Moc07g10400.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGCATACACATAACTAAAAGAACTGATGCAAATCCAACCACGGATCCATTGACTGTACCCGGGGGACCAATTACAAGAAGCAAAGCAAAGAAGATTCAAGAGGTTTTCATAATACATCTTCAAAGGCTAGCTAATGCACACGAGGAGACAAAGATTTCTGAGGCAAAAATTCTTTACAATGTTAATTTAACGAGTCAAGAAGAGAATGAAGCAAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTCTATTTTGAGAGATGGCACGGAGGACAAAAAAAGTGTGCAGATTGGTGAACAGGTGCCTTTGCAGATTGCACCTCTTGGGAGTTTGTGATGTCAAAGCTTGTCAAATCTCATCCAAACGTAAAGCACCTCCTACATGTGATTTCCAAGACAATTTCAAGCAATTTTACGTTTTTGGATTCACATTTAGTTGTCTAGTTTGATGTGCAATCATGTTTTAATTTGCATGTCTTATTTTCTACAATTTGCATTAAATAGGATTTGAAAGACTTTTGGTGTTCCTCATGTTGAACGACCCTTTGGCCTATTTAAAGGCTTGTAATCACCTTGTTTTGGAAGATTAAAACATATTGAAATTCAAGAACTTTTGTTCCTTAACACTTTTGGTGTTGCTTCTTTCAAATCTTGCTTTAGGTTTGATGTTAAACCGATTCATTGGATTAGTCTCGATCAAGCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTAGGAGTGTCTATCGTAGATTCTAAGTCCGATCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACCTTACTCTTGGTTGGAATCATTCGGTAAGTTAGTCGTTTTTGTGAATGTTTGCAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACACGAGCAACCTTGGTGCTTATCATTTGGTATCAGAGCATTGGTCGACATCCTTTGGCCGGTTCTAGAGGTGAAATATCTTTACTTTATTTAATTTTATTTTTCTGTTATTTTCCTTTTTCGAAAGTAGTTTCTTACAAAGTGTAACAAGACATAACTTGTCTTGAAATTCTTGTATTTTGCTCTCGGATCATTAGCAAAGAAAAAAAAAATTAGAAGCAAAAGAAAAAAAAAGGAAAAAAAACAGAAGCAAAAGAAAGAAAAAACAGTAGCAAAAAGAAACAAAAACAGTAGCAAAAAGAAAGAAAACCGTAGAAAAAAAAACATTCGAAGATCCGAGGCACACGAAAGGTTCTTTTCATTATGTTGTGTTTTGTTTAAATTATCAAGTTGTTTATCCTAAGATTGAGTTTCTTTAGTCTTAGTTTGTGAGAGTTGATCATTGAATTAGTTATATCAAGCTTTAAGCAAGATTGCACCAAAATTTAAGCCAACTCTTACATCTTTGACCTAGTACCAAAAGCCTACCCTTGAGTGAAATCTTGGTGAGAAGAGTGGTAAGGTCCTTATTATCATTATTATTGTTTCTAACAAAATGGCACAGGATGGAGTACCACAAGTACCGCAAGATCCTAACATGGTGATTCTTCAAGCAATTCAAGGAATGATGGAAATGATGATGGAAGATAGACAAGAAAGGAGAGCGCAACAACAAAGAGAAGAACGAGCCTTACAAGAAGATGATGCGTTTGACCTTGCTGAACAAGAAAGACAAGTTGGAGGAAGAAGAAATGGGAGAGGAAGAGGACGAAATAACTTTGCCAACGTCATGCAACCTAGAAGATTGGAAAGATTAAATGAAAATAGAGATGACGGAGTTAAACTCAAAATTCCACCCTTTAGTGGAACGGCGGACCCCGATGCTTACTTGCAATGGGAAAGGAAGATAGAACATGTGTTTGATTGCTATACATATAGTGAGAATACGAAGATGAGACTCGCCATTGCTGAATTCACCAATCATGTCGGTGAATGGTATCAAAATCTCAAATTAGAAAGAAGAAGGAAGGAGAAGGATCCATTAGACACTTGGGAAGAACTCAAAGAAGCCATGAGAAGGAGGTACGTTCCAAAACACTATGAAAGAGATTTGAAAACTAAACTGCAAGCTTTGAGGCAGGGAACGAAAAGTGTTGCTGAGTATTATCAAGAGATGGAGACCTTAATGCTAAAAACCCAAATCCGAGAAGAAGAGGAAGACACCATGTCTAGATTCCTTGGAGGTTTGAATCGAGAAATTGCTCATGCTGTTGATAGAAATCCACCGCCTTACCTAGAAGATATGTACCATTATGTTGTCAAAATTGAAGATCAATTGAAGGAAGAAAAGGAGTATTCAAAAAGGTACACATCTAAAGCTAATACATATTCCAATTCTAATGCTTGGAACAAGGCTGGTTTTGTGAATAGGAATGAATCATTGCAACCAAAAGAAAAGTTCGTAGCTGCCAAAAGAATGGAGGGAGAAAGTTCCAATACTAAAAGGAATGAAGCTCCAAAGGAGGTAAGGGAAAAGACTAGTTCTATTCAATGTTGGAAGTGCAAAGGGTTTGGACACATGAGTAAAGATTGTGTCAATAAAAGAGTTATGGTGATAAGAAATGGTGTAGTTGACTCGGATGATGATTGTGAGGAACATGATGAAGAATTTGAAGAACGTGATGAAGAGTATATTGAAGAAGGTAACTTCATATCCTTGATAACAAGAAGGGTACTTAGTGTACAAATCAAGGAAGAGAAAGTTGAAGATCAAAAGGAAAACTTGTTTCACACAAGATGCTTAATTGAAGGAAATCCGTGTAGCTTGGTGATTGATAGTGGAAGTTGCACAAATGTGGTAAGTAGTTTTCTTGTTAAGAGACTTCAACTTGCTACACGTCCACATCCAAAACCATACAAACTTCAATGGTTGACAAACAAAGGAGAACTAAAGGTAAACTCCCAAGCTCTTATTCCTTTTACATTGGGAAGATACAAAGATGAAGTCCTTTGTGATGTTGTCCCTATGAATGCGGGGGATATACTATTGGGCCGACCATGGCAATATGATAGAGAGGTCACATATGATGGACTGTTGAACAAGTATAGTTTTACTTTGAAAGGAAAGAAATTTACTTACTTCCGTTGTCTCCATTTGAAGTACATTGTGACCACTTGAAATTAGAGAAGAAAAGAAAAGAATTTGAAGAAAAAGAGAAGAGAGAAGAGAGCAAAAGTGAGACTAGTGAAAAAAAAGAGAAGAGTGAAAGGCAAAATGAGAGTAAAAATCAAGAAGAAAAAAAAGATGAGTTGAAAAGAAAGAATGTGAGTTTGATTGTAAGAAAGAGTGCATTGAGAAATGTGTTGTTAACCCAAGAGCCACATTTTGTGCTTATGTGCAAAGGTATGTGTTTAGCAGTTGAAACAAAATCTCATGATGTTTTGCCAAGTGCATTTAAGTCTCTTTTGCAGGAATTTAATGACATGTTTCCCTATGAAGATGCACCTATGGGTTTACCTCCTCTTAGAGGGATTGAACATCAAATTGACTTTATACCAGGTGCAACTCTCCCAAACATGGCTGCCTATAGGACCAATCCCACCGAAACCAAGGAGATTCAAAGGCAAGTGGAAGAACTCATGGAGAAAGGTTATGTTAGAGAAAGTATGAGTCCTTGCTCGGTTCTGGTAATTTTGGTACCCAAGAAAGATGGCACATGGAGGATGTGTGTTGATTGTCGAGCCATCAACAAAATCACGGTAAAGTATCGACATCCTATTCCTAGATTGGATGACACGTTAGATGAATTACATGGTGCTAATCTGTTTTCAAAAATAGATCTTAAAAGTGGTTACCATCAAATTCGAATGCATGTGGGAGATGAGTGGAAAACAGCTTTCAAAACAAAGTTTGGGTTGTATAAATGGATTGTTATGCCATTTGGCCTTACTAATGCACCAAGTACTTTTATGAGGCTAATGAATCATGTTTTAAGAGAATACATTGGAAAATTTATTATTGTATACTTTGATGATATTCTTGTTTAGTCAAAAAGCTTGAATGATCATATTTTGCATGTCAAGACAATTTTACTAAAACTTAGAGAAGAAAAGCTTTATGCCAACTTCAAAAAGTGTAGTTTTTGTCAAGACCAAGTCAACTTCTTAGGGTTCATTGTTGGAAAGGATGGGGTGAAAGTTGATGAGGAAAAGGTAAATGCTATTCGAGAGTGGCCAACACCCACCAATGCAACCGAGGTAAGGTCTTTTCATGGGTTGGCTAGTTTTTATAGGAGGTTTATTAAAGATTTCAGTAGCATAGCCTCACCATTAAATGAACTTGTTAAGAAGCATGCTAAATTTGAGTGGAAAGAAAAGCAAGAAAATGCATTCAATGAATTGAAAGATAAATTGAGCAATGCACCTTGTCTTGTTTTGCCTGACTTTGACAAATCTTTTGAGATTGAATGTGATGCAAGTGGGATAGGTATAGGAGCTGTTTTGATGCAAGAAAAAAGGCCGATCATGTTCTTTAGTGAGAAGCTAAATGGAGCACAGCTTAACTACCCAACTTATGACAAGGAACTCCATGCACTTGTGAGGGCTTTACAAGTTTGACAACACTACTTATGGCCAAAAGAGTTTGTTATCCATACCGATCATGAAAGTTTGAAGCACCTCAAAGGCCAAACAAAGTTAAATCGGAGGCCTGCTAAATGGGTGGAGTTCATCGAGACATTTCCTTATGTCATTCATTACAAAAGAGGTAAGGACAATGTAGTGGCCGATGCATTATCGAGGAGGTATGCTCTATTTTCTTCACTTAGTGCAAAAATTCTTGGTTTTAAGCATATGATTGAGTTGTACAAAGTTGAGAAATCGGAATTTTATGATGTGTATGAGCAATGTTTGGAAGGGAAAAATATACATGATTATCTTGTGTTTGACGGTATGCTTTTTAGGAAAGGTAAGCTTTGTATTCCTAAGTGTTCCATTCGGGAGTTGCTTGTAAAGGAGGCTCATGGGGGAGGACTTATGGGACATTTTGGAGAATTTAAAACATATAGCATGTTGTGTGAACACTTTTATTGGTTAC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ATGGGCATACACATAACTAAAAGAACTGATGCAAATCCAACCACGGATCCATTGACTGTACCCGGGGGACCAATTACAAGAAGCAAAGCAAAGAAGATTCAAGAGGTTTTCATAATACATCTTCAAAGGCTAGCTAATGCACACGAGGAGACAAAGATTTCTGAGGCAAAAATTCTTTACAATGTTAATTTAACGAGTCAAGAAGAGAATGAAGCAAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTCTATTTTGAGAGATGGCACGGAGGACAAAAAAAGTGTGCAGATTGGTGAACAGGTGCCTTTGCAGATTGCACCTCTTGGGAGTTTGTTTGATGTTAAACCGATTCATTGGATTAGTCTCGATCAAGCTAATTCTGGAGATGGAGTACCACAAGTACCGCAAGATCCTAACATGGTGATTCTTCAAGCAATTCAAGGAATGATGGAAATGATGATGGAAGATAGACAAGAAAGGAGAGCGCAACAACAAAGAGAAGAACGAGCCTTACAAGAAGATGATGCAAATCCACCGCCTTACCTAGAAGATATGTACCATTATGTTGTCAAAATTGAAGATCAATTGAAGGAAGAAAAGGAGTATTCAAAAAGGTACACATCTAAAGCTAATACATATTCCAATTCTAATGCTTGGAACAAGGCTGGTTTTGTGAATAGGAATGAATCATTGCAACCAAAAGAAAAGTTCGTAGCTGCCAAAAGAATGGAGGGAGAAAATCCATTGACTGTACCCGGGGGACCAATTACAAGAAGCAAAGCAAAGAAGATTCAAGAGGTTTTCATAATACATCTTCAAAGGCTAGCTAATGCACACGAGGAGACAAAGATTTCTGAGGCAAAAATTCTTTACAATGTTGATTTAATGAGTCAAGAAGAGAATGGAGCAAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTCTATTTTGAGAGATGGCACAGAGGACAAAAAAAGTGTGCAGAATGGTGAACAGGTGCCTTTGCAGATTGCACCTCTTGGGAGTTTGTTTGATGTTAAATCGATTCATTGGATTAGTCTCGATCAAGCTAATTCTGGAGTGAGTCAGATTTCTACTGCCAGGCTTTTGCCAGAAAGTAGCACGAGCTCGTGGGTATCAGAGTGGGTCGTCAGACTCTTCGCCGTCATCGATCAATCGCAGCTCGCACCGTCGAAGTTCACTGGAAAGGTGCACCAAATCGATCTGTTGTGCTGCTTGGGTCTACTGCCCATTCGTGCCTATTTGCGTGGTCACCAGATTCTGTCAGATGGACCCGAAATTTATGGCTTCAACCTCAACTTGGATCGCATTCGATTTAACCAAAAGAGAAAATGCAACAGACGTGGCTTTAATACAGGCTGGGACCTTGACTTAGATCAGGAGACCTGCAAGAGAAAACACTCTGACGCCCAGTCAAGAAGAATTCGAGCTGCATTCGAGAGAAAATACAATGTTCGCGTACGCCCAGGATTTGGAATCCAGATTCAGCACCTCTTTGCCCCGACATTCTCCTACGACCTGGCTGTGCCACCGTTAAGTTCTAAGCAGGGGAATGCACGGGCAAAGAGGTGCCGAATTCGGATTCCGAATCCTGGGCCTGGGGCATTACAATGTCTACATCTTCGAGGCGTAACGACTCTTGACATTTATCCCCAAGATATCGACCTCCCTCTACCACGCTTGGTGTTCGACCTTGCCATTTATCCCCAAGGTCTTGAACTGTGTGCACTTGCATCTATAGAATTGTTACCACGCTTAGTGCGTGCGTTCAGCATAACCCCAGTCAGCTGTCCGAACTATTTTTATCAGAAAAACCCACCAAATCGATACCCACAACACTGTGTGCAGCAAGGACCCGCGCCACGACTTTCGACCCCCAAGGGAGACCGAACCCGCTTTCGAGGGAAGGGCTGCGCCGCCAGAAAACACCCCGAAGACAGCACCCACGCGTGCTGCCGCCGCCTGCTGCTGCCCGAAGCCCGCTGCTGCCGGAATCCTCGCGTCCGTTGCTGCCCGACTCCGCGCACCGCTGCTGCCTGCCGCGCCGTCTGCTGCTGTCAACCGGAGAAGGTGAGCCGCTGCGTCGGAGGTCGTCTTCCGTTGAGCGCTTTGAGGAGGGATGAGTATCATGATGAAATTGTTCTCAAGCGAAACTCATCAAAGGAGATTGAGATCTTGAGACTATTTGTCAGTAAACAGTCAACTCTCGATATTTACCGTATTCACCACATATCTAATAGGCTAGCTCAAATGGTTAGGCTCAAAGTGGGCTATGCTCAAGAACTTGCGCTTTATGCTTCAGCGAAGTACAGTTCTAAATTGAATGACCTACAGCTCCTGAATGGTAATCGCAGCGGACTTGCGGGTTGTACCACTTCGGATAAGCCGGTTGCAATGGTTCCATGGGTATCAGAGCTAATAAATGACTTTGAAATAATTGAGATAACAGCTCGGTATAGGATATTGGGATTGGACGAAAGCTCTCTCGCTTTAGTTGCCTCTGACGATTGGCAATCTTAG MGIHITKRTDANPTTDPLTVPGGPITRSKAKKIQEVFIIHLQRLANAHEETKISEAKILYNVNLTSQEENEAKMAREKLSILRDGTEDKKSVQIGEQVPLQIAPLGSLFDVKPIHWISLDQANSGDGVPQVPQDPNMVILQAIQGMMEMMMEDRQERRAQQQREERALQEDDANPPPYLEDMYHYVVKIEDQLKEEKEYSKRYTSKANTYSNSNAWNKAGFVNRNESLQPKEKFVAAKRMEGENPLTVPGGPITRSKAKKIQEVFIIHLQRLANAHEETKISEAKILYNVDLMSQEENGAKMAREKLSILRDGTEDKKSVQNGEQVPLQIAPLGSLFDVKSIHWISLDQANSGVSQISTARLLPESSTSSWVSEWVVRLFAVIDQSQLAPSKFTGKVHQIDLLCCLGLLPIRAYLRGHQILSDGPEIYGFNLNLDRIRFNQKRKCNRRGFNTGWDLDLDQETCKRKHSDAQSRRIRAAFERKYNVRVRPGFGIQIQHLFAPTFSYDLAVPPLSSKQGNARAKRCRIRIPNPGPGALQCLHLRGVTTLDIYPQDIDLPLPRLVFDLAIYPQGLELCALASIELLPRLVRAFSITPVSCPNYFYQKNPPNRYPQHCVQQGPAPRLSTPKGDRTRFRGKGCAARKHPEDSTHACCRRLLLPEARCCRNPRVRCCPTPRTAAACRAVCCCQPEKVSRCVGGRLPLSALRRDEYHDEIVLKRNSSKEIEILRLFVSKQSTLDIYRIHHISNRLAQMVRLKVGYAQELALYASAKYSSKLNDLQLLNGNRSGLAGCTTSDKPVAMVPWVSELINDFEIIEITARYRILGLDESSLALVASDDWQS Homology
BLAST of Moc07g10400.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022153198.1 (uncharacterized protein LOC111020753 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 2.7e-32 Identity = 119/312 (38.14%), Postives = 120/312 (38.46%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022158838.1 (uncharacterized protein LOC111025303 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 5.1e-31 Identity = 111/278 (39.93%), Postives = 113/278 (40.65%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023520950.1 (uncharacterized protein LOC111784506, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 6.0e-24 Identity = 58/75 (77.33%), Postives = 66/75 (88.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023544048.1 (uncharacterized protein LOC111803745 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 4.8e-21 Identity = 64/108 (59.26%), Postives = 74/108 (68.52%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022932136.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111438459, partial [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 1.4e-20 Identity = 64/106 (60.38%), Postives = 73/106 (68.87%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGU9 (uncharacterized protein LOC111020753 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020753 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 1.3e-32 Identity = 119/312 (38.14%), Postives = 120/312 (38.46%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DX75 (uncharacterized protein LOC111025303 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025303 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 2.5e-31 Identity = 111/278 (39.93%), Postives = 113/278 (40.65%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EVI6 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111438459 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438459 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 6.8e-21 Identity = 64/106 (60.38%), Postives = 73/106 (68.87%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V454 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold89G004320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 1.8e-18 Identity = 55/93 (59.14%), Postives = 66/93 (70.97%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g10400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TLJ3 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold8446G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 5.3e-18 Identity = 55/93 (59.14%), Postives = 65/93 (69.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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