HG10000421.1 (mRNA) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10000421.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr09: 5017168 .. 5020445 (+)
Sequence length351
RNA-Seq ExpressionHG10000421.1
SyntenyHG10000421.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTGGGAGGTCAATTTTGTATGTAACTGATATTTTATACATATGTCCACCAACAGTGCACTCAGCCCTCATCAGTCATCACCATCGATGTCTCTCGTTGCCATTTCAGCGACTTCCGTCGGTGGCCAACTCCAGCCACATTCAATCACCACCGTCGACAGCCAACTCCGGTAACCTCCAATAGCTGCCACCTCCACTAACTCAGACGACCATTATTTTAAATTATTAGTTCATAGTATTTTATAGTCGTTTTTTTAATAATATTTTGACATTAATAAAAACACTTTTAACATATAACAAATCAAATAAAACTTGTATAAAAAACACATTTGAGAAAGACTTGTCAAACACATGAGTATTTTTATTTTAAACAATTTTTATCAAAAGTTTTTAAATGAAAATGACTTTTTGAAAAACATTTTTTCTAAGTTAATCCTGACAAAAGCTTGTATGATGGCAAAAAGAGGAGTATGAAATGGAGTTTTGGAGGCTGAAGGAAGCTGTCGAACATATCTATCAGATAGAAGATTTGGATGGATGTTAGTTATGTATTTTTTTTTTATGTGGACTTGGTCATTTTTTGGCCCATATCATATGTAAATTTGTTTGTATCATATACTGAACCGGAGAATATGACCTTTGTTACATATTTTTTTATGCCAACCATGCAAATATTGCCATCAATAGGGTCATTATAGTACAATTATATTTTGAGGATATTTCACTTACAATATAAATCCAAATTTGTTTTGTTCCAACGAATCCAATATAATTTTGTCCAACTTAACTTGAAACATTACATGCACAAATTTGCAAAATAATTTCTTAAATTAAAAAAAATTGAAATGCATTAATCAAAAGTAAGCCCTAAATCTCATTTTCCAAAACTTCCAACATTACATGTGTATTTTTTTAAAAAAAAAAATAACAATAAAACAAAATGTAATCCATAGTTTATTAAAAAAAATATATGTGTACAATTATTGAATAAAAAAGTTTCAAACAAAAATAATCACCATAAAAACATATTATTTAGGTCATAAAAAACTACACTAGATGCCCCTGACATATGAACTCAACTCAGCACCCTAAATACCCAAAACACAGACATACAAACATATAGACTCAACTTGGCGCCCCAAAAAACCTCATAATGAAAAATCTCATCAAAATTAAGGGTCTCTTATGATTGACTAGAGAAGAAAGTGTTTTTCAAAAAACTCATTTTTATTTAAACTCTTTTGATAAAAGCTGTTTAAAATCAATTTTAAAAGTGTTTCAAAAGCTATTTTGAGAGGTTGTCAGACACTTCAATTTTTTTTTTTCAAAATGACTTATTTTAAAAAATCAAATACTTAAAAAATTAAACCAAACACACCTTAATTGTCAATTTTTATAAAGTAATGATTTAGTTTTCGTAGTTTATAAACACATTGTGTTATGGTGTCTAATCAATTTTTCGATCTACATAGGAAAATAATCTTGCCAAATTCTAACATTATGGACTAAATCATTACAAAATTTAAAATACATAAGGATTAGATTCTTGTATGCTAAATTTCATAATTGACTAAATTGTTGTCAAATTGTGTTAGCAAATAGGTGATTTGATTTTGAATAATATGAATTAATGAGCATTTGATTTTGAATAATATGAATTAATGAGCTAGCATAGGCAGGTATTGAGACATCCTATATTAGCTTAGAAGTCTTTGGTGGGTTACAATTTGACAATAAAATAAGCAAGACATTTTTTCTATATATAGTCAATGTAAATAAAATGGATCTTCAAAATCTAATGACAAATATAAATTAAGCCTAAATTTTAGAGAAATTATTATAAATGAAAAAATATCAAACTATTTATAAATATTGAAAAATTTCACTGTCTATTAGCGATAGACGACCGCGATAGACTTATATCACTGAGAAATCTATCGCGATCTACCGCCTAGTGATGAAAGTCTATTGCGATCTATCGCAGTCTGACGCTAATAGACACTAAAAATTTTCTATATTTATAAATATTTTGGCTCATTTTTCTATATTTAAAAACTAACTCTAAATTTTATAACAAAAAGTAATTTTTTTTTTAATTGTAATACTCTATTTTTAAGTTGATAATGCATGTCTTTATTCATTAAATTATATTGATATTGATAATCGAAATTTAAACTTTATTAAATATTAAAAAAAATATCAAAATAATGTAATTGGTCTAACATAAAATATATTTTTCCTCCCTTAGACTACTTGTCAAGATCAAATGAGTTAAGAATTAATATTCCTAAACTTTCTCACACATTGGACATTCCCATTACTTTATTTAAAGTTTGTTTGAAAATGTTTCAAAATAGACCATTTTTTAATATAAAAAATTACACAAAATTAGTGTATATCAATATAATTTGACTTAAAAGATTGAAGTGATCTAAGTTGATTAAGAAAAGGTAATATGAAGATTCAAATCTCTATGCTTTACATTAATGTGTAAGAAAAAAAGGTTAAAAAATATCTAAAATATTTCAATTTAACAAATTGGTTGTTATTGAATTTCAATATATTTTCTTTTATTTTCAATACATCATTAAACTTAAATCGGTTGGATAACAATTTCGATATTGATTTTTTTTTTAAAATTAAACTTATAAATACTACTTTGTTATTTATTTATTATCTACTTTTTAAAAATGTTTTCAAAACTAAATTAAAATTTGAAAACTAAAGCAAATAGTTTTAAATTTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGGTTTGATCTTAGAAATTAAATGTATTTTTAAGGGGAAAAAACTTGAAACTTAGTAAGATAACAAGTATAATTTTCAGAAATTATTATTATTATTATTATTTCATTTGACTTTGTGGTATTTGTTTAAATAAATTATAAGAATTAAAGCTAATAACTTATTTAAATAATTCAATTGTTTTTGGAAGATTGAAATAAGGTTTTTCATAGGAGCTTATTCCTTCGGTAGTGTTTTGGTGCGATTGGATTATGGATTATTTAGAAGCATTTTTGGGTATCTTAACGAATGATAGAATTTTTTTTTTGTTTTTTTTATCTAACATGTCCCTTTTAAGTTAATTTGGCCATGTTAGGACCTCAGTTATGTATGTGGATGATCGTGTATGGTGAGGTGAGAGTTACTGGCTTTGGAATTGTTCGTCTTGATGTTGAGGCACGGGCGAGGGATGTTTTTCATGGTTTTCAGGAGAAGTTCCTTTTCGCCCTTGGTGTGGGAAAGTTCTGGTCATTTTAG

mRNA sequence

ATGTTTGGGAGGTCAATTTTGTATGTAACTGATATTTTATACATATGTCCACCAACAGTGCACTCAGCCCTCATCAGTCATCACCATCGATGTCTCTCGTTGCCATTTCAGCGACTTCCGTCGGTGGCCAACTCCAGCCACATTCAATCACCACCGTCGACAGCCAACTCCGTTAATTTGGCCATGTTAGGACCTCAGTTATGTATGTGGATGATCGTGTATGGTGAGGTGAGAGTTACTGGCTTTGGAATTGTTCGTCTTGATGTTGAGGCACGGGCGAGGGATGTTTTTCATGGTTTTCAGGAGAAGTTCCTTTTCGCCCTTGGTGTGGGAAAGTTCTGGTCATTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTTGGGAGGTCAATTTTGTATGTAACTGATATTTTATACATATGTCCACCAACAGTGCACTCAGCCCTCATCAGTCATCACCATCGATGTCTCTCGTTGCCATTTCAGCGACTTCCGTCGGTGGCCAACTCCAGCCACATTCAATCACCACCGTCGACAGCCAACTCCGTTAATTTGGCCATGTTAGGACCTCAGTTATGTATGTGGATGATCGTGTATGGTGAGGTGAGAGTTACTGGCTTTGGAATTGTTCGTCTTGATGTTGAGGCACGGGCGAGGGATGTTTTTCATGGTTTTCAGGAGAAGTTCCTTTTCGCCCTTGGTGTGGGAAAGTTCTGGTCATTTTAG

Protein sequence

MFGRSILYVTDILYICPPTVHSALISHHHRCLSLPFQRLPSVANSSHIQSPPSTANSVNLAMLGPQLCMWMIVYGEVRVTGFGIVRLDVEARARDVFHGFQEKFLFALGVGKFWSF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
HG10000421HG10000421gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10000421.1-cdsHG10000421.1-cds-Chr09:5017168..5017339CDS
HG10000421.1-cdsHG10000421.1-cds-Chr09:5020267..5020445CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10000421.1HG10000421.1-proteinpolypeptide