCATAACAAGAAGTTGTTGTTCGTGAGTTTGATTAGAGCAATTTGATGTTCTGGATTAGCTACCACTGCATTCTATCCAAGTATGGATGTTGCTCAATTGTTAATTTTGGTGGACCTAGAAGATGCCATCACTGTTAGCCTAAAGGCTCTGATACCATTTCAGTTTAGTCAAGGTACAGTAGAAGTGAAGAATCATAGATTCAGCTTATTAATCACTTCATTATATTTGTAATACAGTGAATCTCCTTTATATAAAGGAACTAAACTAGAGGGAGAGTTTACAACATAATTATCCAAACGGTAATTACAAAACAAAAGGTGAAACATAATGTAAAATAGTATTTTAGTGAGTTGTCTCAATAAATCTAATATGGAAAAAATCTATAAAAAATTATTGCAATTACATAATGGACTATTAAATATTTAATCATTTAATATGAAATATCGAATTTGCACAAACCTGACATGAGATTGCATAAATGTCCGGATTTAATTAAAAAAAAATTCAAGATTCCATGAATAACGGTCGGGTCAAGATTGCATAAATGTCTAAGATTTAATTAACAAAGAGGACCAAGAATAGATGCCCAGATTAAACAAAAAAATTGCATGCTATCCTGGCCCAAGATAGTGCTATCTCAGCCCGAGATAGCATGCAATTCCTGTTTTTTTAATATATATTTGGGCATTTATTATTGGTCCTCTTTGTTAATTAAATTTCGGGTATTTTTTCCAATTCGTAATTGATTCTTCAGTTTAAAAAGTTAGATTTTTTTTTCCATATTACGTTCTCAATTGAAAAAAAAATCAAGAAGATCGACATTAATTCACTTATAATTTTCCTTTTATGAGTTTCCAAAATTTTGATAGATTTTATCAAAATGGAAAAAATTTGAAAACAAAAAGGGAAAAAATGAAAAGAAAGTTTTGAAAAATAAGAAGTTAGAAAAAAAGAGTATATGATGTTTTAGTCTTTACACAAGTGCAAAAAGTGAAAACTGGTAAAACAATTATATATATATATATACACACACACGCGTTGAGAGGTCACAAACAAGAGTTTTTAGAAAATACGTAAAAAAATTATGAAATTGCATATTATTATATTATAAAATTGCATATTATAGTGGACCTGAAATCAGGTATGTCTCCTTCTGGATTCATTTTCACAAGCTTCCTCTTGTAGATTTCTCTAGATCGGTAGCTATTGTTGGGAATGACTAAGTAAAAATGTATTTTTAAAAGCAAAATGTAAGAAATATCTTTTGCTAAAATTTAATTTATTGGAAAATACTTTTACGAAATTAATTAACGTTTTTTATGTTATTAATTAATGATTTTATTAACGATTTTAATGTTAATTTAAAACGTTAATTCATTAATTGTATAAAGTTATAAAACGTTTATTCATTAATTTTGTGAAAATGTTACTTATTTATTTTAAAACTTGTTTTTAAAATGATTTGGAGCCCCTTTTAAATCCCATGTTTTGGTGTCTCAAAAACAGAGGGAAAAATATATGTTTTGTGGGGCTCGACTTTTCTAAATGGTGTTGGGTATTTTGTCCTGAAACTCGTAGTTTGTAAACAGTGAACATCAATACATGTGAGGTTATTCAGACAAGTGTTGAAAGTGAATTTTTTAAACTCTAAATCCAATAAACTACGAACTCTTGGCTATTATAATGAGTACTTGGACTTTATATGAAGACATAAACTGGTTCAAGTTCAAGTAAATAGTCTAACAGTCTATAGTACATGGATCAAGTTGAATACGACCCGCTTTATGATTGTTACAAATGTTGTAAGGTGTCATAAACGAAGTGATCCTGATTCATTCATGTAGGAACATGTGAGCGGGGGTGTTCTACACAATGAGATTGTGTAAGACTGACCGTGAAATAATCACTGTTACGTATTAACACCGTTTACGGATAACACTGATTAATTTCGTTTATTGATGACCTAGATAACTTGATCTAAATCCTGAGCCGTCTATGAACTCCTATTTTTTCAGGATTCTCCCTTGATCTGCATAGGTGAGAGTAAGCTCATCAACGCTGTTCAATATGTCTTTCATTTCAGGGATAAGACTGGGTAGGTAGCTGGGGATATAGAATTAGCAAGACGAAATTCACTCCTACCCGATTTAGGGATAGTAGAGAGGTTTTTCCCTTAAGGGCTGATCCCGGGTCTTGAACAAAGGGCCCCATCCTCTCACTGACGTGAGATGAATTAGATTTAGTGATTTGATCCTATGTCAATTGTTCATTAGAGGGATAGTGGTACTTAAGGAGAAAAGATGTAACTCAGGGGTAAAACGGGTTTTGACCTAGCTGAGGTTACGAACGGCCTGTGAAGGATCAACTTACCGATGACGGTTATATCGAATGGACACAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTGCATCTACAGGCTATAGTGGACAGTCCTGTTAGTTAACGAATGTTGATTAACTA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mRNA sequence

ATGAGGTACAGTATGTATGGTGATATGGAGGGTGTAGAATTGGGTACCTCTAGCAGAATAGGAATAGAAAGCCTGGCTGAAGAAGTAGCAGATGGAAAGGAAGAAATAATTGGTGGAGATAAGATAAAATCTATTGAGAAGATAATGAAGAATTTGAAAGCTACCACTGCATTCTATCCAAGTATGGATGTTGCTCAATTGTTAATTTTGGTGGACCTAGAAGATGCCATCACTGTTAGCCTAAAGGCTCTGATACCATTTCAGTTTAGTCAAGGCAATGACACCTATCTTTACATGCTAGTGGGGTTTGATGAAGATCATTTGGAGAAGGCTAATGCTTCCTTGCATAAAGTACAGATCGAAGTTGTTTGTACAGGTCAACTGAAGCTGCTATTCACGAATCAGGTCTTCTCAGATCTCGTGGTTCTTGGGTCGTCGAGTTTGAGATCTGGTTCTATAACACCTGATATATGTCGTGGATTTGGTTATTGCCACCATGGGAGATGCAGCGTCGCCGTGGACTTTGTGCAGCTGCCGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTACAGTATGTATGGTGATATGGAGGGTGTAGAATTGGGTACCTCTAGCAGAATAGGAATAGAAAGCCTGGCTGAAGAAGTAGCAGATGGAAAGGAAGAAATAATTGGTGGAGATAAGATAAAATCTATTGAGAAGATAATGAAGAATTTGAAAGCTACCACTGCATTCTATCCAAGTATGGATGTTGCTCAATTGTTAATTTTGGTGGACCTAGAAGATGCCATCACTGTTAGCCTAAAGGCTCTGATACCATTTCAGTTTAGTCAAGGCAATGACACCTATCTTTACATGCTAGTGGGGTTTGATGAAGATCATTTGGAGAAGGCTAATGCTTCCTTGCATAAAGTACAGATCGAAGTTGTTTGTACAGGTCAACTGAAGCTGCTATTCACGAATCAGGTCTTCTCAGATCTCGTGGTTCTTGGGTCGTCGAGTTTGAGATCTGGTTCTATAACACCTGATATATGTCGTGGATTTGGTTATTGCCACCATGGGAGATGCAGCGTCGCCGTGGACTTTGTGCAGCTGCCGTAA

Protein sequence

MRYSMYGDMEGVELGTSSRIGIESLAEEVADGKEEIIGGDKIKSIEKIMKNLKATTAFYPSMDVAQLLILVDLEDAITVSLKALIPFQFSQGNDTYLYMLVGFDEDHLEKANASLHKVQIEVVCTGQLKLLFTNQVFSDLVVLGSSSLRSGSITPDICRGFGYCHHGRCSVAVDFVQLP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Moc10g15480Moc10g15480gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc10g15480.1.exon5Moc10g15480.1.exon5exon
Moc10g15480.1.exon4Moc10g15480.1.exon4exon
Moc10g15480.1.exon3Moc10g15480.1.exon3exon
Moc10g15480.1.exon2Moc10g15480.1.exon2exon
Moc10g15480.1.exon1Moc10g15480.1.exon1exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Moc10g15480.1cds.Moc10g15480.1_5CDS
cds.Moc10g15480.1cds.Moc10g15480.1_4CDS
cds.Moc10g15480.1cds.Moc10g15480.1_3CDS
cds.Moc10g15480.1cds.Moc10g15480.1_2CDS
cds.Moc10g15480.1cds.Moc10g15480.1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc10g15480.1Moc10g15480.1-proteinpolypeptide