CmUC06G119010.1 (mRNA) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC06G119010.1
TypemRNA
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr06: 22087390 .. 22093417 (+)
Sequence length204
RNA-Seq ExpressionCmUC06G119010.1
SyntenyCmUC06G119010.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTAATTACTTGAATCTTCCAGTTGACCTGGTTCTTATGTGTTTTAAGTATTTATTATTCAAGTGCTTTCACTGTTTTCTTATTATTTTATTATTGTGTTGTGTTCTCGGACATTCCATTTTCTTGGAGTTCCTAATTTTAGAAGCAAAAGTTTAACATTGACGTTTAACAAAAGCAATTTACGTATTTGTGAATTGTGAATTGATTATGATAACTCTAATTCGTTAAAAATATTGTTTATTATTTCACTTTGGAGAGAACATGTACTTAATGTCATATTTTATAGTGGTATATTAAGTGAATTCAAGTAAAAGCAAGACAAACATTGTGTTTTAGTCTTAATTTGTGAAATGAAGCTAAAAAGTGTAAATAAATAGAGTCAAATTTTGGTGTGTTATAATGTTTGTATGTTAAAATGCAGCAACATTATCAAAGCTGCGCTACATTGCATCCTCGATCACAATAAATGACATAAGCAAAAGCAAATGAAAAGTGCAGGAATTGAGCCAAGGATGCACCAACCTTGCAAGTGTATTATACATTTACGGAGAATCAAGATTTGCAAAATCTCTAACCAATTCAAATCAAATCTACCTTATTCTCGATTGAACGGAAATGAATCCCAAGTTGATTTGGAGGAAACTCTAGGCTTAGAAAGTTTATAAAAGGCGGTCACAACTCCATTAGATCATCAAGATTTGATCTCTCGGAGAAACTTTAGAAAATCCATCACTTTCACATCTATTTGATCAAGATCTTTAGAGAACTACCGATGCAACATTCTCTCTTCAGTTTTGTCTAGCATTTATTTAGCTACTTATATGGAAAGAACAAGTGTAAGCTTGATTCAACTTGAAAAATATTGAACCAAGCTGGGTAAAAGAGCAAACTTTTGAGAGTTTTTCATTTTGTTCTACATTCTCATTGTATTTTTTCTTTGTTGAGTCTAACGTTTTATGTTCTTTACTTCATTTTATATGCTAGAACACTTTTTATATTCTTTCAAGTTTCATTTAATATGAGTTTAAGTTTATTGTCATTATGTTCTTTCTATTTTACTTTGAGCTCTTGGGATTCAAATGTGTAGAGGCTTTAAGAAAGGAATAATAGTCACTTTTGGGTTCTAACTACTTGCTCAAAACTTAGTCTCATTTTTTTTTTATTGATTTAATATTTATTGTTAGCCACTTAGGTAAGCAAACCATATCAAAATTTGATGATTGAAAGAGTAGGGTAATATATGGTTGTCATACAAATAATATAGGAGAAAATACTATACATAAGATTTCACTTTTTACCTAGAAATTAGGGCATAACGTATAGAATTTTTAGAATTGCATGCTCATTTATCTAAGTATATTTCTATTTAATTGTTTAGAGTCTTAAAAGTACCTAAAAGATGAACAAATAGTTATTGAAATTGATTCACCTTGCTAAGTAAAACTAGGGTCAAACTTGGGCCAAAGAGCCCAATGTAATAGCAGAAACTCTAAGTTCAAGCTCTACAATCTAAACCTAAAATCATTTCATTCTCATTAATTTCTTCCACTCTCACACGTTAATACTCATTTGACAAATGAGATGATATGTGTTAACCAATTAAACTATATTTAAGTTGATATAAAAATTATATTAATTCATCGAACATGGTCTCATACTCAGCCTCAATTATTGTGAAGGCATTACCACTGGTCTCTATCAATGTCGGTGTTACTCAGCTCATTTCACTTAATGGACTAAAACTTGTGTCCTCATAAATTTTGAATTCCCTACAATTATATTCCATTGTATTCTTTTTAGTTTTGCATAGAAGAAAAGTGGAGTAAGAAGGATTAAGTTAAAAGGAGAGTGTCTATTTCAAGGGCATGTGGGGGAGTGGCATAGGAGGCCGCCGGCATGTGTAAGATATGTAGGCAGAGGTTTTTAAAAACCACACTGTCCATTGCTCTAATTGTGGCCTGTGGGCCAAAACACCTTAACATCGATGTGATTTTTCACTGTCGGTGGGTTGTCCATTGGCCCCAAATTGCCTCATCCATTACCTTTCCAACCCACATTCAGTTTCATAGGCCTCTCATATTATGTTAAGATTAGGAATCTCCTCTCATACTTTTCAAAATCAGGATCCATTTTATAATTATCAAACATTTATATTCTCTCTCAATTCATAAAACCATCATACAAACCAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATACGAGGATGCATTTTAGTACCAAAAAAATTAAAAACAAGCCCGTAAATCTACCAACAAATTTAATTGAAAACAACGATTACAACAACACTTAGTGCCTAACTTAATCAACCACCTAGGCTACCCCTATATGTGAGACTCCTTCTCAATTATATACGTCATATTAGTGAAACAACACTTAGTGTGAGATTCCCTCTCACAGTGAAGAATATTTCTCTCCTATCAGCTTCCCTTTACTTGAAAACTTAGGCTCCCTAAGTCTGAGAACCCCTTCTCAATGAACTTATCCTTAAGCTCCCTCTATGGACAAATAATACTTCTCAAGAATATATATGAACTAATCACTACACAACCATTAGTAGAACAAGCTGCTAATAACATAGAAAACTTCTTGCTCTATAAACATAAAAACCACATAATGTTGTATGTCAAAGACACAAAGAACAACCTCACAAAACAAATGCAGCAATCCTAGCAAAATCACTTCTTGTCCTTACATAGCACAATGGAAATATGGAAATAATCCCTCAAATAAAACCGACAAACCGTAAGCAAGAAAAGCAGAGGAATAAGGAGTAAGATGTAGAATAATTTAAATAAAGAAAGAAAATATTCTGCAAAATCAGCATTCTGTGAGACCTCCTCTGAGACAACACAAAGTCAACCCATTAAGCAACCAACCACAATCTTAAAATAAATATAAAATCAAATGCACAACTCTAACGAGTTTCATTTTGAAAAATGACAAAAAAGTTTTGAAATCAAAAAGTTGTAAAATGATTTCAAGGGTTGTTGTTCAGAAAATATTAAATGACCTAAATACCTGTAAGGAGAAAAGAAAAAAAAACTTATTAATTGAAAAAGAATGAAAATAAACATGCAAAATAAAATTTAAAAAACAGCTAATTGAAATTGATTTTATCCCAATATTTTTCAAAAATTTCAAATTTAATAAATATTTATAAAAAATTACTTTTTTAGTCTCCGAAGAATATATGTGTTTGGTTATTGAGATTTCAAAACATACTTTTTTTTAGTATTCAAATTTTAAAAACTCATGGACCAAATACACTTATTCTAAAATACTGAAGATTAAAAAGATATATATGTTTGAAAATTTTCATACAATTTAAAAATTCATTGACTAAATACACTTATTCTAAAATATTGAAGATTAAAAAGATACATATGTTTGAAAAACTTAGAGACCAAACGTACTTATTCTTCCGAACTCAGTGATTAAAAAATATATATTTTTCCTAAATTTTTTCTTAAAATTGAAGCTAAGAGAATGAAATACCTCTCTCTAACCATAAATCTTCTGGAAACTTGGAGGGATTATTTGTTTTTCTTTTCATATTATTTATAGTGAAAATTAAGAAAGTTTTAACCAATCCAATTCCCTTATAGCAATGGTGAGGTCTCTTCATTAGTTTCTCAACAAGCCTTTCAAGATAATACCTTTTTAACCTCATAATTCTTGAGTCGAAGTTTTTTAGAATGAATACCATTTGGACTCATGTATCGTTTTAACTTGAGATCCTCAACATTCGATGTCTATCTCCATTTTTCTAGTCTTCCTTAATGTTCATGCAAAATTATAATTTTAAAGTGATATATATCTTCCTATCTCTTCTGTCAAATAGACAAACTCCCACTTTCATGATAGAAACTAAACCATAATTTGTTTCTTCATCCATTTAATATGAAGAAAAAAACCAAAAGGGATGTCAAATTCCTCCCCCTAAGTTCTTTAATTTAAACCAAATTTATTAATGGAGGGGAAAAAGGGGGGAAAAAAAGTTGGAGAATAGTTAGTAATTAAAAGACTAAGACTTTACATAATAAATTAAAACCCAAATCCCAAATGAATATTAATGTAAAACTAAAAACAGGACATGTTCTGTCTCTAAGCATCAATTTGGAAGGCACCTGTTTTTGTCTCTCCCATTTTCTTCTATTTCTTTTTGGGTGTTTTATTTCTTAGGAAATATCTATAACTTTTTTCTTCCCATTAAATTCAATTGTCAATGCATTTGATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCTGGATATTCTCATGCTTAAGAAAAAAGTAAAAACAGTACTTATTTTTTCTTTTCAGATTTTCAAACATGAAATTGGAAGGCTTTTGCCATTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAAAACCTTCTCATTTTATATGTCAACTCAATTCAATTCAAGTTCTTGTTTGTTTTTAGGTTGAAATACCATTTTGGTTTTTACTTTAAGGTTTATTATATTTTAGTCTCTATAATTTTGAAATGTTCAAATTTAGTTTATGTATGTTCAATAATCTTAAATTTAGTCATTTAAAGTTAATTTTTATTGTCAAAGTTAGCATAACTCAACTCACATCTAAGATGTATTGTTAGTGACTAAAATTTACTTTAAATAATAATAATATGTTACTAAAATTTATTAGAAACACTAATAGGGACTATTTTTTTTTTTTTGGAAAAAAAAAGCAAATTTGAGTTTAAACTTAAACAAGTGTTGTCATTTTTACCCTTTGTTTCAATTTCCACTAATTCAATTTTAACAATATATATAAAAACCCATTATTTTCAATAAAATGAAGAATTGTAGAGAAACAAGTTTGACCAAAGCACAAAATTAACAATTGACAAGACTTTATTCATATATTAAAAAAAAAAAACATTCTAATGGCTTTTTTCCTCTAAAATTTTATCTAGCATACATTTATTTGATAATCTACTAGACATATAAAGAAAAAAAATATTTTCTAACTATATATGGAGGGAGATTTAATAGAGAGTTAAAATTGCAATACATTTTTAAAGTTTAAGATTTAGATGGCAATACTTATCTACATTTTGGATACAATTTGATGAAATAGAAAGTTTATGGTTAAAATTGATACAAATTAACGAAGTTATAGGTCAAAATTTGATTTTTTTTCAATTAATAATAAAGTAACAAAAATGGCTACATTTAAGATTTATTAAAAAAAAAAACTTCATAAACTAGATTTAATGATTGGAAAGTAAATGATATATTAACCTTAGTTTTATTTATTTGTTTTGGGGCAAAGGAGAGTGAGTGAGTTAGTCAAAAGTACAAATGATTAAAAAAAAAAAAGGACACAAAGACAGTTTGAAAATGGACACAAATAGACAGAGATATATAATTTTAAAGGAACAATTCCCATATGGTTATGGAAAGTTTTCTTTAGCACAATCTTCTGCTTCCTTTGTGTTTCTCTCTTACACTTTACTTCTCCAATAATGAAATTACTATGAAAACTACTTTCATGTATTTTTCAATCTATTTTTTCATATCATAATATTAAACAAACACTAATAATTGATATGAAAATTACATTAAGAAAAAAAAAAAAAAAGGGCCTTTTTGGTTGGACATAAAAATGAATATTTATTGAGAAAGTGAAAAGGAAAACTAGTGATGATGTTCATAGATGGCAGTGACAGCCTGAAATTGAGACACAGATTTTAACTTTAAAACTGAAAATAGAGAAAGGCTCCAATTGCAATCAAAGATGGTTGAAAAAAAACATTATATTGTCAGAGTTTGTTATGTTTGGTACAAGAAGACAAGTTGTCATTCATGCATTCTATTGATTTTTCCCTTTTTCTTTATTCAATTTTCATAATTTAAATATAAGATTATAGTTTGATTGTAATTTATTTGTAGTGGCAGATTTAGTATGA

mRNA sequence

ATGTTTAATTACTTGAATCTTCCAGTTGACCTGGTTCTTATGTGTTTTAAGTATTTATTATTCAAAAGCAAAAGTTTAACATTGACGTTTAACAAAAGCAATTTACGTATTTGTGAATTATTTAATGATTGGAAAGTAAATGATATATTAACCTTAGTTTTATTTATTTGTTTTGGGGCAAAGGAGATGGCAGATTTAGTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTAATTACTTGAATCTTCCAGTTGACCTGGTTCTTATGTGTTTTAAGTATTTATTATTCAAAAGCAAAAGTTTAACATTGACGTTTAACAAAAGCAATTTACGTATTTGTGAATTATTTAATGATTGGAAAGTAAATGATATATTAACCTTAGTTTTATTTATTTGTTTTGGGGCAAAGGAGATGGCAGATTTAGTATGA

Protein sequence

MFNYLNLPVDLVLMCFKYLLFKSKSLTLTFNKSNLRICELFNDWKVNDILTLVLFICFGAKEMADLV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmUC06G119010CmUC06G119010gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G119010.1-exonCmUC06G119010.1-exon-CmU531Chr06:22087390..22087454exon
CmUC06G119010.1-exonCmUC06G119010.1-exon-CmU531Chr06:22087535..22087588exon
CmUC06G119010.1-exonCmUC06G119010.1-exon-CmU531Chr06:22092717..22092784exon
CmUC06G119010.1-exonCmUC06G119010.1-exon-CmU531Chr06:22093401..22093417exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G119010.1-cdsCmUC06G119010.1-cds-CmU531Chr06:22087390..22087454CDS
CmUC06G119010.1-cdsCmUC06G119010.1-cds-CmU531Chr06:22087535..22087588CDS
CmUC06G119010.1-cdsCmUC06G119010.1-cds-CmU531Chr06:22092717..22092784CDS
CmUC06G119010.1-cdsCmUC06G119010.1-cds-CmU531Chr06:22093401..22093417CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC06G119010.1CmUC06G119010.1-proteinpolypeptide