HG10014802.1 (mRNA) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10014802.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr02: 20186344 .. 20189548 (+)
Sequence length219
RNA-Seq ExpressionHG10014802.1
SyntenyHG10014802.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGGTTGAAGAAGAGGAATCTCAGTTATTTGAGTTTGTGTTGGTTGAGTTTGCACTTTGCAGTAAACAGAAGAAAACAGGGGAGGGATTTGAGTGGATGAGAGAATGTGTTGTACTTGTAAACGGTAGGTTAAAATGAGTCAACTTATTTATTAATATAGTAAAATATCATCGATAATTGACATTGATAAACTACTATTATTTATCATTTATTAGTGATAGATATTGATATACTAACATTTTGTAATATGTAACAGTTTTGTCATTTAAAACAACTACCTTTATATATTTCAAATATTCAATTTTAATTATTTTTTATTTTTAATGTTTAATAAAACTCTTTATTATAGGAAAATTGTTGTGTATAGAGAAAAAACAAAACTAATTACACATATAGAAAAAAGTGCACTCCATACTTTTGTATTTCTCACTTTTTTTCTATATGTGTAATTAATTTTGTTTTTTTTTTTTCTATTTGTGAAAAGACCCCTTTATTATATCTATTAAAATTTTCACTATAAATGTAAAAACATATTTATAATATTTTTTTTATAACTATTTGTATTATTTAACCATTTTTTTTAAAAAAAAAACTAAACTTACGATTTATAGAAAATGAATATATTAAAATTAAACAAATCCTAAAATACTGGATCAAAATTATATTTTAACATAAGTTGTATTAGGTTAAAATATCATTTTGGTATCTATACTTTGGAGTTGATTCAATTTTAGTTTATATATTTTAAAATGTCAAATTATGGTATCTGTACTTTAAAAAAAAATCTTAAATTTAGTTCATAATGCTAATTTATTAAAGACTTTACTTAAAAATATTATTATCTATTAGTATTTTCACTATAAATTTTGAAAACATATTGACACATTCTATTTGCTTGCATGAAAATTATTATTATTATTATTTAACTAATTTCAATAAAAGTTAATTTGAAAAGACTAAAGTTTAGGATTCTTTAAAAATATATGGACTAAAATTAAAGAAATTTTGGAGTAGGACCATCATTTTAGTCTTTTTATTATAATTATTATTTTTTTTTCTAGGCTATAGAGTCCTTTACGCAGGCCCCATTCATTCAAAAGTTTGTGCGTTGGTATTCTCAAAATATAAAATTGAGGACAGCAATTCTCTTTTCTTACTAGAGTTTGATCAAATTTAATAACTTAGGATTAGAATAAGAGGAAAAATTAATATGTTTTTTCCGAGTTTGTGGTGTGGGTTTGGCATCTAATACGAGTGTAGGCTTGGACTTGAGTCTTAAAAAAATTATGTTTGTTATATAGGTCTAATAGGTGTGTTTCTTTTACTAACCGTGTAGAGAGTTTGAATAAGTTGCTATGATAGTCTGTTGGTTTCTTTAACTAAACTCGAATTTAAAAACGTGTTTCCTACATTTAACGGAATAACCACAAAGACACTTTTATAATTTCTCTCTCATACATTAAACAGTATGCAAAACCGTTCGTCTTTATTAAATAATCTTTTTTTTTATGCGGTTTGGAGTTTAGTAATTCGAATTCACCCTAAGCTCAAATTTCACCCTAAATTGTCTGATTAGGTAAGCAAGTTGTGAGAATTTTTGGGATGGGATGAGATAATTTTGGTAGGTAGGTATTTTTTTTCATTGTGAATTTAATTGTGTTGTTATTTTTTGGTTGAGTTGGGTGTTTTTTTTACCTCCTGAGTTTATGGTTGGACTTAACTTAGGCTATCAATATTATTATGGTGGAGAATATTTCTCCAACTTTATATTGGTAGGTTGGTTCATGAATAATTTCTAATTTAATGTGAAAATTGATTAAATTTAAAGATTTCAAGTTAAAGTAAAAAGATTTTTTTTAAAAAAAAAGCTAAATTATACACAATATCCTTAAAATTTGTACTTTGTTTCAAAAATACTCTTGAACTTTCAAAAGTTTCAAAAATATCTTAAAACCCAAAAATGGGTTAAAAAATATCTTTACCATTAATTTTGGATGTAAATTGTTAGTATTTTGTGTCAAAAATACCCTTGAACTTTCAAAAACTTCAAAAATATTTTTAAACTTTAAAAAAGTTTAGTAATACCCTTCCTTCTCTATTTTCCATCTTTTTTCTCACCTCGCCCTTCTTCAATATCCCTCTTACTCTCCCTTTTTTTTTTTTGTTGACTATTTGACATTTGTTTATCTAATATATAAAACTGCACACTTAGTTAAAGTATATGGACTATAAAAAGAAGAAAGAGAATAAAGGAAGTACCAAAAAGGATTTTAAGATTTAAATGTTTTTAACAAAGTTGTACATTAGTTGAGTGTGTGTTAATACCAACTAATTTTTTTATTTTACAATTATCGTTCCTATATGTTTTAAGGGGAGATTTTGATTTTGGAATTTTTTGAGATTTTGTGTGTGTTATGTTTGGTTTTATTTTGGTTGCTGAGAAAATTGGTGTAAGCTAAGAATTGAAAAATTAAGAAAAATTTGAGAGCATCTATATGAAAAAAAAATTGAGAATATCTATATAATTTGTTTTAAAATTGGTTTTTTTCGAACTTAAGAAAACTTCAAACAAATTGATAACATATTAATGGTAAGAGTATTTTTAAACTTTTTTTTTATAAAATTCTTAAAGTTATTTTTGCAACTGAGGTATTAATGTTTTCTGTTCATATACTAACAGTAAATGTATTTTTGAACTTTTTTAAGTTGGGTATTTTTTTAACTTTTGAAAGTTTACAGATATTTTTGAAATAAAACTTTAACAGTTTCCATCTAAAAATAATGACAAGGGTATTTTTGAACTCCTTTTAAAAGTTTAAGGGTATTTTTTAAACTTTTAAAAGTTTATGGATATTTTTTACACAAAATTCAAAGTTGAAGGGAATTTTTTATAATTTAGCCCAAAAAGAAAAAGTTTTTGCCTCTCCCCCGTTTTGCCAAGTGACCATTGAAGACTCATCCCAATCATTTTTTCTCATTCTTTTTTTGGAAGCTGTATGTTTAAGTTAATGGGAGTGTATACTTTATTGAGGTAGGAGATTCAAATCTAAATCCACCATTATCAAACGAGTTTTCATGATGGGAACACATGGGTTTCCCTTCGCCTTTAGTGACGTTAGCACTTACCATTGACGATGAGTGTGAGAAAGTTTCAGGCGGCGATCTTGTTGAAGATGGCAGTGGCCATGGTAGTTTCTCCTAA

mRNA sequence

ATGGAGGTTGAAGAAGAGGAATCTCAGTTATTTGAGTTTGTGTTGGTTGAGTTTGCACTTTGCAGTAAACAGAAGAAAACAGGGGAGGGATTTGAGTGGATGAGAGAATGTGTTGTACTTGTAAACGTGACGTTAGCACTTACCATTGACGATGAGTGTGAGAAAGTTTCAGGCGGCGATCTTGTTGAAGATGGCAGTGGCCATGGTAGTTTCTCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGGTTGAAGAAGAGGAATCTCAGTTATTTGAGTTTGTGTTGGTTGAGTTTGCACTTTGCAGTAAACAGAAGAAAACAGGGGAGGGATTTGAGTGGATGAGAGAATGTGTTGTACTTGTAAACGTGACGTTAGCACTTACCATTGACGATGAGTGTGAGAAAGTTTCAGGCGGCGATCTTGTTGAAGATGGCAGTGGCCATGGTAGTTTCTCCTAA

Protein sequence

MEVEEEESQLFEFVLVEFALCSKQKKTGEGFEWMRECVVLVNVTLALTIDDECEKVSGGDLVEDGSGHGSFS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of HG10014802.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10014802.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10014802.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10014802.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
HG10014802HG10014802gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10014802.1-cdsHG10014802.1-cds-Chr02:20186344..20186470CDS
HG10014802.1-cdsHG10014802.1-cds-Chr02:20189457..20189548CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10014802.1HG10014802.1-proteinpolypeptide