MELO3C027572.1 (mRNA) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C027572.1
TypemRNA
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 23915769 .. 23924488 (+)
Sequence length178
RNA-Seq ExpressionMELO3C027572.1
SyntenyMELO3C027572.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATAGCACTAGAAGTTACAATATTGACACCGTTAAAGTCACCAAGTGCCAAGTCCTTTTGGGCATTTTCAATATCACCAATAGCTTCATCATAGCTCTCAGCACAAGACGAATATCGTTGCTTAAGTTGAGGATTGGGGGTGGTTTTGGCTAGTGAGCTGGCTAGGGTCAAAGATTTGCGAGCATTTGTATGGGCAAAGATTAAGGTGTATACAACCAAGCCTTTTAAATCTGTAGTGCCTGCAGATTTCAACACACTTGAACAAAATGGTGGATTTGAGGTTTTTGGACAGATGGTGGAAACGACatcagtagatgatgccacattgatagtgaacaaaagaatccaatgagcgagacaataatgagacaagagttattggccattttaatttctttgttcttacccaaaaacgtgttctatgggtcatttaatcaatacatatatagatgacatttagagaaatggtttattttttTCctacGgaggagaaaaggtagttgcaattacataattattaaagcctaTtttagtcttttgtttggtttgTTTTAtttatttatttgttgtttttatcttaCaaaaaataacaaaaatcaattcatgaataatcacaattttcAtttttttttgacataattacaactaagatgtctttTAattatttatttatttaTttttattaTtattttgaaaagatacagctaagatgttaaaatttgaattttttttcaccatgtatgatgccaaaaacTtggtgtgAaatgtaagtatacccgtcaagttaattataaagtagtaaaaaggtaattaagaaatcaaTATCGTCTTCTATAGAGAAAATGTGTTCTAATTGAGTCTGTAACTGTAAGCCCTCGTTCCATTTTCTTTTATGTCCTCCTTCTCGATTTTTCTCTTCATCTTTCCCTTCTTCTTCTTCTTGCCGATGCCACCATCTCTATCTATCTCTCCATCGCCGCACGCCGATAGCTACTATATTTGAGCGTCAACCACATCTTCCCCATTTTTTTCTTTTTACATTGGGTCCTTAAACTTGAGATAGATGTTGAGGTAGAATCTGAGAAAGAAGAAGAAGAGGAAAGGGCCGAGAATTAAGGTGAAGAGATAAAGAAAACCAAGAAGGGATAGATAGCCATGGCAGAAGCTTCGCGTTTACAGATGAGTGTGTGATGAGTGTCTGGAAAGGACTTCAGCTTGCATTGGGCACGAGCGATAGAATGCATGAATATTTTCAGCAATCAAGTGAGAATTGATATGTCCTTGCTTGTGGAGTGCTTGAGGGTTGATGGAAGTTTCTAGCTTTGTCCAATCCTTAGTTTGTTAGATCATCTAAGTAATATGAATATAACCTATATCTTAGGGGTTCAAATCGAATTGGTTTTGGAGCTGTTGGGGTTGTGTTTTTTTAGTCTTGTTGTTATTAACATGATTCTTAGATCCAATGCCTAGAGTTTCATATCATAATACTTCTCATTAAATGGGGACTACGGGAGAAGATTAGATATAACTAAAATAATGCAATATACATCATTTAAAGTCCTTCCATTCTTTGGAAGCAATGACAAATCTTTCGATGGCTGTTTGAAGCTATCTTAACAAGTCGTCGATCGCTGTCATGATGCCATAAGTTGCCATGTTGACACAATTGAAATCACTAACCGCCAAATTAATTTGTTTTCGCATTCTTAATGTCATCCACGGACTTCCTCGTGCTCTCGTAGCAAGAAAATATTCAGTTTTTAACTTGAGAACTGGTCGTCGTTGCTGTAAGAGATTTGGCCAAATTTAGATATTTTTCTGCATTTGTACATGTAAGTTTGAGAGTGTAAGTGGCTAACACTTTTAGCTCTGGGTTGCCTCTAGATTTCAACACATTAGCACATAGTGATGGATTTCTAGTTTTCGGGGATATGCTTGATGCTACATCGTCTGATGTTGTCGTCGTGTCAACACTATGTAAGGAATAACATTGGAGAAAAGAAAAGAAAAAACTCTAAAACTAGCCAAAGGTTCCAAGACTGAAATTGGAATGGGTCACTTTAATAGAATTATAAGTCAATGTATAATTAATGATTTTCCTTTCTTTGTTCTTTAAATTTTAATTAATGTGACTATATCACATCTAACGAATTAAATAAATTATTTAAGTTCAATTTGATGTTTTTATTTGGTTATTTTTATTTTTTAATTTAATTATTACTTTAATAATATATACATTAAACGATCTTATTTAAACGATAATATATACATTAAACATATTTAAAATGCTTCATTCCTTAAGAGATTATATTATGTGAATTATCTTAACGATTGTTTTTAAATATAACAAAATATTTACAAAATTTCAGTAATTTTTCTTTTGTTAGAATTATCTATTAATATACGTGGATCTGTGTTATTAGAAATATTATCTTTCGAGTCTGATTTTTTATATAGATATTTTGATTTGTTGGAATTATCTATTGATTGATTTTTTTCCTCTTCTAAAGTTTAACCAAAATCAATTCCAATCACCATCAAATTGTAGTGTTATTATATATGTTAACAATTCAACTTCATATTATTTATTGATAAAAATCTCAAAAGTACATAGTCCTCAAAGAAGATTGGATATAACCAAAATAATGCTGCATATATCGTTTAGAGTCTTGCCATTCTTCAAAAGCAACGACGTATCCTTCGGCGGCTGCGCGAACTTATCCTGACAGTCGTCAATCTCTGTCATGGCACCAGAAGTTGCAATATTGACAGCATTAAAGTCACCAAGTGCCAAGTCCTTTTGGGCATTTTCAATGTCACCAACAGCTTCATCATAGCTCTCAGCACAAGACGAATATCGTTGCTTAAGTTGAGGATTGGTGGTGGTTGTTGCAAGTGACTTGGCTAAGGTCAAAGATTTGCGAGCATTTGTATGGGCAAGGTTTAAGGTGTATACAGCCAAGCCTTTTAGATCTGCAGTGCCTGCAGATTTCAACACACTTGAACAAAACGGCGGGTTTGAAGTTTTTGGACAGATGGTGGAAACGACGTCGTTAGATGATGCCACATTTGAAATGATGGCGAAAAAAAGAACTCCAATGAGAGACACAATAAGAAGACAAGAGTTATTGGCCATTTTATTTTCTTTGTTCTTTCCTAATATTGTGTCCTCGTTGAGATGGGTCATTTGATCAATACATATATATATTGATGAAATTTAGAGAAACGATCTTTTCCTAAGGGAGGAGAAAGGAAAGTTGTTAGTTACATAATTAAACAACCTATTTTAGCCTTTTGTTTGTTTGTTTTATCTTCAACAAGTTAACCCAAATCAATTCATGAATAATCACATTGTCAATTTTTTTGACATAATTACAACTAAGATCGGCTTTATTTATTTATTTAAAAGATTCAACTAATTAGATGTTAAAATTTTAATTTTCTGACCATGTATGATGCCAAAAACTTGGTGTAAAGTGTAAGTATACCGGTCAAGTTATAAAGCAATAAGATGGTGAAGAAATCCAAGTATCATCATCTCGAGTCTAACCTATTCAAGAATTTTTTGGATTTTATTTCAAGGAATGAAATTCATATGTGACGTGTGTTCTAAAATAATGAAATATAAGAAAAAGTTAAAGTTTTAAATTCAGGAAACAAAGATGTTCAAATGTACTGATTTTCTTAATAATTAATTTCATTTAACCATCGTAGTTATATGACTTTTCATTCTATAATCATTAAAATGCATATTTAGTTTTGGAAATGTTTTGTTGCCTACATTTCGTTTTAGGAAAAGATAATTTGTAACTATTGTTTCCATCTTTTTCAGTTAAATTAGTTGAAAAACACGTGCATGGATTCATGTGAAATCTCTAATTAAATTCAAATTATTTTTTAAATATGGATTTCTTTCGCATATAATAAATAAATATTATACAATATTTAACGTTATTTTAGTTACCATCAACTTTTTAAATTAGTTAATGTAACAAATTTTATTTTAATATTCTTCGATCATCTTAAAAACAGAAAGAAATTCTTCTCTCTAGTACAAGGTGATTTTTTTTTTAATAAGGATAAAATGGTAGTATCAAAAGGAATTTAAAAAATGGGAAAAAGGAAGTCGGTATCCGTATAGGAGTTCCCAACATTTATAATAATAATAATAATAATAAAAGTCAAAACTTTGTTATTTGTTTTAAAAATGTATAGCTTATTTCAAAGGTTACAATTTTAATCTTGATTCTTTTTTCAATAGTTTAAAATGCACCCATTAAATAGAAATTGTATAAATTCCTTAATGAAATTCAAGTTTTTGTGACCCAAAACAATGCTATATTTCTTAAAAATATGTTGTCGCAAAAGAAAAAACGAAGTTTAGAAATTAGAAATTGAATAATAATAAAAATGATAAGTTTGTAACCTGATCCTTTTCCTACAATTTGATTGAAATTTAAATTTTAAATTAGATGTAAATGTTTTTTTTTTCAAGATTGCAATTTTTAATTAGTTGAGTGCATATTTAAAAATAAATAAAAAGGATTGAAATAATTGATTTTGCTTCTTATTTAGCTTGATTACCCAAATTTTAAGTTTAGCGAAAGAAAAAGTTACAAAAAAATAATTTGTTACGAGTAAATTAGGAAAAACCCACATTTTATGTTATTATTTATGAAAGAAATATAATTACATACGATAAATTATTTTAGGTAATGAGAAAGTATATATGATAATTTTATATATAATTACCCAAAATTTAAGTTTGGCAAAAGAAAAAGTTACCAAAAACAATTTGTTAGTAAATTAAGAAAACTCACATTCTACGTTACTATTTATGGAATATAAATATAATTACATATGGTAAAAAGACGACACATGACAGTGGAATATTCGATCGGAGTCGTGGATTGGATCCACAACTTCAATTATGAAATAATGTTTTTATTTAACTTCCAAATATCAATGATTTTACAAACCTCCTATATCCATAAATTACAT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mRNA sequence

ATAGCACTAGAAGTTACAATATTGACACCGTTAAAGTCACCAAGTGCCAAGTCCTTTTGGCTAGGGTCAAAGATATGCGAGCATTTGTATGGGCAAAGTTTAAGGTGTATACAGCCAAGCCTTTTAAATCTGTAGTGCCTGCAGATTTCAACACACTTGAACAAAATGGTGCATTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGAGCATTTGTATGGGCAAAGTTTAAGGTGTATACAGCCAAGCCTTTTAAATCTGTAGTGCCTGCAGATTTCAACACACTTGAACAAAATGGTGCATTT

Protein sequence

MRAFVWAKFKVYTAKPFKSVVPADFNTLEQNGAF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C027572.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C027572.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C027572.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C027572.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572MELO3C027572gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572.1:exon:331971MELO3C027572.1:exon:331971exon
MELO3C027572.1:exon:331972MELO3C027572.1:exon:331972exon


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572.1:five_prime_utrMELO3C027572.1:five_prime_utrfive_prime_UTR
MELO3C027572.1:five_prime_utrMELO3C027572.1:five_prime_utr_2five_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572.1:cdsMELO3C027572.1:cdsCDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572.1:three_prime_utrMELO3C027572.1:three_prime_utrthree_prime_UTR


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C027572.1MELO3C027572.1-proteinpolypeptide