Chy8G146640.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy8G146640.1
Type	mRNA
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Girdin-like
Location	chrH08: 1975207 .. 1991758 (+)
Sequence length	1177
RNA-Seq Expression	Chy8G146640.1
Synteny	Chy8G146640.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

TGCTCAATGAATGCCTTTGAAGGCAGTGATTTATAGATGTGGAGATTTTCATAGTGTGCCTTTGTTGGGATCATGATAAGGTGTTAACTATACACCATTGTTAGTTTTGCGTCAGGTGTGGCTCAAACAGTTTATACCACCAACTCATAATCTACAAGACTATGACTTTTCATATAATCTTGAAGACTATCAAGGAAAAAAACATCGAGCAGTATGTGCATGGAAGTCTGTGAGGAAGATAAAAGACAAAGGACACTAAGAAGGGGTTACTAGTGGATATGAGGCATGGCAGACAAATGGAAGGAAGAATGTAATATATACCTTAAGGGAGGTAGTTGAAAGGTAGAAGAGACGACCTCTGAACAACCGGACCAGTAGGTTGAGAAGACCATTAAATTAGAAAAGAAAAATCGATTGTTAGAGCAAGAGAATGAGAAACTTCGAAAGGAGACGAGCCAATGGATGGATCATGCGACTATTTTGCAGAAAGAGCTTGAAAAGACCAAGAGTTTCTTAAAAAATTAAGATAAGTTAGAAAAGAATCTTGAGGTGTTAGATAAAGAGATGAGGCGAATGAATAAAGCGAATAGAAGCTTGAAAAATGAAAAGACAATATTACAGAGAACAGTAGAATCGCAAGATGAATATATTAAAGATTTAGAAAGTAGGAAGGAATATTCTCTCGAGCTTGTCAATGATTTGAATACATCAATTGGTAAACGGGAAGCACATATAGTAGATTTGGAAGTACACAATCATTCTCTATGCCAAACTGTTGATAGCCTACATGTGAAGATGGTTGAGCACTCTGAAGAGTATAAGATACTAAAAAATTATGCTGATTCCTTACACTATCAACTTACTGCATTTCAAAATTCAAGTGAGAGGATAGTGCAAGAATAAGAATTATTGAAGACAGATTACATGCAAATGAAGGTTGATTATGATTTGCAAAGGAGAGATTTTCAAGCATTAGTTGAACGTGTAGATCAAACAATTGGATTTCTCAGAATAGTGTCTAGAAGAGCAAATGGTTTTGCAGAATGGACAGCTGATTTATGGATTAATTTTTTCTCAATACAACCTCATGCAGATGATCTGAATAGATTCTTAAAGATGATATGCAGAGAACTTGGGCATTTTGGTCGTTTTCATTAAGCTGTTTATTTTGCTATTA

Coding sequence (CDS)

TGCTCAATGAATGCCTTTGAAGGCAGTGATTTATAGATGTGGAGATTTTCATAGTGTGCCTTTGTTGGGATCATGATAAGGTGTTAACTATACACCATTGTTAGTTTTGCGTCAGGTGTGGCTCAAACAGTTTATACCACCAACTCATAATCTACAAGACTATGACTTTTCATATAATCTTGAAGACTATCAAGGAAAAAAACATCGAGCAGTATGTGCATGGAAGTCTGTGAGGAAGATAAAAGACAAAGGACACTAAGAAGGGGTTACTAGTGGATATGAGGCATGGCAGACAAATGGAAGGAAGAATGTAATATATACCTTAAGGGAGGTAGTTGAAAGGTAGAAGAGACGACCTCTGAACAACCGGACCAGTAGGTTGAGAAGACCATTAAATTAGAAAAGAAAAATCGATTGTTAGAGCAAGAGAATGAGAAACTTCGAAAGGAGACGAGCCAATGGATGGATCATGCGACTATTTTGCAGAAAGAGCTTGAAAAGACCAAGAGTTTCTTAAAAAATTAAGATAAGTTAGAAAAGAATCTTGAGGTGTTAGATAAAGAGATGAGGCGAATGAATAAAGCGAATAGAAGCTTGAAAAATGAAAAGACAATATTACAGAGAACAGTAGAATCGCAAGATGAATATATTAAAGATTTAGAAAGTAGGAAGGAATATTCTCTCGAGCTTGTCAATGATTTGAATACATCAATTGGTAAACGGGAAGCACATATAGTAGATTTGGAAGTACACAATCATTCTCTATGCCAAACTGTTGATAGCCTACATGTGAAGATGGTTGAGCACTCTGAAGAGTATAAGATACTAAAAAATTATGCTGATTCCTTACACTATCAACTTACTGCATTTCAAAATTCAAGTGAGAGGATAGTGCAAGAATAAGAATTATTGAAGACAGATTACATGCAAATGAAGGTTGATTATGATTTGCAAAGGAGAGATTTTCAAGCATTAGTTGAACGTGTAGATCAAACAATTGGATTTCTCAGAATAGTGTCTAGAAGAGCAAATGGTTTTGCAGAATGGACAGCTGATTTATGGATTAATTTTTTCTCAATACAACCTCATGCAGATGATCTGAATAGATTCTTAAAGATGATATGCAGAGAACTTGGGCATTTTGGTCGTTTTCATTAAGCTGTTTATTTTGCTATTA

Protein sequence

CSMNAFEGSDL*MWRFS*CAFVGIMIRC*LYTIVSFASGVAQTVYTTNS*STRL*LFI*S*RLSRKKTSSSMCMEVCEEDKRQRTLRRGY*WI*GMADKWKEECNIYLKGGS*KVEETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN*DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLNTSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSERIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWINFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH*AVYFAIX

Homology

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DJ95 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold4336G00010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 427.2 bits (1097), Expect = 7.6e-116
Identity = 221/270 (81.85%), Postives = 240/270 (88.89%), Query Frame = 0


Query: 116 EETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN* 175
           +ET+ EQP+Q +EK+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQW+DHAT LQ ELEKTKSFLKN 
Sbjct: 56  KETSFEQPNQWIEKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWIDHATYLQNELEKTKSFLKNQ 115

Query: 176 DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLN 235
           DKLEK++E LDKEMRRMNKANR LKNEKT LQ TV SQDEYIKDLE+ KEY LELVNDLN
Sbjct: 116 DKLEKDIETLDKEMRRMNKANRRLKNEKTTLQATVGSQDEYIKDLENGKEYFLELVNDLN 175

Query: 236 TSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSE 295
           TSIGKRE  I+DLE  NHSL QTVDSLH+KM E SEEY+ILKNY DSLHYQLTA QNSS+
Sbjct: 176 TSIGKRETQIMDLEAQNHSLHQTVDSLHLKMAERSEEYEILKNYVDSLHYQLTALQNSSK 235

Query: 296 RIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWI 355
           RI QE E L TDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVERVDQTI FLR+VS+RANGFAEW ADL +
Sbjct: 236 RITQEYESLNTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMVSKRANGFAEWAADLRV 295

Query: 356 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 386
           NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH
Sbjct: 296 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 325

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T6E2 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold86G00290 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 1.3e-112
Identity = 217/270 (80.37%), Postives = 239/270 (88.52%), Query Frame = 0


Query: 116 EETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN* 175
           +ET+ EQP+Q +EK+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQWMDHAT LQ +LEKTKSFLKN 
Sbjct: 348 KETSFEQPNQWIEKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATYLQNKLEKTKSFLKNQ 407

Query: 176 DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLN 235
           DKLEK+LE LDKEMRRMNKANRSLKNEKT  Q T+ SQDEYIKDLE+ KEY L+LVNDLN
Sbjct: 408 DKLEKDLETLDKEMRRMNKANRSLKNEKTTFQATMGSQDEYIKDLENGKEYFLKLVNDLN 467

Query: 236 TSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSE 295
           TSI KRE  I+DLE  NHSL QTVDSLH+KMVEHSEEY+ILKNYADSLHYQLTA QNSS+
Sbjct: 468 TSIRKRETKIMDLEAQNHSLRQTVDSLHLKMVEHSEEYEILKNYADSLHYQLTALQNSSK 527

Query: 296 RIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWI 355
           RI QE E L TDY+QMKVDYD+Q RDFQ LVERVDQTI FLR+VS+RAN FAE  ADL +
Sbjct: 528 RITQEYESLNTDYVQMKVDYDMQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMVSKRANDFAESAADLRV 587

Query: 356 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 386
           NFFS+QPHADDLNRFLKMICRELGHFG FH
Sbjct: 588 NFFSMQPHADDLNRFLKMICRELGHFGHFH 617

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DK34 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold250G00110 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 411.8 bits (1057), Expect = 3.3e-111
Identity = 214/270 (79.26%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 0


Query: 116 EETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN* 175
           +ET+ EQP+Q ++K+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQWMDHA  LQ ELEK KS LKN 
Sbjct: 187 KETSFEQPNQWIKKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHAAYLQNELEKNKSSLKNQ 246

Query: 176 DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLN 235
           DKLEKNLE LDKEMRRMNKANRSLKNEKT L+ TV S+DEYIKDLES KEY LE VNDL+
Sbjct: 247 DKLEKNLETLDKEMRRMNKANRSLKNEKTTLKATVGSEDEYIKDLESGKEYFLEFVNDLH 306

Query: 236 TSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSE 295
           TSIG RE  I+DLE HNHSL Q VDSLH+KMVE SEEY+ILKNY DSLHYQL AFQNSS+
Sbjct: 307 TSIGIRETQIMDLEAHNHSLRQIVDSLHLKMVERSEEYEILKNYPDSLHYQLIAFQNSSK 366

Query: 296 RIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWI 355
           RI QE E LKTDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVER+DQTI FLR+VS+RAN FAEW ADL +
Sbjct: 367 RITQEYESLKTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERIDQTIKFLRMVSKRANVFAEWAADLRV 426

Query: 356 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 386
           NFFS+Q HADDLNRFLKMIC+ELGHFGRFH
Sbjct: 427 NFFSLQSHADDLNRFLKMICKELGHFGRFH 456

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DX26 (girdin-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107990936 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 411.8 bits (1057), Expect = 3.3e-111
Identity = 214/270 (79.26%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 0


Query: 116 EETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN* 175
           +ET+ EQP+Q ++K+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQWMDHA  LQ ELEK KS LKN 
Sbjct: 113 KETSFEQPNQWIKKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHAAYLQNELEKNKSSLKNQ 172

Query: 176 DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLN 235
           DKLEKNLE LDKEMRRMNKANRSLKNEKT L+ TV S+DEYIKDLES KEY LE VNDL+
Sbjct: 173 DKLEKNLETLDKEMRRMNKANRSLKNEKTTLKATVGSEDEYIKDLESGKEYFLEFVNDLH 232

Query: 236 TSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSE 295
           TSIG RE  I+DLE HNHSL Q VDSLH+KMVE SEEY+ILKNY DSLHYQL AFQNSS+
Sbjct: 233 TSIGIRETQIMDLEAHNHSLRQIVDSLHLKMVERSEEYEILKNYPDSLHYQLIAFQNSSK 292

Query: 296 RIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWI 355
           RI QE E LKTDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVER+DQTI FLR+VS+RAN FAEW ADL +
Sbjct: 293 RITQEYESLKTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERIDQTIKFLRMVSKRANVFAEWAADLRV 352

Query: 356 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 386
           NFFS+Q HADDLNRFLKMIC+ELGHFGRFH
Sbjct: 353 NFFSLQSHADDLNRFLKMICKELGHFGRFH 382

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D533 (Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold390G00200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 409.8 bits (1052), Expect = 1.3e-110
Identity = 214/270 (79.26%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 0


Query: 116 EETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN* 175
           +ET+ EQP+Q +EK+IKL++KNRLLEQENEKLRKETSQWMDH   LQ ELEKTKSFLKN 
Sbjct: 107 KETSFEQPNQRIEKSIKLKEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDH---LQNELEKTKSFLKNQ 166

Query: 176 DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLN 235
           DKLEK+LE  DKEMRRMNKANRSLKNEKT LQ TV S+DEYIKDLE+ KEY LELVNDLN
Sbjct: 167 DKLEKDLETSDKEMRRMNKANRSLKNEKTTLQATVGSEDEYIKDLENGKEYFLELVNDLN 226

Query: 236 TSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSE 295
           TSIGKRE  I+DLE  NHSL QTVD+LH+KM E SEEY+ILKNY DSLHYQLTA QNSS+
Sbjct: 227 TSIGKRETQIMDLEAQNHSLRQTVDNLHLKMAERSEEYEILKNYVDSLHYQLTALQNSSK 286

Query: 296 RIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWI 355
           RI QE E L TDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVERVDQTI FLR++S+RANGFAEW ADL +
Sbjct: 287 RITQEYESLNTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMMSKRANGFAEWAADLRV 346

Query: 356 NFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 386
            FFS+ PHADDLN+FLKMICRELGHFGRFH
Sbjct: 347 KFFSMHPHADDLNKFLKMICRELGHFGRFH 373

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr
Match: TYK23632.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 422 bits (1084), Expect = 5.96e-144
Identity = 221/269 (82.16%), Postives = 239/269 (88.85%), Query Frame = 0


Query: 117 ETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN*D 176
           ET+ EQP+Q +EK+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQW+DHAT LQ ELEKTKSFLKN D
Sbjct: 57  ETSFEQPNQWIEKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWIDHATYLQNELEKTKSFLKNQD 116

Query: 177 KLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLNT 236
           KLEK++E LDKEMRRMNKANR LKNEKT LQ TV SQDEYIKDLE+ KEY LELVNDLNT
Sbjct: 117 KLEKDIETLDKEMRRMNKANRRLKNEKTTLQATVGSQDEYIKDLENGKEYFLELVNDLNT 176

Query: 237 SIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSER 296
           SIGKRE  I+DLE  NHSL QTVDSLH+KM E SEEY+ILKNY DSLHYQLTA QNSS+R
Sbjct: 177 SIGKRETQIMDLEAQNHSLHQTVDSLHLKMAERSEEYEILKNYVDSLHYQLTALQNSSKR 236

Query: 297 IVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWIN 356
           I QE E L TDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVERVDQTI FLR+VS+RANGFAEW ADL +N
Sbjct: 237 ITQEYESLNTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMVSKRANGFAEWAADLRVN 296

Query: 357 FFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 385
           FFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH
Sbjct: 297 FFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 325

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031738551.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101203611 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 449 bits (1155), Expect = 5.81e-139
Identity = 237/270 (87.78%), Postives = 253/270 (93.70%), Query Frame = 0


Query: 114 KVEETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLK 173
           +VEE +SEQPDQ VEK  KLE+KNRLLEQENEKL+KETSQW+DHAT LQ+ELEKTKSFLK
Sbjct: 112 RVEEPSSEQPDQWVEKITKLEEKNRLLEQENEKLQKETSQWIDHATFLQRELEKTKSFLK 171

Query: 174 N*DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVND 233
           N DKLEKNLEVLD+EMRRMNK+NRSLKNEKTILQ TVESQDEYIKDLE+ KEY LELVND
Sbjct: 172 NQDKLEKNLEVLDEEMRRMNKSNRSLKNEKTILQATVESQDEYIKDLENMKEYYLELVND 231

Query: 234 LNTSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNS 293
           L +SIGKREA IVDLEVHN SL QTVDSLHVKMVEHSE+YKILKNYADSLH+QLTAFQNS
Sbjct: 232 LKSSIGKREAQIVDLEVHNCSLRQTVDSLHVKMVEHSEDYKILKNYADSLHHQLTAFQNS 291

Query: 294 SERIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADL 353
           SERIVQE +LLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQ LVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEW ADL
Sbjct: 292 SERIVQEYKLLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQTLVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWAADL 351

Query: 354 WINFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGR 383
            INFFSI+PH+DDLNRFLKMICRELGHFG+
Sbjct: 352 RINFFSIRPHSDDLNRFLKMICRELGHFGK 381

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr
Match: XP_016900531.1 (PREDICTED: girdin-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 406 bits (1044), Expect = 5.05e-137
Identity = 214/269 (79.55%), Postives = 235/269 (87.36%), Query Frame = 0


Query: 117 ETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN*D 176
           ET+ EQP+Q ++K+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQWMDHA  LQ ELEK KS LKN D
Sbjct: 114 ETSFEQPNQWIKKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHAAYLQNELEKNKSSLKNQD 173

Query: 177 KLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLNT 236
           KLEKNLE LDKEMRRMNKANRSLKNEKT L+ TV S+DEYIKDLES KEY LE VNDL+T
Sbjct: 174 KLEKNLETLDKEMRRMNKANRSLKNEKTTLKATVGSEDEYIKDLESGKEYFLEFVNDLHT 233

Query: 237 SIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSER 296
           SIG RE  I+DLE HNHSL Q VDSLH+KMVE SEEY+ILKNY DSLHYQL AFQNSS+R
Sbjct: 234 SIGIRETQIMDLEAHNHSLRQIVDSLHLKMVERSEEYEILKNYPDSLHYQLIAFQNSSKR 293

Query: 297 IVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWIN 356
           I QE E LKTDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVER+DQTI FLR+VS+RAN FAEW ADL +N
Sbjct: 294 ITQEYESLKTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERIDQTIKFLRMVSKRANVFAEWAADLRVN 353

Query: 357 FFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 385
           FFS+Q HADDLNRFLKMIC+ELGHFGRFH
Sbjct: 354 FFSLQSHADDLNRFLKMICKELGHFGRFH 382

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr
Match: TYK18656.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 404 bits (1039), Expect = 2.13e-136
Identity = 214/269 (79.55%), Postives = 235/269 (87.36%), Query Frame = 0


Query: 117 ETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATILQKELEKTKSFLKN*D 176
           ET+ EQP+Q +EK+IKL++KNRLLEQENEKLRKETSQWMDH   LQ ELEKTKSFLKN D
Sbjct: 108 ETSFEQPNQRIEKSIKLKEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDH---LQNELEKTKSFLKNQD 167

Query: 177 KLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLESRKEYSLELVNDLNT 236
           KLEK+LE  DKEMRRMNKANRSLKNEKT LQ TV S+DEYIKDLE+ KEY LELVNDLNT
Sbjct: 168 KLEKDLETSDKEMRRMNKANRSLKNEKTTLQATVGSEDEYIKDLENGKEYFLELVNDLNT 227

Query: 237 SIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYADSLHYQLTAFQNSSER 296
           SIGKRE  I+DLE  NHSL QTVD+LH+KM E SEEY+ILKNY DSLHYQLTA QNSS+R
Sbjct: 228 SIGKRETQIMDLEAQNHSLRQTVDNLHLKMAERSEEYEILKNYVDSLHYQLTALQNSSKR 287

Query: 297 IVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSRRANGFAEWTADLWIN 356
           I QE E L TDY+QMKVDYDLQ RDFQ LVERVDQTI FLR++S+RANGFAEW ADL + 
Sbjct: 288 ITQEYESLNTDYVQMKVDYDLQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMMSKRANGFAEWAADLRVK 347

Query: 357 FFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 385
           FFS+ PHADDLN+FLKMICRELGHFGRFH
Sbjct: 348 FFSMHPHADDLNKFLKMICRELGHFGRFH 373

[Close]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0036949.1 (girdin-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 412 bits (1060), Expect = 3.70e-136
Identity = 219/284 (77.11%), Postives = 243/284 (85.56%), Query Frame = 0


Query: 102 EECNIYLKGGS*KVEETTSEQPDQ*VEKTIKLEKKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATIL 161
           E+C         + +ET+ EQP+Q +EK+I+LE+KNRLLEQENEKLRKETSQWMDHAT L
Sbjct: 334 EDCQGKKTSSIERGKETSFEQPNQWIEKSIELEEKNRLLEQENEKLRKETSQWMDHATYL 393

Query: 162 QKELEKTKSFLKN*DKLEKNLEVLDKEMRRMNKANRSLKNEKTILQRTVESQDEYIKDLE 221
           Q +LEKTKSFLKN DKLEK+LE LDKEMRRMNKANRSLKNEKT  Q T+ SQDEYIKDLE
Sbjct: 394 QNKLEKTKSFLKNQDKLEKDLETLDKEMRRMNKANRSLKNEKTTFQATMGSQDEYIKDLE 453

Query: 222 SRKEYSLELVNDLNTSIGKREAHIVDLEVHNHSLCQTVDSLHVKMVEHSEEYKILKNYAD 281
           + KEY L+LVNDLNTSI KRE  I+DLE  NHSL QTVDSLH+KMVEHSEEY+ILKNYAD
Sbjct: 454 NGKEYFLKLVNDLNTSIRKRETKIMDLEAQNHSLRQTVDSLHLKMVEHSEEYEILKNYAD 513

Query: 282 SLHYQLTAFQNSSERIVQE*ELLKTDYMQMKVDYDLQRRDFQALVERVDQTIGFLRIVSR 341
           SLHYQLTA QNSS+RI QE E L TDY+QMKVDYD+Q RDFQ LVERVDQTI FLR+VS+
Sbjct: 514 SLHYQLTALQNSSKRITQEYESLNTDYVQMKVDYDMQTRDFQVLVERVDQTIEFLRMVSK 573

Query: 342 RANGFAEWTADLWINFFSIQPHADDLNRFLKMICRELGHFGRFH 385
           RAN FAE  ADL +NFFS+QPHADDLNRFLKMICRELGHFG FH
Sbjct: 574 RANDFAESAADLRVNFFSMQPHADDLNRFLKMICRELGHFGHFH 617

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy8G146640.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy8G146640.1 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3DJ95	7.6e-116	81.85	Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold4336G00010 P...	[more]
A0A5A7T6E2	1.3e-112	80.37	Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold86G00290 PE=...	[more]
A0A5D3DK34	3.3e-111	79.26	Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold250G00110 PE...	[more]
A0A1S4DX26	3.3e-111	79.26	girdin-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107990936 PE=4 SV=1	[more]
A0A5D3D533	1.3e-110	79.26	Girdin-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold390G00200 PE...	[more]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
TYK23632.1	5.96e-144	82.16	girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_031738551.1	5.81e-139	87.78	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC101203611 [Cucumis sativus]	[more]
XP_016900531.1	5.05e-137	79.55	PREDICTED: girdin-like [Cucumis melo]	[more]
TYK18656.1	2.13e-136	79.55	girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0036949.1	3.70e-136	77.11	girdin-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]

BLAST of Chy8G146640.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 163..197
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 119..146

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Chy8G146640	Chy8G146640	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy8G146640.1.exon1	Chy8G146640.1.exon1	exon
Chy8G146640.1.exon2	Chy8G146640.1.exon2	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy8G146640.1.cds1	Chy8G146640.1.cds1	CDS
Chy8G146640.1.cds2	Chy8G146640.1.cds2	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy8G146640.1	Chy8G146640.1-protein	polypeptide