Chy8G147520.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy8G147520.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH08: 3185643 .. 3197857 (+)
Sequence length209
RNA-Seq ExpressionChy8G147520.1
SyntenyChy8G147520.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AACTTGGTATTAATGCTTTGCATATAAAGCTCCGGGCTATCGGTGGAAACAAAACCAAAACTCCTGAACTTGGTGCTCAATCGACTCTTAGGGCCCTTGCTCGTTCAGGCATGCGAATTGGCCGTATAGGTACATCATATTCGTACTTCCTTCATTCACTTGTGATTATTAGCCCATGTATGTAACTGAAACATTTCATTCACCTACAAATGAAATGTATATGAAAGAATTCCTCAAAAGTCAATAATATAGGATCATTTCATCGGTTGCTAGTTGCTAGTTGCTACAACATTTGGTATACACGTATAGATTTTCCATATTAGAGGCTTAATTCTCCCAAACGTATTCCTAATGCATACTATTTCTGGCTTTTATGATTCCTTATGTGACCATGCATAGAGTTAAAGTGGTGTATGAGTGTCCCTTAATTTAGGGAACACATTTTTCAACGACCATCTTGTCCCATACTCAAACTGACTGGCTAGCATCTGAGATTGTTGCTTACACGATTTATTCCACTTTTCCCAGAGGATGTAACTCCAATTCCCACAGACAGTACTCGTAGAAAGGGTGGCAGAAGAGGAAGAAGGTTGTAATTCATAGGCTCCTTAAAAATATAAGCTCTTTGCTTATATTTTTCGTTCTTTTTTGTAAGCTGATATGATAGTGTTACTGCTACATTTTAGTTTAATTTGGCAGGCTTGCAAATAAATGATATTGAGTCTTTTTGTCAAGATGAAATAGCAGTTTATCGACAGTATGCTGAAAAACGGGTAAGACTATAATTTGCACATTTGTTTAGTCTCAGTTTCTCTAAATTAAGGTTTATAACAATGGAAATTCGAGATGCATTTTTTCTTTTTAAATTTTATTTTTTAGATTATTTAGTTGATTGCTTCCAGATAAGCATAGACACTTGTAGGAATGAAATTTTGGAATCCATTAAATTCAAGGCTTTCTCTTGGAGTTGACTCTTAAAATTTCTTACAATTTCTAATCTACTTGAACAATTCCAACTGGAAGAACTTTTCACCACTCCCGTGATGCCCTTTTGGGTTGATTCCTCATCTCCCATTATATTTTGTTCCCCTAATTCTTTGATGAAGTTCGGTTTCTCTTTCTTATCAGAAAAAATGTCAATTTTTTCTATTCATCAATACCTACCTACTAATTATTTGGTGCCCAATAAACACATTGTAGGATAGAGAATTAAGACAGCGGCTGCAAGACAGTGAATGTAAATTAGGGTCATCAATGCCTCTAGATGCAACAAAGGAAAGGGCTACAGAACTTGAATTAGAAGTTACATTATTGGAGAGGTATGCCACCACTCTTTTGTAATAGGGTTACAATCACCAATCATTATTATCAAGCTTCAATGTTATCGTTGAAGCTTTTTCCCCATGTTAATCTTTTGCATTAGTTCTATCAAACTGGTTGATCTTCAGTACAAATTAAATTCTCAACAAGGTTGATTAGTGTAAAATAAACCTTTCAGGAATTCTTCATCCAGAAACCTTTATGTTGGCCTTAGTAAACAAAGTTACTATTTTGTGGAGCAACGTGGCTATGGAAATGGATTGGATATGATGGTAGAAATGAGCCCTCTTACTTTTGAAAATTAATCCATGACTCGATGAGAAATAGTGGATCTTGTGATATTCTTGGATTGGATTAATTTCTAGATGTGTTGTAATTATGCTCCTTTTTATTTGAGTCACACAACGAACCCTCCAACATATATCCACAATGTCGTAGGCCTCCAACATATCTCCAAAATGGTATATGATATTGTCTACTTTAAGCATAAAGCCTTCATGGCTTTGCTTTCAATTTTACTCCAAAGGTCTCATGCAATTAGATATAGTTGCCCTTACTTATATCATGGATATTTTCCTTACTTATCCAACGCAGGGCTTTGGTCGCACTCCAACGTTGTTGATTCTGACTTGGATTAACTTTCAACTGTCTGCAGGAACTTTTACGAGGAGACTATCCTATCCCTTCTTTTTTCTTATTGTTTATATTAACTAGTAGAATGCTTCTTATAGATTTCTTTTTCTGGTCTGATAGTATGGACACCATATATCAACAACAAAGATTGCTTTCAAGGTAACTGCAATTGCCGTATGTACTCTATTGTTGTCAGTAGTTTTATTTTTTAAGGTTGTAATGATGTCTTTTCACTTATAGTGAGATTCTTTTAGATTATCATTATTGGCCAGATGTAAATATAAATTTTAATTCAGTTCGTTCTTAGGATTTCAAACTCTTAAACTCAATCATTTAAGCACAACTGTACTCATCTTGACATATCAAAAGGCTTAGCTGAATAATTCTACCAAAGAGGTATAATTAGGAAATTTTCTTTACACTTGTTTAGAAATTAAACCACTATCTGTTATCTCAGCCATATCTAGTATACCAAGTCCACAAAATTCATTTGCAGGTACTTTATATTTTGTTAGACAAAGTTTCTAAATAGTTTTTATATGGAAGGCCTTTTATTGGTTCCCCATTCCATTGCAAGTTTGAAGAGATTGAAGATGTTGGAAACTTAGACATATTTACTTGTATTATAGAGATTTACTTGGACAATATTTTCTCTATAGCTTGTACAACTATCTCGTTGATTTTTAATGATTTTTCTTGAATGAATTAAGTATTTAGATCAGTCAGTTTCTTTTCAGTATGGTGGTTGCATTTCATATTCAGTACTTTTTGATGCAATTAAATGGATTGACTCTCTTTTTTATTTGTAGGGTTATTATAGCTTTAGCTAGAAGTTAAAGCATATTGTTCGTCTACCTTTTGTAGTTATTGCATATGGTATGTTAGATAGTTTTTTGATGACCCAGTCTTTATAGTTCTTCACATTTAAGTCCTCATTGCTATATGCTAGTTGGAGTTAGAAGTTAAAGTTCTTAGTTTTAATGCTATTCTTATTTCGTTTGTAGATTTCAAGGAGTTGATCTAACCATTAGAAATTAGAAACGAAAAAATTGGTGAGACTTTGATCAGTTTGGAGTTATCTAAGAGTGTTGTGGTGTTTCGAGGAGGGTGATGTCTCTGTTTCTTATTATTACATGTACTTTGTGTTTTATGATTAAGAATGATGTTCATAACTCGTTTTGTAATATGAATAAGAACGATATGTTTCTATGTTGTAAGTATATTGTAATGACCATAATTATATGTATATAATCAATGATATATATCCAATTTGTTAGTTATTTGATTGAAGGTTTGGATTGATTCAAGAAATATAAATAGTTCAATTGATCATGTTGTATACCATTGTTGGACTTCAAAACAGGTGTAATATAATTATTTGACTATTTCAAATTGTACAATTTTTTATTTGAAAGGAAAAAAAAGTCTTGACATGTAAAACGTGTCAAGAATAAACAAATTCTTGATGTTTATAAACTGTCAAGTATATATTTACTTGACGCGTAAAAAATGTCAAATAAAAAATCCCCTTATTCTTGACACTGGATTACTTGACGCGTAAAAAACGTCAAATAATCTTATATACTTGACGTTTTTTACTTGTCGAGTATAATTGTACTTGACACTTAAAAACTGTCAAGTAAACCTCTCTTATTCTTGACATTGGATTGCTTGACACATTGAAAAACGTCAAGTAAATAGGTACTTGACAGTTTTTAAGCATCAAGTATTACCTGTTTTGTAGTAGTGATGACAAAAGAATAAATAAGTTAGAGGTCAAGGATAAAAGAAGCGTCATCGCAGCAACACGATGTCAATGACTAGGGATAAAACAAGCGCCTCACGACAAAAGAATAAATAAGTTGGAGGCCATGGATAAAACAAGCGCCACCACAACAACATGGTGTCAAGGACAAGGGATAAAACAAGCACCTCATAACAAAAGAATAAATAAGTTGGAAGCCAGGGATAAAACAAGCACTATATGACAAAAGAATAAATAAGCTGGAGGCCAAAGATAAACAAACGCCATCACAGCTAAAATATGACGCTGGTAGCCAGGGATAAACGAGCACCATCATAGCAATAAGTGTCAAGGGTCAGGGATAAACAAGCACCAGTTGACAAATAAAACACTAGAGGCTAGCTGAGATAAACAAGCGCCATCATAGCAAAAATAAAACACTGTGGGCCAAGGATAAACAAGCACCTCCACAGGATAAAGTTTCAAGAGCTAGGGATAAACAAGCACCAGATGACAAAATAAAATGCTGGAGGACATGGATAAACAAGCACCATCACAACAAAAATAAAATGTTAGAGGCCTGAGATAAACAAGCACCTCCATAGCAAAAGTGTTAATTATTAGGGATAAACAAGTGTCATCACAGCTAAAAGCAAAAGGATAAATGTTATTCATGAAAATATGGAGGCATGTATATGCTTACTAAGACATTCTTATTTTAATAGTTTCTTTTTTTTCAAACATTCTATAGATTCTTTTCAAAAGAAGAAAACAAGTCAAAACATATAAAATAGGTGGTTTACTTTTTCACAAAAACTGATAATTAGGTATCATGAACTTGAGCAATGATATGGCTGCTAATTTGCTTTGAAAATCTCTTTGGAGTGATTATTTACCAAATAAAACACCATCTCTAGTCCTTGAGACCATTGGTAGTAACTAGCTTGATAAAAGATAGTGATCATGTAACTTAGATCTTGATTTTAAAGTCCTTCCTCAAAATTTAAACTCTTCATAAGTGATGGACTTTAAAAGCTCTTCGTCTCTAAAGTGCGGAAATTTTCTTCGAAATTGGCTCTCTTCTACAAATAACGATGACAAACATTATGTACTTTGCAATGCAATCTTACTTGTTGTGATATATATATATAATTATATTTATATCATATGTCCTTTATTGTAATTGTACATAAACTCTAGGGTTTAGTTTATTCTCTATATAAATATTTAACATTCCTTTGACTCAAAATAATAAGAAATATACTTCTCTGAATTCTAGATTACATGGTATCAGAGACATTAG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mRNA sequence

AACTTGGTATTAATGCTTTGCATATAAAGCTCCGGGCTATCGGTGGAAACAAAACCAAAACTCCTGAACTTGGTGCTCAATCGACTCTTAGGGCCCTTGCTCGTTCAGGCATGCGAATTGGCCGTATAGAGGATGTAACTCCAATTCCCACAGACAGTACTCGTAGAAAGGGTGGCAGAAGAGGAAGAAGGTTGAATTCTTTTTTATAA

Coding sequence (CDS)

AACTTGGTATTAATGCTTTGCATATAAAGCTCCGGGCTATCGGTGGAAACAAAACCAAAACTCCTGAACTTGGTGCTCAATCGACTCTTAGGGCCCTTGCTCGTTCAGGCATGCGAATTGGCCGTATAGAGGATGTAACTCCAATTCCCACAGACAGTACTCGTAGAAAGGGTGGCAGAAGAGGAAGAAGGTTGAATTCTTTTTTATAA

Protein sequence

NLVLMLCI*SSGLSVETKPKLLNLVLNRLLGPLLVQACELAV*RM*LQFPQTVLVERVAEEEEG*ILFYX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy8G147520Chy8G147520gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy8G147520.1.exon1Chy8G147520.1.exon1exon
Chy8G147520.1.exon2Chy8G147520.1.exon2exon
Chy8G147520.1.exon3Chy8G147520.1.exon3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy8G147520.1.cds1Chy8G147520.1.cds1CDS
Chy8G147520.1.cds2Chy8G147520.1.cds2CDS
Chy8G147520.1.cds3Chy8G147520.1.cds3CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy8G147520.1Chy8G147520.1-proteinpolypeptide