CmUC08G158690.1 (mRNA) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC08G158690.1
TypemRNA
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr08: 27417124 .. 27422658 (-)
Sequence length213
RNA-Seq ExpressionCmUC08G158690.1
SyntenyCmUC08G158690.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGCCTAAAAATTTGGGCCGCTTGGGGAAATGAATTGTGGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGACCAACGCACCGCCAATATTTCGTTAAAGTTCATTTTTTTTCTTTTTTGTTGCGCGCGCGTGTTAGTTATACATTAAAATTATTTTTAAATCAATAGGTTAAAAGTGTACTAACAATAGAGCTATTTTTACAAAGATATATTTACCAGTTATTTTTAGTCCAAATATCAATACCCTTACGTTTTTTTGTTGTATCGATAAAAACCCAAAATTAATAATTCTATTAAGAGAAATTGTATATAATGGAAAAAAAAAAAGAGAAAAATAAAACTCTCATTTGTTTAAATAACCAATTTTTAATTTTTTTGGTTAATAGTCATTACACTATGTGGAGGGTCCCATCCATCTAATTAATTTCTCTATTTTACCACTCAATTTCATGGTAGCTTCAAATAATAAAATAAAGAGGACAAATATTTTCTCACAAATTTAGGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGTTTTTAAATTTTTTTAAGTAGATTTTGTATGGATTTGGTAAACCCAAATAAAAATTTTGTGTTGTTTTTTTCTTCCAAAAGAGACTTCTACCTTTGTCCAGGTGACATTGACAAATTATATTTTCCAAATTATGTTTTTTAAAAAATTATGATTGATTCTATCATAACTTTTTAAGACTAGTTCTATGGTCGTTTATGAAAGTGACATTGCTTAATCATTTAGTCATTAGATTGACATTCTCAAAATGTGTTCAAACTTAAGGTATGTATTGTATTTTTGTATTAGGGTATATAGATTGGTTCGAGGTATTTTTGCAAACTAATTTGAGGTGTCTCTAAATCAATGATGATTGGAATGAAAAATGAATTGGAAATTTGAAAATAATTGGTATTTCTATGGGAGAATTGTAGTAGTGTAGGCAACATGAGAGGTTGGGAAGGAGAAATGGTGTATTTGGTGATGGTGAATCTACCGTGCACACATAAGTCACCATGGAAGTTGAGAAGATAATAAGTTGTTTAGATTTTGGCCTAGACTTTAGGTTTTGAGTATAAAGTATATGTGAGGTTCAGTTGATGGTTTTTTAGTTTTACGAGTTTATGAGTTTACGAGTAGAATGTATTTGTGGGGCTCAATAGACTTCATTTGATAATTATTTTGAATACCATGTATTTGCTTATTTCATGTCTAAATTTTGAGTTATTAATTATAACTTTTCTAGTTTTCAACTATAATTTTTAATTATGTTTTTTTTTCAAATTTTTTAACTTTAAGTTATTTTAGTTTGTATGATATTATTTTCTATAATAAAAGTTAGTTTTGATATGTTATTTGATTTAAATATTTTTTTTTGCTTCATAATAAATGTATGTTCAAATTTCAAATTTATAAAATTTTTTATGGTTGAGTTTATTAGATATTGTTTCAGGCTGTTAGATTTTTCTTTGAAATACATCGTAATCTTAGGGATTTGATAGCAGGGGTACTCTTGTCTATTATTAAATTTTAAGTAGTATTAGAATTAGTCGGTCGACCATTTTCACCGATAAAAACTCGTTAGACCATTTTTCTAAAATGTCATTTTGTTTTAGCCATTTGTCCAATCGCTCATTCTATTAATTTAAACATTGAACACCTAACATTCATAGGAGGATCATTTATATTATTTCTTAGTGATTTTCAATTATTCTCACTTGAATTACCTAGACAGAATTATCCTTATCCAAAAATCCTACTAAAGTAAAAAGAAAAGAAAAAAGTCACAAAATTATTTGGGAAGAGTAAAAAAATATTAAGGAAAACGAGCATTTTAAAAATTACTATTATCTATTTGATTATTGTATTTCTCACTAATTTACATTAATCCTTACAATTCAACGAGCTTTAAACATGTGTGAAATTATGCATTAATAGTTTTAAAACAAAATTAGTTCACTCATCAATACTTAGAATTTAACTAAGTACAATTATTAGTTTGAACTTTTAATCAATATGATTTTCAATCTCTTAACAGTATCAATTAATATATACACGTTTATTTATTTACCAAATCATCAATTATGAAATCACATTTGAACTAATGTTTGATGGACACTAATAACAATTTTAAAGTTGGAGTGTTTTTGAGTGTTAAAGTTGAGTTATTAAATCTAGAGTTTGACATGTTGGAGATAAAGTTCATCAATAAATGTGTAAAAATTCAATAGTACTATTAAAGTTGAATTTTTTAACCTCAACTTATGAAGTTAGTGGGCCAAGCACTCCTTAAGAAAAGTTGAATTTTTTAACATCAACTTATGGAGTTGGTGGGCCAAACACTCCCTAAGTACCCGTTTGGATTGCATATATTATTTCATAGGTATAAATATTAAATATTTAGGATTTGATTGTTTGAGTTTTAAATGTCCGAGATAATTAATGTCTATGTTTGGATATACAAAATATTTAATGTTTAAAAGTTAAATATGTGTGTTCAATTTACCAATTTTGTACATAGAAACAAATTATTAAGTAATTAAATGCAAGAGACCAATTTAAGTAGTCATCAATTAAATTTAGATTATCTAATTTATCAATATTAATTAATTATTTCATCCATTAAAATCAAAATAAATGAATACTTTTATATTAAACCTAATTAAATTATTTAAATTAATTACTAAAAGCAATTAAATTAATATAAATTAATTAGAATATTCATAATCCATAATAATAATTTATATTAAATAGTAAAAGAAGTTGAAATTTATTAAGTCTAAATAATAAATCAATATATATTTAATAATTAATTAAAATTAATAGTAATCAATAATTGATATTAGTTTATTAATTAATTATGCTATATTTTACTACTCATCTTTTGGGCATAAAAATCTCACAATTATGCATAGTATTAAAAAACCCATGACAAATAAGTTTTAAAGTTAGATAATAATATCTTGGGTTTTAAGAAGTAGAATTTTGTGAAACAAATATGAATATTAAATGTTTGTCCGAGATCTCATAGAAAACTTGTGAAACAAAGAGAAAGAGACCACAAGTTGATAAGAGTACCAAATTACATGATTGGAGAACGATTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAAGAAATACTTCATTGAAACATCAAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTGGAAAAAAAATATATACTGAAAGCTTTACCATGAAAAAAGATTGAAAGACTTATGGCACCATATCTTTCTTTTATAAGCAAATAAAGATCATTAATAAAGTTAGGTCTCTTCCTTTAATGTCAAATGTACAAGTCACCGAACAAAATGCAACTTTGACAGTTTTATCAATATGGGGTGAAAATTTGAATTTCTAACCTGATAATATAAATAGTTAAACTATGCTTCAAACTGAAAAGTTTAGAGAATATTTTTCGTTTAATATCATAATATCTTAACCAAATTAATAAGCTAGGTAGATTACGTTCGCAATTAACTCAAATTTTATAGTTCACCAACCCTAACACTTACATTAGTTTCACTTGATTAGTGCATGTGATCTTATACACCATGCCTAACTATAAGGACGCCCTTTTTTCTTCTCACATGGAAAGTGTTTTTTATTTTTATTTTTTCTCCTCCTAATAAAAAACTTCATAAATAGAAAAGGAATTTTAGGGGAAAAAAAATGAAATATTAATTATTAGCCAAAATTTTGGAGAAATGGAACTGAGAGGCCTGTGTTGTGTCCTTTATAATTAGACAAGTCTGGTAACTGTTTGTTAAGTTAGTTTAAATAAATAAAATAATGGATGGTATGCTGTTCAACTTTATGTTAAGTTGATGATATTAATCACTATATCCCTTTTCTTGGGGCAATATCAAGTTTTGTGAATACTTATTCACATAAGTATGCATTTTAATTTTAATTGTATGACCTATTTTTATGAATCATTATTTATTATTTTACTTTTATTAGGTAACAATCTATGCTATGCAAAATAGTATTCTCAATATCATTTATTCACAAAATTCAAAGTCTATTTTGGATACTAATGTGGTCAATTGGATATCGATATTATAAAAGTTATAAATTATGCGTTGATTAACATTTATCTTGGTTACTGAAAAAAAAAATAAATTAAAATGCTATGAAAAGATTACCATTACATGCTTATTATAGCTTTCATTTAAATGTCTAAGTAAATATTTATATTGATAAATAAATACTATTATAAACAATCAATTAAATTTTAACTCCTTTCTTAAAAAATTCTTTTTCTAATCTATTTTTCACTTTTTCAGCTTGTTAGTAGAGTACCCCATAATGTGAAATAGCGTTTTTATCCTTATTAATTTTGACTTCTAATTCTTCTTGAAATCATCGCTCTCTTCCTCTAAAACTTTCAAAATGAAAAGAAGGGTGGGTCATAAATGTGTTCTGTCACTTTTTTCGTAAAGTGTTGATCGGAACTTTGCGGAAAAGGTCATATAGAGCTAATTTCTTTCTAGTAAGTTTGCTATTTTGAAAGTCTAAGTGTCCAATTTTTTCAAAAAATAACAGATTTGTTCATTTGAGGTCCATTACTTAGCAGAAATTGTGGTTCTTTTTCAAAATGGATTTGACAGAAACCCAAGTTCAAAATAGTTAAAGTCCTTTGTGTTTTTTTATTCTCCTAACAGAAATCACACAAAAACCCCCATCCAACATAATATTTCAATGCAAACGTTGGGAAAAAAACCCTATAATAGAATCTAAACAAATGAAGGATTTACTCTTTTTTTCCAGAGAGGAAGGGATGGAGGGGATGATTTGGTCAGAGGAAGTTTTAGAGGAAGGTGAGCGATGATTTCGGGAAGAACTAGAAGTCGAAATTAATAAGAACAAAAACGTCATTTCACAATGTGGGGTCCACTAAAAAACTGAAAAAGTAAAAAAGATGTTAGAAAAAAAAGTTTTTTTACTTTTAAAAAAGATTAGATTTGTCCTCCAAAAACATTTTTAAGTTAGAAATAGCAATTTTCCAATCTCTTTCATAACTTTGATATAAATCACTAGTTTATAAAGAGAATAATATGCTATTAAAAAGGTATTTTTATAACATTTATCAAACACTATAAAAAAAACTAAACTTTTATAGCTTTTATAACATGACATTGGTTATCATGACTTTTTGTAAAATGGTATTAAGGTCTGTGATAACATTTTTCGTAAGCTATAGTACATCTTTTTTTTCGGTAGCGAGCTCAAACAAAAAGTCAAGTTCGAATTTTCACTATGAATTTACTATTTTCCATTTTTTAAAAAGAGATTATTTTGTCTATATGTGAACATTAATTACCACAAATATGACTACGTTTTAAAACGTTTATGTTTCAATCTTCCAACTCCAATGAAAAAAAAAGTTCCACATTCAACAGCTGACCTATAAACTATAGAACTTTATATTTAGCTACGATATCAAATTTTATTTTTTATGTTTACTGTAGTCATGAATGAGAATATAAAACGTGCGACCTAA

mRNA sequence

ATGGGCCTAAAAATTTGGGCCGCTTGGGGAAATGAATTGTGGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGACCAACGCACCGCCAATATTTCGTTAAAACAAGTCTGGTCTGTGATAACATTTTTCGTAAGCTATAGTACATCTTTTTTTTCGGTAGCGAGCTCAAACAAAAAGTCAATCATGAATGAGAATATAAAACGTGCGACCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCCTAAAAATTTGGGCCGCTTGGGGAAATGAATTGTGGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGACCAACGCACCGCCAATATTTCGTTAAAACAAGTCTGGTCTGTGATAACATTTTTCGTAAGCTATAGTACATCTTTTTTTTCGGTAGCGAGCTCAAACAAAAAGTCAATCATGAATGAGAATATAAAACGTGCGACCTAA

Protein sequence

MGLKIWAAWGNELWAGRIYVFCGSDQRTANISLKQVWSVITFFVSYSTSFFSVASSNKKSIMNENIKRAT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmUC08G158690CmUC08G158690gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC08G158690.1-exonCmUC08G158690.1-exon-CmU531Chr08:27417124..27417155exon
CmUC08G158690.1-exonCmUC08G158690.1-exon-CmU531Chr08:27417383..27417453exon
CmUC08G158690.1-exonCmUC08G158690.1-exon-CmU531Chr08:27418875..27418883exon
CmUC08G158690.1-exonCmUC08G158690.1-exon-CmU531Chr08:27422558..27422658exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC08G158690.1-cdsCmUC08G158690.1-cds-CmU531Chr08:27417124..27417155CDS
CmUC08G158690.1-cdsCmUC08G158690.1-cds-CmU531Chr08:27417383..27417453CDS
CmUC08G158690.1-cdsCmUC08G158690.1-cds-CmU531Chr08:27418875..27418883CDS
CmUC08G158690.1-cdsCmUC08G158690.1-cds-CmU531Chr08:27422558..27422658CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC08G158690.1CmUC08G158690.1-proteinpolypeptide