CSPI01G04710.1 (mRNA) Cucumber (PI 183967) v1

Overview
NameCSPI01G04710.1
TypemRNA
OrganismCucumis sativus var. hardwickii cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr1: 2952965 .. 2954040 (+)
Sequence length1076
RNA-Seq ExpressionCSPI01G04710.1
SyntenyCSPI01G04710.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTAGAATTGAAATGAACAGTGAGTACAATAATCAATGGTATATGTATATACTATGTATGGAATACCTGATCGTTCTGAGCTTTTCTGAATCATCTTTGTTTCTGAGTATGAATTTAAGGGGAGAGATGAAAAGGGGTTGTGAGAAAATCAGTTTGAAAGTGGATGGAGACAAAAGCTTGTTTTATAATTTAGTCGGATTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGA

mRNA sequence

CTAGAATTGAAATGAACAGTGAGTACAATAATCAATGGTATATGTATATACTATGTATGGAATACCTGATCGTTCTGAGCTTTTCTGAATCATCTTTGTTTCTGAGTATGAATTTAAGGGGAGAGATGAAAAGGGGTTGTGAGAAAATCAGTTTGAAAGTGGATGGAGACAAAAGCTTGTTTTATAATTTAGTCGGATTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGAACAGTGAGTACAATAATCAATGGTATATGTATATACTATGTATGGAATACCTGATCGTTCTGAGCTTTTCTGAATCATCTTTGTTTCTGAGTATGAATTTAAGGGGAGAGATGAAAAGGGGTTGTGAGAAAATCAGTTTGAAAGTGGATGGAGACAAAAGCTTGTTTTATAATTTAGTCGGATTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGA

Protein sequence

MNSEYNNQWYMYILCMEYLIVLSFSESSLFLSMNLRGEMKRGCEKISLKVDGDKSLFYNLVGFEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEGEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE*
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 60..354
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 62..354

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CSPI01G04710CSPI01G04710gene


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CSPI01G04710.1.utr5p1CSPI01G04710.1.utr5p1five_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CSPI01G04710.1.cds1CSPI01G04710.1.cds1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CSPI01G04710.1CSPI01G04710.1-proteinpolypeptide