Cmc06g0159381.1 (mRNA) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc06g0159381.1
TypemRNA
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr06: 7619465 .. 7622266 (+)
Sequence length2080
RNA-Seq ExpressionCmc06g0159381.1
SyntenyCmc06g0159381.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTCTTCTTTTATTGTTACAACAAAAACCGTCCCTTTACATCTTCTCTCCCGTTTCAAATTTCTTCCACAACCTTCCTCTCTAACGGCTAACTCCCTCTCCCCTTCTCTCTCGCTCTCTGCTCTTCTTCTTCTTCCTCAGAATTTTCACTCTTCCTCCTATCTCTCAATTTCTACTTCTCTAAAATGAAGCACGCAGCCAAGAAACCCTATCTTCTGGGTTGCGAGATACCCATCTCGCCGATCCACCACCATCTTCTTCTCCTAGCCCTAACGGCGCTTGATCTACATGCCTCTGTACTAATTGAACCAGACGGGAAGCGGGAAGACATATACCATCTGGGGTCCACCCAATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTTTGTTCTCGAGGTTGGACAACGGTTGCCTTCCACGGTATGATCTACATATTTTATCTCTGAGTTCCTTTAAATTCACTAGAAAAACTTCGTTGCAGATTTACAATGAGCAAATCACTGATTTATTGAATCCAAATGCGAGAAACTCTAGGTTCCCCCTTCTAAACAATAAAATGAAAGAGAAGAATAGAGAACAAAATGTTGTTCTTGTTCTATTTCCTGTAATATGAAAAACTAATTTGGTCTTCTGTTGAGTCATCTCCTCTCTCTCTAAAAAAATCTCTCTGTCGTTTTCTCTTTCTAAATACCATTGAAAAATTTGGGGGTCAAGAATGATTTGAGGGTCAGAATTCACTCTCTAAAAAACACTCTGAGATTTATTTGAAATTCTTGTTGCTTAATAAATTCCCTTTTGCATCTCTTCATCCACCCTTCTCTTTATCCTGAATTTTATGATATTTATTTTGCATCCTAAATGCCTCTGTACTAATTGAGAACCAGACGGGAAGCGGTAAGACATATACCATCTGGGGTCCAGCCAATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTCTGTTCTCGAGGTTGGACAATGGTTGCCTTCCACAGTATGATCTACATATTTTATCTATGAGTTCATTTAAATTCGCTAGAAAAACTTCGTTGCAGATTTACAATGAGCAAATCACTGATTTATTGAATCCAAATGCAAGAAACCTCTAGGTTCCCGCTTCTAAACAATAAGATGGAAGAGAAGAATAGAGAACAAGATGTTGTTCTTGTTCTATTTCCTGTAATATGAAAAAAACTAATTTGGTCTTCTGTTGAATCATCTCCTCTCTCTAAAAAAATCTCTCCGTAGTTTTAACTTTTTGTGTGTCGGTGAAATATTGCTATGGATATGGAGTTTATTATGATTTTTGTCTACACCGGCGGTTTTCTATATGGTTCAATGGTGCCTTTGAATTGACAGATCAATGGACGGTATGTGACTTAATTATTTATCAAGATTTATGCTTAATGCATTGTTTTTGTTTGTGCGAGGTGAACCATATCAAATTGTTGAGTTTGTTGTAGGTTTATTAATGAGAGAGAATGTCTGGTGGGGCCAGAATAGCTTTAGAAATGCATTGGGAGCTCTGAAGTATATACTACCACAGTTTCATTAGCTAAAGTTAACAATGATTATAAGGTTTTATAAGTCCTACTCTAATTGCATCTCAATAGCCTAGATTTACCTCATGTTCTTGACGTGGTGTTGAATTCAGGAGTTGGACATTGCTATAGTTAAGTCAACAATGAACGTCCTGCGAAGGAAAAACATATATGAGGTGTGTTCTTTGATGCCCTTCTCAAGATAGTAATATATATTCTCGCATAATTAATTATACATCTTCATCTTTTTTTCATTTGAACCTTACATTTTTGTTTGACAATGCAGCTCTAAAATTTGGTATTGTACGATAATAGAATCATAATATTACAATAAGATGGTTTTGGACTTTTTTCGCAGCTATTTTAGCTACCAAGCCTAGAGCCGATGTTGCATATTGCATTCATGCTCTGGCAAGAAGATTATCGAAGAAACATAATTGGGTAGTAAGTCTTCATCTTTTGATATCATAAGCATTACATTATTGCAGCACCACGACTTCTCAGGTTTTTCTATTCTATTCTTTTTCTTTTAATATTTCGGAATTTGGATTGTCTATATATATTGTTGTTGTTTTCGTTTATCATTTATTTTTATTTTGGAGAGTGTCTATGGTAATTTTGAGGTGATTTAAGAAAAATTGATTGTCCGGGAATCAATTTTTCTATATTACCTTAATTCTACCTTAATAGACAAATATGTGTGTTTTAATTTCACTTTAGTTGGGTCTTTATTTTTTGTTCTCTTATTTTAAATCTTTCTTTTTCTTTATTTTTTTTGAATATTTTTGAATTTTGCTTGTTTAATTTCTTTATTGCCTTTTTTCCTTTATCATTTGATTGGAGTGTTCTTAGTAAATCTGGAGGGGTTTATTGATTGATCAGGAATCAACCTTTCTATATTTTAATTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTTATATATTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTATTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTATTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATATTGT

mRNA sequence

CTCTTCTTTTATTGTTACAACAAAAACCGTCCCTTTACATCTTCTCTCCCGTTTCAAATTTCTTCCACAACCTTCCTCTCTAACGGCTAACTCCCTCTCCCCTTCTCTCTCGCTCTCTGCTCTTCTTCTTCTTCCTCAGAATTTTCACTCTTCCTCCTATCTCTCAATTTCTACTTCTCTAAAATGAAGCACGCAGCCAAGAAACCCTATCTTCTGGGTTGCGAGATACCCATCTCGCCGATCCACCACCATCTTCTTCTCCTAGCCCTAACGGCGCTTGATCTACATGCCTCTGTACTAATTGAACCAGACGGGAAGCGGGAAGACATATACCATCTGGGGTCCACCCAATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTTTGTTCTCGAGGTTGGACAACGGTTGCCTTCCACGACGGGAAGCGGTAAGACATATACCATCTGGGGTCCAGCCAATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTCTGTTCTCGAGGTTGGACAATGGTTGCCTTCCACAGTATGATCTACATATTTTATCTATGAGTTCATTTAAATTCGCTAGAAAAACTTCGTTGCAGATTTACAATGAGCAAATCACTGATTTATTGAATCCAAATGCAAGAAACCTCTAGGTTCCCGCTTCTAAACAATAAGATGGAAGAGAAGAATAGAGAACAAGATGTTGTTCTTGTTCTATTTCCTGTAATATGAAAAAAACTAATTTGGTCTTCTGTTGAATCATCTCCTCTCTCTAAAAAAATCTCTCCGTAGTTTTAACTTTTTGTGTGTCGGTGAAATATTGCTATGGATATGGAGTTTATTATGATTTTTGTCTACACCGGCGGTTTTCTATATGGTTCAATGGTGCCTTTGAATTGACAGATCAATGGACGGTATGTGACTTAATTATTTATCAAGATTTATGCTTAATGCATTGTTTTTGTTTGTGCGAGGTGAACCATATCAAATTGTTGAGTTTGTTGTAGGTTTATTAATGAGAGAGAATGTCTGGTGGGGCCAGAATAGCTTTAGAAATGCATTGGGAGCTCTGAAGTATATACTACCACAGTTTCATTAGCTAAAGTTAACAATGATTATAAGGAGTTGGACATTGCTATAGTTAAGTCAACAATGAACGTCCTGCGAAGGAAAAACATATATGAGCTATTTTAGCTACCAAGCCTAGAGCCGATGTTGCATATTGCATTCATGCTCTGGCAAGAAGATTATCGAAGAAACATAATTGGGTAGTAAGTCTTCATCTTTTGATATCATAAGCATTACATTATTGCAGCACCACGACTTCTCAGGTTTTTCTATTCTATTCTTTTTCTTTTAATATTTCGGAATTTGGATTGTCTATATATATTGTTGTTGTTTTCGTTTATCATTTATTTTTATTTTGGAGAGTGTCTATGGTAATTTTGAGGTGATTTAAGAAAAATTGATTGTCCGGGAATCAATTTTTCTATATTACCTTAATTCTACCTTAATAGACAAATATGTGTGTTTTAATTTCACTTTAGTTGGGTCTTTATTTTTTGTTCTCTTATTTTAAATCTTTCTTTTTCTTTATTTTTTTTGAATATTTTTGAATTTTGCTTGTTTAATTTCTTTATTGCCTTTTTTCCTTTATCATTTGATTGGAGTGTTCTTAGTAAATCTGGAGGGGTTTATTGATTGATCAGGAATCAACCTTTCTATATTTTAATTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTTATATATTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTATTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATGTTGTTATTTATATATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTATATATTGTTGTTGTTGTTTATATATTGT

Coding sequence (CDS)

ATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTTTGTTCTCGAGGTTGGACAACGGTTGCCTTCCACGACGGGAAGCGGTAAGACATATACCATCTGGGGTCCAGCCAATGCTTTGTCCGATGGTTACTGTTCTGTTCTCGAGGTTGGACAATGGTTGCCTTCCACAGTATGATCTACATATTTTATCTATGAGTTCATTTAAATTCGCTAGAAAAACTTCGTTGCAGATTTACAATGAGCAAATCACTGATTTATTGAATCCAAATGCAAGAAACCTCTAG

Protein sequence

MLCPMVTVLFSRLDNGCLPRREAVRHIPSGVQPMLCPMVTVLFSRLDNGCLPQYDLHILSMSSFKFARKTSLQIYNEQITDLLNPNARNL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc06g0159381.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc06g0159381.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc06g0159381.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc06g0159381.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381Cmc06g0159381gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381.1-exonCmc06g0159381.1-exon-CMiso1.1chr06:7619465..7619873exon
Cmc06g0159381.1-exonCmc06g0159381.1-exon-CMiso1.1chr06:7620338..7621020exon
Cmc06g0159381.1-exonCmc06g0159381.1-exon-CMiso1.1chr06:7621097..7621159exon
Cmc06g0159381.1-exonCmc06g0159381.1-exon-CMiso1.1chr06:7621342..7622266exon


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381.1-five_prime_utrCmc06g0159381.1-five_prime_utr-CMiso1.1chr06:7619465..7619814five_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381.1-cdsCmc06g0159381.1-cds-CMiso1.1chr06:7619815..7619873CDS
Cmc06g0159381.1-cdsCmc06g0159381.1-cds-CMiso1.1chr06:7620338..7620551CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381.1-three_prime_utrCmc06g0159381.1-three_prime_utr-CMiso1.1chr06:7620552..7621020three_prime_UTR
Cmc06g0159381.1-three_prime_utrCmc06g0159381.1-three_prime_utr-CMiso1.1chr06:7621097..7621159three_prime_UTR
Cmc06g0159381.1-three_prime_utrCmc06g0159381.1-three_prime_utr-CMiso1.1chr06:7621342..7622266three_prime_UTR


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cmc06g0159381.1Cmc06g0159381.1-proteinpolypeptide