Cucsat.G17101.T8 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGAACTCGCAATTTCACGGTGTTGTTCAACGGGCAGGACAAAAGGGCACTGGGCAGAGGCATTTTGGTAGTTTCATCCCATCTCTTCCAAATCTCCTACATAATTTCTGTCTCTACTTACGATCACTTTTCACTTCCCTCCCCCACCACCTCCCTCATCGTTGCTTCTTTTGCATTATTAAAACTTCCTCACTTTTCAGTTTCTTTCATTTTTCCTCAACAAAATTCTCTCTCAACTCTCATTTTCCTCCACCAATCTCTTCTTTCACGCATTCCGGTTTGTTGATTTCTTTAATCTCCACTTCTTCAGGCCTTCCGTAACGAATGTCGCCCCCAATCCTCTCCTTAGCTCTCCCGTCCCCCACTGGTCGAGTTCTCAGTATTCAGTCCCACACTGTTCAGGTTTGTTCAATACTTCACTACGGTTCCGGTTATTTTGGTACAATTTCATTTCAAACTCCATATTCACTTTGTTTTTGTTTCTTTCATTAGGCTTCTGTAGGAGTTTCCTTCAGTTCTGTTGCCAATTTGTATTGTTATATACTTAGACTTGGTGTTTTTGTTATAAGTGCTGTGTTTGTGGGAGGTTTGACTTTATATTTACTATCTTGATAATGATGTCTGATGTTACTTTTCTGCTTTGTGTATTTCTGTGGATTGTTTGTTCTTATATTGTTCTTGATTGGCTTTATTTCCGTGCTATTAGTTTTACTTCAATGGATTGTTCTATTGTCCGCTGCCGTAGGGATACGTTGGGAATAAATCAGCTGTTTTCCCTCTCCAACTATTGGGCTATGATGTAGATCCAATAAATTCCGTGCAGTTCTCAAACCACACAGGCAAGATGCTTCTATTTGTTCATTCAAATGGTCTTAGAACTCTGAGGCTTAATTATATAGGTGCCTTATGTCCGTATGCATAGGTTCTGGTTTGATTTTGTTGTGTTAGTGAAAGTGTATTATGGTTCCTTTTGAAAATAAAACAGGGTATCCGACTTTTAAGGGCCAAGTTTTGAATGGAAGACAATTATGGGACTTAATTGAAGGCCTTGAAGAAAATGAATTGTTGTACTATACTCATTTGTTAACAGGTACTTTAGTTTTTCACTAAGTGACTTTTGGTGTGGAGTATAATTTGGTGACTTTGCAATATGAGGACCTATGAATTGTATGTTGGCAGAAAATAATAAATGTCTGCTAGAAAAGGAGAACTATGCTAAACTATTGCCAGCATCACGTATAAAGCTCCTGCAGTAATTTGCATACTGTGAACATGCCTATTTTTATTTTTCAGTTAATGTGAGATTTGTTGTAATATGGTACCTATGGATTTTGCAGGATATATTGGTTCTGTTTCTTTCCTCAACACAGTGTTGGAAGTTGTCGATAAGCTTCGCTTGGTGAACCCTAAGCTAACATATGGTCAGATAAATTCAAGTTCATGGTGCTTCATTATCATTTGTCCATAATCATATATAGGTTTTGTAAATGTTTTCTTCGAGCTCTTGGTAACCTAGAACTGGTGAGCTGGGAGGATAATGTTTTCCCAGGAAAAAAAGCTGGGAGAATAATAATTTTCTAATGTGTTTTTGCACGCAATGGACAATCTTGTCCATGATTGATGATTCATTATCTTCAAGTCCAGAACTTCTTATATTGCCTTTGTTCCATGCATATAACGTATATGCTAGGGAAACAGAAACATTGTAATTTATAATGTGGAAAATTTTGAGGATTAGTCAACCACCTATTTAACCATCTCATTTTTTCTTTTTTGAAACGGAGACAAGCCTCTTAAATTATTATTAATAAAAGAGCCTTAAGCTCAAAGTACAAGAGTATTACACTAAGAGCAAGAGAAAGGAGAAAATTCAGTCTACATCTACAACACAAGCTAAAAAACAAATTCCAAATAGAAGAGATCAAGCTAAACAAAACCAACTCATTAAAACTAATGTTTTTTCCAGTATGTGATCCAGTGATGGGCGATGAAGGGAAGCTTTATGTTCCTGAAGAACTAGTATCTGTATACCGAGAGAAGGTGAGAAATCCAGCTCACAATGGCCCCTGGTAGTGCTTGATAGCTCATTCACTTAATCTTGACTTGACTTAGATTTTTCCTTAATTAGCATTGTCTGTTGAACTTTTCAATGTTTGAGTACTTTAGTATGTGGACCATTAAAAATGTAATTCTGTATCTCTGTGTGTTGGAAGCTAACAATTATTTATGCATCTGCCCTTTATATTTTCATTTTCATGTTCTTGTCCATAAATTTTTTTGATAAGTCCAATTCATGATTAGGTAATACCGGTGGCTTCAGTGTTGACTCCTAATCAATTTGAAGCTGAACAACTGACTGGGTTAAGGTAATTTGAATAGGATAGACATGATGTGCTAATGTTATTTTTACTGGTCTATGTAGATATATGGAAAGCGTATAACACACGTTTACTTTTGTCTTTTTGAATGTGTGCATGTGTTGGTGAAGTGCAAGAAAAGATACCTTTTAAACCTTATTAGTGTTTTACTGTATGATGTCTATACTTAAATCATGAAATTAAGTGCAAACTGGTATGGTTGGAAGTGGAGACTGGGGTTCCTTGTCTTTTTGATCGAGCCAAATTTGATACACCCTTTCTTGAATTCTTCTGAGTTTTTCTCCCACCTTCTGATCTTATTATTTTAGATTTCTCTATGTAATTCTATATAACAATTAGCTGTTTTTCTTTAAAACTCTAGAATTTTTAGTTTAAGTGAACCTCAATTTGTCTGATTTGCAAGTAGTTGGTACTTCAGCATCCTTTTCTTCCTTGTCAGATAGAGTGATTTTTGAGAATCCTTGCTTTTTGCAGGATCCAATCTGAAGGAGATGGTAGGGAAGCTTGTAACATTCTTCATGCTGCAGGACCTTCAAAGGTAAGAATTTCGAATGTGGCAATTGGCCTGCTGAGAAATTGATGGGCATAGGTATTTCTTTTCTTAAGGGTGCTTGTTAGTAGTCAGCCATTGTGAATTGGAGACATTGGAGGTCAATGAACTATTGTAGGAGTGATATCTTACAAGTGAATTTCACGTTCACAACTTGTGAAAGGTAGATGGCAATCGACACATTAGATGCCTGTCTCTGTTAGATAATTGATGCATCACAACCATAGTTTGGCTGTATGAATTGGATCGTGCAACAAAATAGTTGGAGGCCTGCGTACAATAATAGTCAATAAGATTTAATTACTGATGAGTTACGGATTTAGTTTGGAAGTAGTTTAAACATCTTCTGTTTTCCAGGTTTTCCAGACACTGTGTTGAGACAAAATTTCAATTGTAGGTGCTTATCCTTTTAAGAATTCCAATTTCTACAGCTCTAGTCCTAATTACTTAAGGCGGTTAGAACTTCTCCCAGCTTAGGGTACCTAGCTGTCGAACTGTGTTTTACATTTTAATATAATCCTAGCTCCTTTGGTAAACATAAATACGATCCATTATGTTACTGTCAACCTTTTTTGTAAAAATGTCAGACATCATTCTGAGTATTATTTCATGCATTGAATAACTCTGTTTTCTGATGATTAAGTCATGACAAACACCCCAGGTTGTGATTACGAGTATAAATATGAACGGTGAACTCCTTCTCATTGGCAGTCATCAGAAGAATGAGGTGAACTTTTGCATTAAGCTCTTGTAGTTTGTCTACAAAAAGACCCGAGTCATTTGGTTGATTCTTTTGTCTTCTTAAACTCCAAGCAAATTGTTTATGCATATGAGGTTAGATTCGCAAATAGACTTCATCATTATCACTGTCTGAATATTACCGAATAAGCTGATGTACCAAGTGTACGCTACTTTCCTAATCCTAGGTAACCTGTGCTTATGATGCTATGCTACACAGTATTCCAATCCTCCATTACTAGACATGGCAAAAGTTGAGACTGAAAAGAACCATTTCACTAAATAAGTTTATTTAGGTTAAAATATTATTTTACTTCCTGTGCTTTGAGTTTCATTGCTTCTTGAAACAACAATCTAAAATGCATTTACAACTTCCCTCTGTAATAAGCAAAATTTACTACTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTAATTTTTTTTTATAATAGAGGTACAAATTCTTTTCAACTAAGATACAGTTGACAAGACTTTAGATTTAAGTTGAGCTCAGATAACTGAAATTTTGAAAGGACCATACTTTATTCCATCCATCCGACGTACGTTATTGGCATGTGAATGGTTCAGGAATTCATGTCCCTAGACTGAAAATTCATGGATCAACTCAAAAGAGAATGTGCTGTTGTATGGCTAAGAAAAAACCTACAAGAGGGAAGGAACCCTTACTGAAACTGTGTATTTTGATCTTAGAAAAGTTGTAACACTTAATGGTTTCTGGCCCTAAAATGATTCATCATAGTAGGGTCAGTCTTCATTCTTCAAGCTGCACGAACCCTATTTTACTCATGTAGACCTTTATTCACCTTTGCTCAAAAGATTTTTTGAGGATTGATTATTCGTATTCCGAGATGTCTATTTCAGTCTTTTATGACGATTAAATAAAACCAAAAAAGTCCCACGAAATTTTTGAATCTTTAACTCATAGCGGATGGTTGGGAAGGTTTTGTGGATTATGCAATGATTGACCATAAGAAAGCTTGGTATCGTGAAAGCTCCTACTGAAATGAAGAAACGAGCCTTTTCCCTACCTGAGATTCCCCTCCCCTTCATTTCATCCACCTTATTGTCTCTTTCACTACAAGCCCATTTCTGTAATGAAAATTGGTTGATTATAAAGTTGTCGGGCTGCATGGTTCCTTCTTTTGGGATTTAGGAAGCAGTACTTCATTTCCGTTATACATAGCCTTTTTTTTTTGTTGCATGAAGGGAGAAAACTGATTTTATATTTATTATTTGATGCTTTACAGTTGTATACGACACATTTTGTAGCCTTATGGTATGCCACTCTTATATGGGGAGCTGTTGTATTTTTTTAGTTT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ATGTCGCCCCCAATCCTCTCCTTAGCTCTCCCGTCCCCCACTGGTCGAGTTCTCAGTATTCAGTCCCACACTGTTCAGGGATACGTTGGGAATAAATCAGCTGTTTTCCCTCTCCAACTATTGGGCTATGATGTAGATCCAATAAATTCCGTGCAGTTCTCAAACCACACAGGGTATCCGACTTTTAAGGGCCAAGTTTTGAATGGAAGACAATTATGGGACTTAATTGAAGGCCTTGAAGAAAATGAATTGTTGTACTATACTCATTTGTTAACAGGATATATTGGTTCTGTTTCTTTCCTCAACACAGTGTTGGAAGTTGTCGATAAGCTTCGCTTGGTGAACCCTAAGCTAACATATGTATGTGATCCAGTGATGGGCGATGAAGGGAAGCTTTATGTTCCTGAAGAACTAGTATCTGTATACCGAGAGAAGGTAATACCGGTGGCTTCAGTGTTGACTCCTAATCAATTTGAAGCTGAACAACTGACTGGGTTAAGGATCCAATCTGAAGGAGATGGTAGGGAAGCTTGTAACATTCTTCATGCTGCAGGACCTTCAAAGGTTGTGATTACGAGTATAAATATGAACGGTGAACTCCTTCTCATTGGCAGTCATCAGAAGAATGAGGGCCAGGCTCCTGAACAATTTAAGATCATGATTCCCAAGATTCCAGCATATTTCACGGATCGTAGCACTCAATCCATTGGTTCATATATCTGCGTTGGTGGTTGTTAG MSPPILSLALPSPTGRVLSIQSHTVQGYVGNKSAVFPLQLLGYDVDPINSVQFSNHTGYPTFKGQVLNGRQLWDLIEGLEENELLYYTHLLTGYIGSVSFLNTVLEVVDKLRLVNPKLTYVCDPVMGDEGKLYVPEELVSVYREKVIPVASVLTPNQFEAEQLTGLRIQSEGDGREACNILHAAGPSKVVITSINMNGELLLIGSHQKNEGQAPEQFKIMIPKIPAYFTDRSTQSIGSYICVGGC Homology
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W1X2 (Pyridoxal kinase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 397.5 bits (1020), Expect = 1.1e-109 Identity = 195/228 (85.53%), Postives = 212/228 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O46560 (Pyridoxal kinase OS=Sus scrofa OX=9823 GN=PDXK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 1.9e-58 Identity = 118/225 (52.44%), Postives = 156/225 (69.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P82197 (Pyridoxal kinase OS=Ovis aries OX=9940 GN=PDXK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 1.6e-57 Identity = 107/185 (57.84%), Postives = 142/185 (76.76%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0II59 (Pyridoxal kinase OS=Bos taurus OX=9913 GN=PDXK PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 3.7e-57 Identity = 111/225 (49.33%), Postives = 159/225 (70.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O00764 (Pyridoxal kinase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDXK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 222.2 bits (565), Expect = 6.2e-57 Identity = 109/225 (48.44%), Postives = 158/225 (70.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. NCBI nr
Match: XP_004149445.1 (pyridoxal kinase isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN57886.1 hypothetical protein Csa_011119 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 457 bits (1177), Expect = 7.63e-161 Identity = 229/229 (100.00%), Postives = 229/229 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. NCBI nr
Match: XP_008457077.1 (PREDICTED: pyridoxal kinase [Cucumis melo] >KAA0060743.1 pyridoxal kinase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK01484.1 pyridoxal kinase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 450 bits (1158), Expect = 5.98e-158 Identity = 226/229 (98.69%), Postives = 227/229 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. NCBI nr
Match: XP_038875447.1 (pyridoxal kinase [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 446 bits (1146), Expect = 4.02e-156 Identity = 223/229 (97.38%), Postives = 226/229 (98.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. NCBI nr
Match: XP_022998513.1 (pyridoxal kinase-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 437 bits (1124), Expect = 9.00e-153 Identity = 217/229 (94.76%), Postives = 225/229 (98.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. NCBI nr
Match: KAG6607001.1 (Pyridoxal kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 436 bits (1121), Expect = 2.58e-152 Identity = 216/229 (94.32%), Postives = 225/229 (98.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCU0 (Pyridoxal kinase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G363190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 457 bits (1177), Expect = 3.69e-161 Identity = 229/229 (100.00%), Postives = 229/229 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BQN4 (Pyridoxal kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold451G00360 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 450 bits (1158), Expect = 2.89e-158 Identity = 226/229 (98.69%), Postives = 227/229 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C498 (Pyridoxal kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496845 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 450 bits (1158), Expect = 2.89e-158 Identity = 226/229 (98.69%), Postives = 227/229 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KGY9 (Pyridoxal kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 437 bits (1124), Expect = 4.36e-153 Identity = 217/229 (94.76%), Postives = 225/229 (98.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17101.T8 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G9F5 (Pyridoxal kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452161 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 436 bits (1121), Expect = 1.25e-152 Identity = 216/229 (94.32%), Postives = 225/229 (98.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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