IVF0024046.2 (mRNA) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAATAATTAAATGAACCAAATCATGACAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATTCCGATTTTTTATAAAATAAAAATAAAAAGAATTTCCAATCCCATATTTATTAAAGCGGTGGTGTGTGCCACAAACACACAATCAGCAACCGGAGCCCTCCAAGGCTGAATCAGTGTATTTATTAAAGAAACAAACTACAAGTTTAGGATTTTGCTTTTTGCTGCCTTACTTGTGTTTTCAAGGGAAATTGGAGACGATGGAACCCAAAAAAGTGGGCATAATCGGAGCTGGAATAAGCGGTCTAGCGGCCTGCAAATTTGTTCTATCCAAAGGATTGATTCCGGTTGTGTTGGAGGCCAGAGGTGAGATTGGCGGCGTGTGGACAGAGACGCTGCAGACGACGGTGCTGCAAACCCCAAAAGAGATGTTTCAATTCTCCGATTTCCCTTGGCCGAAATCGGTGACCGAAGAATTTCCGAGGTATGATCAAGTGCTAGATTACCTTAGTTCTTATGCCCAACATTTCGGATTGTTGAAGCACATCAGATTCAACACTAGAGTTGTTAGTATCCAATACGAAGGTTGCTCTGATGAGGAGATTGGAGGTTGGAATCTTTGGGGTGGCTCCGGAGACGCCTTCGGCGAAGGGCGGAAATGGAGGCTCAACGTCGTTGATGCTCGGACTGATGTTCCGGTCGAGGTGATTTTATCATTACCTTTTTCACCGCCTCCACACATATAATTAAAAGCATATCCCTCTCCGTTTGCTTCCCTTCATTCACTCATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAAAATTAAAATTTCAGAAAGAAGAAGATAGAAAAAAGAGAGGCAAATTAATTAGAAAACGGGTTTTTTTAAGACTAACGAAAAGAAAAACAAAAACAAAACACGTTAAGCGTCGTGACGAAAAAGATGACGAACAACCACACCTCTTTTTTCTACTCTCTCATTTTTTACAGTTCCTCTTAAGTTTTTCCCTGAGGAACAAAACTATTTATCAGCGAGAGCTCATATGCTTCATTATTAAATAAATTTATATTTTGATATACTAAATTAATTAATAGTTTTACCTCATGATTTAGTGGTTAGAAGAGCCAATTGCTTTTTCAATCATAATCATCTGATCAAATTGATCTTATGAACTTTGTCTTTATCATTGCATTTTTCATCTCTCTTTTTTTGAGTTGGATCTAGAATATACTTTTAACTATTATTATATATTTCAGTAATAATATAAGAAGAAGATATTTGAAATTTAAAAAAGAGGAATAGTAATAATAACTTGCTGCATAAAATCTGTGGTGGTAATTGTAAGTTGATCCATTGGGCTAATGTTGTTTGCATGTGCCTTTTGTTTCTTTTCTATTAATTATTGAATCTTTCTTTGAAAGAAGTTCAAATATTAATAAAATATGTAGAGATATGTTCGGTTGTTTTGAAAGAAATAATTTTACCAGAAATTCTAATGGGAACTTTTTTGGTCCACAATTTAAGAGGGTTTCACAATCTAAGAAAATAAAATTTAAGATATAAATTTTGATTTATTAACCCCAGATTTATGAATTTTTATTAGATTTTTTTTTCTTTTTTTGAAGTTTTATGAACGTATATGCATTTTTGAAACAAATAAGAAAGTTCACAACTCCATGTTATCTTACTTCTAAATGTTTCACTTGAATTAATTTTTAATTTAGAATATTAAATTTCATGGATGTGCAGTCTCAATCGTAGAAGGGTAGTAATTTTAAGTTTGTTTTGCTTAACAAAATTTCTCGTCTCTCCAATAAGAGATATTAGATAAAATGAATCTTAGTGCTAAATCTCTAATTAAAGTTTATAAATTTTACAAACAAAAGACTTATCTTAGTGCTAAAATTTGGTAATCAAACTTAACACTATCAAGGATTATTTTTAATATTGAGATGGTTAAAATCAATTTTTTTTCTTTTTAAGAATGGTGTTTGGAATGAATTAAAATTGATATTAACAAAGTATAAAATCATTTAAAATTGATTTTGGACTAGTATGTTTAGAATATTGTTGGTTATCTAGAGGTAAAATATTAAATTATTGATAAAAACCAATAATTATATTATTCCTTTAATTTTATTTCAGTGATAGACATTCACCCTACGTAACCTGTTAACCAGCTAGGTATCATAGATGTTAAATAATTATTTTCCAAACAGAAAATACAATTAATAACTGAATGAATCAAACCTAAAATTAACTTTTGGAACCCAACCTAATACCTAAAATCAATTATAAACATAAATTTAATTGTTTAAAAATCATTATTCTAACTATTATTTTAAAATGCACCCTTAGTACCATCAACCTCGACAGTTATCTACAGCCGACACAATTAGTGACCACCCCATTGGTCATACTCTGATCTTAAATGTAAATTTGGAACTTATTATTTCATTACCTCTAATAGTTGATCATTCAAATCAAATTTTATGTTTTATTTTGATTAAGATATCAATTTCAGTTTGTACGGTAATAGATTCTTGAAAAATTCCAAACTTTGCGATTTCAATTTGGAAAGTATCACGTGAGAATTGCAATGGTTTTAATTAAGGTTGTAAATTAAGATTTTTGGAAGTCATCAATGTAACAATTCTTATACGTACTTAGACTTCTTCAGGTGCTGAATAATTGATGCATATAAACAATTAGTTGATAACAGTTTATGTGAGTTTAATCGATAAAATTATATGCTTATCTAAATGAAATATTATAGGTAATTTAAATTGTTACACTCAGTAAAGGATGTTATATTTTCTTATAATTTAAAAGGGATAACAAAATTTAGAATTTGAAAATTTAGCGGTGAATTTCGTAGAAAAAAAAAAGTCTAGTATGTTCGGGACAAGTAAGATTGTAATAACTACCTTTTGTTAAGATAATTACTATTAAAAAATTCCAAATTAGCTCTAGTATTAACTATTTAGAAGCCTCCCTTTTCTATATACATAGCTTTTACTTATAAATATTCATCGTCTTTTTATTGTTTGTTATAGTATTTGGTAGTTTAATCTCAAACACATACTATTATAATCTAACTAAAAACAATCTACATCTAAGTCTAAACTATTATAATCTAACTATAATAATCTAGAATTATACCTAAATAATTGCTCTCTTAAAAGTGAAGATTGATCTAATATCTGCCGGCAAAAAGTTTAAAGTATAATTTAAGTTGGTATAAAGCATGAATCATCTATCAGCCAACAAATGTTGGAGTCCCTACTCCCACCTATTGTTGAAGGTATGGAAGTGCCTTTTGTGGAATTAAAAACTATACATTTCACAAGTGACACACAATGACATGGCAGGTGTTTGGAGAGTTCGTGGTGGACTTCGTAGTACTTTGTATTGGCAAATTCAGTGATGTTCCAAATATCCCTGAATTCCCTCCAAATGGAGGTCCCGAAGCTTTCAAAGCCGGAAAAGTTCTTCACTCTCTAGAGTTTTCTGCCATGGATTTCGACAATGCTTCAAACCTCATCAAGAACAAGCAGGTCACTGTCGTTGGTTTCCAAAAATCTGGTATTGACCTCGCCATGCAATGCGCCAATGCCAATGGTAATTTTGCCTTTAAAATTTCTCGATTATTATTCCACTTTTTATAATCTCTCATTTTGATCTTCATTTCTCCATTTATTTGCAGGCCCGAACAAACCTTGCACGGTTCTCTACAGAACCAAGCATTGGAGCATAACTGATTATTATCCGTGGGGGATCGCTCTAGCTTTTCTCTACATGAATCGGTTCTCTGAGCTTCTTATTCACAAGCCTGGCGAGGGTTTCATTCTCTATCTCCTCGCCCTCCTTCTCTCCCCAATCGTAATTATCACCTCTCTCTCTCTATTTTTTTTTCTTTGTTTCTATTTATTTTGAAGTTTCTTGGTTTTGTTTTTCACAGAGGTGGTTGTTCTCAAAGATTGTGGAAACCTACATGATGAAGAAGCTAGGATTGGCCAAATACGGAATGGTCCCAACCCAAAGCTTTCTTCAAGATGTTAGCTCTTGTTTATTTGCGATAATGCCCGAAAACTTTTACGAAAAAGTGGAGGAAGGAAGCATCATTTTAAAGCAATCACAGAGTTTCAGCTTTTGTGAAGAGGGTATCATGATCGAAGGAGAAACAAAACCGATACGCTCAGATTTGGTCATTTTGGCTACAGGATTCAGAGGTGATCAAAAGCTGAAAGAAATCTTTGCTTCCTCTACATTTCGAGATTACATGACGTTTCATGATTCAGCAGCTCCCATGTATAGGTTAGTGCTTCCTCAACTATTGAATTGCAGTGGAAAATGTCTCAAATTTTTTAGTTTAAAGCTCAAGTTTTGTTTGTAGAAACTAGACTAGATTGTAGAACTATTATCGAAAGAGAACATAAAAAGGTTTGCCTAAAATTCAACTCCATGCGCATAAGTAAATTTGTTATGAAAACAGAGGCCAAGTTGAATCCATCCCCTTGTGATTGTAGTCCAACCTGTAATATCTACAATCAATTGAAGTCGAATTTTATCAGTCAAACAAGGAAAATGGACCGAAATATGTTTAGTGCATTGAAAATGGTGAATTGATCCTTTTAAAATACAAAATTTCCCTTTTATCTTATCATCATTATCATCAATCAGATTTGATTTTGAGAAAGCTTTGTGGTGACTCGTTACACGCTCACAGATGCCAATTCATTACACGCTCACACTCTTAATCGCACGTGTACTTTCCTTCTTCGCCCTCCTGCTATATTGCAATACAATTGGAGGACCAACATTACACTCCTCCAAAATCACCTTATTCTGAGAGTGGAATTTAGGAAATTGTTGTTTGAAGTCATCATAGTTCTCCCAAGTTGCTTCTTGTGGTGGTAGGCCTTTCCAACTGATTAACACCTCCCAATCTCATGTTGAAGGATTCTTCCGGCATCTAGACAC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ATGGAACCCAAAAAAGTGGGCATAATCGGAGCTGGAATAAGCGGTCTAGCGGCCTGCAAATTTGTTCTATCCAAAGGATTGATTCCGGTTGTGTTGGAGGCCAGAGGTGAGATTGGCGGCGTGTGGACAGAGACGCTGCAGACGACGGTGCTGCAAACCCCAAAAGAGATGTTTCAATTCTCCGATTTCCCTTGGCCGAAATCGGTGACCGAAGAATTTCCGAGGTATGATCAAGTGCTAGATTACCTTAGTTCTTATGCCCAACATTTCGGATTGTTGAAGCACATCAGATTCAACACTAGAGTTGTTAGTATCCAATACGAAGGTTGCTCTGATGAGGAGATTGGAGGTTGGAATCTTTGGGGTGGCTCCGGAGACGCCTTCGGCGAAGGGCGGAAATGGAGGCTCAACGTCGTTGATGCTCGGACTGATGTTCCGGTCGAGGTGTTTGGAGAGTTCGTGGTGGACTTCGTAGTACTTTGTATTGGCAAATTCAGTGATGTTCCAAATATCCCTGAATTCCCTCCAAATGGAGGTCCCGAAGCTTTCAAAGCCGGAAAAGTTCTTCACTCTCTAGAGTTTTCTGCCATGGATTTCGACAATGCTTCAAACCTCATCAAGAACAAGCAGGTCACTGTCGTTGGTTTCCAAAAATCTGGTATTGACCTCGCCATGCAATGCGCCAATGCCAATGGCCCGAACAAACCTTGCACGGTTCTCTACAGAACCAAGCATTGGAGCATAACTGATTATTATCCGTGGGGGATCGCTCTAGCTTTTCTCTACATGAATCGGTTCTCTGAGCTTCTTATTCACAAGCCTGGCGAGGGTTTCATTCTCTATCTCCTCGCCCTCCTTCTCTCCCCAATCAGGTGGTTGTTCTCAAAGATTGTGGAAACCTACATGATGAAGAAGCTAGGATTGGCCAAATACGGAATGGTCCCAACCCAAAGCTTTCTTCAAGATGTTAGCTCTTGTTTATTTGCGATAATGCCCGAAAACTTTTACGAAAAAGTGGAGGAAGGAAGCATCATTTTAAAGCAATCACAGAGTTTCAGCTTTTGTGAAGAGGGTATCATGATCGAAGGAGAAACAAAACCGATACGCTCAGATTTGGTCATTTTGGCTACAGGATTCAGAGGTGATCAAAAGCTGAAAGAAATCTTTGCTTCCTCTACATTTCGAGATTACATGACGTTTCATGATTCAGCAGCTCCCATGTATAGACACACCATTCATCCTAGAATCCCACAGTTAGCTGTCATTGGATATTCGGAAAGCGTTTCAAATTTGTACACCTCGGAGATACGGTGCCGATGGCTGGCAGAATTTCTAGATGGCACATTCAAGCTACCGAGTATCAAGGAGATGGAGAAGGACATAGCCAACTGGGAGAAGTGCCTGAGGCTTTACTCGGGCCCTTTCTACAAGCGAGCTAGCATTGCCGTTTTGCATATTTGGTATAATGATCAACTCTGCAAGGACATGGGTTGGAACCCCAAGAGAAAGAAGGGATTCCTTGCTGACTTGTTTTTACCTTATGGTCCTTCAGACTATGCCACCGCTTGA MEPKKVGIIGAGISGLAACKFVLSKGLIPVVLEARGEIGGVWTETLQTTVLQTPKEMFQFSDFPWPKSVTEEFPRYDQVLDYLSSYAQHFGLLKHIRFNTRVVSIQYEGCSDEEIGGWNLWGGSGDAFGEGRKWRLNVVDARTDVPVEVFGEFVVDFVVLCIGKFSDVPNIPEFPPNGGPEAFKAGKVLHSLEFSAMDFDNASNLIKNKQVTVVGFQKSGIDLAMQCANANGPNKPCTVLYRTKHWSITDYYPWGIALAFLYMNRFSELLIHKPGEGFILYLLALLLSPIRWLFSKIVETYMMKKLGLAKYGMVPTQSFLQDVSSCLFAIMPENFYEKVEEGSIILKQSQSFSFCEEGIMIEGETKPIRSDLVILATGFRGDQKLKEIFASSTFRDYMTFHDSAAPMYRHTIHPRIPQLAVIGYSESVSNLYTSEIRCRWLAEFLDGTFKLPSIKEMEKDIANWEKCLRLYSGPFYKRASIAVLHIWYNDQLCKDMGWNPKRKKGFLADLFLPYGPSDYATA Homology
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LMA1 (Probable flavin-containing monooxygenase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FMO1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 5.0e-112 Identity = 222/520 (42.69%), Postives = 313/520 (60.19%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FKE7 (Putative flavin-containing monooxygenase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FMO2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 5.5e-87 Identity = 197/503 (39.17%), Postives = 274/503 (54.47%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q01740 (Dimethylaniline monooxygenase [N-oxide-forming] 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FMO1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 3.2e-34 Identity = 137/525 (26.10%), Postives = 229/525 (43.62%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P36365 (Dimethylaniline monooxygenase [N-oxide-forming] 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Fmo1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 134.8 bits (338), Expect = 2.8e-30 Identity = 139/537 (25.88%), Postives = 229/537 (42.64%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5REK0 (Dimethylaniline monooxygenase [N-oxide-forming] 2 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=FMO2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 4.8e-30 Identity = 134/523 (25.62%), Postives = 227/523 (43.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DX31 (Flavin-containing monooxygenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490485 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1085.1 bits (2805), Expect = 0.0e+00 Identity = 522/522 (100.00%), Postives = 522/522 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KG35 (Flavin-containing monooxygenase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G125250 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1030.8 bits (2664), Expect = 2.0e-297 Identity = 489/522 (93.68%), Postives = 505/522 (96.74%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G853 (Flavin-containing monooxygenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451752 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 897.9 bits (2319), Expect = 2.0e-257 Identity = 415/521 (79.65%), Postives = 471/521 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I797 (Flavin-containing monooxygenase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469789 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 897.5 bits (2318), Expect = 2.6e-257 Identity = 414/521 (79.46%), Postives = 469/521 (90.02%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4G0 (Flavin-containing monooxygenase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 892.5 bits (2305), Expect = 8.5e-256 Identity = 413/521 (79.27%), Postives = 468/521 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. NCBI nr
Match: XP_016900536.1 (PREDICTED: probable flavin-containing monooxygenase 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1075 bits (2781), Expect = 0.0 Identity = 522/522 (100.00%), Postives = 522/522 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. NCBI nr
Match: XP_004139954.1 (probable flavin-containing monooxygenase 1 [Cucumis sativus] >KGN46711.1 hypothetical protein Csa_021007 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1021 bits (2640), Expect = 0.0 Identity = 489/522 (93.68%), Postives = 505/522 (96.74%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. NCBI nr
Match: XP_038901456.1 (probable flavin-containing monooxygenase 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 944 bits (2439), Expect = 0.0 Identity = 449/521 (86.18%), Postives = 483/521 (92.71%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. NCBI nr
Match: KAG6604964.1 (putative flavin-containing monooxygenase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 889 bits (2298), Expect = 0.0 Identity = 415/521 (79.65%), Postives = 471/521 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. NCBI nr
Match: XP_022948057.1 (probable flavin-containing monooxygenase 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 889 bits (2296), Expect = 0.0 Identity = 415/521 (79.65%), Postives = 471/521 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. TAIR 10
Match: AT1G19250.1 (flavin-dependent monooxygenase 1 ) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 3.5e-113 Identity = 222/520 (42.69%), Postives = 313/520 (60.19%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. TAIR 10
Match: AT5G45180.1 (Flavin-binding monooxygenase family protein ) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 3.9e-88 Identity = 197/503 (39.17%), Postives = 274/503 (54.47%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. TAIR 10
Match: AT5G61290.1 (Flavin-binding monooxygenase family protein ) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.2e-14 Identity = 72/249 (28.92%), Postives = 114/249 (45.78%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. TAIR 10
Match: AT4G32540.1 (Flavin-binding monooxygenase family protein ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 2.4e-13 Identity = 66/243 (27.16%), Postives = 106/243 (43.62%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0024046.2 vs. TAIR 10
Match: AT5G07800.1 (Flavin-binding monooxygenase family protein ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.6e-12 Identity = 68/252 (26.98%), Postives = 112/252 (44.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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