Chy7G138980.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy7G138980.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH07: 15642197 .. 15656708 (+)
Sequence length436
RNA-Seq ExpressionChy7G138980.1
SyntenyChy7G138980.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AACTACATGCAAAAATTTGCATGTAGTGAGCTTCCACTCTCCACACTTGGCATGCAATATTCTTCCAAGGATAAATTGGTAATTTGACATTTAAAAAGTTAAAAGTCAATATTTTGACTTTTTACCATTTTATCCGTCTTGACTAATTTCAATCTCCCGAATATGAATCCGCATTCATTTTTTTAAAATTCAAATCATATTTGAATATAAAGTCGGTCAAAGTTTGATTTTTCAAAGTAAAAAATCAACATTTTGACTTTTTACATCTTTGACCTTTTTCATCAATTTCGAGCTTCCGAATATGATTCCATATTGATATTTAAATCATATTTAAACATGAAGCTCCACTTAAGTTATAACCGATGACTATATCAAATATATTTATCGGTTTCTCTCTCTTTACCTATTTTGAACAATTCAAATTATTTCATCATAATGTTCTAAGTTGATTCCTTATGAGCTAGCGGGGGAAGCTAATGGACCTATAGATCATGGGCTCCAACGATCCGAGATTAACTAGCTAAACTCTTTAGACCGAGTCAATCAACCTTCGTTAACTAACGGGTCATTCCACTAGAGTCCCGTAGTTGCACTCCCCTCACTATAGATATATTTGTGTCCATGTGATATGGCCATGATAAGTAAGTTAATCATTCACAGGTTGTTCATAATCTCGGCTGGGTCAAAGTACCGTTTTACCCCCGAAACTATATCTTTTCTCCTTAAGTCCCACTGATCCACTATTGAACAATTGGTTTAAGGTCCAACCTTTAAACCGAATCCCTCTCGAGCCAATGAGAGGGTGTGGCCCCTTGTTTAAGACCTGGATTCAGTCCTTAAGGGAATAACCTATCTACTAACCCTAGAGTGGGTAGGAGTGAATTCCGTCTTGCACCCTATGTCCCTAGTTATCCACCCGATTTTACCCCTGAAATGGAAGGCTTATTGGGCCAGCGCCATTGAGCTGCTTTCACCTATACAGATCTAAGGATAATTTCATGTGAACCGAAGTTCATAGTTAGCTCAGGATTAAGATTAAGTTACATTGGATATCTATAAACGAAATAGTCAGTTTTACAAAGTTAACGGTGTTATAACTTAAAAGCAACTATCTCATGGTTCCAGTCTTATGTAAACTCTTTACATAGGATGCCCCCATTTCCATGTCTCTACATGAACGATTTAGGATCACATTGTTTGTACTAACTACAAAGTAGGCCGCATCAATAGTATCTCCCGAATAAGGCGTCCAACCTTATCCATATACTATAGACCATTTAGGCTATGACTCAAACTTGATCCACTATTATGTTTGTACATAAAGTTCAAGTCTACATAATAGCTTCGGAACATTAGTTTATTGGCTTTCAGATTATAGTATCAATAAGACTATTTTATTGAACAGAATTTTGAATACAAACTACGAGTTTTAGGACATAAATTCCAACAAACTCCCACTTGGACTAAAACTCCTAATGAGATCAAACAATGTTGAATTTAATCATGAGAGACCAATATACATATGAGTACAATAAACATATGAATATTTTAAACTAGGGCACAAGCCCAATAAGTCTTCCACTTGTCCTAGTTTACTAACTTCATCGACCTAAAACTCTTTTAGGGGACCTTCATACACTTTAGAGGTGAAGGACTTTGTAAACCAAAGTAGTCATAATATGCTCAACAAGTATCGGGGTTACCACAACATTACTACGATGTACAATCACCCAGATAAGGTAGTACAATTTTACTTTACGCTTCTTCACACTACTGCTTTTTCACTTAGAGTGAATATTGATTCCTATGTAGACTTTCTAGCAATTTTTTTAGAAATCATAATTAATGTATCTAGTAAGGATCAGATCCTTAGCACTATACATAAGCACGCAGTCTTTTGTTTTCTAAACTATTTTAGAATATTCTTAACGGCACTGTTCAGTGATCACTTCCAGAATTGAACTAAAACCTACTGACAATTAGGGGTGAAATCGAGTTGGGTTGGGAGACATTCTCAACCCAACCCATATTTTCGGGTTATTTGGGTTGGCAACCCGAATAACCCGAATTTAGTTTCTAACCCAACCCAACCCAACTCGTAAAATATGGGTTGGGTTGGGTTGGGTTGTTGGGTTGTATATATAAGTATTTTTTTTAAATCTTTTTCTGTTTTATAGTTTCTAATGGTAATAAAAGTTTGAAATTGTTACATTTAAATTTCAAACATACATAATTCAAACTTTCATACAATAAATTCAAAATTTATATACCTATAATTTGTTTTTATTAAAATAATATATATAATATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATATATATATATTATATTAATTCGGGTTGGGTTGGGTTGGGTTGAACCGAATTTTTCAACCCTCCAACCCGAGACCCAACCCAACCCAAAAAAATCAAATTTTTTTAACCCTACCCAACCCATATTTTAACCTAACCCAACCCAACTCTTATAATATGGGTTGGGTAGTCTGAGTTATTCGGGTTCAACCCATATTTGTACACCCCTACTGACCATCCCTACTGAGTAGCAAATGTCAGATCTAGTATAGAACATTGCGTCTATCAAAACTCCTAACAAAGGAAGCATAGGGAATATTTCTCATACCCTCAACTTCTTGAGGTGTCTTAGGAAATTCTACCTATAAACAGACAAATGAATTCCATGTCTACAACAACAAACCCTTTTTGGAATTCTGCATCTTATATCTAGACATAATTTTGTCTTTATAAGATACTTGGGACATGGCCAGTGTTACGTTCTTGAAGATCCAAACAATTTGGATTTTGAGAACACATTGCGCATTTACAAATTTTGAAATTGCTTAGCTAGCCATTTCTTGAGGTCAGATAAATAATCTACATCATTCATTGCTCCCTTTTTGCAAGTCAATGGATCCTCTAAACCATCATCAACTATGATGATTTGATTTATGATAAAACCAAGTAATGTTCAGGCTAATGAACAACCCTCCCACTACATTGAGGCTCTCTCAACTCTTGAAAAGGATGTGATTGACCAGATTTTCAAGTTTTATCAACTACTTTAGTTGATGAACTAGGTATATCTGTTAACCTTTTTGAAAATTCTATTCAATACTAATTTACTACGTGGTTTGATGATTACTGATGAGGTTTTCCTCAAGAATGTGAGATTTGTCAATACAAATTCCTTGTTCCTTGAGGATCATAGAGAGAAGCTTATCATAGGGCGAACCATGTCTAACAAGGCTCAGTTTCTTCTTTCTGATACACCGTTCTACTTAAGCGTACTAGATGCAGAGAGTTGTGACTAGATTCTGTGCTCTATCAAATAGTCTTGGAATATTAAGTTCACATACTCTTCATCTCGATCTAATCGAAGTGTCTTTATAATTTTACCTAATTGATTCTCAATTTAGTCGTATATTCTCTGAACTTTTCATGAGAATCAGACTTGTGATGTATTAGGTAAACTTGACCAAATCTTGAATAAGCATCAAGTAAACTGATGAAATATTCATGTCCTCCCCGCGTTTTGACATTCATTGGTCCACATAGGTCCGAATGTACGAGCTCTAAGGGTACTTGTGTTCTTAGACCTTTTCCTGTAAAAGATCTCTTTGTCATTTTTCCTTTAAGACAAGATTCACATTAAGAGAGTTATCTTCTAACTGATTTAGAAGTCCACTCTTAACTAATCTCCCAATCACATTGAGAATTATGTGACCAAATCTTAATACCATAAATAGGTGTTAGAAGAAACCAATTGTCTTTTATACTAAACAATTAGATATTAAAGATAAATTTTGCTTTAGTTAGTCTTAATTTATATAAGTTGTTCATAAGTAGAACAAAATTGAATATATTATCTAGAAAAGGTGAACACTTCATAATTTCAAAATATATTCAATACATTTGTTCCAAAATACAATAGATAGATACTAAATTTCTCAAATGTTTGAGAAGCATACATAATATCTTTAAGGTAGTATGATATATCTATCAACAAAAAACAACTTCAAGTCTCTCACTGCTTCAGCCGAGATTACCTCTCCCGTTCCAACCTTGAGAGTAATCTCGTGTTCTGCAAGCCTTTTCCAAGAACTAGTTTCCTGAAATGAGAAGCAAATATGATTAGTGGCTCCTGAATCTAGTATCCAGGTTGAAGTATCATATTCGACTAAGCATGTTTCAACAACTAGTAAATCATATTTACCTTGTGCTGCATTCTCTGCTTCCTTCTCAGCAAGGTATTTCGGGCAGTTTCTTAACCAATGCCCGTTCTGGCCACAATGGTAACACTTACCTTTTTCTGCAGCTTTCTTTCCCTTGTTCGTCTTGGGAGTCTTCCCCTTTCCCTTCTTCTTCATTTGAGATTTAGGATTAGAAGGTCCACTTGTGCTTTTAGAGGACGATCCTTTTGAAAATCTCCTTTTTGTGGTAGCAACATTTGCTTCCACTTGTTTTCCCTTACCCGAAGTAAGAGTTTGGAACCTTTAAAGCTCATTCAGAAGGGTTGTCTGGTTAAACTCTATCTTGTTTAAAGACGCATTCGACTGAAATGGAATGAAGCTCTTCGGAAGAGACTCTAAGATAAAGCTAACTTGATTAACCTCTTCGATGGGACCACCATTTACTTCGGCGATGTTGAAATGCATCATCATGTCAAGAACATGTTCTCTAACAAAGGTCCCTTCCTTCATACGCTTAGTGTAAATGTATTTGACTGCCTCGTGTCTTAAAGACCATTCTAGTTGCCCAAACATTTCCTTTAATGAATCCATAATCTCATTAGCCGTAGCTAAGGATTCATGTTTCTTTGCCAAAACATCAGACATGCTGGCAAGAATATATACATGAGCCTTTTCATTTGCTTTTACCCATCGATCATATGCTTTCCGACCAGTTCGGTTACCATTAGAGGTAGGGATTTGAGGACATTCCTCAGTTAAGACAAATCTTAAATCATCAACC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mRNA sequence

AACTACTTTCTTCTCCTTTCTTCGTATTCCGATTAGGTTTTTGGTACCCGTGTCATCATTTTCCTCTTCACTTCACATTCTCCACTTCATCATCTACAAACTTCTTTGCGCATTTAATTATTCTCCACTTTAATTATGGATAAGAAAAAAGTAACTATGGAAAACGAACCAAGTGAAGTGTTGTTCAAGAAAAGACAAAAGTGAAAACTATGGAAATAGCGAAGAGCATTGAAAACGTTAGGTTGAAGAGACATCCTAAACCATCAAAGAAAATGTTGGAGAATGTGAAAGACCAAAAAAATGCAAAAGACAAGAAAAATGAATCTCCAAAAGCAACAAGACATTCTCCTAGAATAAATGATTTTGCCCCTAGTTTTGATTTGCAAATCTCTCAATTATGAGTAGATGGATATTGTAGCTAGTACATTAGTTTGGT

Coding sequence (CDS)

AACTACTTTCTTCTCCTTTCTTCGTATTCCGATTAGGTTTTTGGTACCCGTGTCATCATTTTCCTCTTCACTTCACATTCTCCACTTCATCATCTACAAACTTCTTTGCGCATTTAATTATTCTCCACTTTAATTATGGATAAGAAAAAAGTAACTATGGAAAACGAACCAAGTGAAGTGTTGTTCAAGAAAAGACAAAAGTGAAAACTATGGAAATAGCGAAGAGCATTGAAAACGTTAGGTTGAAGAGACATCCTAAACCATCAAAGAAAATGTTGGAGAATGTGAAAGACCAAAAAAATGCAAAAGACAAGAAAAATGAATCTCCAAAAGCAACAAGACATTCTCCTAGAATAAATGATTTTGCCCCTAGTTTTGATTTGCAAATCTCTCAATTATGAGTAGATGGATATTGTAGCTAGTACATTAGTTTGGT

Protein sequence

NYFLLLSSYSD*VFGTRVIIFLFTSHSPLHHLQTSLRI*LFSTLIMDKKKVTMENEPSEVLFKKRQK*KLWK*RRALKTLG*RDILNHQRKCWRM*KTKKMQKTRKMNLQKQQDILLE*MILPLVLICKSLNYE*MDIVASTLVWX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy7G138980Chy7G138980gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G138980.1.exon1Chy7G138980.1.exon1exon
Chy7G138980.1.exon2Chy7G138980.1.exon2exon
Chy7G138980.1.exon3Chy7G138980.1.exon3exon
Chy7G138980.1.exon4Chy7G138980.1.exon4exon
Chy7G138980.1.exon5Chy7G138980.1.exon5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G138980.1.cds1Chy7G138980.1.cds1CDS
Chy7G138980.1.cds2Chy7G138980.1.cds2CDS
Chy7G138980.1.cds3Chy7G138980.1.cds3CDS
Chy7G138980.1.cds4Chy7G138980.1.cds4CDS
Chy7G138980.1.cds5Chy7G138980.1.cds5CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G138980.1Chy7G138980.1-proteinpolypeptide