CcUC07G131600.1 (mRNA) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC07G131600.1
TypemRNA
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr07: 3169173 .. 3181953 (+)
Sequence length861
RNA-Seq ExpressionCcUC07G131600.1
SyntenyCcUC07G131600.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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TGTACCAAATCGAATTCCCTGGATATTTTGCTAGAATTTCTCATCCAACTCTTATCCTTAATATAAACCGATTACAAAAATCTTGAAGATAAAATGGTGCGATAAATACAATTTCGAACATGTCACCATTACAAAAATAAAAAAGTGGTTCTCAGAGAACGGTTGTTTCTATGACATCAATATCAAGAGAACCGTCAAGTTTCTCGATGATAAATCTAAACTATTAGTAGCTTTGGCGCAAACAACCTCGGAAGCTGACTTCTAGAAAATCCTAGCCCTTACGACCTCAAATTCATCGTTTAGTCCATCTCCTCCTCCATCAAAAGAAGCATAAGAGGAGCTGAGTATGATCTTGACGATCCATTTCTCGACTCACAACCTAGGTGAGCTTCGAATCCATAAGAGTACATGTTTCATATAGAAGCACAAGGTATTCATAAGGGATGCTTCGCAAAGAAATAGTTCCATAATTGTTATTAAAAAAAAAGTCCACGTAAATTCTCATCTTTAGTTGTAAATCCATGTGTAACCCTTGTAAATTTTCTGGTTTACACTGTACATATGATGCTGGCAGTCAGAAAAATCAAAACGAATATATACCGGAACAGCAAAAGCAAGCACGAAAGAGTCTGAAGCTTGAAGATGAAGATTATTGATTTGTCATTGCGTCAGCTCGTAATGTGCCTAGTTTGGCATCACTGCAGTTGAGTGTAAGACGACTATTTTGCCTATAACCAGTCTAGCACAGACAAGTCCAAATGAATCAATAATTTAGCCGACAAGAACAAGACTTAGTTAAAGTATCTTTAATAAAGCTACTTTATTAAAGATAAAGAAAGGCTATTCAAATATTCGATTCTGAAACAAATGACCGACAACATCTTATCACATCTCTTATCCTATCCTATCTTATCCTTTCTTATGTTTTTCTATCTTTACTTTATCTATTTTGTCTTTATTACTTTAATAATGTAACTAATTATTTGAGGTCCTGTCCAATTAATTCATCTTTACTATTTTGTCATTTTATCTTTTTATCTTTTCAAAAAGACGAATCTTATCAGGGTCATGTCCTATTTGATTCAATCTTATCTTTTAGTTTACTAAATTTAATTTCTATTTCAATTCCGGGTCTATTAAAGACTTCCATTTGTAATTCAAAGCAAGGATTCAAGAAATCACTCAAGCATCTTCAATTCTTGATATCCTCGAACTATTAGCTTCCTTTTGTACACTCATCCAAAAGATTGAAGCAAAATATTCGAGGATATCAAGCATTGAAGATGCTTGAGTGATTGCTCGAATTTTTGCTCTGATTTACAAATTGGAAGTCTTTTATGGACCTCGGAATTGAAATAAAAATTAAATTTGGTAAACTAAAAGATAAGATTGAATCAAGCAGGATAGAACCCCTGATAAGATTCGTCTTTTTGAAAAGATAAAAAGATAAAATGACAAAATAGTAAAGATGAATTATTTGACAGGACCCCAAATAATTCAGTTACAGTAATAAAGACAAAATAAATAAAGTAAAGATAGAAAAAGATAAGAAAGGTCAAGATAGGATAGGATAAGAAATGTGATAAGATGTTGTCGGCCATTTGTTTCATAATCAAATATTTGAATAGCCTTTTTTATCTTTAATAAAGTAGCTTTATTAAAGATACTTTAAGTCTTGCTCTTGTCGGCTAAATTATTGATTCATCTGGACTCGTCTGTTCCAAACTGATTATAGGCAAAATAGTCGTCTTACACTCAACTGCAGCAATGCCAAACTAGGCACATTACAACAAGTTGTCGCCATGACAAATCAATAATCTTCATCTTCAAGCTTCGGACTCCTTCGTGCTTGCTGTTGCTATTTCGTTATTAGTTCTGATTTTTCTGACCGCCAGAAACGTATTTACAGTGTAAACCAAAAAATTTACAAGGCTTACACATGGATTTACAACTAAAGATGAGAATTTACATGAACTTTTTTTTTAATAACAATTCTGGAACTACTTCTTTTGCAAAGCATCCCTTATGAATACCTTATGTTTCTATGTGAAACAATTATTCTTATGGATTTAGAGCTCACCTAGGTTGTGAGTCAAGAAATGGATCCTCAAGATCATACTCGGCTCCTCTTCTGCTTCTTTTGATGGAGGAGGAGATGCATTAAACGATGAATTTGAGGCCGCGAGGGCTAGAATTTTCTGGAAGTCAGCTTCCAAGGTTGCTTGAACCAAAGCTACTAATAGTTTAGATTTATCATTGAGAAACGTGACATTTCTCTTGATATCAATGTCTTGGAGACAGTTGTTCTCTGAGAACCACTCCTTTATTTTTGTAATGGTGGCCTGTTGGAAATTGTATTTATCCCACCATTTTATTTTCAAGATTTTTGTAATCGATTTATATTGAGGATAAGAGTTGGATGAGAAATTCTAACAAAATATCCAGGGAATTTGAAAATAGAGGCAAAACCTCATAAAGTTATGCAAAGAAGTTTTTTGTATATTCTTTGCAAAATAGAAATATGATTCTTGCAAAGGAGTTGGAAGAATATCATTCGTAAGGCCGAATGCATTCCACCATTGAATGAACCAAAGAAATGAACCAATAATGATGGTAATTTGAGTACCACATAACATTATACCAGGTTTTTATGTAATCTCGATCTGAGTATGTTTGTGGGACAAAGGGTTTGGAAAAAGATTTTTCTGTATAGATACAGTGATTCTAGTGGGTTGAATTCAAGGCTTCAAAAATTTTTAATTTTGAATAAGCGATCTTAAAGGGATCCTTTTTGTCTGGGATATGAGTTATTTTTGCAAGCTTTGTGTCTACAAGAATGAATTCATAAAAAATTTGTGTTTTCTTCAAGTATTCTGGGATAAACATGAAGCCTTCAAGATACATTTTTTAAATTGTCTCTTCTAGGTTAAGACCTTGGAATTCAAGTTTAGTGATAACCTGAGTTTTTTAAAAATAGGTTTTGATTTTAGGTTGGGGCACAAATTTGTTTCTAGGTGCAACCAACGGAGAAAAAGTTGAAGGAGAAGGGATTGACGATCCCTGATTTGAAGATGGAAAGGCAGTAGGCCTTAATTGAACTAATCCACCAAAAGGGCGAACTAGGTTGGTCGAAGGCCTTGGAGGTGGAGTTGATGACTCCATTGAAGATCCTATCCGAATATCGGAGGATCTTGCTTTGGATCGAGTTACCGTGGTAAACCCTAATTTCTTCGCATATTGATCAGCACTCATTGGAGCGGGTGTTGAGCTTGAAGAGGTTAGGCTTTTGCCCTTTGAAGAGAAGGGGTTGTTCCTTCCTCGATTATTACTCTAATCGCCACTCATGTCTTAGAAGGAGAGGGAGAGAAGAGCTTTGGAGTTAGAAACTCCCTTGAGAGATAATCAACTAAGGGGTTTTGCTTGCCTTTTCAGCAAAACTTCAAAATCGAGACAAAATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAAAATTTGTTTTGAGACAAGATTTTTCACATCTTTTTCTAAAACAAAATTTGATGCTCTTGAATCGGTTTTTATGATAATTTTTTTATTAATTAACTCGTCTTTAAAATTTTTTAACACAAAGGACTATTGCGAGTAATTCTTTTTTTACTGTTGAGTAATTTTTCTGCATTACATTCCAAATTCCTGAGTGGAATCGAACTACTGACTCGTTCTTATCTAGGTATTGTTTGAGGATTCCTCCATATCCAATGTCGGAGGTATCAGTTTCTACGATAAGATTTGCTTTCGAATTGATAAGGCTTAGACAAGGAATTGATTTGACTAAAGCCTTAATTTTTTGCATAGTCTGGGTGTGTTTGTCGGACCAAGGTTTTGGATTTTTTCTTAGCCTTTGATAAAGTTGCAAATGGGTTTAAGATTTTGAATAAAATCTTATACATAATTGAGGCATCCTAAAAACCTTTGTAATTGGGTCTTATCGGTAATGTGATCAGGAAAGTTTGATGGGAACTTTATGGATCTTTGAATGGGCTTGATCATTCTAAATGAATTTCAAAGCCCAAAAATCTTATCTTTATTTCAAACAATTTGATTTTTGGTAGAGAGACCACCAAACATTTCTTTTGATAATGTCAATAAAAATATTGAGATGTTTGAAATGTTGATCTGTGTTTGAAGAAAATACTAGAGCATCATTGATATATACGGTAGTAAAATCTTGAAAATCATTGAAAATGTCATTCATGATTTTTTGAAACTCTGATGAGCCATTTTTTAGCCCAAAAGGCATCACGTTCTATTCGTATTGCCCAAATGGAACATTGCAGTTTTGTACTTGTCTTTTTTTCAGAAATTTGTATCTGCCAAATTTCTTTTCAATAAATCTTGTTTATTTGGAATTGGATATCTAATCCATTCCAAAATTTTGTTTAAAGGTTTATAGTTAATTACTAATCTTGGCACTCCAGGCTCCTTTTCGGTTGCATTATTCATGTAAAAGGCAGCACATGACCATGGACTCTTTGAAGATCTTATTAGACTTTTGTCCAACAAGTCTTGGATTTTTTTTCCTGCAATGTGTTAGCACTTCTGAATTCAATTGAATCGGTTTAGCCTTTGTTGGAATATCCGATTCTTCAAATTTTTTTGTATAAGGAAGATTGACTATATGTTTTCTTCTTTCCCAAAATGCATTAGGAAGATTTGAACAAATTTTTTGTTCTATCTTGTTTTGGATTTCTTTTATTCGATTTTGAATTAAAGAATCTTTTAAATTTTCTTCTATTCTTTAGTAACTAATTTCTTCTTGTAAGGAATTGGATTTGTTTTTGTTTTCTTTTGATTTCTTGGTTTTTATTCATTTAATCTCAATAGATCATGTGGGACCAATGGGGCAATGAAACTAAAAAGAATTTCTTTCCAAAGATTTTGCTTACTAGACCCTTTTAGGTAGTCTTAATTGGGTAGAATGGGGTTTCTAAAATTAACTCTTGTTTTAAATCTTTGACTAAAAGAAATGA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mRNA sequence

ATGTTTGTGATATTGTTATTAAAGGGGCTTGAGTTTACCAACACAAGGTCCTTTCGAGCTCTTCTTCAGTTAACTGTACTGAGGTCGTTCATGAAGTTTCCTTGGACTGTGAGCTCTGCTTCATTCATTAGGAATTTATATTGGCTGTCAAACTCTTCTCTTGTGAGTAGAGCTTCTTGTTCTCTCTGTTCTCAGCTTTGTCTGTATTCGGCCAGGGCTTTCTTGGCTTCATCAAGATTGGTGTACTTCTTGTGTATAATTCCAGTGCGTCCGGTTATGAAAACTGAGGCTTTTGCCCAGTCATCAAAAATTCCTGCATTGGGTCCATTAAATATAACGTATACATACTTGATGCTTCGTTCTTCTTCATCGAACACGACCTGCTTCATTTTTTTATCTTCATTTTTGGATTCATCAGCTTTTGGTATAATGTTTACGGAAGATTCTCCTTCCTGTGGGAGGCGAACTAGGTTGGTCGAAGGCCTTGGAGGTGGAGTTGATGACTCCATTGAAGATCCTATCCGAATATCGGAGGATCTTGCTTTGGATCGAGTTACCGTGCACTCATTGGAGCGGGTGTTGAGCTTGAAGAGGAAAGAAAAAATGAGTGGCGATAGAAATAATAGAGGAGGGAACAGCTCCTCCTCCTCAAAGGACAAAAACACAGCCTTCTCAAGCTTAGTACTAACTCTAATGAGTGTTGATCAATACGCAATGGATTTAGGCTATCCTGGTCGGAATCGAAACCAAGAAATGAAGAAAAAAAATCCTAACCCACTGTCACAGTTGATTCTCCCCAATTCCACCACTAGTTTTCCACATTTCATTGAGGACTCAACAGATTACTTAAGAAGTAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTGTGATATTGTTATTAAAGGGGCTTGAGTTTACCAACACAAGGTCCTTTCGAGCTCTTCTTCAGTTAACTGTACTGAGGTCGTTCATGAAGTTTCCTTGGACTGTGAGCTCTGCTTCATTCATTAGGAATTTATATTGGCTGTCAAACTCTTCTCTTGTGAGTAGAGCTTCTTGTTCTCTCTGTTCTCAGCTTTGTCTGTATTCGGCCAGGGCTTTCTTGGCTTCATCAAGATTGGTGTACTTCTTGTGTATAATTCCAGTGCGTCCGGTTATGAAAACTGAGGCTTTTGCCCAGTCATCAAAAATTCCTGCATTGGGTCCATTAAATATAACGTATACATACTTGATGCTTCGTTCTTCTTCATCGAACACGACCTGCTTCATTTTTTTATCTTCATTTTTGGATTCATCAGCTTTTGGTATAATGTTTACGGAAGATTCTCCTTCCTGTGGGAGGCGAACTAGGTTGGTCGAAGGCCTTGGAGGTGGAGTTGATGACTCCATTGAAGATCCTATCCGAATATCGGAGGATCTTGCTTTGGATCGAGTTACCGTGCACTCATTGGAGCGGGTGTTGAGCTTGAAGAGGAAAGAAAAAATGAGTGGCGATAGAAATAATAGAGGAGGGAACAGCTCCTCCTCCTCAAAGGACAAAAACACAGCCTTCTCAAGCTTAGTACTAACTCTAATGAGTGTTGATCAATACGCAATGGATTTAGGCTATCCTGGTCGGAATCGAAACCAAGAAATGAAGAAAAAAAATCCTAACCCACTGTCACAGTTGATTCTCCCCAATTCCACCACTAGTTTTCCACATTTCATTGAGGACTCAACAGATTACTTAAGAAGTAACTGA

Protein sequence

MFVILLLKGLEFTNTRSFRALLQLTVLRSFMKFPWTVSSASFIRNLYWLSNSSLVSRASCSLCSQLCLYSARAFLASSRLVYFLCIIPVRPVMKTEAFAQSSKIPALGPLNITYTYLMLRSSSSNTTCFIFLSSFLDSSAFGIMFTEDSPSCGRRTRLVEGLGGGVDDSIEDPIRISEDLALDRVTVHSLERVLSLKRKEKMSGDRNNRGGNSSSSSKDKNTAFSSLVLTLMSVDQYAMDLGYPGRNRNQEMKKKNPNPLSQLILPNSTTSFPHFIEDSTDYLRSN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 244..267
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 198..220

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CcUC07G131600CcUC07G131600gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3169173..3169176exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3170383..3170409exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3171161..3171198exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3171714..3171775exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3172259..3172322exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3172425..3172689exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3177286..3177386exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3177418..3177449exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3180252..3180383exon
CcUC07G131600.1-exonCcUC07G131600.1-exon-CicolChr07:3181818..3181953exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3169173..3169176CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3170383..3170409CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3171161..3171198CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3171714..3171775CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3172259..3172322CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3172425..3172689CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3177286..3177386CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3177418..3177449CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3180252..3180383CDS
CcUC07G131600.1-cdsCcUC07G131600.1-cds-CicolChr07:3181818..3181953CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC07G131600.1CcUC07G131600.1-proteinpolypeptide