MELO3C034946.1 (mRNA) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C034946.1
TypemRNA
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 10593407 .. 10597925 (-)
Sequence length633
RNA-Seq ExpressionMELO3C034946.1
SyntenyMELO3C034946.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAGCTTTCTTCCCTTTGGTAACCATGGTCTCTCTGCAACCCATTGGTTCACAAAGTAGAAATATAGGTAAAAGTTCAAACCTTTTTCTCACATCATTCCACTCTTAAGCTTGATTCTTTTCAAGTGCAGGTTCGAAAATTTTTAAATTTTGTTTTGGTTCTGCTGATCTCCATTTTTATACAAAAGGTATTACGTTGATCCATGAAACCCATTCATAAGACTTGGTTGGAAGCACATTATCAATCAACTACTATTGGAAAGTTCGTTCTCTTTATTATTTTGTAAGTTTATAAACATATTAGTTGGGAGTTCTTAGAGACCATCTTATGAGTAAACTATTGTTAGCTTTGCTTTTATACTTCTATTTGTTTTGTTAGTTTTTAGAGACTATCATATGAGTAAACTGTTCTATTAGTTGGGTGTTCTTACGGATTCATCTTTGTTTTCTTGCCTATTGTCCTATTGATTCTTTTGGAATATGTTGGATTCATCATTTTTCTTCTCTTCGTTTCATCTTTTTGTTTCCTCTCTACCCCATTTTGTTATTGTTAACTATTACGAAAGATTTTCTATTGTTTGCTTTTTCCATTACGTGTACAGAGCACGTAAATAACGTTAGAGTGAATTAAAAGTTCGTTTGTATTTTTATTTTCATTTGCCATGTCGTGCATACACATCATGGCCATCTGGCTTGTAGCTATCTTATATTTATAGGTATAGGTATCTATATAGTTTTTATCAAGAATTGCTGGCTATATTTTTTTAGCTCAAAAATGCTTCTTTTATTCAACATTGAGATGTTTTTCTCTTTTTCTCACATTGGATTGACTGCCCTCCATAAATACTGTGCAAGATATGTGATAATACAAATGTTAAAAAGAATATCCGACTACAGCATTTCATGTCAAGCATCAGCAGATCCTTTGGAAACTAAAGGTGTTGTTATTAAATTAACGACCTCACAATATTACGAACCTTTTAATAATTATTTTTAGCTGAGAGCTTGGAAATTACTGAAAAATGTATGCCAACTTTGAAGATTTTAGGTACCTCTTTTCCTTCGACCTTTGTTCATCCCATGTCCTTTAATTCGTTGCAAGACGAAATAAATGTTTCTTAAATTATAATTATATGATACCACTTCTTATACTTTGAACTCCACATTTATAACTATTGTGCAAACACCTTAAATTAAGGAGTTTGAAGTAAGTCAATTTAAAGGTAAATATATGTTTCTTCGTTTATTTATTTATTTATCGTGTACAATTATATGAGATGGCTTCTTAGTTCTTATATTTTAAACTCTACATTTATAATTATTACTATTTTGTGCAAACACATTAGATTAAGGAGTTTGTTGGAGTAAGTTTAAAGGTAAATATATGTACAATTATATATTTTGGAGTCTTTGTAGTGATTTGAGAGAAACATTGCGAGTTATGTATATATTGATATTTTTATTTGATGCAAATGTAATTAATTATTTTAATTTAACGCATGGTTTATATAATTGAAATTGATTTTACAAATATTTGTGGACAATTTGTTCTTCTTATATATAATATGTAAGCAATAACAAAGAATATGTGATTTGGAATTAGTACAAACTCAAACCGAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAATTGCTACCACAAGTTGCTTAATTAATTAATATCAATGACAATAGCCACCAGAATGAGGTTTACAAATGCTGTAAAAGTGCTATTAAAGATACATAGCAATTTTGTAATGCTATAAACAGTTCCCATAAAATCAAATATTTTATGAAATAAAAACAATTTTTTATAGGGTTGGGAAATGCTATTAAAAGAAGGAGACCTTTTGATAACATGCACTATGGAAACACTTTTATAGTATTCTTAAAATATTGTACAAAATGATAATGAAAGTCTTTTATAGCCTTTTTTTGGATGCAGTTATTGAAACACTTTTTATAGCATTTTCTTTTTCCCTATGAAAAGTTTTTACAACAAAATTTGGCAGTGTCAAAATATATTTATTATAGCATTTTTGTAACACTTCAAAGTTTTAAGGTAATTTTTCTCAACAAGTTGTTAAGATTTTTATTTTGTTAGGAGTTGGTTATTTGAGTTGGGCCAGAAAAAGAAAAGGGAACAAAGATAATATTAGGTGATAAAATAAAATAAAATAATTATATTATTAGTAGAGGTCTTTTAAAAAAATATAAAAAAACAGCAAAATATTTATGAAAATTGAAAGGTTGAACGTGTAAAATACAAAAAAAAAGTGATTTGATACTCGTTTAGATTTGAATATTTGGTAGACGATCTTTTAGATTTGTTTTTTCAATTAAGTCATTTAATTTGTTAACGTTTTAATTAATTGGGTTACACGATGACATAAACCATTTTTTTTCAAATTTGTTAGATTTGGTTATACATTATTTAGATTTGACCAAATTTTTTAATATTATTCAAAAGTAAATAAAAATAAGAAGAAATCGCACGTAAAAAAGAAGACTACACAAAAAAACGATAAAAAGATAGAAAAAATTACTAAATTTTTGGGTTTGTTAGGCGACTCGTAAATATTTAACTTAATTTCCTTATTATTATTATTTTATAAAAACCTAAACTATCTTCTTCATCCTGGCCGACAGCCCCCACCCTCAATCTTCATTCTTCTTCTCTCCACGAAGCCGACCGCCGCACGCGCCATCTCTGCCCGTTCGCCGCCGCTGCCGTCTTACCCAGTCGCCGCCGTCCCGTTCCCAATCCGCGTGAGGCTAGTTTCGCTGCCGGCCTCGCCTTCACCACCTTTTCCTTTCAGTTTCGCCGCCGGCCCCCCTCCCCCAATCTCCACCTTCCTTCGTATCCAGCCAACGACACCGCCCCACCCCTCTCCTCTTCCGATCAAGCATCGACGACTGCGTCAACCTGTCAGCCGTGTTCTCCCCTTCGTCCGTCGCGCAGCCAAGCCACCGCCGGCGTCTCTGCTTTTTCCGTTCGCCGCGAGCTCCAGCGCCGTTGGGCACTCATTCGCCCGCAGCCGAGCCGCCTCCACCTCCCACTCCAAGCCGCACGAGTTTTCCCCTTCTCTTGAGCCAAACCCGAACCATCCACTTCAGTTCCGAGCCGCTTAAGCCGTCTCCTTTCCGAGCTGAGCCGCCCTGAGTTTTTGGTAAGAGTATTTTGGTAAGTTTCATAGCGTTTTACATACCCGCTTTAAGAGTTTGTGTCCAACTAAATTGTGGAATCTAAATGGTTGATTCTTGAAGGTGCCGTTGGAGGAACAACGCTTGAATCTTGGAGTACACGTTGTGTTTGGAGTGTGGTTTAAGCCTTTGTTGTTTGGGTAAGTTTATGGGAGTTCCGTTTGAATGAATGGATGAATGTAGTTGCAAAAGTGATTGATTTTTTGTTTATGTTTAGGTAGGTTCATTGGATTTTAGTTCGATCAAGGACTTTTAGCTATCTGGAGGTAATGGATTTCCTACTATTGTGACTCAATGCTGAGATTTGCATGTATTGACTCATGGAAATTAGAGTCTAATGATTGCACTTATTCGACTGCTATGTATGCTATGTATAAGTAGAAAACATTATTGGCCTACATTTTTACATGAATATAGTTGATGGGGATCTGACTGTTAAAGGCAACTTAGTTATATTCATGGATTGTGTCGTTAACTGAATATAGATGAGGATGATAAGACTGACATGTGTAGATTGTTTATTGATGGGTTGTGCTGTTATTGAAATAGTGATGTCGATGGAGTAGTGATGTTTGGTTGTTGTTTATAGTTTATTTATATTTTTGAGTTATGCATATTATAGTAGTGATGTTTGGTTGTTGTTGTTGATGGAGTATGGGTTCTTGGACCGTTATGTGTAGTTTGTTTAGATTGATGGGGCGTGTTGTTAAATGAATATAGATGACGACGATACGATTGACATGTGTAGTTTGGATACTGTTGGGTTATGCTGCTAATGGAGTAGCGATGTCTGGATGTTATGTATAATCTGTGCTGGGCTGTGATGTAGAGTTTGTATGTTTACTGATGGATTGTGTTGTAGACTGAATATGGGCGTTATGCCTAGTTGAGATTTACTTGTAGTTATGCTAATGGTTGGGTTTAGATGATGTGATTGTTAGGTGTAATTACATAGCGATGATTTGATTTGTTGACTGGATTTAGGTAGTGTGACTGTATTGTGTGGATTGGTTAGATGTATAGTGACTGATGATACCTTTGACTAAGCATAGATTGTCTGATTGACTATATTAGAGACTGAACTGTTAGTTTGAGCTACGTTGTGATGTGACTATTATAGCCTTTTTTTTATGTAGTTAGCGAAACTGTTATAAAAAGCTTTTTATAGCGTTTTCTTTTCCCCCTATGGAAAGTTTTTACAACAATTTTGCGCTATCGGAAATAAACTTATTATAGCATTTGTTATAGCGGTGAAAAAGCTATGGAATGTCACGAACTTTCAATAACATGGGCTATGACCGTGTTTTAA

mRNA sequence

ATGGAAGCTTTCTTCCCTTTGGTAACCATGGTCTCTCTGCAACCCATTGGTTCACAAAGTAGAAATATAGCCCCCACCCTCAATCTTCATTCTTCTTCTCTCCACGAAGCCGACCGCCGCACGCGCCATCTCTGCCCGTTCGCCGCCGCTGCCGTCTTACCCAGTCGCCGCCGTCCCGTTCCCAATCCGCGTGAGGCTAGTTTCGCTGCCGGCCTCGCCTTCACCACCTTTTCCTTTCAGTTTCGCCGCCGGCCCCCCTCCCCCAATCTCCACCTTCCTTCGTATCCAGCCAACGACACCGCCCCACCCCTCTCCTCTTCCGATCAAGCATCGACGACTGCGTCAACCTGTCAGCCGTGTTCTCCCCTTCGTCCGTCGCGCAGCCAAGCCACCGCCGGCGTCTCTGCTTTTTCCGTTCGCCGCGAGCTCCAGCGCCGTTGGGCACTCATTCGCCCGCAGCCGAGCCGCCTCCACCTCCCACTCCAAGCCGCACGAGTGCCGTTGGAGGAACAACGCTTGAATCTTGGAGTACACGTTGTGTTTGGAGTGTGGTTTAAGCCTTTGTTGTTTGGCGGTGAAAAAGCTATGGAATGTCACGAACTTTCAATAACATGGGCTATGACCGTGTTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGCTTTCTTCCCTTTGGTAACCATGGTCTCTCTGCAACCCATTGGTTCACAAAGTAGAAATATAGCCCCCACCCTCAATCTTCATTCTTCTTCTCTCCACGAAGCCGACCGCCGCACGCGCCATCTCTGCCCGTTCGCCGCCGCTGCCGTCTTACCCAGTCGCCGCCGTCCCGTTCCCAATCCGCGTGAGGCTAGTTTCGCTGCCGGCCTCGCCTTCACCACCTTTTCCTTTCAGTTTCGCCGCCGGCCCCCCTCCCCCAATCTCCACCTTCCTTCGTATCCAGCCAACGACACCGCCCCACCCCTCTCCTCTTCCGATCAAGCATCGACGACTGCGTCAACCTGTCAGCCGTGTTCTCCCCTTCGTCCGTCGCGCAGCCAAGCCACCGCCGGCGTCTCTGCTTTTTCCGTTCGCCGCGAGCTCCAGCGCCGTTGGGCACTCATTCGCCCGCAGCCGAGCCGCCTCCACCTCCCACTCCAAGCCGCACGAGTGCCGTTGGAGGAACAACGCTTGAATCTTGGAGTACACGTTGTGTTTGGAGTGTGGTTTAAGCCTTTGTTGTTTGGCGGTGAAAAAGCTATGGAATGTCACGAACTTTCAATAACATGGGCTATGACCGTGTTTTAA

Protein sequence

MEAFFPLVTMVSLQPIGSQSRNIAPTLNLHSSSLHEADRRTRHLCPFAAAAVLPSRRRPVPNPREASFAAGLAFTTFSFQFRRRPPSPNLHLPSYPANDTAPPLSSSDQASTTASTCQPCSPLRPSRSQATAGVSAFSVRRELQRRWALIRPQPSRLHLPLQAARVPLEEQRLNLGVHVVFGVWFKPLLFGGEKAMECHELSITWAMTVF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C034946.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C034946.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C034946.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C034946.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 88..128
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 99..128

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MELO3C034946MELO3C034946gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C034946.1:exon:317934MELO3C034946.1:exon:317934exon
MELO3C034946.1:exon:317933MELO3C034946.1:exon:317933exon
MELO3C034946.1:exon:317932MELO3C034946.1:exon:317932exon
MELO3C034946.1:exon:317931MELO3C034946.1:exon:317931exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C034946.1:cdsMELO3C034946.1:cdsCDS
MELO3C034946.1:cdsMELO3C034946.1:cds_2CDS
MELO3C034946.1:cdsMELO3C034946.1:cds_3CDS
MELO3C034946.1:cdsMELO3C034946.1:cds_4CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C034946.1MELO3C034946.1-proteinpolypeptide