MELO3C012686.jh1.t2 (mRNA) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCAAAATCAACCTCGGGGAATACATTCCAACACGGTTCTTCGAAGGTGATGTTCATATCTTAAATACTGTTCTCATGCCAATAATGATGTATGCAGTGTCTCTTTCTCTTGATATATGATGGGTTCATTTCTCATTCCACTCGTGAAGATAGGTTTATATCAGGATAGTTGGTGATAGTTGTGGCTCATTCATTATTGTGGAACATGTTACTGTGAAATAAGGGTTCAATATAATCATTATTTATTGTTATAGTTTATTTTATGTTCTTATTCAATTTTATTCTCACTTATCATTTTGTAATGTTTCTTAGATTTCAGTTCAGCTTGGGCGATAGTATAGAGATCAGCTCTCAGCGGTCTTCATTGAATATTAGTCATGCTACCAAAAGGCAGAAGTTGGAGGCTGGTTATTTTTCCAATGTATGTGGAAATTTCTATTTCTACATTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTGTTTTGGTATTCTACAAATCTCTTACATGTAGCTGTCTTTATTGAGGCAAAGGGAATGAAACATTAGTGTGTCAGACAGAAGAAGACAGTATTCAACCTTTTCTTTTTCCAAACCAAATATTCTTTCTAACAGCGTGCCCATCTTTCCTGTGTTAGCTTAAAAGTGTTTTGCGTAGGACAACAATTAGGATAGGAACATATGAACCACATACCTTATAGCTATTAATATACTCACTCTAGTTGAACTAAGCTCTTACTGGCAACCTCCAAGATTTTGAAACCCATTCATTTAGATGGTTTAGTTACCTCCTTAGCAAATATTGCTATCTGTTTCTCTTGCATTCTTGTTTATTACTGACATCATTTTAAAAAATATTTGAAGATGCTGTTAAGGGTACGAAGACTTAAAACTGATGGGTTTCTAGAGTGCTGACTACTGTCCAATCGCCAAGACTTGTGTTTTCTAATTGGCGTATTGTTTCCATCTAACTATTGCTATTGCTTTCTTCGTCTCATCTCACACTCTGTAACATCATAAATGCAGCATATTTGAGTGGTTTGATTAGTTTTATCTTGGAATTTCATTTTTGTTTTATCAACCTTTTAATAAATACATTTTTCCTAATCCTAAAATATTAAAAGCAGAGAGACAAAAAGGAAAGGGATTTCGTGGAATTTATTTTTCTTTAATATGCTTTTGTAGAACGGGCAGTTACTCATGTTCCAGTCTATCAAACCTGCAGAGTGAGTCTATTAGTCACAAGTTTTTAAGGAACTTTTAACCTTCTGCTGCAGGTCCGACATTCAAAGCGTCAAACAAGTTTGCTTCACAAAATACCTAAAAAGGTAATCAATGCATCTTCCTTCAATATATCATACTTGTGAATCAAACATTGTACTTATGCAAACTTATCATTACGGTAGTAGAGTGTTAGTATGGAAAGTTTTTCTTTTTTAAGGTAAAGAGTCTTTTATTAATATTAATATTGAAAGTAACAACAATAGCTAACACAAAGATTTACGTGGAAACCCTAATACAAGGAGAAAAACCATGAGAGAATTTTCAATTTTCTTATTATTTTCTTATGCCACACAATAATACAAGAATGGAGATTAATAGACAACATGAACCTAAGATAAAAAAGGAAAGAATAAATAAGGTTACGTAGAGTACAAAAGAACCTTTGGGCTTTCAACATACAACAAGCCCACTAATTCTAACCATTAATAATGACACAAAAGCACAATGTACAAGAAGATTATACATTACAAGAAATCGGGCTTTTTCCGACGTCGAAAAAGACGTCGGCATAAAAGACGTTGGTAATAAGAGGTTCTCCCAACGCATAAAGTAAGACGTCGGGAGAAAAAGCTATTCTCGACGCATAAAGTAAGACGTCGGGAATAAGAGGTTTTTCCGACGCACAATTCATGCGTCGGGCACAAGACGTCGAAAAATAAGGGATATTTCCGACACCGACCTAACGCGTCGGGAAATGTCGTCGGGAAATAAAGGGTATTCCCGACGTTGGCCTAACGAGTAGGAAAAGGCCTAGGTATTTCCGACGCCGTAAGTGTGCGTCGGGAAAGGCAAGTAGTGCGTCAAGAAAGACCTAGGTTTTCCCAACGCCGTAAGTAGTGCGTCGGGAGATCCCCTTAATATTTATTTTGTTTCTATTTTACACAGAACTGAAAACAAAAGGGAAAGGGTTCGGACAAGAGAGAAGCATTTGTCGCCGTCCGTAGCTCGCCGCCGTCTGTTCCATCATCGTTGTCGTCCATCGTCGCCGTCCGTCGCCGCGGCCGCAACTTCAGCCTTCCTCTGTTCGTAGCTCGCCACCAACCTTCTCTTTGATGTCTTTCAAGTTCTTCTCTCTCCATTCTCACTTTTTCAGGATCCCGTTTGTCACCCTGTACCTAAGTCAGTCCTAAACAAATATATCTCAAATGAATATTTTTTTTATTGAAACAACTTTCATTGAATGAATATGTGTGCGTCTGTGCATCATAGGGTTGACCTAACATTGGATAAACAAGAAAAACCTCAAGTTTAATGAACCTTTTCAAGTGTCTTTTCTCGAGCTTTCAGTATAGTGTCGGCAAAATGGTTCCTTAACAAAGCTGCATGGTAAAGCCTGTCGAGAGAGGCTTTCCTGACGCAGTGCTTTCCCGACGCCATGGATTACGTTGAAAAGGATGCCGTCGGGAGAGGCTTTCCCGACGCGTGACCAACACAGCATCGGGAAAGCCTATCCCGACTCACTCCCTCCGACGTTTGTCCCGACGCCGAGGACTGCGTCGGGAGATCCTTTCCCGACGTATTTTTCACTTCCTCCGACGTTTTTTGGCGTCGGGAAAATTTCGATTTCTTGTAGTGATATAATGAGCATAAGAACCTAAGGATTACTAGACGCACCCGGACATCTGAACCAAGTTGATACCTCCTTAGCATCCTCATCATATCTGTATAAACTATTAAGAACATATAATATGAGGATAAATGAAGGTCAGCACAAGCTGTAAAAACCCAGAATCCAAAATCTAATACACCAAATCTACACTGACCAAAAGGCACCGATAAGGAAGGAGACCAAAAAATAATGAACCTTGATTAAATTGTTGAAATGAAGGCACCCTAGTTTAGATTTAAATCAGAGATGTTGTACATGTTGAATTCCTTAGAAAGAATGTACCACAAAGAGGCATTTTGATGAGCATTTTCAAAACGATCGAACCAACTTAGAGATTTGTTGTGAAAAGTCCTTTGGTTTCATTCAATCCAAAACTTGGCCAATAAGGCTTTGTCTGCATTCCACCAAAGAATTTGTGCAGTCTTCTTAAGATGGGGTCCTCCTACAAGCAGTCTAACCCATTCTCTACTCTCCAAGAGAGGCATCCAAGACATTTTAAAGATGGAGAACCAACTTCTTCCACCAATTGGCTGGATATGATTAAAGAAAAAAGAGGTGTAAAGGGCTTTCTTCATGCTAGAGACAAAACGAGCAGATTGAGGGTGAGAGACAACTATTTGGCAATTTTATCTGTAAAATTATATAAATGTTCAATTGACCAACCAACATCACTCAAACTAGAATATTCACATACCCAGTGGTATAATATACAAATGTCGAGTTTAAGTGAGAAAATGGAATACAATAAACTCGGGTATACTTTAGATACATATCCAATAAAAACAAGGATAGTGGATATGGATAATATCCTTAAATCTTGAACAAATAAAGAAATTATAATAAAGAAATGTGATAAAGTTATTTGACTAATACATCCCCTCAAAACTCAAGACAATGAAGTAGTCATGAGTTTGGAAGAGCATGACGGAAAGGGACGTGATGGAAGAGCCTTGGTGAAGAGATTAGCAACTTGGTCTTGTCAAGAAACAAATTGGATGACAAGATATTTCCAAAGAACATTCTCTCAAATAAAATGATAGTCAATTTCAATGTATTTGGTATGAGCATGAAATACGTGATTGTTGGCTAGTGAGATACCAGACACATCATCACACCACAATAGAGGAGGGTCTACCAAGAAAAAGGATAAAATCATTGGTGGTTGATACAATCGATAACTATTCTAATTTAGATCAGGGTTTAAGCTTGTTGCCATTTATTCCTAGCCCATGCATCTAATGATTTTTTTTGAATTCGTGAATCCCACCTTCGAAAAATCTCGACAAATCTTGCTCTAATCATGCTTGTTTACTTCATAAAAGTCTCTATGGTCTCAAGCAGGCAGCTCGAGCATGGTATGATTGGTTGGCATTTTATTTACTCACACTAGAATTCATTATGTCCAATGCAGACAACTGCTTATTTGTCCAATCTGATGGCTCTTCATTGACTATTTGTCCAATTTGATGGCTCTTCATTGACCTATCTTTTACTCTATATTGATGATATTATCATCGTTGGCTCAGATTTCGATCCTGTGCTTCTTTTAAAAGATCAACTTTCTTCAAACTTTTAGATATTAGGCAATCTTAGGCATGTCCATGACAAATTCTTGTCACATACTCATGTCCACGACAGTTATTCTCCATGCATCAGATCCACTTTTATCTAATGTTACCCTATACCGAAAGTTTCATTACAGTATCTCACACTAGACCTGATATTGTATTTGCGGTCAATCGTGTTAGCCAATTCATGCAACAACCTACTGCGATTAATTACACGACTATTAAACACATCATTTTGATATCTTTGTGGAACACATGATCTTGGTATTTTGTTCAAATCTGGCAAGCTTTTTGTAGAAGCATTCTATGATGCAAATTGGGCAAGTGATTCTTCAAATCGTCGCTCCACGACAGAATATGTTGTTTTTCTTGGCTTCTCTCCTATAACCTAATCTGCCAAGAAGCAACCTACTATTTCTCGATCGTCTACCAAGGTCCCTTGGCTATGTTATTTTCATATTTTCTTGGCAGATCCTCCTCTCTTGCAGTGTGACAATGTGTTAGTTATCTCACTAGGTATTTCATG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Match: XP_011659005.1 (protein TPX2 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 282 bits (722), Expect = 1.49e-91 Identity = 146/179 (81.56%), Postives = 151/179 (84.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. NCBI nr
Match: XP_011659002.1 (protein TPX2 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011659003.1 protein TPX2 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031744915.1 protein TPX2 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031744916.1 protein TPX2 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 282 bits (722), Expect = 1.63e-91 Identity = 146/179 (81.56%), Postives = 151/179 (84.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. NCBI nr
Match: XP_038887479.1 (uncharacterized protein LOC120077612 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 248 bits (633), Expect = 4.37e-78 Identity = 129/162 (79.63%), Postives = 141/162 (87.04%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. NCBI nr
Match: XP_022995793.1 (uncharacterized protein LOC111491222 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 224 bits (572), Expect = 7.26e-69 Identity = 115/160 (71.88%), Postives = 130/160 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I2H7 (Protein TPX2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TPX2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.1e-12 Identity = 57/168 (33.93%), Postives = 90/168 (53.57%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DXC4 (protein TPX2-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489692 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 334 bits (856), Expect = 6.83e-116 Identity = 164/164 (100.00%), Postives = 164/164 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K915 (uncharacterized protein LOC111491222 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491222 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 224 bits (572), Expect = 3.52e-69 Identity = 115/160 (71.88%), Postives = 130/160 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K2W6 (uncharacterized protein LOC111491222 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491222 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 224 bits (572), Expect = 5.05e-69 Identity = 115/160 (71.88%), Postives = 130/160 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H1Y0 (uncharacterized protein LOC111459624 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459624 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 220 bits (560), Expect = 3.26e-67 Identity = 114/161 (70.81%), Postives = 131/161 (81.37%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ46 (protein TPX2-like isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025952 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 219 bits (557), Expect = 5.22e-67 Identity = 113/160 (70.62%), Postives = 134/160 (83.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. TAIR 10
Match: AT4G22860.1 (Cell cycle regulated microtubule associated protein ) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 5.5e-20 Identity = 63/150 (42.00%), Postives = 90/150 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. TAIR 10
Match: AT4G22860.2 (Cell cycle regulated microtubule associated protein ) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 5.5e-20 Identity = 63/150 (42.00%), Postives = 90/150 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. TAIR 10
Match: AT4G11990.1 (Cell cycle regulated microtubule associated protein ) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 6.7e-18 Identity = 61/160 (38.12%), Postives = 87/160 (54.37%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. TAIR 10
Match: AT1G03780.2 (targeting protein for XKLP2 ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 7.7e-14 Identity = 57/168 (33.93%), Postives = 90/168 (53.57%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C012686.jh1.t2 vs. TAIR 10
Match: AT1G03780.3 (targeting protein for XKLP2 ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 7.7e-14 Identity = 57/168 (33.93%), Postives = 90/168 (53.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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