HG10011195.1 (mRNA) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCATTCAACAGATGAACACTCAATGGAGTCGGTTCCTGATCTTCAAAATTCGATGTACCTAGCGGTTGATGGTTATCCATGCATTCGACTACTTAATCTTTCTGGAGAAATTGGCTGTTCAAGTAGGTTCTTTTGCACTAGATGTTGAAAATCAATTACTTTTTCTAGTGCCAATGTAATCCTCAGTGGAATATGGTGGTATCATCCATGTCTTTTTACTTTGTACCTCAGATCCTGGACGAGAAAAGGTTGTAGTTCCAATGATTAACTTCAAAGATGCTAATGAGATATTGCAGCCATCTGCAATTTTAGTTTCAATGGATGAAATCTCGAGTTTCTTTACTAGGTGGGACTTACATTTTTATATGTACTCCCTTGATTCATACATATTCTCGTTTCCATATAAGGATTATTTTCTAGGCTTGGGTCTAAAACACTTTCCAAACCTCCCGATGAAAAACTAAAGATAAGTGAAGATACAACCTGCTTTTGTAAAGGAAACAAAATTTTTCATTAATGAAGAAAAGAGTACAAGGGAAAATGAAAAATAGACTACAATGGGTAGACTGAGAAAAGAAAGAAAAAGCATATGGATGATAAAGACAAATAAAGCAAATAAAGTTTAAAACTACAAGAAAGCACCCCAATTATAACAAATATATTGGGAAGAGTAACCCTTAAAAGCTTTTGAATGGGAGCATCAATGAGAAGTTTTAATCTTGATAAGCTCATAACCATCTCCATGAATAAAATTTATCCTCGAAGATTCGTTGATTTCGTTCCAGCCAAATGTCTAAAAGAATGGCTTTTGAACATTGATCTATATAAGCTTAGGTGTGATTGGAACAAGTGGAAAACAAAGAATTTGAAATATATTGCCATGAACATCTTCACCAAAAAGCCTATATAGAAATAGAGAACAAAGAAAACCAGCAAATCTCGAGAAAGAACACAGATATGAACTTTATCTTTCAAAGCTGCAAAACACATAGCAAAAGGAAGGAGATAAAGCCAGAAATGGAATCTTCTTTTGGAATTGGAAAAAAAAAAGGTTTGGAGTGGAATAATAACTAAGAAAATCGAAATCTCCTTTGGATCTCTTGTACTAAAATCTATCACCACTTGCGATGACATTCAAATAAAAAATCCTCAATTGCACTTTTCCTTGCATATTTTGTGAACTGTTTCTCCATTGGGATTATATAAATGATCTCTCCTCATTAGAATTGGTAGAGAACTATATACTCAGGTAGAATTCATTTACCTATTTCAGACTACAGGAAGATTTGCATTTTGCAAATAATGTTGGCGGTGTTTTAATCGAACCAGGAACTGAAATACAAAATAGAATGGAAGGTAAAATTCACTTACTTATTTAGGTTCTTTCCCCCCTTCATTTTCTTCTTTCCCGTTCTCTCTCTCTCTGTGTTTTTTTCTTTTTTTATTTTTTTTTTGGTTGTAATTGTGTGGTAGTTCAGGCAGGCACATCAATTACTGACGTGGTCATTTATTTTTGCTTGCAGGATTTTCTCCTGCCCAAAAGTTTCCCCAAGCTAAATTTGCTCCCTATAAAAAAATTGACTATGAATGGAACCCAATTGTATGTTTGAATATCCTTACAGTATTCTCAGATTTTTTAGGAGTGGTCAACTTTTAGAAGCTTTTTACTGCAAAACTCTTATTCTGTTCTCATTTATAAAGCTAGGCATCAATCTACGAATCCTTGTTTGATATCATATCAGCCATATGTTAACTATGACTTATTCTCAGCTTTCCCCTCACTTTATTAAAGGATTCCTCTGTTTAAGATCATTGCACCATCAATCAGGCATGTCAGTTATGGATTTTTGAGGAAACCTAAAAGAGTGGAATTTGCAGAATAGGTTGATCTGAACCTCACTCTTTCTACTGTCTGGCTTAATACCAGCAAAGATAAATGGCTTTCACTTTGGTGGCTCGTGAAATTTGGGTTTTCACCATAAAATCATTAATCAATGTTCTTTCAACTATACCTCGGGGGATCCTCAGACTTATAGAAGCTGATTTTGGAAGGGGCTCTTTTAGAAGAAGAATAAATTCTTTCATGGGATCAACCTAAATTGAATCAATACAATGGAAACTTTTTTATAAAAAGCACTCTTGAAGCCAACTTGTGCATAGGTTTTTGGGTTGGCAGCAGGCAAGTTAGTATGGTTTTGAGCTTCTTTTTTAGTTTCCTCTTGCTTTCAAAGCTCTATGGCATTCAACTCTCAAGTCTTGGACTTTGCTAGAAGATTTGTAGATTGAAAATTTTTGTTTATAGGGAGTTGTATAAAGGATTAGTCTCCTTTTATCTTTCATCTTGTTCTTGTTGCTCCATTTTCTTTGATGTATTTTCTCTTTTCTTTGTTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATTAGACTCATTTCATTAATTCAATGAAAAAATCTTGTTTCCGTTTAAAAAAAAAGCCAACTTGTGCATAGCTCAACTGGTTTAGGGCCTTAGGCATATACTCTCGACCAAAAGGTCAAAAGTTTGAATTAATACCCCTGGATTAGTCTTTCCCCATATTGGTTAAAGACACTTTGATTATGAGACTCAAGACCATCTCTTCATACATGACCGTTTTTCAAAAGACCACCTCTAATTGGTTTTTCAAGCCGCCTTTGACCTAAATGACAGTTGCCCACTCTTTTCAGACCATCCCTTCTAAGAGAAGAAATAGGTGCGTTGGGTCAATATCAGCATGGTTTTCTTTGCATTATTTGGAATGAAAGGAACAACAAATTTTTTTCATGACAAATATAGAACTACTGAAGCTTTGATTGACATTGACAACATTCTTTTTCTAGCTTTATATTGGTGTAAACATGTCTCTCTTTTAACAATTATGGTTTGAGCACTCTAATATTCAATTGGTGAAGTGTTTTGTAACTTCATTTGGTTGCGATGAATGATTCCTTCTAATATAAATTGGGTCTCAATCCATTCTACTTTTGAGTATCTATCTAAGTTTTCTTTGTAATAGGTAGAAATAGAAACATGGCTTTGCTGGCAAGGGGGTTGGGGATTTATCTTCGAGGAGGAAGCTTTATGGCGCAAAGTGGTAGGGAGTATTCATGGAAGTGGTTCACACAATTGGCATACTTTGGGTAATTATGGAAGAAGTCTTCGAAGTCCATGGATCAACATTTCTTGAGCTTGGCTACAAGTAGAATATCTCGCTTCCTTTATACTTGACAATGGAAGAAGGATTTCATTTTGACGGATACTTGGCCGAGAACTTCTTCTTTGAGTTTTCTCTTCCCAAGTTTACTAAAAATTGCTTCTAATCCCAAAGATTCTGTCCTTGATCATTGGGATCCAGTTACTCAATCATGCACAATCACATCTAGAAGATTTCTGAAGGAAGATGAAGTGTTGGAGTTTCAGCGGTTATTGGCATCTTTAGAGGGCCAAAAGGTGGTTGATAGAAATGATTCTAGAAGCTGGAAGTTGGATTCGTCAGGTTCACTTTCAGTTAATTCTCTTTTCAAGCATTTGGTGGCATCTCCTCCCATGACTAGATGCCATGACTAACAAGTTGTATAAAGCTTTGTGGAAATCAAACTGTCCAAGGAGAGTTAACGTTATTATTCGGGTTATGATTTTGGGGCGCTGAATTGCTCAAATACTCTTCAAAGGAGGCTTCCAAGTCACTCACTCTTGCCCTCAATTTTTCCTCTTTGCTTGTTGGAATAATGAAGATTCTCTGCATCTATTCTTGGGTTGTTGTTACTCCATAGAATGTTGGAGGAAGCTTATCTCTTTGTTTAATCTTCAATGGGTCTTGATCGATGATTTCAAGTCCAACGTCATCTAGCTTTTAGTGGGCCCTTCATTAAAAGCCTAGGCTCAAATTTTGTGGGCTAACATGGTTAAAGCTATTCTTTTTGAAATTTGGTTTGAGAGGAATGAACGCATTTTTCAAGATAAGTCACATCCTTAGTTTGATCGTTATGAGATTACAAGAGTCAAAGGCTTCTACATGGTGCTCTCTTTCCAAATATTTTGCAGACTATTCTATCCAAGATACTTGTCTAAATTGGAATGCTTTTATCGTTTCTTCTAATATTTGAATCTTTGTTTAGTCTTGTATTACTTGCTTTATATTCGTAAGTTTGAGTTTTATGTTTCGTTTTCTCTTCTGTACTTTGAGTATTAGACTCATTTTATTAATTCAATGAAAAGTCTTGTTTCTGTTTCAAAGTGAAATATCACTGGCCTTCATTTCTTATTTGGCTCGACAATCTGTAGCATCTAACAATTTGCACTTGCAGGGATCGGGAATTATGTGGAATCAATATAACTTTCCTGTTTTCTTAATATCTGAGAGCAGCATTTCATCTATACAGGAAGTAATTCTGATAACTTTCAACTGTTAGATGTTTTAATTACTATTTGAGAGTTTGGCTCAGTTGCTATATGCTTCTCTCTGGAAATCAAATTTTTATTTTGATTTTTCTGATGGTAGCCATAGCCATTAAGCGTTCTTTAATAATGTATGGTTCTTTGTCATTAGAATAAGATCATGACGTGTTTTTATAATTCTTATAAATGGTTAAGGAGAACCTACCTTTACAGATCATGATTCTATGTTTCTTTGTGGGCTTTGGTTATGATGCTTTTTTGTAATTATTTCCTTAGCTTTATTTTGCTTGATTGGAGACCTTTCTTTTAGGTAGCCTCCTCTTTTTTGTGTGCCCTTACATTCTTTCCTTTTTTTTGAAAGTGTGGTTATTCATCACAAAACTGAAACACAATATGTAAACCTCACCAAATAACAACCCAAAGCAGAAAGTAGAAATGTTTTTGAACCAGTGCATGTGACTTAGGGTTGAAATTCATTGATGTTTTGCAATTATGTTTGTATACTGAATTAAAAGAGGACAGCTTTAGTTTATATTTTTCTGAAGCTACAGAACTTACGTATGTATAATCAAGGACAGCATTTT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BLAST of HG10011195.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038896057.1 (nicastrin [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1164.8 bits (3012), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/649 (91.06%), Postives = 609/649 (93.84%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. NCBI nr
Match: XP_004140732.1 (nicastrin [Cucumis sativus] >KGN57470.2 hypothetical protein Csa_011284 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1130.9 bits (2924), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/649 (88.60%), Postives = 594/649 (91.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008457115.1 (PREDICTED: nicastrin isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1127.1 bits (2914), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/649 (88.14%), Postives = 597/649 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022997757.1 (nicastrin [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1108.6 bits (2866), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/646 (87.00%), Postives = 591/646 (91.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023525268.1 (nicastrin [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1108.2 bits (2865), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/646 (87.00%), Postives = 593/646 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUM5 (Nicastrin OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g52640/At3g52650 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 803.5 bits (2074), Expect = 1.7e-231 Identity = 409/644 (63.51%), Postives = 494/644 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F0ZBA6 (Nicastrin OS=Dictyostelium purpureum OX=5786 GN=ncstn PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 1.6e-40 Identity = 157/647 (24.27%), Postives = 280/647 (43.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54JT7 (Nicastrin OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ncstn PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 161.0 bits (406), Expect = 4.3e-38 Identity = 166/686 (24.20%), Postives = 301/686 (43.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92542 (Nicastrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCSTN PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 1.0e-23 Identity = 165/684 (24.12%), Postives = 263/684 (38.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P57716 (Nicastrin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ncstn PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 3.0e-23 Identity = 131/494 (26.52%), Postives = 208/494 (42.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4C7 (Nicastrin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496866 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1127.1 bits (2914), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/649 (88.14%), Postives = 597/649 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K5Z2 (Nicastrin OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1108.6 bits (2866), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/646 (87.00%), Postives = 591/646 (91.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GAI9 (Nicastrin OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452408 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1103.2 bits (2852), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/646 (86.53%), Postives = 592/646 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNM4 (Nicastrin OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013258 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1089.7 bits (2817), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/647 (85.47%), Postives = 584/647 (90.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4S1 (Nicastrin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496866 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1072.0 bits (2771), Expect = 9.3e-310 Identity = 551/649 (84.90%), Postives = 575/649 (88.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.1 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 803.5 bits (2074), Expect = 1.2e-232 Identity = 409/644 (63.51%), Postives = 494/644 (76.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.2 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 787.7 bits (2033), Expect = 6.7e-228 Identity = 409/673 (60.77%), Postives = 494/673 (73.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011195.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.3 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 674.9 bits (1740), Expect = 6.4e-194 Identity = 356/586 (60.75%), Postives = 427/586 (72.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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