Moc03g33770.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCACTAAATGGTATTTGCAGTCCCTGCAATGCTAATCCAAACCCAACTTCTACATTTCAGCTAGTTTCTCCATCTGCAATTCGACCTAATGTGTTATATTTTCTCAACCCACCTTCCGTCAACCTTGGTTCCAGCTCGTGCTATTCCAGATTTTCCCGCGTTGTTGGCCCACTTAGGAGCGCGGATTTTCAAACCAGAAGTCGATTAACATTCGTACGCCGTGGTGCAAGTGCAACAGGGTCTGCCGCTACTGATCACTATTCGACGTTGAATGTTAGCCGGAACGCCACATTGCAGGAAATCAAAAACTCATATAAGAAACTCGCCCGTAAGGTATTTTCCTTTTAAATTCATCTAATAGTTTATTATTGATTTTTACGGGACTTCTTGGTCGCCAGTGAAGCGAATTGGATGGTAAAAAATCGAACGGAACTGCAGTGTGGAAGAGATAATGAAAAACTGGAGACGTGAAAGAAACATAAAATTTCAAGCGTTATGTATATGTTATGAAATTGGCAATCGCGGCCATACATCGGTGCATCTACATGGGTGATTCATTTGATATCCCCACCCCCGGCCCACCCCTAAAGAGAGAGAGCTAGACAAGTTGGGCAGAATAAGTTTCTTGTAGAAATTTAAGAAACAAACTTACTTTTTAAGATTCTAGCTGCTGGGACGCTGGCTAGTACTTTTAAGAAGTCAACTTTGGCCAAGGATCTGAACAATAAACTTCTACCAAGTTGGAATTCGACGACAAAAATTGCCTGCTTTACTTTTTCTCTAGGACGACAAGCCCCTAAGTTTTATCCCTTTGTAAATAAAGGTGATCGTGATTCGGTTTGGAATTACTTCTTTGGACGCTGCGGAGTACGACAAAAATTTTTTTAAAAACAAGAAACAAACATTTATTGATAAATGAAAAGGAACATAGATGTTCAAAGATATAAACTCCCGAAGGAGCGTAAGCAAAGAAAAGAAACGAACAAAAAATAAATAGAATAAGAGACAAGAAAAATTAGAAAATAAATTAGAAAGAGCACACCATTGAGAGACCTTGAACTTTGGCGAGGCTGGAGCTTTCAATCGAAGATTTACTTTTCCCTTCGAAGATCATTTGATTCCTTTGGAACCATAGATCGAACAAATCATATTAGAAGAATTATTAGCAAATAAAAATCATCTATCAATGAAAAGTTAATATCTTGTTTGAGAAAAGAAGAAGCAAATTAATTAGAAAGAGAACACTATTGAGAGACCTTGAACTCGACATGGTTGAAGCTTTCCAACGGAGATTTATTTTTCCCTTTGAAGATCCTTTCATTCCTTTCAAACCATAGATCAAAACACGACTTTAACAATGTTGCACTAAAGAAGACTTGCTTCGGGGACTCAAACTAGACCAAACAGCAGAGAGTTAACATCTGTCAAGACATTCAACTCAAAAGCCCATGAAACGTGAAAAATCTCGAATAAGAGCCTACAACAAACTGAAGCTTAAGGGTAGTGGAAGAAGAGATGCTGCAGAGTTTCACAAGAATTATCACATAAGATACAAATTGATGGATGAAGGATCTAGTGGCTCTGTTAGAGTTATTGGGGGATTTTGTTGTTAGTTCGAGGAGGAGAGATGCCCATCCGTACTCTCCTAACATTACAGAAGGATTTTCTTGTAAATAATTTTTTTCGTGTCTGGCGGACTCCAATCCTTCTCATTGTACTGTTTTCTTTTCGCTTTGGGAAGGTTAAGGTTCCAAAGAAAGATAAGATTTTTTGTCTTGGCAAGTCTTACATGGCAGGATTAATACGTTGGATCGTATAGCTTTGCAATGAATTTTTAAAGAATTCATAGTTTCTTTTCTCAAATACATCTCTTGCCTTTCTCATCCTTAGTTGGATGAATTTTTAGTTATTATCAACTCCGAGCTTGTCAGGCTTCGCAATGAATGAATTATGTTGGTAGAAGAGTTTTCTAGAAGAAGGTTGAAAATAAAAGCTGACCAGGTTTGAGAGTTAGCTGAAGTTCGAGTAAAATTTTCTTAGGATCTAAAAGATCTTTATTTAGAAGATAAAAGAGGGGGTTGCTGGCAAGCTTGAAGCTAAAGGCTTAAAACTTCTCTCTTTTGTGTTCGAGCATCTTGGTGGATTGTTTTGTTTGTAGTTTGCTTGTTCTTTTTGTTGCTTTTATTAGTGTTCTCATTTTGATTGTAAAGCTCCTGGTCCAACCCTTTTTTCTACTTTAGTCCGTTCTGTAGTTTTGTGAGAAAGGTAATTTTTCTTATTTCCCAGAACAACCCATTTAGGGGTAAATATACAAGAAGACCTTTAAACAAATAAGGAATTAATCTAAGCCTATAAGGAAAAAATAAAATTACAGAATATACAGAGATATAATAGCAATGCAAATTCTAATAAGGAAAAACTTAATTTACGGCTTGATTTTCTACACTCCCCCTCAAGCTGGATGATATATGCTTGTCATTCCAAGTTTTGAGATTAATCTACTAAGGCTGGGTCGATGCAATGCCTTAGTTAAAATGTCAGCAACTTGTTGTTGGGAAGATACATATCTCAGATTGATAGTATTTGTCTCAAAGATCTTCTCGCTGATGAAGTGACGATCTATTTCGACATGTTTCATCCGATCATGATGTATTAGATTTCTTGCAATGGCTATGGCAGGTTGATTGTCACACAGTACCTCTATAGTACCTTCTGTCTTCACCTTGAGCTTAGTGAGAAGACGTTTCAACCAAACTTCTTCACAGATCCCATGGGCTAATGATCGAAACTCAGATTCAGCACTACTTCGAGCTACAACTTGCTGTTTCTTACTACGCCAGGTTACTAGATTCCCCCATACGTAGGAACAGTATCCTGATGTTGACTTACGGTCAATAGGAGATCCAACCCAATCTGCATCCGTGTAGACTTTAAGAGCTCGGTTCGTGGTCTTTCTGAACATCAGTCATTTTCCAGGATCGTGTTTGAGATATCTCAATATTCTATACACAGCTTCCATATTCTCCTTTGAAGGTTTGTTCAGAAATTGACTTACCACACTAACAACAAAACTGTTCAGAAATTGACTTACCACACTAACAACAAAACTAATGTCTGGTCGCGTATGAGTTAAGTATATTAGCTTTCCAACTAGGCGTTGATATCTGCCTCGATCAACTGGTTCATCTTCAGGATTAACTCCAAGTATTGAATTTGCATCCATAGGAGTGTCTATTGGTTTACAACCACTCATCCCGGTCTCTATTAGGAGATCTAAAGTGTACTTTCGTTGAGTGACAGAAATCCTTTACTAGATCTTGCTACTTCCGTACCTAAGAAATACCTTAGGTGTCCCAAGTCTTTGATCTCAAATTTCTTTGAGAGAAGTTGTTTTAGATGAACCATTTCTTCAGAAACATTTCCTGTAAGTATTATATCATCAACATATACTATTAATACAGTGATCTTACTTGGTGAGAAGTGCTTGATAAAGAGGGTATGATCAGATTGACACTAGGTATAGCTGTCTTGTTTCAACACATTTGTAAATTTTTCAAACCAGGCTCGAGGTGACTATTTTAGTCCATAAAGAGACTTCCTGAGTTTACCTACTTTTCCCTTAGTGTATCTGTCCTCAAATCCAGGAGGTATGTCCATGTACACTTCCTCTACTAAATCACCATTTAGGAATGCATTCTTCACATCAAGTTGAAACAACGGCCAATCTAAATTTGTTGCAATGGAGAGAAGTACCCGAATAGTATTTAGTTTGCCAACTGGAGCAAAGGTTTCTTGATAGTTAATTCCATAAGCTTGGGTGAAGCCTTTAGCCACCAGACGAGCTTTGAATCGTTCTATACCGCCATCTGGTTTGTGTTTGATTGAGAAAATCCATTTACATCCAACTGTGCGCTTATCTGGGCTAAGTTTGTAAGGATTCACGTCCCAATTTCCTCCAGAGCCTGCAACTCTTCTAGAGTAGCAGCCTTCCATTTAGGTTTCTGTAAGGCTTTTTGAACTGTGTTGGGAGTTTGTACCTGATCTAGTGAAGTCACAAAAGCTCTAAAACACGGCGACAGATTAGTGTAAGACAAGTGATACCGTATGGGATGTTGGGTACATGAGCAAATACCTTTCCTGACAGCAATGGGTCTATCATCTCCTGATGTCTCGTGTGCTATTTCAGGGACATTGAGATTTTGGTTTAGATCTTGGCTTTGTTGAACTTGTGTAGGTTGTATTTCGTTCCTCTCAGGTTGTCTTGTTTGTTGTGAATAAACTTGCAGTTTAGCCTCAAAGGGAGATATGTGAGTTGGGTCAGAAGGAGGTAAAGGTGAACTCTCAGAGAATGGAATTGTCTCAGAAGAGGGTACAAGAGAACTCTCAAAGGATGGGTTTAAAGAGAAGTCAGGAATGCAATCCCAATTTTGTGATTCAAGAGCAGAATTCTCCCCCTGAAGGACAGAATTGGGATAATATGGTTGATTTTCAAAGAAGGTGACATCCATAGTATGAAAGAATTGGTGAGTGGGAGGATGATAACACTTGTATCCTTTCTTATTTGGCGAGTACCCAATAAAGATACATTTTATGGATCGTGCATCAAGCTTACAGACCCTTTCAGTACAGCCCCTTTCCTAACTGTCCTTTGGGAAGGAATTTCCCTCTCTACCCCTCCTTACATAGGTATTTACAATGGGGGGCCTCACAGACACGATCGTCAGGACATTTCCATTCACGAGTTTCAAATAAATCTAGTTTTTGCCAGTAGCGAGATAAATTGGAGTAGTATGCTGTAACCGTTGAATCACCTTGTTTAATATCTTGGAGAGTAGTCTCTATCTGGAACAACTTAGCAGTGTTTTCTTTATTGGAAAATGTATCCTCAGCAGCATCCCAAATTTCTTTGGCAGTAGAAAATAGGAGAAAATTCTCACCAATTTCAGTGGTCATGGAATTTATTAACCAGCTCATTACTTGATTGTTTTCAG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MPLNGICSPCNANPNPTSTFQLVSPSAIRPNVLYFLNPPSVNLGSSSCYSRFSRVVGPLRSADFQTRSRLTFVRRGASATGSAATDHYSTLNVSRNATLQEIKNSYKKLARKYHPDVNKNPGSEERFKEISAAYEVLSDDEKRSLYDQFGEAGLWGEYGVMNSGSPRVDPFENFDAFFGGSDGLFGERDGIGGINLINKRSGRNQNLDIHYDLHLSLEESVFGAEQEIQFSNFETCENCDGTGAKSSNCIGTCANCHGRGGVVKTQRTPFGMMSQVSTCSKCGGDGKIITELCRSCGGSGQLQSIRKMKIVIPPGVTDGATMQIQREGSFDKKRRMTGNLYIMLHVDEKHGIWRDGIHLYSKISIDYTDAILGSIVKVETVEGLKDLQIPAGVQPGDRVRLSCMGVPDINKPYVRGDHLFIVNVQIPKHISNSERAIIKELASLKASKMPQETFDKYTREYQGNVASSQAIKRNASFWSSIKHFIGKGQPREGFASIGMEIPKPFCWGPLKLHSSYTDSLIMVLIVTSLFSLLWRNYLWTFLRGRHRSPPTNRT Homology
BLAST of Moc03g33770.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022137134.1 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1125.9 bits (2911), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/554 (100.00%), Postives = 554/554 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022137133.1 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/563 (98.22%), Postives = 554/563 (98.40%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022137135.1 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 899.4 bits (2323), Expect = 1.5e-257 Identity = 441/451 (97.78%), Postives = 442/451 (98.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022137137.1 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X5 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 6.2e-251 Identity = 431/435 (99.08%), Postives = 433/435 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022137136.1 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 1.1e-250 Identity = 433/450 (96.22%), Postives = 436/450 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DO01 (Chaperone protein dnaJ A7A, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=DJA7A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 1.1e-85 Identity = 187/439 (42.60%), Postives = 264/439 (60.14%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DO02 (Chaperone protein dnaJ A7B, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=DJA7B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 1.1e-85 Identity = 187/439 (42.60%), Postives = 264/439 (60.14%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DO03 (Chaperone protein dnaJ A8, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=DJA8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 1.1e-85 Identity = 187/439 (42.60%), Postives = 264/439 (60.14%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1XQF6 (Chaperone protein DnaJ OS=Synechococcus sp. (strain ATCC 27264 / PCC 7002 / PR-6) OX=32049 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 312.4 bits (799), Expect = 1.0e-83 Identity = 166/378 (43.92%), Postives = 229/378 (60.58%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SJZ7 (Chaperone protein dnaJ A6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DJA6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 2.0e-82 Identity = 175/413 (42.37%), Postives = 247/413 (59.81%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C6D7 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008684 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1125.9 bits (2911), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/554 (100.00%), Postives = 554/554 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C9G9 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008684 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/563 (98.22%), Postives = 554/563 (98.40%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C5T7 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008684 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 899.4 bits (2323), Expect = 7.3e-258 Identity = 441/451 (97.78%), Postives = 442/451 (98.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C7F2 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008684 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 877.5 bits (2266), Expect = 3.0e-251 Identity = 431/435 (99.08%), Postives = 433/435 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C5M5 (uncharacterized protein LOC111008684 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008684 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 5.1e-251 Identity = 433/450 (96.22%), Postives = 436/450 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G17830.1 (Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein ) HSP 1 Score: 472.2 bits (1214), Expect = 5.6e-133 Identity = 258/521 (49.52%), Postives = 352/521 (67.56%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G80030.1 (Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein ) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 4.0e-99 Identity = 196/428 (45.79%), Postives = 274/428 (64.02%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G80030.3 (Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein ) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 4.0e-99 Identity = 196/428 (45.79%), Postives = 274/428 (64.02%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G80030.2 (Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein ) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 4.0e-99 Identity = 196/428 (45.79%), Postives = 274/428 (64.02%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g33770.1 vs. TAIR 10
Match: AT2G22360.1 (DNAJ heat shock family protein ) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 1.4e-83 Identity = 175/413 (42.37%), Postives = 247/413 (59.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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