Chy10G172960.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTTATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTTGATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTGGATGACGAAGATGAAATGATTGGTATGCATAATGATTTACAAGCTTCGATTGAACAGGAACAGGAAATAGAGGAAGGTTTGGAGAATGAGATGTCCTTAAATATTGAGGTAGATATAGACGAAGAAACAACAAACATATTTCAGGACTTATTGAATGAAGCTCGTAGTGAGCTATACCCCGACTGTTCTGAATACTCTTCTCTGAATTTTTTGGTTAAGATGATGCATGTAAATGTTCTGAACGGTTGGAGTAACAAGTACTTTGACATGATGTTAGACTTAATAAAATGTGTGGTACCAATGTTCCTAGTTTATTTTACGAAGCCAAACAAAAATTGTGTGACATGGGCCTGGGATATGAAACTATTCATCCTTGTAAGTACGATTGTATCCTGTATTGGAAGGAGTTTGAGGATTTGTAGTTTTATCCAACTTGTGGTGAGTCTCGATAAAAGGTTAGTCCTAATAACAGAGAAAAAAATTATGCATAAGGTATGCGCCACTTTCCTTTTATACCGAGATTACAACATTTATTTGTATCGCAAGAAAGATCCTCTAATATGAGATGGCACCATGACAAACATATTCAAACAAATGACGTGTTGAGACATCCAGCTGATGCAGATGGATGAAAACATTTTGATTTAGAATTTCTTGATTTCACTGCAAATGCACGGAACGTTCGTTTGGAGTTAGCTTTAGATGGTTTTAATTCGTTCAATCATATGAGTACTGCGTACAGTATGTGACCTATGGTATTAATTCCTTACAATTTGCCACCCTGAAAATGCATGAAAGGGTCAACATTTTTCATGGCATTGCTCATTTCTAGTCTAAAATCTCCTGGTAGGGAAATTGATGTTTACCTTCGACCCTTGATTGAGGAACTTAAAGAGTTATGGACTTTTGGGGTGCGTACGTATGATTCCCTTACCAGTAATTTCTTTCAGTTATACACAACATTGTTGTGGACGATAAATAATTTTTCAACGTATGGTGACTTATCGGGGTGGAGTACAAAAGGGTATTAGGCATGTCCAATATGCATGGAAGATAGATTGTCATTCGGGATAAAAGAGAAAATATCTGTCATGGGGCATCAGTGTTATCTTCCTGAGAACTATGTTTGGCGGAGAAGTAGGCTGAACGATGGCAAGGTAGAGCGTAGAGCTCCTCCAGTGATAATGATTGGGCACAAAGTAATGGAACAAGTAGATCAGTTGGACTTTCCAGTTCTGAGTAAACATCATGCATTAAAAGAGGAGAAAAGAAAGAGAGCTCTAATTTGACTAAGCGAAACATTTTCTTCGATCTTCCTTACTAGTCGAGATTATTATTACGTCACAAACTAGACGTAATGCATATTGAAAAGAACGTTTGTGACAACTTGATTGGTACATTGTTGAATATTGAAGGAAAAACCAAGGACACCACTAATGCACGATTGGACGTACAAGATTTGAAAATTATAAAGGATTTACACTTGATAGAAGTTGGTAACGGACTGGTGAAGCCACACACGAGTTACACATTAACTAGCAGCGAGCGAGTTGAGTTTTACAAGTACCTGAGATCTATAAAGTTTCCCAATGGATTCATTTCTAATATTTCATGATGTGTGCATGAAAAAGAAGAGAAAATTTCAGGTCTCAAAACGCACAACCGTCATGTTTTGCTACATCAACTTCTACCTATTGGTGCTCGAGCATTCTTACCAAAAAAATGTGTACACTATTGTTACTGAACTGTGTAACTTCTTTCGTGATTTGTGCTCCAGAATGATATGAGTAAGTGAGTTGGATAGATTGCAGGCAGATATTATAGTCATACTTTGTAAATTGGAAAGAATATTTCCACTTGCTGTCTTCAGCATAATGGTACACCTTGTCGTTCACCTGAATCAAGGACCTTTTGTTCTCGATACCTAACTGGGATTGAGACGCGATTCACTAAAGATGAATGGAATATGATAGCATTCCAGATGACGAGATGATGGGTGAGTTCGAAGTCTTCGTTTAGAAAGTTCGACCATTAGGGGTGTCAAGCGTTTAAACTCTATCACAGAACGCCTATTTCACTTATACATTCTCAATAATGTAGGTGAAATATCGAAGTACCGCAAGTAAGAATTTCTAACATTTGACTTAGATCATCTTATCGTTGATGTTTTAAGTATTTGTTATATAATATTTTGTTATTAGAAGACACTTACGGTTGATACGTCCACAAGTTCAAAACGCTCAAGAATTTAACAAAAGACACCAACGAGCATTTCCTGAATGGTTCAAAAATTAGGTACACCTAGAGTTTGAGGTAATAACTTTCGGATGAGAATTTTGTATATGATCATTGACTAATCATGATTTTAGGTTATAGGAACATGTGAGAGAGAAAACCTTTTCACTGATTTCTTTTCGCTTCCGATGGGACCAACACCTAACGTTCGATCTTACAATGGATGCATTGTTGGTTTAGTGAGATTTCACACTATAGAACGTGATTCTAGACGCACTACACAAAACAGTGGAATGATGGTAGTCGATGGAGAGAACAATAATTTCAATGGTGTTGATCTTGATGAAGTGTTGGACGTTCATTATCTGATGGGATGACGTGTTTGGCTATTTAAGTGTAGGTGGTACGACACGAACAACAATAAAAGCCATAAGACACATATGAAATTAGGGTAGACAAATAAATCAACACGTCCCATTTCTGGTTCGCCGAGGAACCTGTCATCCTTGCGACGCAAGGACACGAAGTATTTTACACAAAGGATTCAAAAAATGGTACCAATTGGAGGATTGTTCAAGTGGTCCAGAATAAACGTATATGAAACGTTCCAGAAGTCATTGATATTGATAATGAGCAACTTAATATAGTGGAAATCATTATCGAACATCATGTCGATGAGACATTTGAGGATGACACTCTATGCAGACCAGACATAAATCCTGCAGTTGTTGAAAGATCGGCTCGTTCTAACGTTGTTGTCGACTTCATAGACGACGAGAATGACCAATTGTCCCATCAAAGTGAATCAAGTGATTATAAATGATATTGAAGAACCACATACCCACATATTTCATTATTATACACATTCACTTTCATGTACTCGTATTTGTTTAATTAATTTTGGGTTATATGTCTACAGGTACTATGTCTTCATTCCTGACAACTTTCGACAACACAGGTGCTCTCTTTCTCCTGTTTAGCAACGAGTTGAACAATGCGGGACCGACGACATCCTCGGTGGGCGACACCTCAGATGAGTGGTAATTTGATGTTAAGTGCGAACATGACTTGGTTTAATTTCTAACATGACTTGATTTCTACAGCAGAAGTGTCTCAACCCAATTCGACTCCTAGGAGACGTCAACAGTCTCGAAACATGAAGTTAGAGAGGTACATTCAGAAGAATGGTAGAATTTCAATTATCATAGCCCTATGAGTGGAGAAGTCAATATCTCAACGTGTTGTACGGTTCAGTAACACCATTGGCGTGTGTGTGAGAAATACATTTCCAGTCTGCTGCCTTAAGTGGGCTGATGTTGGGAGAGAACACATTGAGGTGGTCAAGGGCTCTCTACAGGTAAAATGTTAAGTGCATTAGTTTTTTTGTTTAGACGTGCACATCAGTATATAAACAAAGCTAACATGTGTGTTTTTTTTACCTTCTTGCACTTTTTCGTGCTTGATTTCAACAATCAAGTACTTATTAGATTTGTTGAGCATCAAATGCTCACATCTTTCAAAGAGTTCAGGGGCGACTCTCACAGACATTTCAAAAAAGTACAGCGACTAGGAACAGACATGTGCCAACCCACCTAACATATTGGTGGGATGTATGGAAGATTGTGACTTCCTGTGCAATCACTACATAAGTCGTGCATTTCAGGTGAGATCTACAAATTGCAATGGTATGTGTTATTTCATTTAATTTTCTTAACGCATGTATACTTTTTACAAACATTTTCATGCAAGATCAATCACGAACGAACAAAGCTGTGAGACAGAAGCAGTCTTACAATAGTAGTATCGGGTTGACGTTATTTCTACAACGACTGCACGACCTCTCTGAAGAATGAGGTCTGCCAATCGATCGACTGGAGTTATTCAAAGAAACCAACGCTCGGAGTGGACAATTCATTTCGCAAGCGGTTGCGAATGTGCATGTAAGTTTCAATTCATGTCTCAAACACGTCTTCTTTTTTACTTATACTTCTGCCTTAATAACTTAATCACATAAAATTTAATGTGTTGCAGAGTTAAATGCTAGAACTTCAGTTCTAGCCTACCCTAGAGGGTTCTCAGCCACTCTCTAAGGACGATATTTGCGAGACTGTTTTGGATAGATGTCCAGGCTACTTACAAGGTCTTGGTTGGGGACCCAAGCCCATGTCCCGCAAGCGTTGTGCTAGCAATTCTTCTACCACATGTCACATTCTTCCTCTCCTGAACAAACTAATGTAGTTATGATTGAGCAGCAAAGACAATAAAGACTCGAGCTTGAAGAAGTTAAACACATGATTGAAGAGCAGAGAAGAATGTTCGAGCTGCAGGCTAAAGAAATGGAACAAATGAAGAAGCTTCTTGAAGAAATGACTCAGGCACAGAGAGGACAGTGAGTGGCGTAGTTGCGGTACGTTTTTTTGAACTTCACAGTTGTTTACTTTGCACTATTAGTGATATATATAATGCATTATATATATCTAAATTTAATTTTTTGTTATTGTAGGTGTGAACCTGTTGATTTATGGCATCTGTGGCCAAATTATCTTAATTTCTTTTCCATGTATTGTAGGTGTTAGACAATGAAATGTTTGTTTATTTATAATACAATTTTGATTTGACATTATATATATATATATAATTATTTACTAACTTAGTTGTTCCGTTTTTATAAATTTTATTGAATTTAAATCAAATTGGAATCGAACAGAAACTACAATCGAAACAACAAATTATAAACAAAAACAAAAACAAAATAAAAAAATCATACCTTGAATAATTCTCGACGCACGATTTGCGTCGGGAAATAGGCCTTTCCCCAACGAATAAAAAATGGCATCAGGGATAGTTGGCAAGATGTTACGTCGAGAAAAATCTTCTCCCGGCTTTTACTTGTACGTCGAGAGAGTCATCTGTGATCCCCTGACATTGTTACATCATCGATAGAGTGAGAGTGGGGGAAAGTTCAATCTGTTGGGATTGATGTCCTAAATCTTATGGTCTTGTAGTTTGTAATTGTATATATTATACAAACATTTATGTAATAAAATAACACACTTTAATAAAGTAAAGTGTGTTATTTTATTTGACATTTAGTTGCATTAACCCACGAAACCATTAAACTAACATCCAAGGTTATCTTCTGTAACCCAAACATGTATGTGGAGACATACAAGTGGATCATGTTTAAATGATAACCTAAATGGTCTGTAGTAGATGGATAAGGTTGGATACCTTATCCTGGTGACACTACGAATACGACCTGCTTTGTAGTTGTTACAATTGTTCTAAAGTGCTACAAATGATTTGATCCTAATCATTCATGTCGAGACATTAGAGCAGGGGTATTCTATACAAAGATTTTGTATAAGATCGGACCATAAAATGAATAGTCTCTCTTATTAACACTGTTACCAGTTGAGACTACATTTCACCATATGACCATAGGTGACTTGACCTGAATCCTAAGTGAGTTTTGAACTCCTGCCTATGAAGTCAGTACTTTGATTTACATGCGTGAGAGTGGCCTATGTCGCCGACTCAATAGGTTGGCCTACTATTTTGGGTATTCGTCTGATTAGGGAGCTGAGAACATAACTACACAAGAAGAAATTCACTCATTTTCTATAGATAAAGTAAGTAGAGAAATTGCTCTCTTAAGGGTTGATTCCATGGCTTGAACAATGTGACGCCACACCCTCTCTTGGCCCGAGAGGAGTTCAGTTATAGTAGGACTATGCCTATTGTTCATTAGAGGAATTGGTGCTACTTAAGGAGTTAGATGTAACTATAGGGGCAAAATGGTAATTTTTGGCCTACCTGTACTTATGAGCAATTTGTGAAGAGTCATTGCACTGTTGATTGGTTATATCTAATGGACACAAAAGTATATTTATAGTAAGAAGAGTGCAACTATTGGTCTTTAATGGAATGACTGATAGTTAATGAATAGTGATTAATTTAATTAAAGAGTTTAATTAAGGTGAATTTTTAAAAATAGCAAATTTTACAAAATATTTACAACCTATAGCAAATTCTATCACTGAATAGTCATTGATATGCTATAGTGATAGAAGACTATCAGTGATAGAATCCAAAATTTGGCTATAACTTGTAAATATTTTAATTTATTTTGCTATTTTTAAAAATGCCCCTTTAATTAATTAATCTCACATCATTGGAGCTTTAATCTGTAGGTCTATAAGGTCCCCTTGTTAGCCCAATAAGGATAAATGAGAATCAAATTTATTTTGGTTAATTTGAATCGTTCAAATTGATAAAGGGGATAAATTGTATATGATACGATTAATATAATGTATTTGATACATTATAATATAAAGTTTTTATGAGAAAAGTTAATATTTGAATATGATTCTAATAATAATAATATGAATAAGATTCATAAATAAACTATAAATTAAAATTAATATGGATTCGATTCATATTAGAACTATAGATCATATGAGAATATCTAAACCATTGGTTATATTATATATGATATAATATAAAGTTAATATTATATAAGATATAATATAGTTTAAATTTATATTAAAGTTAATATTATATAAGATATAATATAGTTTAAATTTATTTTAAATTTATATTAATATAATTTTAAATAAAAGAATAACTCCCAAGGGAGTTATTCTACATGATGGAGAGGGAGGAAGTTATTTTGATAACTTCCCCTCCATCTTTCTTCATATATTTTGGTTAAGATACAGAAGAGAGTAAGCAATCTTTTTTCGGTATATTTTTTACGATCTATTGGTTCCAAATAGAAATCTCTCTAAAAAATATTTCCTTTAACAAAACAAAAAATCACAGAAGCTCCACAAACTCTCTGTTGTTTTTTTTTCTTTTTATCTTGAGGATAACAAGGAAGACTTCGTGGTGTTCTTTGGGAGGTTCCACAAAGGTTAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCCTCCATAGAAGCATGTTTAGGTGTTTTCTTTGAATTTTGTATGTTTTTCAGGTTGAATTTCTTTTGCACGGCGTTCACACGCTTTCGCTATGGGAATTCCATTCGTTCACAATCCCGACGTGTCTCCCATGTGATGTTGGGAATGGGTCTCCCAACACGTTTTCCCCAACAGCCTTTCTGACGTCTAAGATTACGTAGGAAGACCATCTCCCGATGCCCTATGTAATCTACCTCGATGCCACCCTGCATCGAAAAACACCTGACTTGTTGTAGTGTAAATTATAACAAAAACTTAAATAAAATAGGCTTCCCTTGCATAAATGATCGAATCTTATTAAAGATAACTTTGGCTCCCCCTGAGTTTGTTGAATACAAATCAAATGTACTTGTTCTTCATTATATTTCTTATCACGGGTGCAACATGAAATCACTATAAGAAAAGAGAGGAAACGTTGACATTGCGAAACACACGTCGGGATAAGGAGTAAAGGTTGATGCCACCGTAAACCACGTCAAGGATAAATAGAAATTGAATTTTTTTTATTATACTTTCTCCGTTAGCAGCCCACCATCCGCCGTCCGCCCCCATCGTCGTTAGTCGCCCACCGCTCCATGCTCCTCCCTCATGAGCCATCATTGATTTGCTTGGTATAAGATTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGCTTATATAGTTTGAAATGTATGTACATGTAATATATTATGTATAGTTTGAAATGTATGCATGTAACTTTGAAATTCATTGAATTTTTGGTAATGTATTATGTAATTTTGTATGTGTAATCCATGCAAGAGATGTATGTATGTGTAATATATTAAATATGTTTTTATATAAAAATGTACGAGGTTTTATATGTAAGTTTGAGATTGGATGTGTAAATTTGAGATTGTATGTTGATATTATATAATCTATGTATAATGTATGTTTTGTAAAGTTTTGAATAGGAATTAGATATTGAATTTGATAGTTAATTTATATTTGAGTTTAAATATGAATTTCTATTTAATATCAATTATAATACAAATTTGAATTTAAAGTCGAACACGAATGTGAATTTTATGTCTATCCTGCAATTATGGTAGCCTATTTATTTATGTTAAAAATTAGTTTCTAATATGTTAATTACTAGCTTTAAAATTATGAAGTAACTTTTAATTATGTATGTATGAATTGTTAGGTATGTTGAAAGTGTTAGTTAGATTTAAACTTAAGTTTAGATTTGAATTTAATTTTAGTGTTATATTAGAGATTGGACAATATAACTTATTCATGGAGTAAGTTGGAGTTGGAGTAAGTTGTAGTAAGTTAGAGTAAGTTGGAGTAAGTTGAGAGGAGAGATATAAAACTAATCAAACGTCTTTATATTTTAGAGCTTTTAACGAGATGGACAAGAGTTGAATGAAACTTAGGGATAGTTTTCGATTGAGTACAGAGAAGGAGTTTCCCAATTTTTAGAGGTTGCAAAATATCACGTCAATAATTATGGACAAATAAAGTGTCTATGCAAGAGATGTATGAATTCAAATTGGGACTCATTAGAGGGTGTGGAGGGACATCTATTAACCTCTGGAATAGCCTCTTCATACATAGACTAGGTGTATCGTAGAGAGCCCGTGAACTTGTACACGGGTATGCAAAGACTTGATGAAGAAACGAGTAGTAGTAATAATCATTTTGATGAATGAACTAGCAGTAACCCATTTTATGAACAAAACGAAATTTTGGGTGTAACGATCCAACTTTCCTACTAAGTTGAAGTCATTACCATTTAAATAAATATAGATTTTTTTTTATTTTTAAATACAAGAAAATAATAAAATTAAAGGAAATGTTTTAAATATTCAATTAAATTAAATAGTAAAGTATATAAAGAGGGAAAAAAATAACTAATTAAAACACTAGTTTGGACCCCATAAAAATAAAATACTAAAAAATACAATCATGAGTGCCGAAATAAATTTCTGAAAATCAAGTATTGAAAACATAAATAAATATATAATCATGGTCACTTCTTGTCATTCGCCAGCTTGCCTTTACCTCTACCTTTACCAATAAAACTAAACATGTAAAAGAATTAGTATAAATTTATACTTACTAAGGGACCCACTATTAGTCCCACTATGTGTCTGTTAACATCCCGTTAGAGTCCTATAATAATGTACCCCATACTATTGTGCTCCCGAATGCACGCTATCCAGTGGTACCGTAGGGACACATTTGGGCTCTCAATGAACCCGAACCCTAAAGAAGAGTCGGGCTGTAAGTGATTCAGTCGAATCACACATCAAAACTAGCCACACAGGCATACATAGGTGGTGATCCCAAGGGACACCCATATGGTACGATTCTAAAAGATAGACTTAACAGAACACTATAGCCTATACATATATATCATAACATCAATATCATAGCTCAGTCAGACATAACTCAAACATAGCATATTTAATCATAGCATGCCTCGCTCATACTGTATCTCAATCATAATATGGTTTCCGAAGTAACCATTTATAAGGTCATCTCAAATAGTCATATTATATCTCCCTTAGTACACTACTGAGTAATACAGTAATACAGAATATACATGCAGCTTCAAAGTGAGGTCTAATAAGAAAATCTCTTACCTGGAGATTAGTTCAATTAATAAAATCTTGGCTGAAGATCAACTCCTCTCAATTTACTCAGTCCTAAACATCCATAAAAAAAAAAAATTATAAACTTTTGTCAACCATCTACTGACAATCTAATTTAGCATCCAAATTTAACCAAACTTACCCCAAAACTAAAGTTGAATCCAACACAACCTTGAATGGGAAATTGCACAGTCCAAATCTTCAAAGAAAATAGTCAACCTTCAAGTAAAATAACATTCCAACTTAAATTGCTAACCCAAATTACTTGATTTTAAACCATAACTTAATAATTTGGGATAAATAGCTATTGGATGGGAGTACCAAACCCATAAAAAAACTTACCCAAAAGCAATTGGCTCAAACTGATGGCTTGGCTAACCATAGAACTCAAAATGGCTCAGCTAAGCGGAAGACTTGGACTCGGCTCGGGTACTGCTCAGTGGAGGAGCTTTGGCTCGTACAAGAGGAGAGTAGCTCGACTGGAGACGGGTGGCTCAAAGGGAAACTTCACGCAGCTCGGACTTGCAGCCTGCGAACATGAGCGAAAGCAGCGTGGACAAAGACGAGACGAGGTGAATAGCTCGTTAATTTAGAACTTGGCTTCAATAGGCGTGCAGCAAACGCTTCGGCTTCGGGTCACAAATTTGGCAAAGCATCTCAGATGTGGTGGCAGTCGGCGACACGATCTGGGGACGAACCTGCGAAGACAGACACCTCGGCTTCACCTATGCATAAACAAAGGAGTCGGGATAAGAGACGTTGACGAGCTCCTCGACTTCGTCTGGCGTGTTGCAGATGGAGGGTAGATGGCTTAGACGAGCGGAGACGCTCTCACCGGAGTGCTTTGCGTGGCGACGGCTGCTCTAGGGTTGAATGGTGAAGGAGAAGGTAGGTTGAAGATGAAGTTGCACGCTTCACGCGGTGATCTTATTTAATAGAAATAATAACATAAATATCATTATTTCCTTCCCCTTTTCCATGTTAAACAATAATAATAATATACTATTATCATTCTCTTTTTCCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTCCCACTAAAACAATAACTTCTTCTCTCTCCTAATTTAAAAACTCATTCCATCACCTTTAAACTTTCCCTTTTTCCAAAAATATAATACATTTTCCTTAATAATTATATTATCCCATAATATAATCATTCTTATTCCTTCATAACTTAATATATACACATATAAATAATTACCCATAATACTTTCAACTTTACCAACTTAATTCACCAAATTCAATAAATCCAAAAATCAAAACTTTAACAATACAATTCCAATTTCAAAAATTAATTACATAACATTCCAAAATACTTAATTTCCACAATCTCAAACAATTTTTCAAATAACACCCAAAATTCAACATAATAAAAAATTAAAAATTAACTTAATAGTTTTGGGGTGTTACATTGGGTATGCTACCTGATTTACAAGCTGGTATTGAACACGTAGAAGGGATGATGGAAGGTCTGGAGAATGAAATGTTGTTTATCAATGAGATAGATTTAGAATAAGATAGAATAAACGTGGTATTTAAGGAGTAATTAAACCAAGCAAGTTGTGAGCTATACTCCGGCTGTTTAAAATTTTCGTCCCTAAACTTTTTGGTTACAATGATGCATGTAAAGGTTCTAAATGGTATGAGCAACAAGTGTTTCGACATGATTTTTCAGATAATAAAATATGCATTTCCAATGTGTGGTACTAATATCTCTGGATCATTCTACGAAGCCAAACGTAAGTTGCGTGAGTTGGGTCTTGGATACGAGACTATTCATGCCTGTAAGTATGATTGTGTATTGTTCTAGAACAAGTTCGAGGATTTGCAACAATGTTTGACTTGTGGTGAGTCTTAGTACATGGTTAGTTCCAACGACAGACCATCAGGGAAAAAAATTATGTAGAAAGTATTTTTCTACTTTTCGTTGGTGCCAAGATTACAACGCTTGTTTGTATCACAAGAAAGCTCGACGAACATGAGATGACATAAGGATAAACGAGTGGAAACAGAGGATGTGCTGAGAAATCCAGCTGATTTTAATTTTCCTGATTTTTCTTTAGAGCCACGTAACGTTCGTTTGGGGCTAGCTTCAGATGGATTTAATTCATTCGGTCATATAAGTACCTAGTAAAGTATGTGGCCTGTGATGTTAATTTCTTACAATTTGTCGCTATGGAAATGCATGAAATAGTCAAACTTTTTTATGTGTTTGCTCATTCCGACTCAAAATCACCTAGTAGGGAAATTGATGTGTACCTAAAACCATTAATTGAGGAATTGAAAAATCTATGGACTTTTGGTGTGCGTACGTATGACTGTCTTACGAATCAGTGTTTTCAGTTTTATGTAGCCTTATTGTGGACAATTAACGACTTCTCAGCATATGATGATCTATCTAGGTGGAGTACAAAGGGGTATCAGGCATGTCTCGTCTGCATGGGAGATAGATCGTTGTTTGAGATAAGAGAAAAGAGCGGTTGAGTTTTGCAAGTTCCTGAAAGCAGTTAAGTTTCTCGATGGATTCATTTCTAATATTTCACGATGTATGAATGCAATCGAGGGGAAAATATCAGGTCTCAAAATGCACGACTGTCATGTTCTGCTACACCGACTTCTACCAGTCGGTGTTCGTCCATTCTTACCAAGAAATGTGTACATCACTATTACTGAACTGTGTAGGTTTTTCATGATTTGTGCGTCAGGAAGATAAGAGTAAGTGATTTAGACAGATAGCAGGCATATATCATAATTATACTGTGCAAACTGGAAAAAATATTTCCTCCAGCTTTTTTCAGTGTAATGGTACACCTTGCAGTCTACTTACCATACGAGACCAAGGTTGTTGGTCCGGTTTCTTACAGTTAGATGTATCCCATCGAAAGAAGTCTCCACACACTAAAACAATACGTTCGTAACAAACCACATCCTGAGGGGTCTATTACAGAAGGCTATCTTATGAACAAATCAAGTACTTTTTGTTCGCAGTATCTATGTGGGATTGAGATCCAATTCTCTAAAGATGATCAAAATGACGATAACATTCCAGAGGACGAGGTGATTGGTGAGTTTGAAGTGTTCGTTCAAAAGGTACGACCATTGGGAGTGTCCCATTTTCGAAGCATATCACAAGAAGAAAGGCGACTCTTTCATAGGTACATTCTCAAAATGTTGATGAAATAGCGGAGTACCGCAAGTATGTATCTCTACACTAATCATGATGAGTCTTTGTTATTGTCGCCCTCTGAACTCAAAATTATGTACTTCAGAAAACACCTACTGATATGTCATCAAGGTGAAATCGTTTCTGAAACTCTTAAAGGACATGGCGACTTTTTTCTGAATGGTTCAAAGCTCATGTATATAGAGTAGATGACTTCGAGAATTCGTACATGCAGTATTTTATATTCTATATATAATTCATTCAAGTACACTCATTTCAGGTTATAACAAAAAGGCGTGAGAGTTCAAACAATATTTCTCAAGATTTCTTCTCACTCGCAATGGGACCTTCACTTGAGGTTC GTTTTATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTTGATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTGGATGACGAAGATGAAATGATTGGTATGCATAATGATTTACAAGCTTCGATTGAACAGGAACAGGAAATAGAGGAAGGTTTGGAGAATGAGATGTCCTTAAATATTGAGGTAGATATAGACGAAGAAACAACAAACATATTTCAGGACTTATTGAATGAAGCTCGTAGTGAGCTATACCCCGACTGTTCTGAATACTCTTCTCTGAATTTTTTGGTTAAGATGATGCATGTAAATGTTCTGAACGGTTGGAGTAACAAGTACTTTGACATGATGTTAGACTTAATAAAATGTGTGGTACCAATGTTCCTAGTTTATTTTACGAAGCCAAACAAAAATTGTGTGACATGGGCCTGGGATATGAAACTATTCATCCTTGTAAGTACGATTGTATCCTGTATTGGAAGGAGTTTGAGGATTTGTAGTTTTATCCAACTTGTGGTGAGTCTCGATAAAAGGTTAGTCCTAATAACAGAGAAAAAAATTATGCATAAGGTATGCGCCACTTTCCTTTTATACCGAGATTACAACATTTATTTGTATCGCAAGAAAGATCCTCTAATATGAGATGGCACCATGACAAACATATTCAAACAAATGACGTGTTGAGACATCCAGCTGATGCAGATGGATGAAAACATTTTGATTTAGAATTTCTTGATTTCACTGCAAATGCACGGAACGTTCGTTTGGAGTTAGCTTTAGATGGTTTTAATTCGTTCAATCATATGAGTACTGCGTACAGTATGTGACCTATGGTATTAATTCCTTACAATTTGCCACCCTGAAAATGCATGAAAGGGTCAACATTTTTCATGGCATTGCTCATTTCTAGTCTAAAATCTCCTGGTAGGGAAATTGATGTTTACCTTCGACCCTTGATTGAGGAACTTAAAGAGTTATGGACTTTTGGGGTGCGTACGTATGATTCCCTTACCAGTAATTTCTTTCAGTTATACACAACATTGTTGTGGACGATAAATAATTTTTCAACGTATGGTGACTTATCGGGGTGGAGTACAAAAGGGTATTAGGCATGTCCAATATGCATGGAAGATAGATTGTCATTCGGGATAAAAGAGAAAATATCTGTCATGGGGCATCAGTGTTATCTTCCTGAGAACTATGTTTGGCGGAGAAGTAGGCTGAACGATGGCAAGGTAGAGCGTAGAGCTCCTCCAGTGATAATGATTGGGCACAAAGTAATGGAACAAGTAGATCAGTTGGACTTTCCAGTTCTGAGTAAACATCATGCATTAAAAGAGGAGAAAAGAAAGAGAGCTCTAATTTGACTAAGCGAAACATTTTCTTCGATCTTCCTTACTAGTCGAGATTATTATTACGTCACAAACTAGACGTAATGCATATTGAAAAGAACGTTTGTGACAACTTGATTGGTACATTGTTGAATATTGAAGGAAAAACCAAGGACACCACTAATGCACGATTGGACGTACAAGATTTGAAAATTATAAAGGATTTACACTTGATAGAAGTTGGTAACGGACTGGTGAAGCCACACACGAGTTACACATTAACTAGCAGCGAGCGAGTTGAGTTTTACAAGTACCTGAGATCTATAAAGTTTCCCAATGGATTCATTTCTAATATTTCATGATGTGTGCATGAAAAAGAAGAGAAAATTTCAGGTCTCAAAACGCACAACCGTCATGTTTTGCTACATCAACTTCTACCTATTGGTGCTCGAGCATTCTTACCAAAAAAATGTGTACACTATTGTTACTGAACTGTGTAACTTCTTTCGTGATTTGTGCTCCAGAATGATATGAGTAAGTGAGTTGGATAGATTGCAGGCAGATATTATAGTCATACTTTGTAAATTGGAAAGAATATTTCCACTTGCTCTTTTTTCAGTGTAATGGTACACCTTGCAGTCTACTTACCATACGAGACCAAGGTTGTTGGTCCGGTTTCTTACAGTTAGATGTATCCCATCGAAAGAAGTCTCCACACACTAAAACAATACGTTCGTAACAAACCACATCCTGAGGGGTCTATTACAGAAGGCTATCTTATGAACAAATCAAGTACTTTTTGTTCGCAGTATCTATGTGGGATTGAGATCCAATTCTCTAAAGATGATCAAAATGACGATAACATTCCAGAGGACGAGGTGATTGGTGAGTTTGAAGTGTTCGTTCAAAAGGTACGACCATTGGGAGTGTCCCATTTTCGAAGCATATCACAAGAAGAAAGGCGACTCTTTCATAGTTCAAACAATATTTCTCAAGATTTCTTCTCACTCGCAATGGGACCTTCACTTGAGGTTC GTTTTATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTTGATGAAGGAACTAGTAGTAACCCTTTGGATGACGAAGATGAAATGATTGGTATGCATAATGATTTACAAGCTTCGATTGAACAGGAACAGGAAATAGAGGAAGGTTTGGAGAATGAGATGTCCTTAAATATTGAGGTAGATATAGACGAAGAAACAACAAACATATTTCAGGACTTATTGAATGAAGCTCGTAGTGAGCTATACCCCGACTGTTCTGAATACTCTTCTCTGAATTTTTTGGTTAAGATGATGCATGTAAATGTTCTGAACGGTTGGAGTAACAAGTACTTTGACATGATGTTAGACTTAATAAAATGTGTGGTACCAATGTTCCTAGTTTATTTTACGAAGCCAAACAAAAATTGTGTGACATGGGCCTGGGATATGAAACTATTCATCCTTGTAAGTACGATTGTATCCTGTATTGGAAGGAGTTTGAGGATTTGTAGTTTTATCCAACTTGTGGTGAGTCTCGATAAAAGGTTAGTCCTAATAACAGAGAAAAAAATTATGCATAAGGTATGCGCCACTTTCCTTTTATACCGAGATTACAACATTTATTTGTATCGCAAGAAAGATCCTCTAATATGAGATGGCACCATGACAAACATATTCAAACAAATGACGTGTTGAGACATCCAGCTGATGCAGATGGATGAAAACATTTTGATTTAGAATTTCTTGATTTCACTGCAAATGCACGGAACGTTCGTTTGGAGTTAGCTTTAGATGGTTTTAATTCGTTCAATCATATGAGTACTGCGTACAGTATGTGACCTATGGTATTAATTCCTTACAATTTGCCACCCTGAAAATGCATGAAAGGGTCAACATTTTTCATGGCATTGCTCATTTCTAGTCTAAAATCTCCTGGTAGGGAAATTGATGTTTACCTTCGACCCTTGATTGAGGAACTTAAAGAGTTATGGACTTTTGGGGTGCGTACGTATGATTCCCTTACCAGTAATTTCTTTCAGTTATACACAACATTGTTGTGGACGATAAATAATTTTTCAACGTATGGTGACTTATCGGGGTGGAGTACAAAAGGGTATTAGGCATGTCCAATATGCATGGAAGATAGATTGTCATTCGGGATAAAAGAGAAAATATCTGTCATGGGGCATCAGTGTTATCTTCCTGAGAACTATGTTTGGCGGAGAAGTAGGCTGAACGATGGCAAGGTAGAGCGTAGAGCTCCTCCAGTGATAATGATTGGGCACAAAGTAATGGAACAAGTAGATCAGTTGGACTTTCCAGTTCTGAGTAAACATCATGCATTAAAAGAGGAGAAAAGAAAGAGAGCTCTAATTTGACTAAGCGAAACATTTTCTTCGATCTTCCTTACTAGTCGAGATTATTATTACGTCACAAACTAGACGTAATGCATATTGAAAAGAACGTTTGTGACAACTTGATTGGTACATTGTTGAATATTGAAGGAAAAACCAAGGACACCACTAATGCACGATTGGACGTACAAGATTTGAAAATTATAAAGGATTTACACTTGATAGAAGTTGGTAACGGACTGGTGAAGCCACACACGAGTTACACATTAACTAGCAGCGAGCGAGTTGAGTTTTACAAGTACCTGAGATCTATAAAGTTTCCCAATGGATTCATTTCTAATATTTCATGATGTGTGCATGAAAAAGAAGAGAAAATTTCAGGTCTCAAAACGCACAACCGTCATGTTTTGCTACATCAACTTCTACCTATTGGTGCTCGAGCATTCTTACCAAAAAAATGTGTACACTATTGTTACTGAACTGTGTAACTTCTTTCGTGATTTGTGCTCCAGAATGATATGAGTAAGTGAGTTGGATAGATTGCAGGCAGATATTATAGTCATACTTTGTAAATTGGAAAGAATATTTCCACTTGCTCTTTTTTCAGTGTAATGGTACACCTTGCAGTCTACTTACCATACGAGACCAAGGTTGTTGGTCCGGTTTCTTACAGTTAGATGTATCCCATCGAAAGAAGTCTCCACACACTAAAACAATACGTTCGTAACAAACCACATCCTGAGGGGTCTATTACAGAAGGCTATCTTATGAACAAATCAAGTACTTTTTGTTCGCAGTATCTATGTGGGATTGAGATCCAATTCTCTAAAGATGATCAAAATGACGATAACATTCCAGAGGACGAGGTGATTGGTGAGTTTGAAGTGTTCGTTCAAAAGGTACGACCATTGGGAGTGTCCCATTTTCGAAGCATATCACAAGAAGAAAGGCGACTCTTTCATAGTTCAAACAATATTTCTCAAGATTTCTTCTCACTCGCAATGGGACCTTCACTTGAGGTTC VL*RN***PF**RN***PFG*RR*NDWYA**FTSFD*TGTGNRGRFGE*DVLKY*GRYRRRNNKHISGLIE*SS**AIPRLF*ILFSEFFG*DDACKCSERLE*QVL*HDVRLNKMCGTNVPSLFYEAKQKLCDMGLGYETIHPCKYDCILYWKEFEDL*FYPTCGESR*KVSPNNREKNYA*GMRHFPFIPRLQHLFVSQERSSNMRWHHDKHIQTNDVLRHPADADG*KHFDLEFLDFTANARNVRLELALDGFNSFNHMSTAYSM*PMVLIPYNLPP*KCMKGSTFFMALLISSLKSPGREIDVYLRPLIEELKELWTFGVRTYDSLTSNFFQLYTTLLWTINNFSTYGDLSGWSTKGY*ACPICMEDRLSFGIKEKISVMGHQCYLPENYVWRRSRLNDGKVERRAPPVIMIGHKVMEQVDQLDFPVLSKHHALKEEKRKRALI*LSETFSSIFLTSRDYYYVTN*T*CILKRTFVTT*LVHC*ILKEKPRTPLMHDWTYKI*KL*RIYT**KLVTDW*SHTRVTH*LAASELSFTST*DL*SFPMDSFLIFHDVCMKKKRKFQVSKRTTVMFCYINFYLLVLEHSYQKNVYTIVTELCNFFRDLCSRMI*VSELDRLQADIIVILCKLERIFPLALFSV*WYTLQSTYHTRPRLLVRFLTVRCIPSKEVSTH*NNTFVTNHILRGLLQKAIL*TNQVLFVRSIYVGLRSNSLKMIKMTITFQRTR*LVSLKCSFKRYDHWECPIFEAYHKKKGDSFIVQTIFLKISSHSQWDLHLRF Homology
BLAST of Chy10G172960.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UMP4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold186G001050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 1.5e-155 Identity = 296/533 (55.53%), Postives = 363/533 (68.11%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D5X7 (Transpos_assoc domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold418G00580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 511.9 bits (1317), Expect = 4.7e-141 Identity = 233/332 (70.18%), Postives = 278/332 (83.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5I5 (Phytocyanin domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold163G001090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 505.8 bits (1301), Expect = 3.3e-139 Identity = 271/540 (50.19%), Postives = 353/540 (65.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SV11 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold269G00860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.0e-137 Identity = 227/332 (68.37%), Postives = 272/332 (81.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SR78 (DUF4216 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold223G00250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 1.0e-124 Identity = 212/298 (71.14%), Postives = 242/298 (81.21%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0056368.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold186G001050 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 555 bits (1430), Expect = 8.49e-180 Identity = 296/533 (55.53%), Postives = 364/533 (68.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. NCBI nr
Match: TYK18968.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold418G00580 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 509 bits (1311), Expect = 1.64e-164 Identity = 233/332 (70.18%), Postives = 278/332 (83.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0032995.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold269G00860 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 495 bits (1275), Expect = 1.66e-164 Identity = 227/332 (68.37%), Postives = 272/332 (81.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0050152.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold675G001830 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK06408.1 uncharacterized protein E5676_scaffold163G001090 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 501 bits (1291), Expect = 7.25e-157 Identity = 273/540 (50.56%), Postives = 355/540 (65.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G172960.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0032061.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold223G00250 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 454 bits (1169), Expect = 1.91e-146 Identity = 212/298 (71.14%), Postives = 242/298 (81.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
|