HG10014877.1 (mRNA) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10014877.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr02: 21243790 .. 21253736 (-)
Sequence length510
RNA-Seq ExpressionHG10014877.1
SyntenyHG10014877.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCCTGGATGAAGAAGAAATGGTCTCTGGAGCGGTTACGGGCAGAACCTCCACATTCGTCTGCATTGAAAAAGAAGCAGGGTATGCTGAATAGATGGGTTGATGTGGCACATGCACCTGGCCTGAAGTCGTTGGGGCCTAATGTGGGCCAGTTGGGTGTGAAGAGTTTAGGTGGAATGTCTGTTAGTGGGGAGGTGGAAGAGTTGAGTCCTATTGTGACAGAAGAGTTGGCTATGGGTCTTTTGTTAATTTGACTTTGGGTTTACTAGCTAGTGAAACAGTGATTGGCCCCCTTGGTGGGGCAAGACCAAAGATTGTTGATGGAAACAAGGGAAATGGTATGAGGGATCCCTCACAGACTACTTGGGCATCCTTATTTAGGGCACCATCAGCTACTGTTCATGAGCTATTGTTTTATGTCACCAATGGACGTCAATAGGACTCGTTTTGTGGTTCCCGCAGAAGTTGTGGTTGAGGAAGGTGTTTCATTATGGGCTTGTTCCATGGTGGATCAGTTGGGGGATGGTAGGTTACCTTTTCAAGTGATCACACATTTGGTTGAAAGGGTGTGGGGAAAAGTGGAAGTACTGCTTATTACAATTCTGGAGAATAGTATGATTCTTTTTTAGTTTTGTCGTGCTGAGCCTTATGGTTGGGTTTTGGCCAATAGTTTGTGGCACCTTGGAGGGACGCCTTTATTACTTTGACGATGGACCCTAGGGCAGTTGGTTCACCAAGACTAATGATTAGGCAGGCCTGATTTAATTCTTAAACGACTTAATCGTGTTTTGGTGAATGATTTGTGGACTTCTACTCTTCCTCTACTAGAGGTTTTTGCTCATGCTTGGGAGGTGTCTGATCATTGCTCTATGGTGTTTGATGTTGGGGTCCAGTTGGTTCATTATCCACCTATTTTCCTTTTTTTTTTTTAATTTCTGGGCTGAGTCTGCTAATTTTGTGGATTGAGTTAGAGGCAATTGGAGGAGGTTTAGTGAGTTTGCAAAAGAATCTCCAAGCCTTAAATCCTATCTTGAAGGGTAAGTTTGGTCACCCAATTAGTGTGATTGGCAAAAAGGTGGCAGAGGCGAGGCAGAGCATGGAATTGGTGCATGTTGAGTTTGTTCATACCCTAATTCAATTGAGTTACATTGTCATGATAGGGAGGAAACTCGGTTATTTTGGGCTTGGACTTGTTGGGAGGAGACTTCTCTCCCCTCAGAAGTCGTGTGTGCAATGGTTATCTTTAGGGGATAAGAACTCAACTTTCTTTCATCGGATGGTTAAAGGGCGGGTGATTAGAAATGGTATATCCTCGTTGATTGATGGTTCTGCTTAGATGATTTCTTCTAGTGCTGACATTTCCTCCACTATTGTTAATTATTTTAAGACTTTGTTAGGCTCTTAGCATGCTTGGTATCAAGATCTCACTGAAGAGATTTTAGATATTGTGAACTTCTCTTGGCCTAAAGAGTGTAGTGAGGTGTTGTGTCAGCTTGTTACTCAGGATGAGGTTCGAACTGTGTTATTATCGATGAGGAGTTGGAATGCTCCTAGTCTAGGTGGTTACTCTGTGGGTTCCTTTAAATCTACTTAGAATGTGGCTAGTCAGAAGTTTTATACTTCTTCCATGGAGACTTAAGTCGATCTCTTATTGTAATGTACTATATAAGTGCATTTTGAAGATTCTTGTAAATCGGCTTTGTGTGTGTCTTCCCTACTTCATTAGCTCTAATAAGTGAACATTTATGAAAGGTCAGAGTATTATGGATAATATTATGCTGTCAGGAGCTGGTAAGGGCTATCATAAAAATGTTGGTAAGGGTCGATGTATGTTGAAGGTGGATCTTTAGAAGGTTTTATGACTCTAGTCATTAAAATTTTCTTTTTGGCACCCTCCTAGCTATTAGTACTCCTTGTAAAATTGTGAGTTGGATTCGGGCCTGTATCACTTCTCCAATGTATTTTTCTCTATTAATCGGTCGACGAAAAGGTACTTTCCTGGGCTGAAAGGACTTCGACAAGGAGACCCACTTTCTCTGTATCTCTTTGTGATTGTCATGGAAGTGTTGTCTCATCTTTTGAATTCCCCGCCCCTTTCTTTTCGATTTCATCATCATTATGATCAGATTTGACTCACTCATCTTTGTTTTGTGTATGATTTGATGATCTTTTATGCTGGGGACTGTAGTTCTTTGGCTTTTGTGAAGACTACTTTGAGAAGGTTTCAGGTATTGTCTAGTTTTATTGCGAATGATGGTAAGAGTTGGATGTGTTATGCTGGTATGACTATTGGTGAAATTGAGAGATTTTCTGCATTTGTGGGATTCTCGTTGGCTTCTCTCCCTATTTGTTACCTTAAATTGTCTTTTATTTTGGGTAGACTCTAGTATACAAATTATTTGCCTCTGTTGGAAAGAGTTACTTTTCGAGTGAAGAGTTGGTCTATTAGTTCTCTGTCTTATGTTGGTCGGTTACAGCTTATTTGGTATGTTCTGCAAAGTTTTCAAGTCTATTGAGCCAATGTGTTTGTTTTTTCTTATAAAGTTATTCAAGATTTTGATCGTTTGGTGTGTTTTCGATTTCTAGTGCCTGGGAGTCATTATGTCCTAGACATCCTGTGGTGCCTTGGGCGAGCCTCCTTTGATTTGGAGGTAATATTCTCAGGCACTCCTTCATTTCTTGGCTGGCTATTCAGAATCATTTGCAAACTCGTGATCATGTTTATCGACAGTGTTATGATATCCCTAGTGACTGTGTGTTTGTGTAATGATGGTGTTGAGTCTAAAGATCATTTATTCTTTGAGTGTCCTTTTAGTAAGGCTCTTGTGAGGTAGGTGCTCCCATAGGATTTCGTATTAGGATACAGAGCACTTTTGGATTTGTTAGTTTAGCTTTGAGAAGCGGCTGAGGCGTAAGGTTAGGAGAGTTGTTTGGTATGTTGTTATTTACCATGTTTGGTGCAAGCGTAATATGCGTGTCCATGGTGCCACTGATCGACCAAACATGTATGAGTGATGAAAATATAGAATAAGTAAGGTCTACGGCAAGCATACACAATCGATGAAGTAATAACTTGGAGTATTCCAAGTATCGAATCCCAAAAGACTAGATTGAGTTAAAATTCATATGACTGTAAACCAATGTAACCGAGGTAACCAAAGAGAGTTTTAGAATTTTGGTGAAAGGAAACGTAAAAACAACTATCAGTGAGAATCAAACAGAGGTAACAATGCTATGACCATTCGGGTGTTATGCCTTAAGTGATGTGACCGCATCACACCAAACAATGATTTACACATAGACAGGAAACTACACCTACTCGGTCTTGTATCAAGTTCCTTTAGGAGTTCTAAGCAGCTAATGCCTAATGTTTCCATGGTTAGCTAGATCTTAGATTAAATCAAGTTCAATTCCTTTATCCTATGGTGTCCCTTATTTCTAAGGCAACATGACCATCTTATGTCTAGGCTCTTAGCCCCATATCCCTTTGTGAAATCCGCCTACACCCTAATCTTCTCAGTATTAAAGCTCCGCTAGATCGTTAAATCAAATGGTCAGTTTAAGTTACCGATTTTATCTTTTAAAATCAACAAAGAGAATGTGATTACACAAAGTGGTATGAGCATTACATAACCTAAGCCATAACAACCCTAAGGCTTTCACATTGTCAACCCCCTAAAATATTTAGCTCATGGCTTTTGATAAAATAATCATTTTTATTAGATCATCAACCATAACTACAATGTAACGTTTGATTGGGAGAATATAAAATAGAAAATAACACAAAAGTAATAAAGCTGGAAAATAGAGACAACTCAAGTAAACTTGGGAAAATCTTTAAGTACAAGCCTTTCCCTAGGACGATTCTTTCTTTTTCAAGAAAGAATCTTGCCTCAACGCACAGAAGAGTAATCCTAGAGTCGCTACGCCTCAGAGGAACTTTCGTTCTTAAGACTACTGGCTTGAACTTCAAAGAGAATCCCAAGGTGTTGGAAAATTGACAGTGAGATGGAGAATAGAACTAATGGCTGCGGCGGTGGTGAGCTCTCTCCAAGACGTAGGGTTTCTTCTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTTGTATTTTGACTGCCATTAATAAATGGTTATCCATTATTATTCAATAAATGTTATTGATTATTTTATCTTGTTTTAATAACCCTAAAATCCAATAAACTAACATCCTAGGCTGTTTTATGAGTCTTGAACAATATGTAGAGACATATAGAGATCAATGTTTAAGTTACAGCCTAAAGGGTCTATAGTATAAGGATAGGGCTGGGTACCTTATCCTGGTAACACTATGGATACGGCCCACTTTGTATTTGATACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCGTGTAGGAGACATGCGAGTGGAGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTAGACCACGAAATAGTAACCACTAGATCTAACTCCGTTGACTGGTTAGGTTTCTATTTCAATAGGTTGACCTAGGCAACTTAGTCTTAATCTTGAGTATATTATGAACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCCCGTTTGCCGACTCGATATGCCTACCATTTTGGGGACAAGACTGAGTGGGGAGCTGGGAACATAATTATACAAGATGGATTTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGTAAGTAGATAAGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGGGACTTGAACAAAGGGCCCTACCCTCTCACTGGCCCGAGAGGGGTTTCTGTTTGATGGTTGGACCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATTTAGAAGTAATCCAGGGGTATAACGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGAACACTTGTGAAGGACTAACTTGCTGTTATTGGTCTATATCCGTGGACACAGAAATATATCTACAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGCACCCACAGT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mRNA sequence

ATGTCCTGGATGAAGAAGAAATGGTCTCTGGAGCGGTTACGGGCAGAACCTCCACATTCGTCTGCATTGAAAAAGAAGCAGGGTATGCTGAATAGATGGGTTGATGTGGCACATGCACCTGGCCTGAAGTCGTTGGGGCCTAATGTGGGCCAGTTGGGTGTGAAGAGTTTAGCTAGTGAAACAGTGATTGGCCCCCTTGGTGGGGCAAGACCAAAGATTGTTGATGGAAACAAGGGAAATGTGCCTGGGAGTCATTATGTCCTAGACATCCTGTGGTGCCTTGGGCGAGCCTCCTTTGATTTGGAGGAGGAAACCAACCAACAATTGTCAACTGTTGTGATGAAGATTAGGCCACCACAATTACTTTTCATCCATGTTCCTTGTCAACAATATCCTTGTACAGGACACTGCCAACGACCAAACACCGACAACAATGTCACCGTCGACTACTTAGTGTCACCTCACTTCGGCGACATGCTTGAACGACCACCTTCAGCAGTCAAGCTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCCTGGATGAAGAAGAAATGGTCTCTGGAGCGGTTACGGGCAGAACCTCCACATTCGTCTGCATTGAAAAAGAAGCAGGGTATGCTGAATAGATGGGTTGATGTGGCACATGCACCTGGCCTGAAGTCGTTGGGGCCTAATGTGGGCCAGTTGGGTGTGAAGAGTTTAGCTAGTGAAACAGTGATTGGCCCCCTTGGTGGGGCAAGACCAAAGATTGTTGATGGAAACAAGGGAAATGTGCCTGGGAGTCATTATGTCCTAGACATCCTGTGGTGCCTTGGGCGAGCCTCCTTTGATTTGGAGGAGGAAACCAACCAACAATTGTCAACTGTTGTGATGAAGATTAGGCCACCACAATTACTTTTCATCCATGTTCCTTGTCAACAATATCCTTGTACAGGACACTGCCAACGACCAAACACCGACAACAATGTCACCGTCGACTACTTAGTGTCACCTCACTTCGGCGACATGCTTGAACGACCACCTTCAGCAGTCAAGCTCTGA

Protein sequence

MSWMKKKWSLERLRAEPPHSSALKKKQGMLNRWVDVAHAPGLKSLGPNVGQLGVKSLASETVIGPLGGARPKIVDGNKGNVPGSHYVLDILWCLGRASFDLEEETNQQLSTVVMKIRPPQLLFIHVPCQQYPCTGHCQRPNTDNNVTVDYLVSPHFGDMLERPPSAVKL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
HG10014877HG10014877gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10014877.1-cdsHG10014877.1-cds-Chr02:21243790..21243896CDS
HG10014877.1-cdsHG10014877.1-cds-Chr02:21246214..21246310CDS
HG10014877.1-cdsHG10014877.1-cds-Chr02:21251085..21251149CDS
HG10014877.1-cdsHG10014877.1-cds-Chr02:21253398..21253466CDS
HG10014877.1-cdsHG10014877.1-cds-Chr02:21253565..21253736CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10014877.1HG10014877.1-proteinpolypeptide