Cucsat.G19977.T4 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAAATAAGCAATGGGCACAAAAAAGGGAAACGGAAATAATTATAATAATTTATAGAAACGGCTTCCAAAGCCGAACTTCAGTACGCTGGTCCCTCACATTACAGAGATTCGACTCTTCAGAGCTTCGGAGAAGAAGACGAGAGAGAGAGAGAGCTAAATTTTCTACTGCCATTCTTCAAACCTCCGAATCACCATCATTTTCATTCTCCTCAAAGAAGGAAGCCATTTTGGCAATGGATTCCGTGTTCGTTAGAGCCTACCGAAGTCATCTTACAATTACCGCAGGTACGCCTCAAAAGTGACTTCAGACTGCTTCAGTGTTCAATCTTCGATTTCTCCGCTGGAACTTCTGCATCGTGTTTTAGCTTCTTCTTTTTCTTTTTGTTGATTGGTGCATTTTTGTTATCGAGTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTGATGATTCATTTTTATTTGCGCTTGACGAGTAACTCGATTATGTTCTCGCGATTTTCATCTTATTTGGTTGATTGAAGCTAATTTGTTGTTTCTGTTTCAGTTGGTGGGATTGGAAACGGGTGGACGAATCGTGACGTCAACAACGTCCGGCTTCCAGGTAAGATTAATTCGTTTTTTAACCTTTATTTTCTTTGCATTTATCGCTTTCGCCTTTCGTCTTCGTTCGTATCTTTAATTCGTCAGTGGCATTTTCGCTCGTTTCTTCGAATTTCATGTCTCGTATTGCAATTTTTGAAAGAATTTGTTGTTGATTGTGGAAGTTGGATGAATTGAACTGGTGGAGGGGATTATCTAGGCGGCGAATTCCCATGTAACCTTTGGAGGGGCTATTTGAGAGTTGAGAACAATGGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTCCATTGCAATAAAAATTAAATCATTTTTTATAAAATTTAATTTGGAGTGTGTATATGTATATTGAAGGGAATTTGGAAAGTATTATATGAACTCACCTGCCAATCAGCGCCAGTGGCAATTAAAATTCTGGAAAGTGTTTTCTTTGTTCCATAGGAATAATAGATTTGAATCTCTTGATCGTCGACGTCATTTCACTGCAATTTCAGTTTAAAACTGAAATTAAAAAAAAAAAATTACAGTTCTCAAAATTACATTTTCTTTAGAAACAAAATCAATATTTGTAATATATTTTTCTATAATAATGTTTTTGGCATTTTCTTTTGGACCAAATTGCGAATATTTGGATGCCAAAGATGATAAATGAATAGTTTAATATTGATTGAGTGGCCATTTTTCGTTTGGAAGTCATTAATATATCTCCAAGGAGTTTCAAACGAACCACGAGAGATGGAAGAGGGCAAAATACAATTTGATAGTATATTAGTTTATTAATAATTGTATTTCTTTTGCTTGAGAAAGAAGTATCCCACAATCGTGTTTGTTGTGTTGGCAGCAGCATGAACCACGAAATTTTAAAGCATAGATCAACTAGATTTTCACCCTTTTTTAGAAGAAAAGACTTCGACCTCATTTAAATGGCAGCTCTGAAGGAAAAAAAGTGAATTACTAAAGATTATGAATGTCCTCGAATAATAAATTTCCATCTTTGACCTCATAAATGTGGGAGAACACTGCATTGAACCTAAGTTGCCTAATGTCTGACGTGATTGACGCAAGTAGGACACGTTTGATAGCGAATGTTCGAACGCTGGTCCATTAACAGAAGTGCCTGCATGCGAGATATTGCCCTTCTGTCACTGACTAGTGGCACATGGCGTATCGTAATTTAGTTCCAAGTCCATGACCGAAAAGGAAACTAGAAAGCAACGAAGAAAATCAGGAAAGATAATAGGAGAAAAGATTCTTATACGCGCATATGTATGTTGGGAAAAACTTCCCAATATGGCAGAATAAACAGAAAAGTAACAGTACTGTAAAAAAAATAAACCTTGGGAAATTGTAAAAAAAATGATAATAATAGAGAAATAACAAAAATAGTAAAATTGATAACAAAAAGTTATCTGAGAAAACTTCAAATTCAAAAAGGAATATCGATCATAAAGGAACTTTACTACGTGAAAAGTCACCACAATTACAAAAAAAAAAACTCATGTTTAAAGGTATAGACTCTTTTTATGGTGTTAGGAGCCTATCACTTTCTTGAATTTTTCAATGTGAGATTATTAGACTCTTAATGCCAAAACACGTGTGAATCTGACATAGTATTTCAACTACATATGCCGTCTTGCATGTGTACATCTCTGTGCCATAAGAGTGGGAAGGTGCGGATCAATACTAAAGAAGTATATGCTTATAAAGTAGATCTAAGGAAGACCTTACTTTAACCTTACATGGACTTGATCTACTCTATTACTCGTACTTGTTCTATAATTTGTACAACTGTGCTGATTCTACAGAGATTTTGGAAATCTCAAGGCCGGTGTCCAGGATCTGGAAACAATTCTTCTAGCAGGAACAAGATCTTGCACTTGTGTAAACCAAAAGTTGGACTTTTCATCCAAATGATTACTCTCTCAAATGAGTTGAGAAATGTTGTATTCATGTAGAAATATGAGTACAAGTTCCAAACTATCTTTCTAATTAACTTTCTAACTTCCCTTTTTTAAAAACAAGCAACTCTCTTTTAATACAAGTAACTCTCACTCTCTCGGGTACACCATATTCCACCCCTTCGAAAATCAAACTCGTCTTCAAGGGTGTGACTATTTAGAATCCCAATTGTGTAACACTTTAAAAAGCCCCAGCTGTCTGCTTACAGGAATTCTAGCTTTGCATAGATGAATTATTACAAAGTTAACCACCCTTCGAGATTTAACCCAAGCCAAGAAATGGGTTATTTTACTAAATCGATCTGCCACAACCATCACGACATTATACCCTCGCTGAAATTTTGGAAACTCATCAAACAAATTCTGCATTTCTTGATGAACTTCACCATTTTTTTTATTTTCTACAATTTTAACTACTACAAGGCCCAATCTACCTCCCTTTCTTTATCAAACTTTTTGCAATGTATTTGAGGATTAAAATCTCCTTTGAGAGCAATCTGCATCGTTAGGAGAAGACAAGACATCCTACCACCTTCATCCGTGGACCGCGTCAATATAATTGGTTTCTTTCTCATTATCTTCACTGCATCCAGCCAACAAATTCTCTTTTTCTTCATCCATATATGTTCCTGTTTTATGTTGGGGACACTCAGTAGACAAGTGCCTCACTTGGTTACCCACTTAAACATTTTTCCAATATAGGCCAATTATAAAGATTTTGAACTTTCTGCTTGCAAACAACCTCTTTTCTTTCTCACCAACCTCTTCTTGCTCTTCTTTATCCATTTCCTTTAACAACTTCTTTACACTGATTATGACAAACAAATGATTGCATCTACTCTTCTTGGAATTAACACTTTCATTTTCCTTCTGGGTCTGAGGCAACAATACAATCTTTTTATCCATCCATTGAAATTCATAAGCATTCTCTCTCCCATTATGTAAGGCTTGCGTATCGTATCGCCATGATCTCTCCAATAGAATGTGACACACATCCATCTCCAAAACGTCACAAACTATTTGATCTTTGTAGCTATTCCAATTGTCAATGGAACGGTGCATATCTCATTAACTTGAGCTTCTCCTCTTTTCTTCTAGGCATTTGGATGAGACTCAGTTTTCAAATTCAAGGCTGCCACTAACTTCTTGGCAATGAAATTCTTACTACTTCATCTATGATGACATTGCAAACTTTGTTGTTGATTGTGCATATTGTCTTGAAAAGACAATGCCGTTGAGGATGTAATTCTCCCTTTTGGTGTGATCAAGACTCTTTGAAGAACACAAGAAACTTGATCTCTATCATCCGCTCCAATCATCTCCGCTTCTTCTTCACTTTCTTTATTGTTCTCGAATGAATCTTCATTTTCTTCATCAACAAATGCCATTGTTTTACATTGAGGACAAGCACTGGAAGGGTGCCCCGTTTGGCCACACCTATAGCAAACACTCTTAAAGGGTCGAACATAAGGATTTTGGTCAGTCTTCTTGCCATTTGCTTCTTGATTGTCTTTTCCCACCTCTTTGCCTTTATTTGTAGCTGTTTGATATTTGATGGACAATCTCCTTGTTCTTGCTACTAAAGTTGGTTTTCTACCTGTGGATGCTTCCCATGTTGTCTTTCTTGAAGCATTCTTGGAATGAATCTCATTAATTTCTTCCACTATTTCACCAAAACAAATTGGTTCAGAAAGCCGATTAAAAGATTGGAGTTTTACCTTCTCCTTGATATCCATGCGTTCTGTTTTTGTGAGAATTTTACACACAAAACAAAAGGATGCTTAATAATCTTTAAAAAGTGTGTGAGCTGTGGGAAATTATTGTTAGTTTTTTTCTTCCTGGAGTAGACTCTTTTTTTAAAACATATTTTTAAATAACTGGTGACCTTTATTAGGTCTTCTTTTTGTGAGTTTTGTATACAAACGACATTGTTACCACCTTTTAAAAGCATTGTGGATGTACTTCCTAAAGACTAAAAAAGGGAGGGTTTTTTTTTTTTTTTATTTATTATAAATATTATCATTTTGCTCTCTTCTTTTGATATATGCATCTGTCTTATTTTGTTTTTTATTTGTAACGTAGTATAATTAAGGAAATTGGTAGAAAATGCTTACTCATCTGTTCACATGTTACAATTGAAGGTCCAAGGCCTGGAGCATTGAAGATTTCTAAAAGGCACTGTTGTGTTGAATCTGAATATGAATCACATCATTGTGAATTTGTTTTTAGAAGACATCGGGAAAGGTACACCTTCTATCAGAAAAAAGATGATAGAATCCAAGTTAGAAAAGCAGCCTCTAATCAGCCTTTTGAAACTGAATCCGAAGCCTTGAGTTCCAAAAATTATGGTGATTCTGTAAGGAGTTTTTTAGATGCTTTTTACAGGTTTTCACGGCCGCACACAGTTATTGGTACAGTTACGTTTTTTCAAACTCATGTCCTTTTAGACCAATAACTTATTTTTACATTTCTCTTCATGAGGGAAAATTCTTTGATGTAGCTAGCAGCTGCAACATCGTGGCTGCTACCCTCTAAATGATTCGACGTACAGTGAAAATTACTTTCGATTCTTAGCTTACGCTTTCCTTTCATGCTTCTAGGCGTTGAGCATTGTATCAGTTTCTCTACTAGCAGTTGAGAAACTATCCGACTTGTCACCATTATTTTTAACTGGAGTGTTGGAGGTGATGTTTCAAACAAAATGTACAATTTGAATTCTGACAGCGTTCGTAAATATATTTAACACATTTGCAATTTTTTTTTTCAGGCTATAGTTGCGGCCCTCTTTATGAATATTTACATTGTAGGTCTGAATCAATTATTTGACATTGAAATAGACAAGGTACTTCTGTTGTATTCTTTTTCCCACCGAAGCATATTAAATTAGGCATGCTGAACTTCATAATTTTTAGGGACTTGAGAGTGGATCACATTATATGTGAGTGCAGTCATGGATTAGTACCCGTTTTTACATTGAAGGCATTTCTTGCAGAATATCATGCCCATTTCTGCAGTGTTCTCCTTATTGGGCACTTTATCATAATCTTTTATAGTTCACTAGTATGAGCATTTCATATATAATTCTTTAATGTGTGAGTGGAAGCACCTTAAGTCTGCAGAAAAAGCTATCATATAATCTGACCTTCACTGGATAGCGTTGAATAATAATAAAAGGGAAGTTCACGATTTTCTTTCTTGTTGGCATGAAAGAAGACCAAACTTAATGGTTCCAATGTGTTTTAATTGCAGATTAACAAGCCATATCTTCCATTAGCATCGGGAGAATATTCTTTTGGAACAGGCGTTGCAATTGTCTCCACGTTTTCCATTATGGTAGTATTTTTTGTGTCACATCATTGCAAGACCATTTGTTAGAGTTTTTATTTAATATCTTTTGAGTGTTATTTGATTAACTTATACAGGAATATATATTTACTATTTCTTTATTTTTCGGGAAAAAAACATCTTTTTGGTCCATAGACCTTTTAGTTTTTTAAACCTAGAGACCAAATGAAACCTAGGAACCAAATAAAAATAAAACTTAAATTCAGGAGTAAAAATGTAATATTTTGAAACTTAAGAATCAGTGCAAACTAAACAAGATATGCCCATGTTGGATCACTAATTCATTGGCAGGTCTTCTTTCTATCCCTAGAAACATCAACTCTCCCCTTCCATCTGCCATTGCTTCTTGCCACCTGCCTATCATTGACTCTTCCTCATCCTTCACTCATTTGCAGGATGTTTGTTTTGCTCCGTTAAATATATGTCTCTGCCATTCCTCAACCTTCTCACCTTGTTTGGTCTGAACATTCTTTGGTTGAGTTAACAAAGGGTGCTGTTTTTTCACAATTTCTTTAAGCTGGAGAGGAATGATTTTTTAAAATTGTTTTTTAATAAATAATCACTTTTGTTGAGAAACAAATGAAAGAATACCCGGATGTACAAATAACCTTGTCCACAAAACATTGCCCTCTACAAGTAGGAGCTCTAACTATGTAAAATTACACCTATAGAATAGTTACAAAAGATATTTGAAACCGAAGTCCACAAAGCAAAGTGAAAGCGAACAAGGGACAAAACCTCGCTAGGGTCCTGTTCACCTCTCTAAAAATCTTGCTATTCCACTCACCCAACAAAACCCATAAAATCACACACACTAGTGCATGCTACAGAAAAGCGACCCTTCTCCCCTTGAGGTAAATGGAGGAGGTACTCCTCAATCATAGCACTAACTCCCCTCTATCATGCCAACGCAAAGCCATACGTTTGGAAGAACCGCTCCCAAACCGAACTAGCAAACTTGCAGCGCCAAAGAATACGATCCATACCTTCCTTTTCCTTTTGAGAAAAGATGCAATAGAACGCTCATAGCAAGGGGAACTTTTTGGTGAGATGGTCTATCGTGTTTGCACGACCATGTAAAACTTGCCAGGTGAAGAATCTCACTTTCCTAGGAACCTGACTGACCAAAAGGACTGAAAAGAAAAAATTACCTAAGGAGAATGGTCCTTGAGACTATGAATTTATAACTTGAACCCCTCCAAAGGATTGGGTCTCCAGACCCTCACATCCCTTATCCCACGCTTAAAAGAGTAGTTCTCGAGCAAAGAACCAAATTTGTTGTCTCCCTATTGGAAAGGGAACGAAGAAACCATAAGAGAAAGAACAAGAGCTCCCTGACCACATAAGAAAGTCATCAACAAAGTGATTTTTGAGAGACAACAAATGACAAAGTCTAGGATATAAAGCAGAGAGGTCTCTCACTCACCTAGTGATCCTTCCAAAAGTAAGTATTCTTCCCCTCCCCGCCGTACAATGGACTTAAGTATTAATATAACTAGATTATTCTTAGGTGATATTATTCTGGAAATATTATTTGATATTATTTCCTTAAGTGTATTTCTCTATGGTTATATATAAACTTGTACCTCTACTAAATAATTAATGAAATAGAGATTAATTCCATAAAATCAACATTAAGTTCACAAAAGATGGGAGCTCTTTTGAGATATTCTTCTATAATTTCTGGTCAGTACCAAAAATCCCCTAGGACAACCACTCAAAAGGATGAGGACCGTATTTGCATAACATAATCTTATGCCACATCTCAGAAGAGAAGCACCACAACCACTTAGCTAGTGAGGCCTTGTCACACAGCCTAAGATTCTCGATGTCAAGACCCCCGCTATCAATAGGGCTCTCAATAAGCTTTCATCTAATCAAATGTGAACCCTTACTTTACCCTTCATCATCCCCTTCCAAAGAAAATCACACATCAACCCTGAGAGGGATGAATTTGGTACCACTAGCATACATAAGGGGTGTTCTTTGTCCAATTGGATAACTGAGTGCGTCATGAGACCAATCACTAGCCGAATAATGCCCATTAGTGTGCCTGTTGGTCTTTTTAAGTGTGGTGGTCTAACTTTTGGGTTATGTTGAAGGTTTTTATCTCCAATTTTAATAACTTTAAGTTTTATGTGAATGCTCCATCCAACTCAAGTGATCCTCCCAAGGTGTTCTCCCATCCAAGTGCTCCAAGTTCTTTGTGGAATTTCAAAAGAAAAAGAAGTGATTGATTTGGTTTGCAATTTTCTCATGGTGATCTCCCAGTTGAATGTCATCAATGATGACTGAAAGGTGAGGAAGTCATTGAAAATCACTGGCTGACAAAGCTTTATTACAAATGGATGATGGTAGGATTCTTGGGAGACATGGCTCTAATGGAAAATGGATGCACATTGGGCCTTTTTCTTTGAAATTTGAGGATTAGATTACCACAAAACATAACCGACTTGAATTTTGTGTAGGTTATGGTGGATGGATTCAGAATAAGAATATACCTTTGCACTATTAGAACTTGCAGACTTTCAAAGTTATTGGTGAACATTTTGCGGGTTTGATTATGGTTGCTTCTAAAACCCCAAGTATTGTTGGATTATAGTTCTCTTTTATTGAGGTTTTCTAATTCCTACTTCCATTGAAATTCGAGACAAGTTTTTAGGTAACTCTATCTTAATTTGGAGATATAATTTCTAATGAACCTTCTCCTTTTGAACAATCTCGTGGAGGAATCTTGAACTCTAGTGATTTGTTTAACCCTTTGGATTTGGTTCGTATTAATAGAGTAATTGAAGACTATTAAAAGCGGTAAAGAAAATAGGCATCGAGTTACGTGGAAATCCGAGTACCGAGAGAAAAACCATGATCTGACTTTCTTATTAATTTCTCATATTAACAAAAGATACAAAGGAGAAAATAAGTAGACAACAAGCTTATGATAAAAAAGGAAAGGAAATTAGGGTAAATCCTTCCTTGGGCCAAGTCCCCCTAATTCTAACAAAGACAAAAAGTAATGTATGTTGAAGTAGTTCTTAAATCACCCTTTGAACCAAAAGCTTAAGCTGATGGATAAAGGTAAATTTAATTATTTATCATCTAACAATCCCCTTCACTTGACTTCATTAAGGTTATTATTAGTGTGCCTGTTGACCTCAATATTTCAATAAGTAGTCCTCGCAGCAACAAAGTATATTTCAGACTATTGCTTTCCAGAAGCTCTAGTTTCTTTGTTTCAAGATTGTGCTTAGTAGTATTCTCTTCATCTGTCCTCAGTTCTAAGCAACTTTGATTATCTTATTGCAGCTTGTGGTTTTTTTTTTCATTTCTTTCCCTTTTTTTAGCAGCTTGTAGACTTAAGTTGCGTGAAATTTCTATCTTTGTTGATGGAACTGATGGACAGGCTTAATAATATCTTTTTGCAGTTTCCTATCATTGATTTTTACTTGAAGTTATTTATTTCCTTCCCAAGGCTTTTGGATCAGTGTTTTTGTGCCTGTTGAAGAGTTTTATTTTGGTTGTCATGTAGCTTCAGCTCTTTGTTTGCCTTGTGGCTGTTTTCGATTTTGGAGTTTGGGTCCCTACTATCTTGGTTTTTGGTTCCTTGTTGCCTCCAAGTTCGATTTTTGTTGCTTTTTAATTTTGAATCTTACTGCAGTTTTATTGGTCGTTTCTAATAATGTGTTCGGTTTTCTTTAGTTTCTTCTGTGACCTTCAGTTTGTTTTCTTTTACGCATTAGACTTCTTTGTATGGAAGTAATGTCATAATTAAATTTACCGTAACCCATTAAACTCAATTGGTGATTTAACATGGTATTAGAGTAGGAGGTCATGTGTTTGTAATGTCATTTTCCTGGCCATATAATATGGTTTCTACTTGTTGGATGTTCTATAAATGGTCCAAAAGTGAGTGGGAGTGTTGAAGTATTGATATAATTAGATTTACCATAACCCATTTGCTCAAGATTTTGGGTTGATTGATAATGTAACACCTTGTTTTCTTTCTCTCTCCCTCGAAGAGATTGAATCCCTGAGTGTTAGTCCATTTTTTATTTCATTGATGAAAAGTTTTATTTTTTTGTTAGACAAAATAAAAACTAAACTTAAACTTTAGGGATAAAAGTGTAACATTTTAAAATCTAGGGGACTAAAAGGGTTTTCTTTTTCTTGTTCAACATGTGTTATACTTCTTATGGTTATTTTCATGGGAAATTGTATTGGGTGGCAAATTAGTTTAGGCATTTTACAAAAATGTCTTTAAGGTTTGTGATTTTGCAAATATAGCAAAAAATAATCAAATCCAAGCTTTTATATGTGTGGGTTGGGTTTTGTTTTTGCCATTTTCGCAAATAATAAAATATGTGTGCTATAGACTTAATTATGATAACTTGTTTTGCCATTTTTGCAAGTGCCTCTATTTCCATTTGTGCATCTGAACTACAAATAATTGACGCCAAGATTCCATTCTGAAACTACTTTACTCCCAATGCTTTTGTGCAGAGTTTTTGGCTAGGATGGGTTGTTCGTTCATGGCCATTGTTTTGGGCTCTTTTCGTCAGCTTTATTCTCGGGACTGCTTATTCCATTGATGTAAGTGGGTTTCTTTATCTTATCATTTATTTCCAGCTTCGTATCTGTCAAAAAAACAAATCTAGCATGCGTATCTTACTGGCTACTATATGTACATGCTGAAATTTTGATTTGACATATTATCTTATGGCTCCAAAAAGAAAAGTTTGACCTGGAAAAGAGGTAAAACTTCCTTATCAAATTTATTATCACGTAGACTCAAATATCCATGCCACATTTGGTTGAAGTTTTATGCTTGCATATATTCTTCGTTAGCTCAGTAACTTTGCAAACTGATCACCATATGAAGGTATTGGTCTGGTTGGATTATTTAGGGCTGATTATGAACCTTCAATTGGAGTGTTGATACTAATCTTTCCATAATTAAAGCGTGAGGTACCAATAATTATTATTGCACAGGACCCAAATGGGTAATCAATTTTCACATTCTTTTCCTTTTCATGACCATTTGTCTCTCTTTAACCCAATAGAGTTGTTAGATAGGAGTAAGATTTTCGAAACTAAAAAAACGAGAGCAAACTCTTGTCTTCCTCTCTTTCTCAGTGCTCTGTCCCTTGTAATTGGGGTGTACGGAAAGTAGATTGATAAATGACAGGCTAGATAAGACACCTTGACTATGGTATAAGGTCTACGGACCTATCTTTAGAAAGGCAAAGATTCTTAAGGTCCCATCTTCTAAACTTTCTTCTTCTACCTTTTGTAATTCTTCACCATTTATCAGCTATCAAAAATTGGACCAACAATTTGTCTATCACCTACAAATCCATTCTAGAAGGTGACTGTAGAAGGCAACACTTTTTCCAATCTCTCTACCAAGCCTCTGGAAACCACAAATTTTCTTTTTAAGAATTTAACAGGTCAATAGGATTTTGGTTATCTCATACATCGGTTTATAATCTTTCTATTTACTCCATATACTAAAACAATTTACAATAGATCCCTTAACTGTTATGGTCGTATCTGTAAAGTCAAACTTTAAACATTTCTAATAAGTTTTGAAACTTTCAATTTTATGTACAATAACCACTCATGTTAAATGCTTACATGGCACGTGTATTATTGAAGGATTAATCCAAAATCAGTCTGCTACATTATTCTTAAATAATAGATCATCAATATGTCATGTAAGTATTAAACAAATTCATGAAAGGAGCTGTTAGTTACAAAATTGAATTCTTGGATATTTTGCTTGTTTATTTTTGAGAAATTGTAAAAAAAAGACAAATTTGACAAAACACTTACGAAATATATCAAAATTTCACATTCTATCATTGATAGATATTGCTAGACACCTATAGGTTTCTATCAATTTCTATCGGTGACATTCATAGACACGAATAGAAGTCTATCAATATCTATCAATGTATATCATTAATTAATCTAAAATTTTGCTATATTTTGTTGATATTTTAGTTCATTTTCTTATATTTTTAAAATGTCGCTTTATCTTTCGTAATATTAAATTTTATTATTGCTATTATTATTTTAAAAAAAAACTATAAAAACCAAATAGGCATAACCATAAAAGGTCATGGATTCTATGAACTTTTAAAAGTAGGGTCGTTGTAATGGATAGCTATTTGAGGAATAATAATTAAGGATATAGCAACATTTAAAAAAATTGCAAATATAGCAAAACTATCGTTGATAGACTTGTATCGCTGATAGGCTCGTTATGGTCTATGAGTGATAAACCAATATTTACAACATGGTCTATCGGTGATAGAATTTGACAAATTTTGCTATATTTGCAAATTTTTTAAAATGTTGCAATATACTTAATTATTTTGAATCTAATTGCTAAATTTGCAACTATCCCTTAAAAGTATAATGACCGAATAATACTGGACCCAATTTGTAATTAACGATATGTTTTTTTATTATAAAAAAAGTGCTTACGTTTGCATAAAGTGACAACAGAATCATTCCTTAGACTGATTCTGAACTCGGACCCTTCAAATTCTGGACGAAAAGGATCTATTAGCCCCTTTCAGTTTAATTAATAATTTACTTTTTAAAGAAGAAATCAATTTATATGATAAAACTTAGTAGGTTGAATTAATTAAATCTCTAAATAATAATTGTATCAAATTAAAAACCACAGCTTTAATAAGTGAATCAATTTTGATCCTTTAACAAGATTTTGTTTTAAAATTGTTAATGCATAATTTTCATGTGTAACATTTCTTTAAAGGAAAGGTTTAACATAATATTAGATGGAAATATCAGAATCAAGTGGGCAATGGGTGCTTCCATTATATGAGTCATTTTTCATAATATCTTCTTCATGTAATTTTTCTGGTACTTGGTAGAATTATGGGAGAAAAATAATTTTATTTACGTTCTTTTAGTTGATTTTAAATTAGAATTAAGTGAAAGTAGTTGTGCATCGATAATAAACGGCCTGAATTGATTCACTTGCGAAATTTTTGGGTTTTAATTGATTCACCCAGCAAGTTAGTGTGTTATCAAAAGAAAAAAAAAAATCGATTAACCCAGCAAAATTTAGAGGATATATTGACTTTTTCCCTTCTTGGTCACTGAAAATTCTTCCTCCTCAACTTTTATGTTCTATATTGTGATTCTAGATGATGAAAACAGATAGTATTGTGAGCATAGTAAATGTATGAAAGAAACTTGGCTTTGATTAAGAGCTTGATGGTCTTTAACTTTTCTGTTACTTCAGCTGCCACTGTTGAGATGGAAGAGATTTGCTGTCGTTGCCGCTATGTGTATACTAGCTGTTAGAGCCGTGATTGTTCAACTTGCCTTTTTTCTACACATGCAGGTCTAAAGATTCCACTTATGAATAAATAATTGTTGCTATCTATTGTAGGTAGAGATGTAGAACAGACACAAATTTACATGGAAACCCTAGTTCAAGGAAAGAAACTACTATGCTGATAGTTCTATTATTTTCTTATGATAATAAAAATACAAAGAGGAAAATATATAAGCAACACGAGCCTAATTAAAATAATAAAAAGTTAGGGTAAAGTAAATCTCAATTACCCATAGCTTTCAACATGATCCAATTCCGCCGTTTCTAACACTATCAATGACTAAATCATTTGGCTTGTTAAAATAGCATATAGTAGGAAACATTTAAGAAGAAATTAACAAGCAGAAGTTGTTGGGATCAAAGATAATATTTGAACGGGCAGATAGATTGATGGCAGATTATGCATACAAAATTAAGCACTCATGGTGGGATCAACGTCCATTTGTATGCATTGTGAACTATTTCCAACAAGATATCCAAAAAACATGGAGAACTATCCCTGATTTATATAACACGATAATACGATCCATGAAAACAGTAGCAAAGATTATAAGGAAGATAACCGGATACTCCCAGAAAATTAGAGTGTTGGCTCTCACCCACTCTAAGACTTAACCCCAACCCTTCCCACTGCCCAGCCAAACCCCTACATAAACCCTCCTTCTTCAACAATGGTTTTCACTCCCGAAATAACTAACTTCCGTCCCACTTCCCTTATGTCCCTGTGAATTGTCTTTCTTACCCCTCTTGTATGTATGATAGATGGGAGGCCTTCCAGTTAATAATCATCCTAAAATGGGAAATAAGAATGGAGGCGCGTGTCCTAAAAATATTAATATTTAAGTTTACAAACTAGCATTTGTGTTAAAAGTTGTTTCCTAATTCCTATCTTCGACTAATATGTATAAATGTTTACAGACCCATGTGTTCCAGAGACCTCCGGTTTTTTCACGTTCTTTGATCTTTGCAACTGCATTTATGAGTTTCTTCTCGATCGTTATAGCATTATTTAAGGTAAACATTGATTTAAATGAAAAGTGAATTTCAATAAGGTCTTGTTATTTTTTCATATTTAGTGTAATAATATTTTTTTAATATTCATGAGGCCAATTGCATTTCCTGCTACATTTGGTAAGATAACTTGTAGAATATTAAGTTCTAGGTAGGAAGCTACCATAGCTTGAACTCGTTCATAAGCCTTTTGTTATTTAAACGAACCATGTTAACCACTAGATCTACCTCTTGGTTCATATTTAGTATAATAATAATAACATTTACACTAACTCTTACTTGATTATACTTGTAACTTGTTAATTCTACTTGTGTTTCTAGGATATACCAGATATTGATGGAGATAAGATATTTGGCATCCGTTCCTTTACAGTACGTCTAGGGCAAGAGCGGGTGGGTATTGAGTAATTCAATTTTTACGCAAAGCGTCTTCCATGTTGGCATGGATGTATATAGTCATATATCCTAGTGTGAGGATTTCACTTCTGCAGGTGTTTTGGAGTTGTATTTCCTTGCTTGAAGTAGCATATACTTCTGCTGTTTTAATGGGAGTTGCCTCTTCTTCCCCGTGGAGTAAATGGCTAACGGTAAATCTCTGGCTCCTTGAAACCCGTACATAGACAACGTATTTTCCTTTCTAATCATAGACTCATAGTTCTATTAAAAGAAAAATAGATTTCAAATATTAAAAAAAGAAACAATTTCCTAGACCTAGACTGCAAGATAGAGATGGATTTGAAATGGCTAAATGCATGTTTAGGAGTGATTTTAACCCTTTCGAAAACACTTTATAGTATGCCCTTAACATTTATGTACTTTCTAAGTATGTTAATACCTTTGTACACTCTTTAGGTTTTGGGACACGTCACTTTGGGGTCAATTCTTTGGATTCGTGCCAAATCAGTTGATTTGAAAAGCAAAGCTGCAATAACATCCTTCTACATGTTTATATGGAAGGTATGCTGTAGGAGATTATGTTTGTGACTAAACAAGAAACAATTGATAGTTAATTAATGCCAGTCGCATGATCCTAAGCTACTCTATCCGGTGGTCTAACTTGCAGTATAGTAGATAAAATCAATGTTGATTGTGAATTTAAGGTCTCCTATAAAACATGTAACTAATGAATCACTCGTTTATGCTGTTGGATTATAGATTGATTCAGTTGACTTGATGGCTATAAATTCACTTCTGACACAAAAGCATGCTTCATCTTTAGAAAAAGCTAGTTCTCAGATACTAATGTATCTGTTGTTTTTTTAAAAATGCTTTTGGTTATATCTTTGTCTAGTCACGTCAATTTTTGGCTGCTGTCATTATCTTCCTTGTGTAGCATGTTTATATGTGAATAAAATGGTGGCGTCTTTTGTGATGAGAATATGCCTCAAAGCAGTTGGGTTTTTCTTATATCCTCTGTACGATTGATAATCTTACATTGGAAAAATCGATAGGACTCTCACTCTTCATAAATTAGATGATCTGTTTCTTTCACTGTGAGTTGGTTAATTTTGAGATGGAATCAAATATGATATTAGAGTCCATAAAACTCAAATAGGTATTCCGTTCAATAAAAAGAATTGATTCGATCAAGATTGAACCCAATCGAAGCACCATCTTGATGGAACATGTTGAGAATCCCGTGTTGAAAAAACCTAAAGGGAACTCATACTCTTTATAAGATAGATGAGCTACCCCTCACACACCCAATTGATTTTGAGGCAAAACTCCATACTATTAAATAGTGCGTATATATGTTAATTGTTTATGTTTTCATGTAGTCATATACTCAGATGTAGTCTCCTAGTCTTGTGTCGAAGAAATTCTGAATTTGTTTCTTCTTTTTCCAAACTCTGATAATTGGAGCTTTTTCTTTAGCTATTGTTACTTGTTTTGGATCCTGTTGATGTGAACTCATTTGGTCTTTGAAAGCTATTATTATTGTTGTTATTGAAAAAAAATCCCCTCTATCTGACTGTCTATACTAATGTTATGTTGTGCAGCTCTTTTATGCTGAGTATTTGCTGATACCCTTTGTTAGGTGAGGAGGTGGACAAGAATGTGATTAGGTAGTGTTTGTATTGTACAAATTTCTAGTTGAAGAGTTTTAATAAAGAGGTTTGTCTCCTAAAATAAAAAGAACTATAGTTAGAATCATTGTATTAGTTTTGATGAAGAATATGTCTCAGATTCCTTCTTTTTTTGTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTGTGTAATTGTAGCTTTTTTTAAACTCCATTTCTTTTGTACTATATAGATCATTAATGCAGGTACACAAATTGATAACAAAACAGTTGGAATAATATGAAATCCAAATTTAGTATTTCTCTTTC ATGAGTTTTTGGCTAGGATGGGTTGTTCGTTCATGGCCATTGTTTTGGGCTCTTTTCGTCAGCTTTATTCTCGGGACTGCTTATTCCATTGATCTGCCACTGTTGAGATGGAAGAGATTTGCTGTCGTTGCCGCTATGTGTATACTAGCTGTTAGAGCCGTGATTGTTCAACTTGCCTTTTTTCTACACATGCAGACCCATGTGTTCCAGAGACCTCCGGTTTTTTCACGTTCTTTGATCTTTGCAACTGCATTTATGAGTTTCTTCTCGATCGTTATAGCATTATTTAAGGATATACCAGATATTGATGGAGATAAGATATTTGGCATCCGTTCCTTTACAGTACGTCTAGGGCAAGAGCGGGTGTTTTGGAGTTGTATTTCCTTGCTTGAAGTAGCATATACTTCTGCTGTTTTAATGGGAGTTGCCTCTTCTTCCCCGTGGAGTAAATGGCTAACGGTTTTGGGACACGTCACTTTGGGGTCAATTCTTTGGATTCGTGCCAAATCAGTTGATTTGAAAAGCAAAGCTGCAATAACATCCTTCTACATGTTTATATGGAAGCTCTTTTATGCTGAGTATTTGCTGATACCCTTTGTTAGGTGA MSFWLGWVVRSWPLFWALFVSFILGTAYSIDLPLLRWKRFAVVAAMCILAVRAVIVQLAFFLHMQTHVFQRPPVFSRSLIFATAFMSFFSIVIALFKDIPDIDGDKIFGIRSFTVRLGQERVFWSCISLLEVAYTSAVLMGVASSSPWSKWLTVLGHVTLGSILWIRAKSVDLKSKAAITSFYMFIWKLFYAEYLLIPFVR Homology
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWJ1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 1.1e-83 Identity = 152/201 (75.62%), Postives = 180/201 (89.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7FA90 (Probable homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 297.0 bits (759), Expect = 1.6e-79 Identity = 151/201 (75.12%), Postives = 175/201 (87.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DAK7 (Homogentisate geranylgeranyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HGGT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 9.3e-59 Identity = 122/201 (60.70%), Postives = 151/201 (75.12%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1B3P3 (Naringenin 8-dimethylallyltransferase 1, chloroplastic OS=Sophora flavescens OX=49840 GN=N8DT-1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 9.3e-59 Identity = 113/195 (57.95%), Postives = 144/195 (73.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1B5P4 (Naringenin 8-dimethylallyltransferase 2, chloroplastic OS=Sophora flavescens OX=49840 GN=N8DT-2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 225.7 bits (574), Expect = 4.6e-58 Identity = 112/195 (57.44%), Postives = 141/195 (72.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. NCBI nr
Match: XP_031736945.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 391 bits (1004), Expect = 1.74e-135 Identity = 201/201 (100.00%), Postives = 201/201 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. NCBI nr
Match: XP_004148327.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61152.1 hypothetical protein Csa_021364 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 391 bits (1004), Expect = 8.96e-134 Identity = 201/201 (100.00%), Postives = 201/201 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. NCBI nr
Match: XP_008451585.1 (PREDICTED: homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 387 bits (993), Expect = 4.20e-132 Identity = 198/201 (98.51%), Postives = 201/201 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. NCBI nr
Match: XP_023522336.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 377 bits (968), Expect = 1.16e-130 Identity = 189/201 (94.03%), Postives = 199/201 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. NCBI nr
Match: XP_038889438.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 379 bits (974), Expect = 3.12e-129 Identity = 193/201 (96.02%), Postives = 199/201 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059830 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 391 bits (1004), Expect = 4.34e-134 Identity = 201/201 (100.00%), Postives = 201/201 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS9 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 387 bits (993), Expect = 2.03e-132 Identity = 198/201 (98.51%), Postives = 201/201 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7F2 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 378 bits (971), Expect = 3.78e-129 Identity = 190/201 (94.53%), Postives = 199/201 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9K8 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 378 bits (971), Expect = 3.91e-129 Identity = 190/201 (94.53%), Postives = 199/201 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T4 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EV02 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436184 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 373 bits (957), Expect = 5.05e-127 Identity = 187/201 (93.03%), Postives = 197/201 (98.01%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
|