Lag0000781.1 (mRNA) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0000781.1
TypemRNA
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 16413906 .. 16419123 (+)
Sequence length549
RNA-Seq ExpressionLag0000781.1
SyntenyLag0000781.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTTTCCCTTCCCATTCCCTATCTCTATAGACTCCCACAAGTCGTTCTTGGCCCGGAGAATAGTAGGGAAGACACTAGAGGTGGTCCAAACACCATTTGTGATCAAAGGAATCAAAGGGAGTTGTTGAATCGGTCTCCTAAAAGGTTGGTACAAATTCTGCTCTCTATTTACAGTAATTGGACAACATGTTTTCATTTTCTAAAATTGATGTAGTTAAGTGCCATCGATCCTCAAATTGCTTCCGCATGTGTTATATGAACACTTGCAGTAGGGTCAAAATCGCTGTTCATAATTAATTTAGGCTTTTCCTAGTTAATTAGAGTATTCTAGCTTAGAACACCAATTCGTTATCTATTAATCACTGTAGGGCTAGTTAATTAATGAATTGTATGTCGGTCCGACGGGTTAGCGCTCTAGGGGTATCTTGGTCTTAATGCAATTATTTAATTGATTAATCTCGACGGGTTAGTAGGGTTTGATTAATTAGTAATTAGTGATTAAATCGATGTACGATGGGATCGAGTCAATTGTTTTAGAGTACCAATTAGGCAACATGCATTTAAATGATTATTTGCTAATCGATGAGTAAAACCAAATGTACTCAATCCGAGTGTCTCCAGCTACTGTGATCACCAAGGTGAGATTAACTAATCGCCCATTACTTTCTTGTTATTTACTTTTCTACAATTTATATTCCCGCACTTTATATTTTCTGAACTATTCCCTTCTTCTTCAACCCCCTTCTGTTACCACAAACGCAAAAGAGATTAGAGATAAACCACTTGTTCCCTGTAATCGACCCTGACCACTACTACTGCAAGTAGTTTAGTAATTGGTGAATTATAAATTTATTTGATCTGAGGACTCGACAAACTGGTCCGATTAATTGTGAGAACAAAACGCTAGCGTTGTCTCAAGCAATGTATATTAACAAGATGATGTCTCGATATTCGATGTAGAACTCCAAGAAGAGTTTATTACCCTTCAAGCATGGGGTTCACCTATCTAAGGGACAGTGTCCTAAGACACTTCAAGAAGTTGAAGATATGAGTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTTGTAGATAGTAAATGAAACAAATTAATTAAACTCAATAAAGTGTTATATGAGTAATTAAGTAATTTGTTATTGAACAATCGAGTTTTCATTAATTAACCCTAGATCCAATAAACTAAGATCAAAGGTTGTTTAAATGAAACTTGGACTATTATGTAGGGGCATAAGGGGGTCAATGTTCAAGTAACAACCAAAATGGTTTATCGTATAGGGATAAGACTGGGTACCTTATCCTGGCAACATTATGTGATACGACCTGCTTTGCATTCGATACAGATGCATTGATCCAAAGCATCCATGTAGAAGACATGTGAGTGGATGTATCCTATGCAATGGGTTTGCATAAGACCAGACCACGTAATAGTAATTATTAGATGTAACGTCGTTGACTAGTTTAGGTTTCTATTTCAATAGGATGACCTAGGTAACTCAATCTGAATCCTGAGTATGTTATGAACCCCTTTTCATGAGGGATTGTCCTTAGATCTTTATGGGTGAGAGTGACCAGTTCGCCAACTCAATAAGCCTACTGACAAGTTGGGAGTTGTCGAGGCTCCCAGTTTGTCAATAAAAATTTATAGTTCCACGAACACTAAACTACTTGCAGTAGTATTGGTCGGGGTCGATCACAGGGAGTGGCGGTTGGTTACTTAATTCCTATTGATTTTGAGTTTTGAAGGCGATAAATGGGGGGATTGGAATATTGGATAAATGAATGTGCAAGGAATTAAAATTCAAGAATTTAAATGACAGAAAATTAAAGGGGACAAGGAATATAAATAAGCAAGAACCATAAAAGAAACAAGAAAATTAATTAAATTAGGCGACGCCGATTGGAGAGATTATTGGGGTTGAATGATTTACTTTGATCATTGTCTTCCTACCTTATTAAGGCTAAGTTAAATTGCTTAATTGCCCAATCGATCTAATCTGAACCCAGAAAAGACCCAAAGCCCACCTTAGCCATCTAACCTGATCATACAACGTCTATCGAATTAGACTCTAATTGATTAACCAAATAATCTGATTGAACTATCAAACCAAATAATCAACCAATTGCCTTAAGACTAGTGGATTGATTAGGACATTAGAAATAATTAGGCCTAGATTACTTCTAACACTATTTTGGATCCTAAACCTATCGTGTCAAGCAACAAAGTTAGTGTTTGCTCTTGGGACCCATGCCCACGAATCATTCTATGCACTAACTATTGAATTAATAATCCATTAGCTACTTGGAAATCAATTCCTTAGCAAGTTATTAACATATGAGCTCCGAGTTAGGGCATCAATCTAACCTACTGTGCATGCAAATAATACGAACTGAATCCAAAATACAATTTCAATATCGAATCGAATAGAAATTCAGAACATGAAACTCACAAAGAATTACATTTATAACCCAATAATCATCCAATCGGCGTCAACAGGTTTAGACCGACTAAAACCCGTGACCCTACGCTACAATAACAAGAAAATACAAAGAAAATCAATAAGAAAACTTACTCCTCTTAGTTCTGGTCTTGAAGGATAGAAAGAATCGAGAGGAGGACCAAAAAAAACCCCTAAAACTCCCTACTTTTCGACGAAAATAAAATAGGGTATTTTTATAGAAAATTTGATCGCGACGTCGGGACGCCGTGCCGTATGGGCCAAGGGCTAGAAACGGGCCAGTGTCGAGACGCTGGCCACGGTGTCTCGACGCCTGGCCTTCTTTCAGCGTGCTTCAATCTTTAATCCTTCTTTGTTTCTTGCTCGATTTAGGTCTCGAACATTTGACTCTTTGGGACCATTCTTCGAGATCGCCACGATCCTCATGGTCTTCTCACCTCCTCGAGATCCATGGCCCTCAAGTCAGCTCGAAAACTCTCTAAATTGCCCGAATTAGCTCGAATTTGTGTAGTTCGTCATTGATGCCCTGAATGCATAAATAATCTACAAAATAGACAAATAAAGCGTAAAGTGAACCCTAACAAGTTTAGATTAACAACAAATAAATAGGACTAATTAGAACCTATCACCTACCATTTCAGGGGCAAGACCGAGTGGGGGCTGGCAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGGTAAGTAGATGTGTGTTCCCTTAAGGGCTGATTTCAGGTCTTGAACAAAAGCACGTTGTCCTTTCCAGACTCGAGAGGAATTTCTGTTTAGTGGTTGAACCCTAAACAGGTTGTTCATTAGAGGGATCAGTGGTACTTAAGGATCCAGAGGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTGACGTTACGAAGACTCGTGAAAGATTGATTTATTGGTATGGTCGATATCCGTGGACACAAAATATTCTACAGCGAGAAGAGTGCAGTTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGGCTCATAGTTAACGAATGTTGGTTAACTTGATTAATGAGTTTAGCCAGTTAATCTCGTATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGTTCCATTGGGTCCACCTGCTAGCTCGTAATGGGTTCTGAGATTAATTAGTCTTGATTATTAAGGGATTTTTTAGTTAATTGTATTTGATACAATTAATATAATGTATGGAGATACATTATAGTATAAGTTTAATTAGTGAATTAAACTTTATAATAAAAGTAATTTTGGATGTGATTCAAAATTAATTAAGGAGAGAACTATATATTTGAAGGAGTTCAAATATTAAATATGAATTGGATTCATATTAAACTATAGGTTAAAAATAATATGAATAGGGATTCATATTAAAACTATAGTATATGAGAGAATGTGAATTTAATTAAATATGTGATATTTGATTAATTCATGAATTAATTAATTGGAGAATTAATTAGTTTAATTTAATTTGGTTAAATGTGATTTAATCAAATTAATTCTATAGTGAATAATTAATGTACATTTGATGCACATTAAAACTATAGGTTTAAAGAGAGAGGAGCATTTGAATATGATTCAAATGTAAAATTAATTAAGTATTTGTTATTTAATTAATGTGGGGAGCAATTAATTGAGAATTAATTTGTTGACCTAATTAATTCAATTAAATATTATTTGATTGAATTAAAACTATATGTTATAATTCATTTAATTAAAGTTGTTTTAATAAATTTGTTATATAATATATAGTTTTTTGGGTTATTAATTATTATATGATAATAATCAATGGTCCAGATCCTTTTCGATAAATGGCAAAGATTCATCAAGGGAGTTAAGAAGTTACACCCCTTTTACCTTACTTCCACTACATGTTCTTGACAGAAGTCAGTTATGTGGTTGTTTTGGAAAACTATCGATACTCCTTCTCTCTCTCACACTCTCTGCGTGTAGGATACAGAAGAATAAAATCTCTATCTATATTTTCTCTCAATAACACAAAACAACTCCTTGATGCAAAATTTTCTCTCCAAGACTTTGGTGATCCCACAATCACGGATCTCTACAGCCCAAGAGAATAGCGGGTTTTCGCGATTGGTGGTGTCCTTAAACGCAGTACGTGATTTTGGAGCATAGTGCTGTTTTGGCCTCCATTCATGTAAGTTTTCGATCCTAAATGGTTTAGATCGCTTTAATGCATGCTTATTCTATAAAAATCGTTTCTGTTTTGCCCAATGTACGATATTCTAATTGACTGAAATTCGTACACGCTCGGTGAAAACCGCTTTCGCTGAGGATTCAATTCCTTCAAATGGTATCAAAGCTACTTTGTGAATGTAATTTCAGTCTTAGAATTTGCATTGAGGCTGTTGGTGGGATCAATTTTGCATAATTGGTTTGCTTAAAGACTATTTAGGTATTTTGACCTTAGATTTACAATTTCCTCTAATTTGATCATGTAAGGACCCATGTTTTTGAGGTAAAATATTGTAAATCGAGTCATGTAAGTTCGTGTCTAGAATTATGATTTCAATTGTTGAATCGCTACTTAAATCGGGGTTGAAATCGAAGGTTTACGGCTGTTGGAACAAAGAACAAAGAACAAACCCGAGGTGTGGCATCGAGAAGCTGTTCAACGCCGTCGAGACACCGATGAACGCATGCTGGAATTTTTGAGCCAGCATCGAGATGCTGCCTTCAGCGTCTCAACGCTGGTGGCAGTTCGTGAATTCACAAAGCGTGTGCGGTGTTGA

mRNA sequence

ATGCTTTCCCTTCCCATTCCCTATCTCTATAGACTCCCACAAGTCGTTCTTGGCCCGGAGAATAGTAGGGAAGACACTAGAGGTGGTCCAAACACCATTTGTGATCAAAGGAATCAAAGGGAGTTGTTGAATCGGTCTCCTAAAAGGGATAAGACTGGGTACCTTATCCTGGCAACATTATGTGATACGACCTGCTTTGCATTCGATACAGATGCATTGATCCAAAGCATCCATGTAGAAGACATGTCTCGAACATTTGACTCTTTGGGACCATTCTTCGAGATCGCCACGATCCTCATGGGGCAAGACCGAGTGGGGGCTGGCAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGGTTTACGGCTGTTGGAACAAAGAACAAAGAACAAACCCGAGGTGTGGCATCGAGAAGCTGTTCAACGCCGTCGAGACACCGATGAACGCATGCTGGAATTTTTGAGCCAGCATCGAGATGCTGCCTTCAGCGTCTCAACGCTGGTGGCAGTTCGTGAATTCACAAAGCGTGTGCGGTGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTTCCCTTCCCATTCCCTATCTCTATAGACTCCCACAAGTCGTTCTTGGCCCGGAGAATAGTAGGGAAGACACTAGAGGTGGTCCAAACACCATTTGTGATCAAAGGAATCAAAGGGAGTTGTTGAATCGGTCTCCTAAAAGGGATAAGACTGGGTACCTTATCCTGGCAACATTATGTGATACGACCTGCTTTGCATTCGATACAGATGCATTGATCCAAAGCATCCATGTAGAAGACATGTCTCGAACATTTGACTCTTTGGGACCATTCTTCGAGATCGCCACGATCCTCATGGGGCAAGACCGAGTGGGGGCTGGCAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGGTTTACGGCTGTTGGAACAAAGAACAAAGAACAAACCCGAGGTGTGGCATCGAGAAGCTGTTCAACGCCGTCGAGACACCGATGAACGCATGCTGGAATTTTTGAGCCAGCATCGAGATGCTGCCTTCAGCGTCTCAACGCTGGTGGCAGTTCGTGAATTCACAAAGCGTGTGCGGTGTTGA

Protein sequence

MLSLPIPYLYRLPQVVLGPENSREDTRGGPNTICDQRNQRELLNRSPKRDKTGYLILATLCDTTCFAFDTDALIQSIHVEDMSRTFDSLGPFFEIATILMGQDRVGAGNITVQDGIHSFPYWGLRLLEQRTKNKPEVWHREAVQRRRDTDERMLEFLSQHRDAAFSVSTLVAVREFTKRVRC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0000781.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0000781.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Lag0000781Lag0000781gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lag0000781.1.exon1Lag0000781.1.exon1exon
Lag0000781.1.exon2Lag0000781.1.exon2exon
Lag0000781.1.exon3Lag0000781.1.exon3exon
Lag0000781.1.exon4Lag0000781.1.exon4exon
Lag0000781.1.exon5Lag0000781.1.exon5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Lag0000781.1cds.Lag0000781.1CDS
cds.Lag0000781.1cds.Lag0000781.1_2CDS
cds.Lag0000781.1cds.Lag0000781.1_3CDS
cds.Lag0000781.1cds.Lag0000781.1_4CDS
cds.Lag0000781.1cds.Lag0000781.1_5CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lag0000781.1Lag0000781.1-proteinpolypeptide