Lag0000809.1 (mRNA) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTCGATATAGCGAGTGGTGGTGATGCACAAGACAAAACACTCAATGAGGCTAGAGAGATAATTTCGAGCTTGGCAAGGTACGTTGGATTCATCATATGACAAGCACGAGAGGTAAATTCTCCCCATTCCTCGAATAGCCAAGATTCTGAGCAACAACAAGAAGGTAAGTCTAATGAGGTCAGTAAGCCCATACTTGACCCTTCTTTAGATTTTGAGTCTAATTCATGTAATTCTTCATGCCTGATCGAAAAATAGAAATAGGTGATGAGTTAGCTTCGATCGATTCTATGTCAATTTTTGTTTCCCTTGTGCTTGTTAATTTTGATTTGCATGAGTGACCTAGTCATTCTGATCGCTACCTGTCTGTTGCTAAGTATAAAGGTGTTTTGATTAGTATGTTGGGGATGACGATGAATTATTTGCTTGAATTTTCTCATTCTATGAACTCTGTGTGCGAGTTGCATTTGCCTGTGCAGGAGCTTATCAAAAAGAAGAAAAATAAAAAGGATACACTAAAAATAAAAAATATCGATTTCAGATGAAGATCAAAATTTTACCACTTTCTCTTACTTTCTGTCATTTCCTTTTCTTTGTTTCAGTTTATTTTTGATAGATTGCTTTTGATTCTTGTTAGTTGTCATTGTTTCTTTTTAGGTTGGCGGTGCTAAAGCAAGCTCATATTTGTACATAATCGAGACTCACCACCCACGAGCTTGATTTCAGGAAAGTTTTTTATTCTTTCCTTATGCACTTGTCCCTGTTTTCCATGATTTATTACAATGAGGACAATGTAACCTTTTAGGTTGGAGGTGGGGTATGTATTTTATTTTCTGTTGAACCCTGAGCATTTGTGCGTCGGACCAGCGTTTGCGCTTAATGTTTGTCTTGCATGCTTGTTGTATATATGTGTTTATGTAATAATGATTTTATAGGATAGGCTAATTTTTTTTTTTTAAAAAAATAGCTTTCGATGAGTTGTAATCGTGAGTGCCCTAAAAGGGAGCCTTTTTAATATTTTTCTTGGATATGTCTTGCATAAGTTGGGATTCTCTCTTGCTCTAGAGTAGGATTTGAACGCTTAGGAGCGAGTTATTAGGCTCATATTCCTGTTGTCACTCTGATAGGTGTAAGGTTTAGTGAGAAAGTCTAATTTTTTTGCAAAACAGTGTGTGGAGTCTTACCTAGGAGATAAAAAGAAAATTCTTCTGCCATAAAAAAAAAAGAGAGGTAAAATAAGTGAAGTGAGTTTTTTGTAAATATTTTTGTGTTCACCTCTACTTGTTTTTTTTTTCCTTTTAGAAAAAGCATGTCTTGCATCGATTATGAGTGTTTAGGGGTAAAAAGAGTTGCATGCAGTGTGATCAGTTAGACCAACCAAGGGTTAAACTCGAGTTATGGGTCCCTGCATTGTAGTGTGAAAGCTAGTGTCCCACCCTAAAAAGAAATGTAAAAGAAAAAGGAATTTGTTATTCAGGCACCTAGACAAAGATTAAGCAATCTAGTTTGTTCCATTTAAACTTTTTAGCGAGACCTTAGTGCCAGTGTAGGGGGAAGATAGGATGAGAGTTTAATAAATCAATCCCGGGTTAGTAAAGTTCTCTTTAGGTGAGATAAAATTCTCTTATGCAAGATTATCACTGAAAACTTTTGATTTGTCTCCCCATTGGGTCTCACATGCATGTCTCTTGATTGCTTTAGTTTTTGAATATTTGAGCTTTGAGGATTAAATTACTTTGCATATATATATGTACAACTTTTTCTTTTGTTTTTGTGTTTGCCTTGCTTGAGGACTAGTAAGATTTAGGTTGGGGGTATTTAATAGCACCTAATTCGTGCTATCTTATTACCACTAATCTAAGCTTGTTAGAATATTTTACGTTTTAATTGTCTTATTTTCAGGTAATTCGAGCATAGGTGACATTGGGAGCAAACCACACGAATTGGTGCTAATTTGAGTCAATTATAGTGTTTTTGAGCCATCTTGAAGTTTATGGATGACAAAAAGGGGAAAAGACCGAGCGAATCGAAGTAGGCCTGAGAAATAGTGCCAAGAAGTCAAAGGTTCGAGCCCCAAACCGAGATGGACTGAGTTGAGTCGAGAAAAAGGACAACATGCTAGAAAAGGGGTCATCGTCGAGACGTTGAAGTGAATTTTACACAGAAGACAGTATCGTAGCGTCAAGACGCTGTTTTCCTAGTGTCTTGACGCTACAACGATTATTATAAATATAGGGTTACGGTTTAGTCTGCCGTTAGGTTAGATTTTTTTATTATTTTTAGTTTTCTCTCGTTTTTCTCTCATTTTCTTGTATTTCTCTGATAGCTAGTTTCTTTAGGATGTATTTCTTTGATAGAATTGTTGTTTTTGCTCTAAGTATGTCAGCTTAATCTCTTTATTCATCAGATTATTGAATGTAGCTGCAATAGTTTGTTAATTTGATGGAATTTGCTAGTTTTTAATGAATTCTTCGGGATTTTTATGTTCATCTATGTTATCTTGTTTAAATCATTGTCTTTAAATGCTTTCTTAGGCAATCTATTAGTTATTTGAGATAGCCACTAGGTCTGAATCATGTCCTTTGCATCTCTCAATATGAATTTGCATAGCTTGCTTGATAGGGCTTAAGAAACATAGAGAAATTAGTCAATTGAATTAGGAAGTTAATTCTTGATTAAATCGATTAATTACCCTTAGACCTAATGCAATTAATTTAGTAGGCAATCTTGCGGACTAATGAGTTGTCTAGCTAGTTAATTAGAATTAGATTCATGGGCTAGCAGTCTAATGCATGAGGAGTAGCAAACGTAATCTTATATTAAGTGATTAGTTAATCACGTGGGCTAACGAATTAGGTAATTGATTAGCATAGGTTAGGAGGATGCATAATCCAATCAACCAAGAAGCAATCCAGGTTCATCTAAATCCGAATGAATTAAATTAGTAGAGCAAACTAAGAAATCAAGTAAGCAAACTATTCAATGAATCGAAGAATCTGACGATCCCGTCTTTTGATTGATTTTTCTCTTGTTTTCGCCTTTTCTATCTTTTGTTGCATGCTATTTAAATTCTGTTGTTGTTCTGCGTCCCCATCTTTTTAATTATTTGTTAAAAATATAATTTAAAAACCCCCTGTTCGTTTGTGCAAAAGCCTATATCCTATTAGGACTCCCTTCCTTGTGTTCGACCCCAACCAGTACTACTGCAAGTAGTTTAGTGCCGTGGATTATAAATTTTATTTGATTCGGACCCTCGACAAGTCTCATCAACCCCGACCACTACTATTGCAAAGTAGTTTAGTGATCGGTGAACTATAAATTTTATTTGATGCAACTCTCAACAAGTCGCTCCGTCAAATTTGGTGTCATTGTCGGGGAACACGGTGCTTTATTTCTTTTTTTTTGTGTTTTCACATTTTTCTTGTTTCTTGTGTATTAGTTTGTTTCTTGCAGGATCCAATGACAAATCTTTACAAGGAAAACACATTTTTTACCAAGAAGCAAGGAGAAGAATAGCTAAGCTTAATGGATATCTGGTAGACTCTCAACCCGTTGTCCGCTGAGATAGAAAGGGTCGAGCGTGCAGTGCAAGTCTTCTTTTCAGCTCCACAATATCCTTCGCCTACCTGCATTGTTAATCCCGAAGAAGATAATTTTGTGCCCCTAGCTGAATTTATTTTCTCAGTTCCTTCCTTTTATGGTGATTCAAGAGCTAAAGGCTACTATCATGTGTCCGATTTCTACTCGAGTTGCTCCGAGAAGAAATTCCCTAAGATGTTTGAAGATCAATTCAAATTGAGGGTATTTCCATATTCACTACAAGGAGGAGCTAGAATGTGGATTTTCTCACTACCCTCAGGATCGGTAGCTTCTTGGTGCGAGATGAGAAATATTTTCTTGAAGAGGTACCATCCTACCGCTCTGCTGATTGAAGCGACTGAGAGAATTGTCAACGACACGCAAGCAGCTGAGGAAATATTCCATGAGTTCGTGGACCGCTCTAGTGGACACTACATGGTTCCTCACACTACATTATTCAAGGAGTCCTTAATAGAAAGCCTCTATGAATGGTTTGAAGGATTGGAATTTCGTAATTCCGTAAAGCAGAAGCGTGATTGGGACCGATTCGTAATTAATTTTGTTTAATCTAAAATACCAATACATTGGCAATAATCTTAGAACTATTCCAAAATTTATATTAAGGCTAAGCATACAAAAACATTAGATCTAAATCTAATTTATTTAGTAACAAATTACTTACTCTCGTTGACGACTCATATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAAATAATCGCGAACTACTGCGAATACCACCAGCTACACCGGTATGACTCTGAGACTTCTAGAGACAGGAGACTGGTGGGAGTCTAGAGGGAGCCTTCAGGGGAATTCTCAGAGAGTAGGAGAATGAATGGGATGCCTTTCACCCCACCCCATGGGTCCTATTTATATGAAAAGGTCAAGACCTTTTCCTAAGGAAAAGGTCATGAATAAGATCAAATCTATTATCTTATTCCTATTTAATTTAATAAATAATTAATTAATTACTCAATTAAATATCATATATTTAATCTTAGGGATTTTGTTAAATTATTTATATTAATATGAATCCAATTCATATTAATTATTTGAACTCTTTCAAATATTTTTCTCTCAAGAATTAATTTTGACATTAGTTCAAAATTATATTATAACGTTTCATAAACTTTATATTATAATGTATCAATATCCTGGAAACACTATGTGATATGGTCCGCTTTGTATTCGATACAGACGTATTAATCCAAGGCGTCCATGTAGGAGATATGCGAGCGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCACGAAAGAGTAAACCACTAGATGTAACACCGTTAACTAGTTAGGTTACTGTTTCAATACGATGACCTAGGTAACTCAGTCTTAATCCTGAGTGTGTCATGAACTCCTTCTCATGAGGGATTGTCCT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MLDIASGGDAQDKTLNEAREIISSLARLEVGYVFYFLLNPEHLCVGPAFALNTLNPLSAEIERVERAVQVFFSAPQYPSPTCIVNPEEDNFVPLAEFIFSVPSFYGDSRAKGYYHVSDFYSSCSEKKFPKMFEDQFKLRVFPYSLQGGARMWIFSLPSGSVASWCEMRNIFLKRYHPTALLIEATERIVNDTQAAEEIFHEFVDRSSGHYMVPHTTLFKESLIESLYEWFEGLEFRNSVKQKRDWDRFGSFVYCMRSSRELIPLDPEIERTIHRIRRENREIIHMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKTGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDIVYSPGASQCITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARILLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAAGVFEVDKVSALQAQMTSLANAFMKFSESSNRTTKLEEAVIAINTTVNGHSAAIKNIETHLGQLVNVVSTMNKGKARTEQEKTQMEYWEAEEDTSSDEAEKPNPEPPIPSPTLMVPKEKKKKNKKKNNQVQFDKFMNAFMNMNINIPFAEALEMPQYNRFMKEWLAKKRKEKKVDTVYLASICSTRVQQKVPKKVADPGSFSVPCSFGTYSFRALCDLGASINIIPLSLCKKLDIGEIKSTPVKLQLADQSLVRLVGIVENVLIRVGRPFLATGRVIIDIERRELTIRVRNEKEIFKAVEDSKDEVLFMGYKKGARKSTSVGFTKRSLLEARSTRRANDVKQALMGGNPSLFVPYFLYTLRTMSVLSLGVE Homology
BLAST of Lag0000809.1 vs. NCBI nr
Match: KAG7990634.1 (hypothetical protein I3843_02G035100 [Carya illinoinensis]) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 9.9e-107 Identity = 267/770 (34.68%), Postives = 395/770 (51.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. NCBI nr
Match: KAG7947748.1 (hypothetical protein I3843_14G109500 [Carya illinoinensis]) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 2.6e-99 Identity = 243/694 (35.01%), Postives = 350/694 (50.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6734747.1 (hypothetical protein I3842_01G285500 [Carya illinoinensis]) HSP 1 Score: 369.0 bits (946), Expect = 1.1e-97 Identity = 241/694 (34.73%), Postives = 348/694 (50.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023874613.1 (uncharacterized protein LOC111987139 [Quercus suber]) HSP 1 Score: 367.5 bits (942), Expect = 3.2e-97 Identity = 240/688 (34.88%), Postives = 346/688 (50.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. NCBI nr
Match: XP_021279280.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC110412945 [Herrania umbratica]) HSP 1 Score: 353.2 bits (905), Expect = 6.2e-93 Identity = 250/732 (34.15%), Postives = 351/732 (47.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J0ZX64 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC110412945 OS=Herrania umbratica OX=108875 GN=LOC110412945 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 353.2 bits (905), Expect = 3.0e-93 Identity = 250/732 (34.15%), Postives = 351/732 (47.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DU19 (uncharacterized protein LOC111024361 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024361 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 342.8 bits (878), Expect = 4.1e-90 Identity = 223/557 (40.04%), Postives = 321/557 (57.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P8DKJ2 (uncharacterized protein LOC116204231 OS=Punica granatum OX=22663 GN=LOC116204231 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 316.2 bits (809), Expect = 4.1e-82 Identity = 239/729 (32.78%), Postives = 345/729 (47.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P8DD93 (uncharacterized protein LOC116206453 OS=Punica granatum OX=22663 GN=LOC116206453 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 2.0e-81 Identity = 239/727 (32.87%), Postives = 345/727 (47.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0000809.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P6XAQ1 (Reverse transcriptase OS=Coffea arabica OX=13443 GN=LOC113740608 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 306.6 bits (784), Expect = 3.2e-79 Identity = 217/646 (33.59%), Postives = 304/646 (47.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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