Cla97C09G183110.2 (mRNA) Watermelon (97103) v2.5

Overview
NameCla97C09G183110.2
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr09: 36328466 .. 36336615 (+)
Sequence length2568
RNA-Seq ExpressionCla97C09G183110.2
SyntenyCla97C09G183110.2
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AACAAAGTCTTATTTTTCCCTTCAAAATTACGTCTCAAAAAGAAAAGAAAAACGCATCATCCATCCAAAGTTCTTCAGCATTTCAATTCCACAAACCAAAAGATAAAATCAAGATCATAGAAAAGAAGTAGCCGCAAAAAATTCCCCTCGGATACGAAGAACATTCAAAGCAATTCTGTACAGAAATCCAAATCTACAAATCTACCCCTAATCCCAAAGTTCCTACCAGCACTGATCCGTTTCCCACCGGCGGTGCGGCCTAGACCGCGACGATCGAGGAAACGAGCGTCTAGTAAGAGCAGCCAAAGCGAGATCGTAATGAGCCCTAGTAGCAGGATCGGAGAGGGTCTCGTAGGCATTGTGAATCTCGAGGAAACTGCATCCATCGTCGAAAGAAGAATCGCAATCCGATCTTCTGAGGGAATCGGGATGGTAAATCTTGGCGAGAGTCCGGTAGGCGGTCTTGATCTCGACGGAGGAGGCGTTGTGGTTGACGCGGAGGATGTCGTAGAAACTGGCGGAAGAGCGTCGGGATCCGGTGGCGACCTGGACGGAGGAGGCCATCGGAGATGCGAAGAGCTTGGTGGCGGACATGGAAGGAAGTGGTGAGAGAAAATGGAATGGAATGGAATGAGAAATGGCGATGGTGGGGATTATAATGGGGGAATTAGGGTTACCTTTTCTTGCTTTTTCACGGGGACTCAGCACCAAGATTGATGAAGAAACCGTGAGCCCACATCGAAGAACAAGGTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTAGTTCTTTTCTAGGTTTCTAGAAACTTTCCTTTTAATAAACATAAAAATGGGTTTAGGATATTTTTCCAAGGTGTTGGCCGTATCAACTGGTATAAAGTTTGCTGACATGGAATTGATCGATGGCTGACTCACCTCTGACTCAACTAAATATTTTACTAACTACCTTTAAAAATGTATACACTTTTAGTCCTTAAATTATAAGAATGTTTCTAATTGGTACCTAAATTTTTTAAAAATATATTTAAACATTCATTATGTATTTTTTCTTTAAATTTTTATTACTAATTATATGATATTTATATATTTTTTTAAATAATAGTTTTAGAGGGGAGGTGGGTTTTAAAAATTTTATTCTTTTAATTTACAATATAATATAATTATTTAAAATAATTATAAAAAAAACATTTGAGATACCTCTTAAATATAGACTCTGATTCTTTTTCATATTGGATGGAGGATATTTGAACTTTTTTTTTTTTTTTTGTCCCTAAAACCAGATTTCTTTACTCTACATCCAAATTTCTAAGGTTTTGGACAGGTAAAAACAAACACATTTGAATAATTTCTTTTCTCAAATTTGTGTCATGTTCTAAAAAAATGCAAGTTTGTTTTTTAATTAAAAAGAATTAGAGAAAAAATATCTTTTGGTCCCTAAATTATGGATCAAGTTTCTATTTTGGTTCCTAGATTTCAAAAGGTTAAACTTTTAGTCTTTAAATTTGGAGCTTGATTTCAATATAGTCTCAAAGTTTCAAAATGTCACAATTTTACCTTTTGAGATTTGAGTTTTGTTTCAAATTGGTCCCTAGGTTTCAAGATTTTACACTTTTAACATTTAATTTTCACTAAATACTTATTTCAGTCTTTGGCGTTAATGTCTATTAATTAGTTTAAAATCATTATGAAGTGAAAAATTAAAACTAATTTAAGTAGGGATAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAGAGTGAAACTTACATAATTATAATGCTTTTGATTATTTTAAATTAACTAATAGACATTAACATCGGTCATCAAAGACTCAAGTAAGTATTTAGTAGAAAATCGTAGTTAAGAGTGTAAAATCTTGAAAACTAAGAACCAAATTGAAATAAAATTCAAATTTCAAGAGTAAAATTGTAACATTTTGAAACTTAGAGACTAAATTGAAATCAAACTCATAATTTAAAGACTGATATTGTAACATTTTAGCTTGGTCTTTTAAATCATTGATAAAAAGTATACAACAAATGAAGAAATTTGAAGTTAAAAATAGTGTCTATAAACTCAATTTTCAAAAACACATTTTAACTTAAAATACATTTAAGTTGGTTTATAATACAAAATTGGCTTTAGATTAAACATTTTAAAAATAGTATGTGACACATCAGTAAATAAATAATATAACTACAACAAATTTGACATTTAATAACAATTCTAAATTGTATTACACGAGTACGATTACAGTTGCGACTAACCAACCACCAAGCATATTTCATAAATCATGATTTAGTTATCAAGTTATCATAATCTAAAACATGGACCAACATAATCATAAAATAAATAGTAAGTCGCCAAATACTTTAGTAAGAACTAATCTAAATCCCTTTTTTAAGTAGTAGTAATCATCATTATATTAGGTGATTGGACAATGAGACATGCTTAAGTAAGCATGATATTCCAAAGGAGTGCAACCATGATGAGATGGATACTTTACCACCAAACTCTCTTTAATTTGAAGTTCTTATATTGGGTCAAAAATTCAACCAAAATTATTTTTTAGATAATTGTTGTTTTATTTGGTTTCAATTTAGTTACAAGATTTCAAAATGTCACACTTTTACTTTTTAATTTAATTTTCATTTGTTCCTTAAGTTTTAAAACGTCACACTTTTACAACTTTTAAATTTTACATCCAGTTTCCATTCGATTCATATTTCAATGTTTTATCCTTTAGCCCATGAATTTTCATTAATATTCACTTTTGTCATTGGTATTAATTTTCACTTAATTAATTTAAAACAATTTATGTTGTGAAAATTTTTAATAAATTAGTACCAAAGCCTAAAAATGAGTGTACGGTGAAAAACCAAGGGTAAAAGTATAAATCTTGAAATGATACTAAATAAAAATAAATTTTAAATTCAAAAATAAAAATGTAACAATACTAGACTTGAGAATCAACTAAAAACTAAACACAAAATTTAATGTTAAAAGTATAATATTTAAAAATATAAATACTAAACAGAAATAAGATTCAAAACCTACCACAACATTTATATTTTTTTTTTTATCTTTTTCATTATTGAAATGAATCAACATGCAAAAGAAAATCACAATTTTTTTCCACTTAGCTTATTTATGTACAAATGAATTTTTATTTGCTGAATAAATGGCCCATGTAGCCAATAATTAAATAACTTAAAAGTATAATTACGAAAGGCCAAGCCTTGTATGATACTCTCAGCAAAGTTTAAAAATATGGATTTTGATGGAAATATTAAGAGGTTAACTTTACACAAATTTTGATAAAAATATTGATAAAATGTTGATTTTGGTAAATATTTCTAGAAAAATTATAAAAACGAATCTTTAAAAAAAAATTTAGTTAGTAAATAAATATTTTATGGTTTTTAAATAAGTTAACAAGTCTATTATTTATATTTATTTTGATATCAGTGACATTTTGTTGCTTATTTCTTTATGTTTCATGGATATTTTTTTTACGATACAATGAAATGTTGATTTGCCTTTCTTATTGATGCTGAACTCAATAAAATGTAAAAATATCGATAGAATCGACACGTTGATAAAAATTTAATAATATTTCTACAAGTTCATAAGTATGATGAATTCTCACAAATAGGAAAAAGGGGGGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAGATGAGAAAATGTAACAAAACTCCCACCTTAATGAATATAAATCTTATTTCATCGTTAATTAAAAATTCAACTATAACTAAGTACTCGTCTATCGTGAAAACGATTTATTATTAACAACTTAATCATTTTAGTTTATAAATAAATTTAACCTATTAATTAGTTTATCTATCTGTAACTTTATAAATCGAGACTGTAGAGATCATAAATACAAACTACAATTTACGAAAGTTTATTTGGAATTAAAAAATGGAAAATGACGTGGAGGGTGGAGAGTCCCTGTCGACGTGGAACATGTGAGTTGTAAGGGCTTCTAGAAGCAAACCCATCCAAATATACATTCATTGGAATGAATCAATTCTACTCCAAGTCTTCAAAATGTGGGTGGCCCCATCTCCTTCTGGAAGCAGGGCCCACCGCTTTGCTCATACACACTAATTTTTCAAAATCATATTTAATTGTATAAATCAATATTTTTAATTAAACCCTCCAGATTGTTAAAATTGGGTTAAATTCAACTTTTGAATTTATATAGTTGTATTAATTGTAACATCTGTACAAGTTTAAGGGCTTTATTTTTATCATTTGTGGGTCCAATTTCAATAATTATTGTAAATTTGAGGGTCTAATTTTAACACTTGCAAAAGTTTAGATGCTCAATTTTTACAATTGAAAAATTTAAGAATATAATTGCCAAATACTACTATATTTCAGAGGTGATTTTTATAATTTACTCAATTTTATTTTTATTAAGAAAATAGCATTTTGATCCTTATTTTTTTATTTAATTTATGACTTTTTTAAACAATCATTTGTCTTTGTTATAGTATTATTTTTCATCTAATTTTCACTTTTTCAATACTTGTATCTAACTTATTTGGTTGGGAATATTAAACTCATATTTATTGTGTCATTTTAAAATATACATTTTAACTGTTTAGCAAAACAATTGAATTAATATAAAAGTTTAAAGACTAAAATAGATATTTTGAAAGTCTAAAGAAAAAAAAAATGATAAAATATAAAAATTCAAAGACCAAATTAAATTTAAAGCTTTGTTTAATTGATAGCTAAATTTATATATATATTTTTTTATTGTTTATTGAACATTTTCTATTTTAGCATTTTTAATGGGTTTATTTTTAAGTATATCAAAATGAGCTAAATTATTTATAAATATAAAAAAATTTTAGCGATAAAGTGATAGTTTTGCTATTTATACAAATTTTTCATTTTTAATTACAATGTCTGTAAATAAAAAACAATTAATATTTTAATTAATAATTGAATTATTTTTACTTTGAAATTAAG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mRNA sequence

AACAAAGTCTTATTTTTCCCTTCAAAATTACGTCTCAAAAAGAAAAGAAAAACGCATCATCCATCCAAAGTTCTTCAGCATTTCAATTCCACAAACCAAAAGATAAAATCAAGATCATAGAAAAGAAGTAGCCGCAAAAAATTCCCCTCGGATACGAAGAACATTCAAAGCAATTCTGTACAGAAATCCAAATCTACAAATCTACCCCTAATCCCAAAGTTCCTACCAGCACTGATCCGTTTCCCACCGGCGGTGCGGCCTAGACCGCGACGATCGAGGAAACGAGCGTCTAGTAAGAGCAGCCAAAGCGAGATCGTAATGAGCCCTAGTAGCAGGATCGGAGAGGGTCTCGTAGGCATTGTGAATCTCGAGGAAACTGCATCCATCGTCGAAAGAAGAATCGCAATCCGATCTTCTGAGGGAATCGGGATGGTAAATCTTGGCGAGAGTCCGGTAGGCGGTCTTGATCTCGACGGAGGAGGCGTTGTGGTTGACGCGGAGGATGTCGTAGAAACTGGCGGAAGAGCGTCGGGATCCGGTGGCGACCTGGACGGAGGAGGCCATCGGAGATGCGAAGAGCTTGGTGGCGGACATGGAAGGAAGTGGTGAGAGAAAATGGAATGGAATGGAATGAGAAATGGCGATGGTGGGGATTATAATGGGGGAATTAGGGTTACCTTTTCTTGCTTTTTCACGGGGACTCAGCACCAAGATTGATGAAGAAACCGTGAGCCCACATCGAAGAACAAGTTGTTGGGTGCATGGAAACCTCCCTCAGCAGCAAGGGTCCGCCGTCAATTACTGCCAACCGCCAATCATCCACCTCCCTCTGACCGCCCACTGGTTGTTGCTCCGCCATGTCGTGCTGCCCATCGTCGGTAACCCCTCTGGTTTAGATTCAAGTTACAACCGGTGGAGTTTAGGTGGTGCGGATCAAGGGGACTTTATGGGGAATTGGAGTGTGGTTCCATGAGATAAAAGGGGTTAATCCGTAAGTCTTGGATTCAATTCAAGGTAAGAGGTTTTCTAACTATGGATTTAGATATTTGTGTATGGTTCACGACTGGTTTCCAACGTGATGATATTTATTTCTATGTTGTTGCATATGAGAATAATTGTTTGGAAGCGTGTTGTGCACAATTCATGACAGTATGTGCGACAAGTTTGTGTGACGCATTTATGCATGACACAAGCCCTAAATTGTGAGATATATACACCCAATCTGTGTGATATGTTTGTGTGACCTAGTGTGATAACTCATGGGTTGTTTGTTGCCAAAGTGTTAAGCATAATGATGGTCTGTGCAACTCGTGTATCTCAACATCTAGGCATATGTATGTTTCTTGTGTGAGCGTCATATGCATCTAGTTGTCTGTGTGACACGTTTATGTATGGTGGGCCTCGTTTGGAGTCACTTGCTGAGTATTTTAATAATACTCACCTTTTCCATTTTTTTTTCTTGTGTTAAGGCAAGGGCACGTGGGTTGATTGAAATATGTTATTGTATGAGTTGGACCTGTTTTGAGTTGAGCTTTGGTATTGTGATTTTGTTTGGTCATATTTGTTCTTATGTACTATTTGAAAGCATGTATGAGAGCTAACTTTGTAATGGGTGAATTTTGCTTTGCGAATTTTGTAATTGACCTTTGTAAAAAAGCTCATCAAGGGTGGAGGTTTGACGAGACTAAAGCAAAGATGGAGAAGTCGAGGTTGAAAGATGAAGATGACGATAAACATTTAACTAACAATTTTTTTTATTCTCTACGACTTAAGTCCACTATTTTACATAATTATCAACTCTTAAGTAGGTAGCTATTATTTACTTCTTTCTTTTTTATTCACCAAATTTCCCTTCTTTTATGGCGCTTCAACAACATTAATTAGCCAACCAACATCACACAATGTTCTAACCATTATCAAATTTGTATATGGTGCATAGTACCTACTTTAATTAAGGCAGTTTTAATCAACAACCGTTAACGAAAAGGTTAGGTCAAATTTGGTTGTTAAATTCTCAAGTTATCAGGCAAATTCTGATTGGGTTCGTAATGGGCCAGCCCATGACTGTTTGGGCTAACCCTTTCTAGGATATTCTAGTTGACTACTTGATTTATTTTTGAAATATTTAGTTAGATAGACCCTTGGAATATTTTCATAGGTAGATTTTATCTTATATTTTGTATCATCATAATGACATATGTGTTTTCTTTAGTACAATATATAATTGCAAGGCAGGAGATTAATGAACCTCCAATCTCTTGAGACAGAACTCATTTTAGCTCACACCAAAACAACGCAATAAGAATCTTAATCTAGGAGAAATATTGTTCTCAAGATTTTATTTTATGTAAATTTTGTGAAGGGTATTAAATTACAAAAATTATATCTCTTCTCACTTACAAGCTATAAAAAATTAGGAAAAATATCAATTTATATCCCTATCAATTAAAATTTAAGTCCTAAACTTTAGGATATGTCATTTAGATAAACACGACGTTGCAGTCATGCCGAAAGAGGAGGTCATTCGAAGTAGATTTCCATTTGTTGGGTTTGTAGTTTTGTTGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGATGGTGGGGATTATAATGGGGGAATTAGGGTTACCTTTTCTTGCTTTTTCACGGGGACTCAGCACCAAGATTGATGAAGAAACCGTGAGCCCACATCGAAGAACAAGTTGTTGGGTGCATGGAAACCTCCCTCAGCAGCAAGGGTCCGCCGTCAATTACTGCCAACCGCCAATCATCCACCTCCCTCTGACCGCCCACTGGTTGTTGCTCCGCCATGTCGTGCTGCCCATCGTCGGTAACCCCTCTGGTTTAGATTCAAGTTACAACCGGTGGAGTTTAGGTGGTGCGGATCAAGGGGACTTTATGGGGAATTGGAGTGTGGTTCCATGA

Protein sequence

MAMVGIIMGELGLPFLAFSRGLSTKIDEETVSPHRRTSCWVHGNLPQQQGSAVNYCQPPIIHLPLTAHWLLLRHVVLPIVGNPSGLDSSYNRWSLGGADQGDFMGNWSVVP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cla97C09G183110.2 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C09G183110.2 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C09G183110.2 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cla97C09G183110.2 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110Cla97C09G183110gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110.2-exonCla97C09G183110.2-exon-Cla97Chr09:36328466..36329215exon
Cla97C09G183110.2-exonCla97C09G183110.2-exon-Cla97Chr09:36334705..36334904exon
Cla97C09G183110.2-exonCla97C09G183110.2-exon-Cla97Chr09:36334998..36336615exon


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110.2-five_prime_utrCla97C09G183110.2-five_prime_utr-Cla97Chr09:36328466..36329102five_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110.2-cdsCla97C09G183110.2-cds-Cla97Chr09:36329103..36329215CDS
Cla97C09G183110.2-cdsCla97C09G183110.2-cds-Cla97Chr09:36334705..36334904CDS
Cla97C09G183110.2-cdsCla97C09G183110.2-cds-Cla97Chr09:36334998..36335020CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110.2-three_prime_utrCla97C09G183110.2-three_prime_utr-Cla97Chr09:36335021..36336615three_prime_UTR


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C09G183110.2Cla97C09G183110.2-proteinpolypeptide