Chy6G118060.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy6G118060.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH06: 11736550 .. 11746594 (-)
Sequence length171
RNA-Seq ExpressionChy6G118060.1
SyntenyChy6G118060.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTAGAGGGTATTTTTTTTTTTTCTCATAACATAATATTTCGTGTATTTTGTAAACTAAAATTGGTTTCAATTTTGTACGTTGTTTCCCCCTTTCTTTTAGTACAATAGGGGTGAAAGATTCAAACTACAAACGTCGCTAGCTAACACATACTAAATGCAAGTTGAACTATGCGTTCTTTAGCTAATTGTTTACCTTTATGATTCTCTCGAATTGTATTTCTATGCAAGATTTTTCAGGGCATTGTTTTCCCTGGCCCATCTCGTACTCAAAGAAAAGTTCATTCTTGTATTTCTTTTGGTTCCTTTTCCCTTCTCCGAGGAAAAAAGTGCTAGAAATTTTTAAGAATGTGTTGTCTTTGCAGGCATGGTACAAGTTATGTGGATAGTTTGGGGTTTGCTTCACTCACAGTATGGAATATGAGAACTTGGAAGTCAATGGTATGGAAATGCTTGCTATTGGAACTTAAGTTTGCTTTAGTTCCAGTTGCTATTTGGTGCCTTGACTATTGTTTGGTTTCTATGAAGACAGTCCTTCCTTTGGGTAAGGATCCTCCTGCAATCACTTCAATGTGCTTCAATCATAATGGGAAGATCTTAGCAGCTGCTGCTACCGATGGAATGATTCACATGTTTGGTATCCTTCCCATACATTCTAAGTGCTAAGTTTTCTTGTAAGACTATATCGGTATTCAGTGGTGTATGCATGATACATTCATTTTCTTTATTATTAGTATCTCTCATATTCTTTTTATTTTTAATTTTAGTATTATTGTTATCAGTTAATTTCCAGTAGGGATCGTTTTTCTGTACTTGTTGAATGGAATGCATTGAATTGAATCTTGTAGTTTATACATGTGCTTAGATGCTTAGTTGTAAGATGGGACCATTACCGGGTTAAAAGATGGGTTTCCCCAATGGATGTGGAAAAGTGTGGAAATTTGGAAGTATTTGCTTCTTTTTTTCTGGATTATACAAATAGGGAAGGCGGGGAAGACCCTTGGATAGGCTTGTTCGGAGGAGAACCTCAATTGTCGGGCCTTTCTGCTGTATCCTTTGTTGGAAGGCAGAGGAAGACCTTGATCATCTACTTTGGGAGTGTCAGTATGCGCAGGCTGTGTGGAGTTTCGTTTTGCAGGAGTTGGATGTCAGTTTGGCTGGCCAGAGACTTCGTGGGACAATTGAGGAGGAGTTCCTCCTCCATCTGCTTTTCAGAGAGAAATGCTGTTTTTTATGGTGGTGGGGTGTGAGTGTGCTTTGGGATATTTGGGGCAAGAGAAATAATTTTTTTGTCTCTTTGGGCTTTGTCTCTTGTGTCTCTTTGGGCTTCGGTTACGAAGGCCTTTTATAATTATTCGCCTGGAAAGATTTTACTTAGTTGGAACTCCTTCCTTTAGTCGTGGTGTTTTGGAGGGCTTAATTTTTTTGTTTGTCCTTGTGTTCTTTTATTTTTTTCTCAATGAAAGTTGTTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAGTCCTGCAATTCTAGATCTGAACCATAAATGAAATAATAACACCTCAGTGGCTTGTGGAACTGAAGGGGTGAGCTGCATTAACTTATTTAAACAATACATTTCAAAATTCTTGACCTTGACTAGGAAAAAGACATGTCTGCCTGTCTACAAATTACAGGGTGGCCGGCTCATGATTCTGCCATTAACTCGATTCTTTTCGGGCCAGATGAAACTAGCATCTTTACATTAGGGTCAGATGGCAAGGCAAGTAGTTTTATTTACTCATTTGTCTGGATTGAAGTTCTATTGATGCATTGTTAATTTTATTTTGATCTTTGAACTCTTATTTGGTTGTAAGATGATATATATTTCTGTGGTCAGATATTTGAATGGAGCTTGCATAATCAAGGTCAAGTTCTGTGGTCAAGAAATAATAGCAGGTACTTATTGTTTAAAAATAAAATATCTATAGTACTCTTTATGAGGGTTTTAGTAACAATAATTAGCACTTCGTGTTGGTACTTTTAATAAATTTTCTTTTAGATGCTAGGATCTTTTTTATTGTTGACAAGGCCTTACAAAAACAAAGGGATGTAAAACATCTCTCAACCTAAAGCCCTTAGCCGTTGGAGTTGAAAAATGTCTTTCAATTGGCAGTATTAGGGGAAAAAGGAGTATTATGAGAAATTGCTACTGTGGGAAAAACGAGTGGAAATCACACAAAATGGAAAAAAATACAGTTCTTTTTTCTATTTTCTCTTTCCAGGTCAAATCTATAATTTTTTCTTTTTCTTTTTTAGAAAAAATCCATCATAACGTATCTGTCGAGGGTCATTAGGACATTTTTTCAGTCCTGATGTATGCTCATGAATGTGAAAAAGAAGGGAGAATTACCCAATAGACGAATGGATTAATTGTGTGTGGCATGATGATGTTGAAGATAGCTAGTGAATGTTAATCTATGTTTATACCAATCAATACCTTTTTATCTTCTTCATACAAAATTTTGTTGTTCATGTAAACGTATCCTGAACTTCATAAAAAACTATACGTTTCAATCTTCTTAGATGACTGTGCACTTTGATACTGTTTTCCTCGACGACATCCTGTACTAAACTATTCTTGAACTTGGCTTAGTAGTTATACTTTATTCTGTACTTGGCTCGGGCGGCCTTGATAATATATATTTGAGCCTTCTTTTAACAGGTTTTGCGATTCTGAGAGCTCTCTATCTCTGAGACATGAAATGACTTTGGATGCAAATGGAAAAAGACTCTTGGCTACATCAAATTCAGTGAGAGCTCCCATATACCAGGTTCATCATCCATCCATTCCTTTCATCTTGCAGTGGATAGCTCATAGTATTTAAAATTTTATTGTATGAAAATCTTGTTTATATATCAAACATCAAATTAGTTTTGAATTATAAAGACGTGTTGATATGACAAAAAGTAATTTTAACTATTTTAAAATGGACTAATTGAGTAGTACAAGGTGGCTGGCTCCAGCCTAAGCTTATTTAAGACTATGTCCTATAGACCTGCTTGTTCTTGAAATTGAATTCCTCAACTTAGGTGGGTGGTCGTGTGGGCGGATTGAAAACTCTTCCACATACAGCAGCGATAACGACGGTTGATTGGCACCCAACTTTGCCTGTGTTCTTGACTGGATCTGCGGACCACTCAATTCGAGTTACGTCTATTTCTTGAAGGCCATTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTGGTCAGTGTGTTTGATCGATTGGTTTGTGAGTGATTCTCATGTTATTCCGTGCATGATTCGATCTTAAACCTCAATGCTTTCTCCTTGTATTTATTTTCGTTAGTTGATTTTTTTTTAGAGGGAAGTAGGCAGTGATGTATTCTTTTTGTCCAAGAGTGGACTTGAATTGTATCATGTGATAATTTCATACAAGAACCAGTATACAGCAAATAATAGACGTCTGGGTTGGTGCTTATCCTTTATAAATACAGTTTTTATTTAATATAATAATTGCAGAGATAAGAGTTTGAACTTTTGTCATTTTTGTGTTTGCTCATGTTAGATAGTATGGTCTTGTTTGACTTTGTTATTGGTTTTGGGCTGCTCTTAAATTTTAAACTGATATTATGACTTTTGCTCTTAACGTTTTGAAAGATGAGAAAAATGATTGATAATTTCGTAAATTTCAAGTGCAGAGACCTTGTTTAGCACATAGATGCTAAGCAAAATTCTCTTATATATAACAACACATTTGTTTTGAATATTAAACCATCCAGTGGCCAAACTTTTGTTTTCAACGTTAAACCAACTATTAAACAAATATAATTCAGCTCCAATTCATTCTACATTTTGCACTGTTTATTATTACTAGAAAATCACACACACAAAATCATTTTCATTATAACTTTTAATGTTTGCTTTAGTGGAAATGATTTTTTTAACTTTTCATCTCCTTATTATAACTTTTCTCAAAATTTAAAAAATCTCTCCAATTAATTGTATCATTAAATTTATCCAAATCCATTTACATTCCTATTTCTCCTTTAATCTTATATCTCCTAACTATTTACATTTCATTCTCTCATACTAACTCATTTTGTATCTTTTTCAACCTTTCAAATTCTCTCTCTTCAAATTTATGGGTATAAATATCTCACTTTTTTTTGTTTTTCATGAATGTTCGCAAGCACAACAAAATACTAAGGGTAAAATAAGATATCATCAAATTAGTGCTTTTCTATTATCTTCTATTTTTTTAAAAAAAATTCATAATTAATTATATTAAAAAAACAAAATAAAAAATAAATTTACCATAAAACCAAAAAGTGAATTGAAACACAAAAAAATTGGAACCGTCATTATAATATTTTCATATTTATATCATTTTTATATTCACATCGTAATGAGTGAAAAATGAATTTATTTAGTAAAGAGAAAATGTTGTCATCTTTCGAATGTATCTTTAAATTTGATTTGTTTGCCCAATTCAAATTCCATTTCTTAACATCTTGAGCTTACATGTTACAAACTTAAGCATCTAATCTATATATATCCAAATAAAATAGAAGATAGAAAGGTTGTTAGTTGTGTAATAACATATAACATTATGTAATATCAGTTATAAAAGATGGAAAAGTTACATTATGACCCTAATAGCATAGAGCATTAACTAATATCAGTCATGAGATCAAAATCTTTTTTTTTTTCAAATAAGGAGATGAAAAGTTAACAAAGTGTAACTTCTATTTTGTTGAATATGAAAATGATCACAAACATTAAATCTATCTGAATGATAAAATTGTCACTAAAGCAACATTAAAAAAAATTATAATGAGAGGGTAAAACATCCACCAAAATCATATTTCTTTTGAAATTATGAAATTATAAATGTGAAATCATAATTTTTTTTAATGGTTTTATAGGTAAAAAATTAAAGAAAAAACTTTAATATTTCTTCCTTTACACATTTTATTACCTTTATTTATACTTAATAAACTTCAACAATATTTACATTGTTTTAACAA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GAATTTTTCTACGTTCGTATCATCATCAACCATTGCTCCCTTCAT

mRNA sequence

CTAGAGGAGGAGGCGAGTTGAGTAGACGCGCTGACAACGGTACCAGCTTCCCCCATTTCTTCGATACAACCGAAGCTTTCTCTCATTCTCACATTGCCATTGGTAGTTCCGCCTTACGGTTTTGGCGAATTTTTCTACGTTCGTATCATCATCAACCATTGCTCCCTTCAT

Coding sequence (CDS)

CTAGAGGAGGAGGCGAGTTGAGTAGACGCGCTGACAACGGTACCAGCTTCCCCCATTTCTTCGATACAACCGAAGCTTTCTCTCATTCTCACATTGCCATTGGTAGTTCCGCCTTACGGTTTTGGCGAATTTTTCTACGTTCGTATCATCATCAACCATTGCTCCCTTCAT

Protein sequence

LEEEAS*VDALTTVPASPISSIQPKLSLILTLPLVVPPYGFGEFFYVRIIINHCSLH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy6G118060Chy6G118060gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy6G118060.1.exon3Chy6G118060.1.exon3exon
Chy6G118060.1.exon2Chy6G118060.1.exon2exon
Chy6G118060.1.exon1Chy6G118060.1.exon1exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy6G118060.1.cds3Chy6G118060.1.cds3CDS
Chy6G118060.1.cds2Chy6G118060.1.cds2CDS
Chy6G118060.1.cds1Chy6G118060.1.cds1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy6G118060.1Chy6G118060.1-proteinpolypeptide