Moc05g04290.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc05g04290.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 2959090 .. 2963504 (+)
Sequence length552
RNA-Seq ExpressionMoc05g04290.1
SyntenyMoc05g04290.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACTTTGTTTCTGTATGTTTTAGAAATGGATTCATACCGTATCTTCAGCCTATTGCAATTTGAAACTGATGATATTTCTAAAGCTGGTCATTTTGTTGCGATGATAAATGCTAGGGAGTTGAAGGACGTGGTGGTGTCTACCGGTTTTGTCGAGAGGAGAGAGAAGGAGGTGGCTTACAAAATGGCTAAAAGATGTTTGAAGTCTGCTGCTGATTCCATTGGTTCGAGGAGTGGCCTCCTAATTTTTAATTCGTGTTTTCTGTTGCTATGTTTGGATTCTTAAAAAAGAACAAAAAATTTGTTTTTGTTGTTTTCAAAATTTATATACCATTAAAAAAATATTTTTAAAAGATAATAAACAAGAAACATAAACAGTAAAATTTACTAAAAAAACATAAACAGTAAAAAAAAATTTAGATTTCTTAATAAAATTGAAAACAAGAAACCAAACCATAACAAATGGGTCGTTAGGGTCTTGTTTCTTATTATTATTAATTTTTTGTTTATAATTTGTCCAGAAACATAAGTGTTTAGTTATTGTTCATATTTCTCATTTTTCGTTTTTAAAAAACACTAAAAAAATGTGTTCGAACTTTTGGAAATAACAAAATCGAGTTTCTTATTTATTTCTTGTTTCTAATTTCTAGTGTAATCTAGATTCAGAGATAGGAATATTATTTTATTATTATTTTTACTTACAGAAATGTATAAATAATATCAAAATATAAATATAACATAAAATTTATTTTAATTTGAAAAATTAATTTTTTTAATATTTAATTTGAAAAAGTAACAAGGAAAAAAAACAATCATCAAATAGACACCTATTAAACACAAAATTTAGAGGTAATGAAACTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAAACAGTTGATAGAGAATATCAATCTAAAAAATTAAAATTTTATTTTATTTATGTACTCGATCCAAAAAAGACTTGTGACACTGGTCAATATCTTCCCTCTAGATTATTATAGATGTACTAAAATTGTGTTTTGTGGGTGAATAATGGGACTAGAAAGGAAAAATAGTTTGTATATTTGCAGTCCCATGGTATCCAACAATTCCTCATAGGATGCTGGTTAGCATTTATTTGCATTGGTGATTTGTTTTCTTCCTCCTTTGGTTTTAAACCATGTGCTCTGTGCAGCTCCCTTTGCTTTTCACTGTACTTTCTCCACTGCCCCTCTCTGTGCATATTTGCATATTTTGCCTCTATATTTCTATGATCATGGCAGTAGCTCTTGGATCCCACCCTTTTTACCTTTTACCCAATTTAGTAAATTCAGCTTTTTTTTAGGACAATATGCGAGGTGAGATTCGAACTCACGACCTTTCAGTCGAATATAAGTGTCTTAATATAAGGTCTAGATCTAGGATTCGGACTAGGATTACTGAATTTGGAACCTAATTGCCCCTGCATCTCCTGCGACCTTGCCGATTGTCCCTACAAACCAACACAAATCTTTTTAGCATGATATGTTCTCACTCACATGCTTCCTAGTAAATCAACTAGGAGGTCACCCGACTCAAGATTGCTCCAATCTAAGCATGCTTAACTTTTGAGCTCTTATGATTGAACTATCTAAAAATGAAGGTGCACTTTGTTAGTAAGGTAGTATTTATCAATTCTTTTAAGTCTTTCTTAATCATGCTTCCATGATCTCAGGATCTTTCCTATTCGAATGTGGTGGTATCAATTCATTCATGCGCCTCTCCTAGGAGAGGTTGTGCTTTATTGTAACACCCAAATCCAGGATGTGGACCAAGTTTCGAAATCCGGATTCCAAATCCTAGTCCTGGAGTGTTAAACTTAACAACTACGATCAGGTTGACTAGTAAATTCAACTTAGATATGTCAAGTCATCCCTCTTATAGTTCATGTATCGTCAAATTAGCATGCCCACGTGTTTAAATATGTTAACAAAACATCATAGACGGGTACGAAAATCAGATTCCACGCATACCTCCAACTTTTTCTCTTACACCACTCCAAACTCCATTGATACTCTTGGAGTGGTCAGAGTTCACCATCAACAGATTTAATGTTGATCACAAAAGCTTTGACTCATCAAACCAAAAGAGAGAGGCAAAATTCCGTACAGATTTTAGAATGACCAATAAATAAATTGGAAGTGAGAGATTAGTTTTAACTTTTAAATATGCTTGGCTGGAAAGACACTTCTCCAACTCCAAAGTGCTTCACCCACTAACCAAAAATCCCTTGAAATTTGCTAATAATATTCATAATTCAAGAGGGTCAAAAAAAGCCCTGTTCAAAATTTCTCCTTCATCTTTCATTTGCTTTATCACCCATTTTCTCTCTCCTAAGTGCCCAAAAAGGCTCATTGGAAATTTTAAATGATAATTTAAAAAAAAAAAAATCATTTTTATTGGAGTAGCTCTTTTTGGTTCTTATTGTCAATTATACATTTTTTTAATGCATGTTGAAAAGAGGATCAATATTTCATTTTGTTTGTATTATATTTCTTGTTCTTATTTAGGCCATCTTAGAGACAGCATATCTCTAAGAATATTTTGTAGCTAAGACCTTATGACCTAATTATTATATTCTTCAAACATAATATGTTTACACGGTTCGAAAAATGAAAATTAATCAAGTAACGAGTAGTATAATTATTTTTTCTTTGAATCTAGTATTAAAAACTATTTTAATCCTCGTCGTTGTTGGTGTTTTTTTGATAACTTATAACATTTTTAATAAAGTATGACATAAATTAATCCTCAAATTATGAAAGAACAAAATTAATGGCAAAATGCTAACCTGAACTTAGGGGAAAAAATTAGTGGCAAAATAGAGTGTTGGATTAAAAAAATATTAAAAATTTTAGGTTATCATGGGACTAAAATAGGATATAAACTTTGCTAAGATGCTCGCTCTTTCTCAATTTTTTAGACATCAAAATGATTGTTTTTACTCTATATGGCATGGTTGAATACACCCGTATTCAAATTTCTTGTTAATAGCTGGACCTTTTTTCAGCTAACTTTTCAATTTGAAAATTCGAGAAGGAACATATAACAGGCTTTTGAGATGGAGAGATATATTTTTCTTAATCTCTTATTCGCATTTGAAATTTGGATGAGATGATTTTCGCTCACATAAACCCAAAGTATTGTGTATATACCCTTTTAAAAATTTAAAGTTGATGTGTTATTTCGTAAATTACTCACAACTGATATAGTCAAACTTTAGATTTTTTTTAACCTCTGGTATCATTTCTATAATTTTTTAATATGATTTCGAATGTACTTTCTTTCTAATGGACTTGAAATACAAAAATAATTTTTTATTCATCCCCGTTATTTCGTTCCTAATCTGATTGAATGGACTTTTTGAGTAATTTTGATGGGTCAAAAGTGTATTTTATTTTTCAAATTTAATATGTTTAGTAGTAAATAAAAATCACTTTTGCAATAACCTAATTGATTTATAATTTTTTTTAAGACACATTAAAATTGATTTTTCAAAAAAGCGATGGATTTGGGAATCACTCCAATCACTTTTTGGTAATTTTATATTTCTAGGTATTTTAAATGAAATTAAAAAAAAATTTAAGTGGTTAAATGATAATCACGATGGAAATTAAATTTAACTAAGGTGATGGGTTTTAATGAAAAATATAGATTTGAGTTGAGAAGTTCGTGTCCACTCAACTACTAAGCCACTTAATAAATAAATAAATAAATAAATATCCAAACAAACATTCGAAACATCTTACGTGTGGAGATTATGACACCTAACCACAAGATTTCGTAATTTTTTTATTTCGATAGGCCAAAAAAAAAAACACCCATTTAATAATTAATTCATTACCCTTTTGCCTTGCTTTTGGGGTGGATGGAAAAATAAATTAAATCGACAAAAAAGAAGAGGGGAACCCCTAGAACCTGGCAAAGTCACTATCAATGAATTCCCGTCAATCTGCTGTTCATCGATAGACGAAGCTCTCTCTTTATCATCTCGTTCTGGGAGGCCGACGATATAAGACGAAGATCTCCTAGTGCGGAAGTGCCCGTCCATAAACCCTTTCTTTCATTCATTAATAGGGCCCTGGTCGGTCACTTTTCCGTCATCCAATTTCGCTCGCTTGGAATCGGGCTCAAATTCAGGGCCCTCCAAGCATTCACCTGTCGGTTGTACATCGACCTGTCGGGAAACTCGAAACTCTCCGTCCAACGTCATTCGCCCGGAAACATTTGTCATGGCCGAGTTCTTGGTGCGATTCGCGCGGGTCCGCTTTTTTTTTTTTGAAGATAGCAAGGAGGCGATTTGTTCGCTGGGCGATTCAGCTAGGAGCCAATCTTCAACAGGCGCGTACGGTGTTACCGGGGTCGACCCCAAAGCCATAATGTCTCAAAACGAGGAGGCCTCGTAG

mRNA sequence

ATGACTTTGTTTCTGTATGTTTTAGAAATGGATTCATACCGTATCTTCAGCCTATTGCAATTTGAAACTGATGATATTTCTAAAGCTGGTCATTTTGTTGCGATGATAAATGCTAGGGAGTTGAAGGACGTGGTGGTGTCTACCGGTTTTGTCGAGAGGAGAGAGAAGGAGGTGGCTTACAAAATGGCTAAAAGATGTTTGAAGTCTGCTGCTGATTCCATTGGGCCCTGGTCGGTCACTTTTCCGTCATCCAATTTCGCTCGCTTGGAATCGGGCTCAAATTCAGGGCCCTCCAAGCATTCACCTGTCGGTTGTACATCGACCTGTCGGGAAACTCGAAACTCTCCGTCCAACGTCATTCGCCCGGAAACATTTGTCATGGCCGAGTTCTTGGTGCGATTCGCGCGGGTCCGCTTTTTTTTTTTTGAAGATAGCAAGGAGGCGATTTGTTCGCTGGGCGATTCAGCTAGGAGCCAATCTTCAACAGGCGCGTACGGTGTTACCGGGGTCGACCCCAAAGCCATAATGTCTCAAAACGAGGAGGCCTCGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACTTTGTTTCTGTATGTTTTAGAAATGGATTCATACCGTATCTTCAGCCTATTGCAATTTGAAACTGATGATATTTCTAAAGCTGGTCATTTTGTTGCGATGATAAATGCTAGGGAGTTGAAGGACGTGGTGGTGTCTACCGGTTTTGTCGAGAGGAGAGAGAAGGAGGTGGCTTACAAAATGGCTAAAAGATGTTTGAAGTCTGCTGCTGATTCCATTGGGCCCTGGTCGGTCACTTTTCCGTCATCCAATTTCGCTCGCTTGGAATCGGGCTCAAATTCAGGGCCCTCCAAGCATTCACCTGTCGGTTGTACATCGACCTGTCGGGAAACTCGAAACTCTCCGTCCAACGTCATTCGCCCGGAAACATTTGTCATGGCCGAGTTCTTGGTGCGATTCGCGCGGGTCCGCTTTTTTTTTTTTGAAGATAGCAAGGAGGCGATTTGTTCGCTGGGCGATTCAGCTAGGAGCCAATCTTCAACAGGCGCGTACGGTGTTACCGGGGTCGACCCCAAAGCCATAATGTCTCAAAACGAGGAGGCCTCGTAG

Protein sequence

MTLFLYVLEMDSYRIFSLLQFETDDISKAGHFVAMINARELKDVVVSTGFVERREKEVAYKMAKRCLKSAADSIGPWSVTFPSSNFARLESGSNSGPSKHSPVGCTSTCRETRNSPSNVIRPETFVMAEFLVRFARVRFFFFEDSKEAICSLGDSARSQSSTGAYGVTGVDPKAIMSQNEEAS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 91..114

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Moc05g04290Moc05g04290gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc05g04290.1.exon1Moc05g04290.1.exon1exon
Moc05g04290.1.exon2Moc05g04290.1.exon2exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Moc05g04290.1cds.Moc05g04290.1CDS
cds.Moc05g04290.1cds.Moc05g04290.1_2CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc05g04290.1Moc05g04290.1-proteinpolypeptide