Lsi06G007360.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAACGGTTTCTATTGTGATAACTCAATTGGTGCGCTCAAATGGCTGAATCTCTCAATATTGGTGTTCCATGGATCATGTGCCAACAAAGTGATGCCCCACAACCTATCATTAATACATTCAACTGTTTCTATTGTGATAACTTTAGTCTTAACAATCTTAAGAGCCCAAAAATGTTTACTGAAAATTGGGTGGGATGGTTCAAGAAATGGGGTGACAAAGACCCTTATAGAAGTGCAGAAGATGTAGCTTTTTCTGTGGCAAGATTTTTCCAATCTGGTGGCGTGTTTAACAATTATTACATGTATCATGGAGGCACCAACTTTGGAAGAACATCGGGAGGTCCATTCATCACTACGTCTTACAATTACAACGCCCCACTTGATGAATATGGAAACTTGAATCAACCCAAATGGGGACATCTTAAACAACTCCATGCATCCATCAAAATGGGAGAGAAGATTCTCACTAACGGCACCCGCTCAGACCAAAAATTTGGTAGCTTTGTAACTTTAACGAAATTCTCTAACCCAACAACAGGGGAGAAGTTTTGCTTTTTGAGCAACACAGATGGAAAAAATGACGCTACCGTAGATTTGCAGGCAGATGGAAAGTATATTGTACCAGCTTGGTCTGTGAGCATTCTTGACGGTTGCAACAAAGAGGTTTTCAACAGTGCAAAGACCAATTCTCAATCATCTATGTTTGTGAAGGTGCAGAATGAGAAGGAAAATGCACAACTCTCGTGAGTTTGGGCTCCGGAGCCCATGAGAGGTACTACAAGGAAATGGTACATTTAAGGCAAACCTTCTTTTGGAACAAAAAGGAACCACTGTTGATTTCAGCGACTACTTGTGGTACATGACGAGTGTTGTCACCAATGCAACATCTTCACTTAAAAATGTAACTCTCCAAGTGAATACAAAGGGTCATGTGCTTTATGCCTTTGTGAATAGAAGGTACATTGGGTCGCAATGGGGAAGTAATGGCCAGATTTTTGTATTTGAGAAACCCATTCTATTAAAAGTGAGAACCAACACCATAACTATTTTGAGTGCCACAGTAGGACTGAAAAATTATGATGCGTTTTATGACACGGTGCCAACTGGAATTGATGGAGGTCCCATTTATCTAATTGGAGATGGAAATGTCACAACTGATTTGTCATCAAATTTATGGTCGTATAAGGTTGGATTAAATGGAGAAATGAAGCAACTTTACAACCCGATGTTCTCACAGAGAACAAATTGGAGCACATTAAATCAAAAATCTATTGGGAGGAGAATGACATGGTACAAAGCAAGCTTTAAGACACCTTCAGGAATTGACCCTGTAACATTGGACATGCAAGGAATGGGAAAATGTCAGGCTTGGGTAAATGGACAAAGCATAGGCCGATTTTGGCCTTCTTTCATTGCTGGCAATGATAGTTGCAGCGCGACCTGTGACTATAGAGGTGCATATGACCCCAGCACATGCATTGGAAATTGTGGGAATCCTTCCCAAAGATGGTATCACATTCCAAGATCGTTTCTATTAGATGACACAAATACATTGGTTTTATTTGAAGAAATTGGTGGAAATCCTCAACAAGTCTCAGTTCAAACCATCACTATAGGAACTATATGTGGAAATGCTAATGAAGGAAGCACATTAGAGTTGTCTTGTCAGGGAGGGCATATCATCTCTGAAATCCAATTTGCTAGTTATGGAAATCCAGAGGGAAAATGTGGTTCGTTCAAACAAGGCTCGTGGGATGTGACAGACAGTGCTCTTTTGGTGGAAAAAACTTGCATTGGCATGAAAAATTGCTCAATTGATGTATCTGCAAAGTCGTTTGGATTAGGCGATGCTACCAATATGTCTGCAAGACTGGCTGTTCAAGCACTATGCTCAAAGAATTGAGTGGTGTAAAATATATTCTTTATGTATGATAAATGTTAGTTTTAGCAAACCAAATATTTTTATTTCTTTCCTTTTCCTATAATGATTTACTAGTCACAAGCATGCATAAGAATACTCGAAAACTTCTAAACACACATTTTTTGCTCTATAGAAATTTCAAAAACAAAAAAAGTTACGTGCTTCATATAAATTACCTAACAACAAGAAATAAAATTCTAAGAAAAAGATGTACTCGATGAAATGATAACTTGATAAAATTATGAAATAGGTTTTTAGGGTGTTAACAAAAGTTACAAAACTACTATGCAATGATGATTTGAAAAATGGAAAATGTATATATAAGCATTGATATGAGAAGTTATTGGTAAAAGTTCAAACGATCACAAAACGATATCAATATTTGGTCTCGATAACAATTTGACTTGGTTGTAAGAAGCACTACAAACCAAATAATATCAATATGGTTAATCTTATTAAGAGCTAATAAGATTACAAGGACAACTTGACTTATCGATAAATATAAACAACAACTTGGCCATCAATAGACACAAAGAAAATCAACGATTTTTTGAAAATTACAAATGGGTCCTTGAAGCAATATAACCAACAACATTCATGTGTATGAAAAGACATTGCTACCCTTTCCAAGGTGTGCTATAGAATTCAAATTTTATAAACGATATTACAATTACAATGGCTAAGTATCTGGAAAAAAAAGTAAAAATATGCAATTCTCAAAATATAAAAGTACATGTTTATGCACACATCCTACTATATCATTAAACAAAATTCAAGAACACAATATCCACCTAAAGAATAGACGAGTATTTGAAATGTTAGAAATCTTCTATGTTCATAAATACATGTAGGCTAGGGAGAGCCGATAGTATTTTTCTTTTTAACTTTCCTGTTAAAAATGCCACAAAAGACAGGATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGAAAAGATACCATATATATCAAACAAAAAAAGTTTAATGGAATGAACAAAAAATCTTAGTTGAAAATTGAAAGTTATCCCCCATTAATCTTCAGTCCTAGNTATATATATATATATATAGAAAAGATACCATATATATCAAACAAAAAAGTTTAATGGAATGAACAAAAAATCTTAGTTGAAAATTGAAAGTTATCCCCCATTAATCTTCAGTCCTAGAAACTTTATTCATTTTGACATCAATCTTAGAAGTTAAGTAATACATCTTTAACACGTGACTAGACTTCGATCTCTAACTAAACATTATGAACTCTATGAAAATTAGAGATTATAAAAGTTAACCTCGAAATACAAAAGACTAAATTTTAAATCAAGCCTTAAAGATCGTATTTTGTAAATAGAATTTAAAACATTAGTTCCACCCATTTTTAAAAGCATGTTAGATTTTAAGTTAAATATTCTCCGTCTATTTGGTCATTCTGGGGATGCAACAATATTGTTGAGCATGCACAAAATATGTGAGATTAACCTAAAAATTCATATCTTGACTAAGTAAGAAATCTTCGTGTTTGGAGATGCACAAAATCAACCAATTCTTTAATTCCATAATAATGCACATATATATTTAGGAGTGATAGCTTTCAAGTATAGGCCAGCAGTACGATGACACACAAAACAATATTATTGACTTTGATACATGATTCCAAAAAAAGGATGATGATAGGTTATCGTTCAAAAGCAGTTTGAAAAGAAGGGTGGATCAAGCGTGCTTGTTTAGAAAGAGCTTGCAATTTTGGAATAATAAGTAAATATTATATGAACTCAATTAAAATGTATAAATTGATGTAAAAGATTCCTTGGTATTTTTAGTTTAAATTATTGGAGCATATTCCAATAATACTAGTAACTTTATCAAAACGAATCTGTCAGGGGTCTTGTCCTGATGATTCGATCTTATCTTTTAATTTTCTGCATTCAATTAATTATGCATTACGGGGTCTATAAAAGACTTCCAACTTGTAATGCAAAGGCATCACTCGAAAATCTTCAAGCTATCTTCTTCTTGTAAGCTTGATAATTTGGAATTGCCTAAATCTTGTAATTTTCGATCCTTAATTTTCCAAATGGTATCAGAGCCAAGTTCAATTCTATTGAGTTCAATAATCCATTTAATCTATTGATTTCAAATTCAATTCCGGGAGGAAGAGATTGATCATATTTAAAGTTCTTTGTCGATAATTTCATTTCCAAATCGACTATTCTTCCTTTGAGATTCAACCTTCAAAGAAATTGATTCTACGTCCGCCTGTTCGTTCGTGTCTACTTGGTGGTCTTGGCAATAAATCGCATCGTGGCGTGGTGAGTCCATTGATCACCCGTAATCAGCCTAGCACAAACAAGTATAGAGGATATTTCTAAGAAGGTTTAATCTTATTGAATTAATAGTTTGTTTGAAAATAAAATTATTTGCAAATGATTTCTTTAAATCTGAATTAATGTCGAATCTCCTAACGAATATTTTATTTAAAAAATCCTCCACAAAGGAGCTAACTCGAGAAGAAATTGAGGAGCAACACAAAGCTTCCTAAATTAGATCCAAAAATGATTTATTTTCATAATACCTTTAATTTCAAAGAAAATCATTGTGTCAAAATCGTTGAAAGAAAAATCTCTGTATATGGAGAAGTAGATTCAATTCAATTATTTCCAAAAAAAAAAAAATGATATTTTAAAACATAAAGAATAGTTTAAATTTCTCTACATAGGAGCAGTTCAAGTTGCTCTTAGGCCAATGTTTAGATCAGGTCTTGATACGTCTGTTCTAGCCATCCTAAGAGATAAGAGGCATAAAGATTTTGCAAACTCCTTACTTGGAATAATTGAGTCAAACTTAGCAGATGGACCAGCCTATTTCACCTGCTATCCAAACTTTATGGTGGCTCTTGATGATCCACATATACTCAAAACTTAAACCTTGATATTACAGGAAAAGGCCTAAATTTAGAAGATGGTGTTAAAAAGTTAACACTTTTACACAAGGTTACTTATAAAACACTAACTACCACAATGGAACCAAAAGCCTTAGTGCATTCCCCTAAAGGGAA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MQRLNNLKSPKMFTENWVGWFKKWGDKDPYRSAEDVAFSVARFFQSGGVFNNYYMYHGGTNFGRTSGGPFITTSYNYNAPLDEYGNLNQPKWGHLKQLHASIKMGEKILTNGTRSDQKFGSFVTLTKFSNPTTGEKFCFLSNTDGKNDATVDLQADGKYIVPAWSVSILDGCNKEVFNSAKTNSQSSMFVKVQNEKENAQLSDYLWYMTSVVTNATSSLKNVTLQVNTKGHVLYAFVNRRYIGSQWGSNGQIFVFEKPILLKVRTNTITILSATVGLKNYDAFYDTVPTGIDGGPIYLIGDGNVTTDLSSNLWSYKVGLNGEMKQLYNPMFSQRTNWSTLNQKSIGRRMTWYKASFKTPSGIDPVTLDMQGMGKCQAWVNGQSIGRFWPSFIAGNDSCSATCDYRGAYDPSTCIGNCGNPSQRWYHIPRSFLLDDTNTLVLFEEIGGNPQQVSVQTITIGTICGNANEGSTLELSCQGGHIISEIQFASYGNPEGKCGSFKQGSWDVTDSALLVEKTCIGMKNCSIDVSAKSFGLGDATNMSARLARTSSFIGRMQERNQGFPFPSSLQGPSKEMVPSSSLVLVAHILLTSSNASEVRTEDEKEVFGSILRNIEKDGGLVEVGVVGQPAKEKATKVSPEEKLHLRSVLAATSLEEKTSVDSNEGPVNMKEETKEEKKKEDKRRRKEERKIEK Homology
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SCV5 (Beta-galactosidase 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGAL7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 3.3e-148 Identity = 269/572 (47.03%), Postives = 369/572 (64.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49676 (Beta-galactosidase OS=Brassica oleracea OX=3712 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 2.8e-147 Identity = 267/575 (46.43%), Postives = 365/575 (63.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RUV9 (Beta-galactosidase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0533400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 477.2 bits (1227), Expect = 3.0e-133 Identity = 251/577 (43.50%), Postives = 339/577 (58.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C6W4 (Beta-galactosidase 15 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGAL15 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 8.3e-131 Identity = 261/587 (44.46%), Postives = 348/587 (59.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7G3T8 (Beta-galactosidase 13 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os10g0330600 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 457.2 bits (1175), Expect = 3.3e-127 Identity = 250/578 (43.25%), Postives = 335/578 (57.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V9Y9 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold130G00750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1016.5 bits (2627), Expect = 5.1e-293 Identity = 487/576 (84.55%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DUP4 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold325G00870 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1015.4 bits (2624), Expect = 1.1e-292 Identity = 486/576 (84.38%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U918 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold761G00120 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1013.8 bits (2620), Expect = 3.3e-292 Identity = 487/576 (84.55%), Postives = 512/576 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJ19 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G003860 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 5.7e-292 Identity = 485/576 (84.20%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQ87 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492519 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 5.7e-292 Identity = 485/576 (84.20%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038896535.1 (beta-galactosidase 15-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1028.5 bits (2658), Expect = 2.7e-296 Identity = 495/576 (85.94%), Postives = 521/576 (90.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0062481.1 (beta-galactosidase 7-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1016.5 bits (2627), Expect = 1.1e-292 Identity = 487/576 (84.55%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. NCBI nr
Match: TYK27403.1 (beta-galactosidase 7-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1015.4 bits (2624), Expect = 2.4e-292 Identity = 486/576 (84.38%), Postives = 513/576 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031741738.1 (beta-galactosidase 7-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1015.0 bits (2623), Expect = 3.1e-292 Identity = 484/576 (84.03%), Postives = 516/576 (89.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0050887.1 (beta-galactosidase 15-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1013.8 bits (2620), Expect = 6.9e-292 Identity = 487/576 (84.55%), Postives = 512/576 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. TAIR 10
Match: AT5G20710.1 (beta-galactosidase 7 ) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 2.4e-149 Identity = 269/572 (47.03%), Postives = 369/572 (64.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G31740.1 (beta-galactosidase 15 ) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 5.3e-125 Identity = 251/586 (42.83%), Postives = 337/586 (57.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. TAIR 10
Match: AT2G28470.1 (beta-galactosidase 8 ) HSP 1 Score: 441.4 bits (1134), Expect = 1.3e-123 Identity = 251/596 (42.11%), Postives = 328/596 (55.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. TAIR 10
Match: AT2G28470.2 (beta-galactosidase 8 ) HSP 1 Score: 441.4 bits (1134), Expect = 1.3e-123 Identity = 251/596 (42.11%), Postives = 328/596 (55.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G007360.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G13750.1 (beta galactosidase 1 ) HSP 1 Score: 414.8 bits (1065), Expect = 1.3e-115 Identity = 240/598 (40.13%), Postives = 324/598 (54.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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