CaUC01G019590.1 (mRNA) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview


Name	CaUC01G019590.1
Type	mRNA
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	Unknown protein
Location	Ciama_Chr01: 32606545 .. 32614033 (-)
Sequence length	549
RNA-Seq Expression	CaUC01G019590.1
Synteny	CaUC01G019590.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGAGAGAAAGGGGTTATGGGGTTCTTTTGGTTCTTGGAATTTTGTTGAGCATTTACTTGGTTGAGGGGAAGGGGGCGAATAGTTCTGAAAAAAGTCGAAGTCTTGATGGTATATCCAATCAATGGTCTAATTTGGATGATACCCTCTTTGGAGTTGGTGTAACCGGAAGAAATGTGACTGTTACTGGCGGCAAGGGTGGAGGAAATTCATCCGGTGAGGGCGGCGGTGGTAGTGGGGTAAGAAAGAAAGGTACAAAACATCATAAAGAACAAGGAAAAAACGGAAATGGCGGTGGTGGAGGAGGTCGCGGGGGCAGTGGTGGTGGCGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGTACAAAGGGTGGTGGAGGGGGCGGTGGAGGGGGCAATGGCGGGGGTGGAGGCGGTGGAGGTGGAAAGGGCGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGAGGAGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGGTGGCGGAGGTGGAGGATGGGGTTTTGGCGGAGGAGGGAGTAGGGGTTTTTGTTGGATTTGGGGATGTGGTGGCGGCGGCGGTCATGGAAAAGCCTTGGCTAGAAGAGGAGGTCCTTCAAACTAAAAAGTAA

mRNA sequence

ATGGGGAGAGAAAGGGGTTATGGGGTTCTTTTGGTTCTTGGAATTTTGTTGAGCATTTACTTGGTTGAGGGGAAGGGGGCGAATAGTTCTGAAAAAAGTCGAAGTCTTGATGGTATATCCAATCAATGGTCTAATTTGGATGATACCCTCTTTGGAGTTGGTGTAACCGGAAGAAATGTGACTGTTACTGGCGGCAAGGGTGGAGGAAATTCATCCGGTGAGGGCGGCGGTGGTAGTGGGGTAAGAAAGAAAGGTACAAAACATCATAAAGAACAAGGAAAAAACGGAAATGGCGGTGGTGGAGGAGGTCGCGGGGGCAGTGGTGGTGGCGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGTACAAAGGGTGGTGGAGGGGGCGGTGGAGGGGGCAATGGCGGGGGTGGAGGCGGTGGAGTGGTGGTGGCGGAGGTGGAGGATGGGGTTTTGGCGGAGGAGGGAGTAGGGGTTTTTGTTGGATTTGGGGATGTGGTGGCGGCGGCGGTCATGGAAAAGCCTTGGCTAGAAGAGGAGGTCCTTCAAACTAAAAAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAGAGAAAGGGGTTATGGGGTTCTTTTGGTTCTTGGAATTTTGTTGAGCATTTACTTGGTTGAGGGGAAGGGGGCGAATAGTTCTGAAAAAAGTCGAAGTCTTGATGGTATATCCAATCAATGGTCTAATTTGGATGATACCCTCTTTGGAGTTGGTGTAACCGGAAGAAATGTGACTGTTACTGGCGGCAAGGGTGGAGGAAATTCATCCGGTGAGGGCGGCGGTGGTAGTGGGGTAAGAAAGAAAGGTACAAAACATCATAAAGAACAAGGAAAAAACGGAAATGGCGGTGGTGGAGGAGGTCGCGGGGGCAGTGGTGGTGGCGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGTACAAAGGGTGGTGGAGGGGGCGGTGGAGGGGGCAATGGCGGGGGTGGAGGCGGTGGAGTGGTGGTGGCGGAGGTGGAGGATGGGGTTTTGGCGGAGGAGGGAGTAGGGGTTTTTGTTGGATTTGGGGATGTGGTGGCGGCGGCGGTCATGGAAAAGCCTTGGCTAGAAGAGGAGGTCCTTCAAACTAAAAAGTAA

Protein sequence

MGRERGYGVLLVLGILLSIYLVEGKGANSSEKSRSLDGISNQWSNLDDTLFGVGVTGRNVTVTGGKGGGNSSGEGGGGSGVRKKGTKHHKEQGKNGNGGGGGGRGGSGGGGGGGGGGGTKGGGGGGGGGNGGGGGGGVVVAEVEDGVLAEEGVGVFVGFGDVVAAAVMEKPWLEEEVLQTKK

Homology

[Close]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038882243.1 (glycine-rich protein DOT1-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 1.6e-14
Identity = 99/164 (60.37%), Postives = 112/164 (68.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRERGYGVLLVLGI-LLSIYL--VEGKGANSSEKSRSLDGISNQWSNLDDTLFGVGVTG 60
           M RERG+GVLL++GI L+SIYL  VEGK   + E S +L   SNQWSN D++L+GVG+TG
Sbjct: 1   MLRERGFGVLLIIGIVLISIYLVEVEGKEVKAFETSENLGTTSNQWSNSDESLYGVGLTG 60

Query: 61  RNVTVTGGKGGGNSSGE---GGGGSGVRKKGTKH---HKEQGKNGN---------GGGGG 120
           RNVTV+GGKGGGNSSGE   GGGG GVRKK  KH   HK + K            GGGGG
Sbjct: 61  RNVTVSGGKGGGNSSGEGHGGGGGGGVRKKDVKHNKKHKNKQKRAGEAAEAAMAVGGGGG 120

Query: 121 GRGGSGGGGGGGGGGGTKGGGGGGGGGNG-GGGGGGVVVAEVED 146
           G GG GGGGGG GGGG  GGGGG G G G G G GGV   E E+
Sbjct: 121 GNGGGGGGGGGSGGGG--GGGGGNGRGLGWGEGSGGVAAVEGEE 162

[Close]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6603927.1 (hypothetical protein SDJN03_04536, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 1.5e-12
Identity = 96/166 (57.83%), Postives = 105/166 (63.25%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRERGYGVLLVLGILLSIYLVEG-KGANSSEKSRSLDGISNQWSNLDDTLF-GVGVTGR 60
           M R RG GVLLV+GI+LS+YLVEG KG   S +     G SN+WS LD   F GVGV+GR
Sbjct: 39  MERGRGCGVLLVVGIVLSLYLVEGVKGFERSGRV----GASNEWSKLDGRPFEGVGVSGR 98

Query: 61  NVTVTGGK---------------GGGNSSGEGGGGS-------GVRKKGTKHHKEQGKNG 120
           N TV GG+               GGG   G GGGG+       GVRKK TKH K+ GK G
Sbjct: 99  NATVNGGRDSVKRGITNGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGEGSGVGVRKKDTKHSKKHGKGG 158

Query: 121 NGGGGGGRGGSG-----GGGGGGGGGGTKGGGGGGGGGNGGGGGGG 138
           NGGGGGG GG G     GGGGGGGGGG  GGGGGGGGG GGGGGGG
Sbjct: 159 NGGGGGGGGGGGKGYGWGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG 200

[Close]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. NCBI nr
Match: KAE8647602.1 (hypothetical protein Csa_004179 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 9.8e-04
Identity = 97/201 (48.26%), Postives = 114/201 (56.72%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRERGYGVLLVLGI-LLSIYLVEGKGANSSEKSRSLDGISNQWSNLDDTLFGVGVTGRN 60
           M  ERG GVLL LGI L+SIYLVEGK   S + + S+   SN WS+L+++L      GRN
Sbjct: 1   MKSERGSGVLLFLGIVLISIYLVEGKEVKSFKINESVGSTSNGWSDLNESL-----RGRN 60

Query: 61  VTVTGGKGGGNSSGE------GGGGS--GVRKKGTKHHKEQGKNGNGGGGGGRGGSGGGG 120
           +T++GGKGG NSSGE      GGGGS  GVRKK TKH+K+ GK+GNGGGG G G      
Sbjct: 61  MTISGGKGGRNSSGEGHGGGGGGGGSDVGVRKKDTKHNKKHGKSGNGGGGEGVGAMVAVE 120

Query: 121 GGGGGGGTKGGGGGGG------GGNGGGGGGGVVVAEVEDGVLAEEGVGVFVGFGDVVAA 180
                       G G       G +GGG G G            EEG   FVGFGDV  A
Sbjct: 121 VEAARAEVVEVEGEGKWERVWMGRSGGGWGFG------------EEGAEGFVGFGDVAGA 180

Query: 181 A----VMEKPWLEEEVLQTKK 183
           A    VMEK W+ E+V QTKK
Sbjct: 181 AAAVTVMEKHWVGEKVPQTKK 184

[Close]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KGL8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G504700 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 4.9e-25
Identity = 122/195 (62.56%), Postives = 139/195 (71.28%), Query Frame = 0


Query: 1   MGRERGYGVLLVLGI-LLSIYLVEGKGANSSEKSRSLDGISNQWSNLDDTLFGVGVTGRN 60
           M  ERG GVLL LGI L+SIYLVEGK   S + + S+   SN WS+L+++L      GRN
Sbjct: 1   MKSERGSGVLLFLGIVLISIYLVEGKEVKSFKINESVGSTSNGWSDLNESL-----RGRN 60

Query: 61  VTVTGGKGGGNSSGE------GGGGS--GVRKKGTKHHKEQGKNGNGGGGGGRGGSGGGG 120
           +T++GGKGG NSSGE      GGGGS  GVRKK TKH+K+ GK+GNGGGGGG GG+GGGG
Sbjct: 61  MTISGGKGGRNSSGEGHGGGGGGGGSDVGVRKKDTKHNKKHGKSGNGGGGGGGGGNGGGG 120

Query: 121 GGGGGGGTKGGGGGGGGGNGGGGGGGVVVAEVEDGVLAEEGVGVFVGFGDVVAAA----V 180
           GGGG GG  GGGGGGGGGNG G G G V   VEDGVL EEG   FVGFGDV  AA    V
Sbjct: 121 GGGGAGG--GGGGGGGGGNGKGYGWGGV---VEDGVLGEEGAEGFVGFGDVAGAAAAVTV 180

Query: 181 MEKPWLEEEVLQTKK 183
           MEK W+ E+V QTKK
Sbjct: 181 MEKHWVGEKVPQTKK 185

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038882243.1	1.6e-14	60.37	glycine-rich protein DOT1-like [Benincasa hispida]	[more]
KAG6603927.1	1.5e-12	57.83	hypothetical protein SDJN03_04536, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
KAE8647602.1	9.8e-04	48.26	hypothetical protein Csa_004179 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0KGL8	4.9e-25	62.56	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G504700 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CaUC01G019590.1 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 61..117

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CaUC01G019590	CaUC01G019590	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CaUC01G019590.1-exon	CaUC01G019590.1-exon-Ciama_Chr01:32606545..32606681	exon
CaUC01G019590.1-exon	CaUC01G019590.1-exon-Ciama_Chr01:32613622..32614033	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CaUC01G019590.1-cds	CaUC01G019590.1-cds-Ciama_Chr01:32606545..32606681	CDS
CaUC01G019590.1-cds	CaUC01G019590.1-cds-Ciama_Chr01:32613622..32614033	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CaUC01G019590.1	CaUC01G019590.1-protein	polypeptide