CmoCh05G002860.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh05G002860.1
TypemRNA
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr05: 1238701 .. 1242500 (+)
Sequence length219
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G002860.1
SyntenyCmoCh05G002860.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCATATGGTTGCAATGTCACAATCCCACACAAACTGGCAGTTTCTTGTAGCATATGCTACCATTTAATACGGACGTAACTAACTTTAGAGTTAAGAGTTTGGTGTATATTTTTAATTGCAACATTACAAATATAAGCGACATGCTCCTAGCTGCTACCAATCGAGATCGCTAGAAACAAAAAATAATACGTTATTCCATAATACATACGGCGTCGTTTCGTGAGCCAAACTTAAATGAGAATTTATTTTTTAATTATCTTTATTTATATCACAAATTACCCAAGAAAAACCGTTTAATTTTGAATCTAACTGATAAAAAGCATATATTTTTAATGGAAAAGTTTAAGTTATATATATTATTATTAATTTTTATCTTCTTATCAATTATATATACGGAAATAAATTAATGTATATTAAAACAAATCACATATAAATTTCTTTACATTTAACTTTAAACTTTTTTAAAAGGGTCTAAATAACCTATTTTATTTTGAAACTTATAAAAAATTAAAATTGTGGACAATATTCAAAATTATATGTCGAGATTGAGTAAAGAAGCTTTAATAGTTAGATCTCGAAGTCCCTTCAATGCTGCAATGAGCTTAACCAGTGAAAAGCATTATATCCACGAGTACGATTGAACTGAGCTAAGGTTTGAACCGACCTTTGGTCGAACCGAGCAAAAGTTGGAAAATTTGGAGGCTTTAATGAGAGTGGGCATTTTCCTAAATCTAAAGCCGTAGACATTAGGAGACAAGGAGTAGCATTTATGGGGCGAGTATAGGTTAGATTGACAGACACACAAAAACAAAAGAGAGAGAGGAATGAATGGCAGCAGATGGGTGAGCGGGCATGTTATGATGCACAACAAGGAAGAAGAGTCTCCAAATCAAGCAGGCCATTGGCCATTGGCCGCCCCATGCCATGCAGTTTGCAGCTAGCCCGCCAGCATCGGCAGAAAAAGAAAGGGAAAAAATAAATAAATAAAGCATGCGGCTGGACCACCCTCCATTTTGTACTCTCCGGCGGAGGAGAGAGCCAAAGATAGCAATAAGATATAATTAAGCTCAGCGGCCGGCTGGCTTTTGCATGCGCATGGGACATCCCATGCCCCTACGCTACACATAATGCTAAACCCAACTATCACCCCACATTCATTGCTTGATCTCGATCTCGATCTCGATCCGATCTATTTCACTTTTCAAATTATTCAATGTCATCGTTCCTATTGTCATATATAAAAAGTTCAGAAGTTGAATAATATTGTCGAGGATAATAATAGAATTTTCACGTATATTTACAATAATATGATATTACCTACTTTAAACGTAATTTTTTAAATTATATTTAACGATGATACGATCAGTAATAATAATAGTGAGTATACTATGCAGGACCGATCAAAGGCAATTTTCTAAGGTTGAATGTTAGCTAGGTTATTTTTACTATACATATTCCAAAAATCAATGAGAATTTAACCATATTATGTGACTGCTGGCAATAATTTCTTATTATAAAATAAAGACGTCCCAACCGTCGACTGATTGGAGGTATTCTTTTTGAGGTTCGAGGCTAATGATAGATATACACCCTTATTATTTCAAATTTCGTTATGTTATCTCCCGATCTTTCATAAATATTTCAAAACTACTCTTAAAATAGAAATCCATTAAATTTTTGACGAAATTTGAGACTTGAAGTAGTGATCTATGATAGTGAGATCCCACATCAGTTGGAGAAGGGAATGAAACATTTTTTATAAGGTTGTAGAAAGCTCTCCTTAACAAACGTGTTTTTAAAACCGTGAGATTGGCGACGACATGTAATAAGCTAAAGCATATAATATTTCTTAGCAATGGGTTTGAACTCTCGCAAATGGTATTAGAGCCAAGCACCAAGCGGTGTATTAGAGAACGCTTGGCTTCCAATGGGGTAGATTATAGGAACGAACCATTCCTGATAAAGATGTAGAAACCTCTTCCTAACAAACGTGTTTTAAAATTCGTGAAGCTAACGACGATACATAACGAGCCAAACCGACAATATTTGTTAGCAATTGGTTTAAGCTATTACAAAAGGTATCATAGCCAGGTATCAGCCGGAATGCCAGTAAAGACGCTGACTCCAAGGGGGTGGATTGTGAGGTTCCACGTCAATTGGAGAGAGGAATAAACCATTTCTTATAAGGGTGTGAAAACTTCTCGGACACGTACGCTGACGGTGATTTTTACTTCATTTGAAAGAAAAAAAATATTATTTTAATTATTTAAGAAATTTGGTATTCAAAGTTTTGACTTGGAGATTGAATTAATGGGACGATAGTGATGACGCAGAGACAATAATTCATCCCAATTGATTTTTGGAGTGAAGAGTAGCAATTTTGGGATCCTCCTGAATTATTATATATATATGTTTCAGAAAACAGCTAGAAATAAGTTATTGGCCATTTCCCACCTATATATGGATCATAACTCATGCCATGTCGAAATGTTTAATAATTCTGCATATAAATTAATACCTTCAATATTTTAAAATATTAAATGCTGGAAGTAATTATTTTATTTTTCTGTTTTTCAAAATAATTCTTTCACAATTAAATGACTTAATAAATATTGAGAACCTCTCCTTATTTTCAAATTTTCACAAAATAAATAATAAAATAAAATAAATATTATTGTTTTAGTAATACATTTATGAAGTAGCCCAATTAATAGAACAAAAATTAACCTATTCTAACTCATTAGGTCATTCATGATAAAATTCTTCCATAATTCACTAATTAGTTATGTGTCTTTTTTAGGATAAAATTGTGGCCACCTTGGAGTGTTCTTGTATACTTGTTTGATGGCTTAAATTTAAGTATTTTGTTAATTCAATTTCGTATGATTTATTAGATGATTAAGGGCTAATTTCTAATTTAGTAGTTTGGAACAACCATTAATTTCATCATTTATTCAATTTAAGGATTAGTATGATAAAATAATTGAAACTTTAAGGTTTGAACTGAATCTAGAGTAAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAATTTTTCGAAAGTTTCATATACGTCTATATATATACTTTTAAATTTGTATTCGGTAATTACTAGAAAAATTAAAATTTTACTTAGATGAGGACTAAACTAGTAATTTCACTTAATACAAGTTATTGTCCGTACCTCAATAAGTGAATAAATTTAACTATCATTTTGAAAAATAACACAAATAACTTTTTATTTGTATAAATGGTCAAACGCAAACGATTTTTTTAATAGCTCAATGGACCAAAATACCCCTGCGTAACATAATTTAAAAAATAAATTTTAATTTTTAAAAAATAAAATCACAACCACCAAAATCTACCGAGATAACTAAAAAGAATTAAACAATAAAATGAAAACCCAACTCTTAAAAATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAATTAAAATTCGGAATTATAAAAAAATAAAATATTTAAATTTTGAGAGTATATATTAATTAAAATATCGTAATATTTGATATTTGATTTGATGACTATATCTTAAAAATATATTACAATTTAATCATTTAACAAGGATTAAGGATTAAGGTTTTAAATGTCTAGACAAACATCAATTTTTATATGTATATGTTGGAAATTAATAAAGGAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAATATATTGGGGCTAAAGACAAATCCAAGTGGGATTGTAAATGAATTTAGACGTCCCCCACCACATGCTCATTTCCACTAGAAGTAGGAAAAGAATCCAATTTCAAATCTTGA

mRNA sequence

ATGTCATATGGTTGCAATGTCACAATCCCACACAAACTGGCAGTTTCTTGTAGCATATGCTACCATTTAATACGGACGATAAAATTGTGGCCACCTTGGAGTGTTCTTGTATACTTGTTTGATGGCTTAAATTTAAACAAACATCAATTTTTATATACGTCCCCCACCACATGCTCATTTCCACTAGAAGTAGGAAAAGAATCCAATTTCAAATCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCATATGGTTGCAATGTCACAATCCCACACAAACTGGCAGTTTCTTGTAGCATATGCTACCATTTAATACGGACGATAAAATTGTGGCCACCTTGGAGTGTTCTTGTATACTTGTTTGATGGCTTAAATTTAAACAAACATCAATTTTTATATACGTCCCCCACCACATGCTCATTTCCACTAGAAGTAGGAAAAGAATCCAATTTCAAATCTTGA

Protein sequence

MSYGCNVTIPHKLAVSCSICYHLIRTIKLWPPWSVLVYLFDGLNLNKHQFLYTSPTTCSFPLEVGKESNFKS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh05G002860.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh05G002860.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh05G002860.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh05G002860.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmoCh05G002860CmoCh05G002860gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh05G002860.1:exon:6937CmoCh05G002860.1:exon:6937exon
CmoCh05G002860.1:exon:6938CmoCh05G002860.1:exon:6938exon
CmoCh05G002860.1:exon:6939CmoCh05G002860.1:exon:6939exon
CmoCh05G002860.1:exon:6940CmoCh05G002860.1:exon:6940exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh05G002860.1:cdsCmoCh05G002860.1:cdsCDS
CmoCh05G002860.1:cdsCmoCh05G002860.1:cds_2CDS
CmoCh05G002860.1:cdsCmoCh05G002860.1:cds_3CDS
CmoCh05G002860.1:cdsCmoCh05G002860.1:cds_4CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh05G002860.1CmoCh05G002860.1-proteinpolypeptide