Chy4G077610.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G077610.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH04: 15450688 .. 15483782 (+)
Sequence length1117
RNA-Seq ExpressionChy4G077610.1
SyntenyChy4G077610.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

AAAAAAAAAAAGAACTTAGACGAAGAAGATGAGATGAGGAAAAGAAATATTTATTGTAAGTTTTCCAAACCATAAGGTCAAACATACACAATCCATCTTTAAGGTCAAACATCCCTAAGGTCAATCTAGAGACTATTTATGAAATCTGTCCTGCTTGAATCGGACATTCGCAAAAATATTTTTCTCCAAGCAAGATCCCCGTGCAAGAGTTTCAATATTTTAGAATAAACCTCTTCATCAACATCTTCCATTGTATTTAAAACGGTCAAACATTTCATCAACTCATAATCGAGATCATCTTTTCTGCTTGATGTTTCGCTCTCATCAACTTGACTAGATGTAAAACCAAAAGATCTTTTCTCAAGGATGTCATTTTTTCTGTTGGAATTCTTTACATATACATTATCTATGAATGTTGAAAAGAAACTGCCAAATTCGTCTTTTCTAATTCTTCGGACTCGTTTTTTGCTTTTTCCTTTATCATTCTCTTCAACACCAAAATTTGTATTACTTGTAACATCATTTTCATTTTCATTTTCATCTTCAGAATTTGAAATAAGTCTTGTTGATGGGTAAGCATTTACACCTATTGGAGTAGTATCTCCAAAAATCCTCACGAGCTTTTCATAATGTGGGCAACCACTTTTTCTAAACTTGTTTGCTCTCTTATTCACCTAAGAAACTTAAAAAGCTCGTTCCATTGATCCTCTTCAAGATTGATGGTACCTAATAATGGATCCCAACCATTTCCTGTCATATCACTCAATATCTTTTTGAAGTCTTTGTAAGTTTGTCTTAATTTATTGAACTTTTTTTTCAATTGATCATGAGAATAATTATATCTTGTACTAACATTTAGTTGGCTTCTTATATAATTACAACTAGTCTTTGTAAATGTTGTAGTTGGTCGATTGCCTTTTGCAACCTCTTCATCCATATATTAAGTTTACAAACAGAGCTTCACTCTTGTCTGAACATGGTCCCGCACTTCTTAATCCATCAATCTCAACAACCTCATTGACATAACATTGTGCAGATGATTTTTGTGACATCTAGAATGTAATAGTAATTTTAAAATAAATAACCACAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAA

Coding sequence (CDS)

AAAAAAAAAAAGAACTTAGACGAAGAAGATGAGATGAGGAAAAGAAATATTTATTGTAAGTTTTCCAAACCATAAGGTCAAACATACACAATCCATCTTTAAGGTCAAACATCCCTAAGGTCAATCTAGAGACTATTTATGAAATCTGTCCTGCTTGAATCGGACATTCGCAAAAATATTTTTCTCCAAGCAAGATCCCCGTGCAAGAGTTTCAATATTTTAGAATAAACCTCTTCATCAACATCTTCCATTGTATTTAAAACGGTCAAACATTTCATCAACTCATAATCGAGATCATCTTTTCTGCTTGATGTTTCGCTCTCATCAACTTGACTAGATGTAAAACCAAAAGATCTTTTCTCAAGGATGTCATTTTTTCTGTTGGAATTCTTTACATATACATTATCTATGAATGTTGAAAAGAAACTGCCAAATTCGTCTTTTCTAATTCTTCGGACTCGTTTTTTGCTTTTTCCTTTATCATTCTCTTCAACACCAAAATTTGTATTACTTGTAACATCATTTTCATTTTCATTTTCATCTTCAGAATTTGAAATAAGTCTTGTTGATGGGTAAGCATTTACACCTATTGGAGTAGTATCTCCAAAAATCCTCACGAGCTTTTCATAATGTGGGCAACCACTTTTTCTAAACTTGTTTGCTCTCTTATTCACCTAAGAAACTTAAAAAGCTCGTTCCATTGATCCTCTTCAAGATTGATGGTACCTAATAATGGATCCCAACCATTTCCTGTCATATCACTCAATATCTTTTTGAAGTCTTTGTAAGTTTGTCTTAATTTATTGAACTTTTTTTTCAATTGATCATGAGAATAATTATATCTTGTACTAACATTTAGTTGGCTTCTTATATAATTACAACTAGTCTTTGTAAATGTTGTAGTTGGTCGATTGCCTTTTGCAACCTCTTCATCCATATATTAAGTTTACAAACAGAGCTTCACTCTTGTCTGAACATGGTCCCGCACTTCTTAATCCATCAATCTCAACAACCTCATTGACATAACATTGTGCAGATGATTTTTGTGACATCTAGAATGTAATAGTAATTTTAAAATAAATAACCACAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAA

Protein sequence

KKKKNLDEEDEMRKRNIYCKFSKP*GQTYTIHL*GQTSLRSI*RLFMKSVLLESDIRKNIFLQARSPCKSFNILE*TSSSTSSIVFKTVKHFINS*SRSSFLLDVSLSST*LDVKPKDLFSRMSFFLLEFFTYTLSMNVEKKLPNSSFLILRTRFLLFPLSFSSTPKFVLLVTSFSFSFSSSEFEISLVDG*AFTPIGVVSPKILTSFS*CGQPLFLNLFALLFT*ET*KARSIDPLQD*WYLIMDPNHFLSYHSISF*SLCKFVLIY*TFFSIDHENNYILY*HLVGFLYNYN*SL*ML*LVDCLLQPLHPYIKFTNRASLLSEHGPALLNPSISTTSLT*HCADDFCDI*NVIVILK*ITTKKKKTKQNKX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy4G077610Chy4G077610gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G077610.1.exon1Chy4G077610.1.exon1exon
Chy4G077610.1.exon2Chy4G077610.1.exon2exon
Chy4G077610.1.exon3Chy4G077610.1.exon3exon
Chy4G077610.1.exon4Chy4G077610.1.exon4exon
Chy4G077610.1.exon5Chy4G077610.1.exon5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G077610.1.cds1Chy4G077610.1.cds1CDS
Chy4G077610.1.cds2Chy4G077610.1.cds2CDS
Chy4G077610.1.cds3Chy4G077610.1.cds3CDS
Chy4G077610.1.cds4Chy4G077610.1.cds4CDS
Chy4G077610.1.cds5Chy4G077610.1.cds5CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G077610.1Chy4G077610.1-proteinpolypeptide