CmaCh16G007140.1 (mRNA) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh16G007140.1
TypemRNA
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr16: 3713387 .. 3730370 (-)
Sequence length327
RNA-Seq ExpressionCmaCh16G007140.1
SyntenyCmaCh16G007140.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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mRNA sequence

ATGGATAATTCCCCATCTCATCAGCCATCGGGAGTTCTGCCATATGGGTACTTGGGGTTTGGATCTGTTAATGCTCCTGGAGCTGCACCCAGAGAAATGAGGGCAGCAACTGAGTGGAACGCCCACTTTCTGCCATGTTTTGGAGCTCGATTGACGACGACTAAGATCAAAGCAAAGCCACGCTTGACGCACAAAATACCGCAGGCGATTGCTGACCTCGATTGCGAAGTTAATCACGGCCAAGAACTTCCCATCGCGTGCAAAAAATGGAAGAAGACGATGAATTTGAGTGGAACGGAGTCAAAGCATTTGTCGACGACTGTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATAATTCCCCATCTCATCAGCCATCGGGAGTTCTGCCATATGGGTACTTGGGGTTTGGATCTGTTAATGCTCCTGGAGCTGCACCCAGAGAAATGAGGGCAGCAACTGAGTGGAACGCCCACTTTCTGCCATGTTTTGGAGCTCGATTGACGACGACTAAGATCAAAGCAAAGCCACGCTTGACGCACAAAATACCGCAGGCGATTGCTGACCTCGATTGCGAAGTTAATCACGGCCAAGAACTTCCCATCGCGTGCAAAAAATGGAAGAAGACGATGAATTTGAGTGGAACGGAGTCAAAGCATTTGTCGACGACTGTTTGA

Protein sequence

MDNSPSHQPSGVLPYGYLGFGSVNAPGAAPREMRAATEWNAHFLPCFGARLTTTKIKAKPRLTHKIPQAIADLDCEVNHGQELPIACKKWKKTMNLSGTESKHLSTTV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G007140CmaCh16G007140gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G007140.1:exon:1036CmaCh16G007140.1:exon:1036exon
CmaCh16G007140.1:exon:1035CmaCh16G007140.1:exon:1035exon
CmaCh16G007140.1:exon:1034CmaCh16G007140.1:exon:1034exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G007140.1:cdsCmaCh16G007140.1:cds_3CDS
CmaCh16G007140.1:cdsCmaCh16G007140.1:cds_2CDS
CmaCh16G007140.1:cdsCmaCh16G007140.1:cdsCDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G007140.1CmaCh16G007140.1-proteinpolypeptide