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Tan0022533 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTGAGACATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACCGTGTGCACACAGGTCATTTTCTGTTGTCGACGTTGAGTGTACTCCGTGACAACAATGCTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACGACAACGACGATGAGAGTGTTTGGCGAGCCCTACTACATCGTAGAGTAAATGTTGGTTGTATTGAGTGTGTCCTATACAACGTAGAATGTCATACGTTTTTAAATTGTTAGTAGTATCGATATGCCTTGCGAGATTTTAATGACGTACTTGCTGGATTTCTGAAAAGCTATTATGATTACATGTGTATTTTTAACGCTTGATTATAGATATATATGCTCATAAGTTTCCAGGTGATATGATTTATGAGTTATAGATTTTTAATTCAGTCACTCACTGAGCTTAATAGCTCATTCTTTCAGTGTTCTCAAACTTTTCAGGTAGAGATCGAGCTCCTGGTGCCTGATAACCTGCCATAGTCTGCTGAAAGCTCCACGAGTTTGATATTTTGTACGTGGGTGGAGTTGTATAAGAAGTCTATATGTATTGTAGGAGGACTAAGAAGTTATGTTTATGTGTACATTCTAGGTTGTGGCTGTGTAAACCATGGTTGGGTATGTTTTTGGTTGTGATGTTAATATCCGTTTCAGGATTCCAGAGAGTCTTAAGTAGGGTTACTCCTTATGTAGGTTACGTAATTGTCAATATTCCGCTGTGTTATGCTTAAAGTGTTTCTTATGCAAGTACAGTATGCTTATCAGGTAAAGCAGGGTCAACAGGTATCGTAAGAGAGGTGAACGATGCCTGTTTGCTTCACGCCGTCTGCCGGGCTAAGTTAGCTAGTAGTTCGGGAGGGGGTGTGATAACTTGGTATCAGAGCAGTTAGCTCCATGGGAAATGAGAGAGAGCAAGTTAGCTCTAGAAGAAACTAAAAAGTAAATAGCAAGTTATTGAGTTAATTCAATAGAACTAGCAGAGCATGATCAAAGTAAGGATAAGAGTAAGTCCAGTCAGGACTAGAATGTGAACACAAGTCTAGAATTGTGCATTTGAGTTAAGTATTCATTACATGTCTAGTATGTTGATATGTTATGGAAGTCATGCCACCACGTACTAGCAGACGATGCATGCAGGATCAGGACGGGACGCAGGATCCTACCCAAGTCCAATCTGAGAGGGGATCTAGTGCCCCGAGAGTCCAGATAGCGGCCAGAATTAAGCAACATGCTAATTCCTCACAGGAGGTAGGTAAGCCATAGAGAGCATAGCTAAGTGATCCAGACAAGACATATAGAATAGATCACCTAAAAGAATTAGGAGCCACAGTGTTTGAGGGTTCCAAAGATCCAGTTTACGCAAAGGTTTGGCTGAATATGAATGAGAAATGTTTTGTTGTGATGAGTTTTCTTGAGAAGCGGAAAGTCAAGTTGGCCACATTCTTGCTGCTAAAGGAGGCAGAAGGATGATGGAAACCAATATTAGCCAGGTGTAGTAATGCACGTACTTTTGACTGGCAAACTTTTAAAAGCATATTCGAAGATAAGTATTACCCTAGCACGTACCGCGAGGAAAAGAGGGATAAATTTTTAGAATTGAAGTAAGGGTTACTTTCAGTGGCTGAGTACAAGAGAAGGTATACCGAACTGTCACGGTATGCTGATGTGATTGTGGCATCTGAGAGTGACAGGTGTCGAAGGTTTGAAAGAGGATTACATCTTGAGATACGTACCCAGTCACAACTATTTCTAAGTGGGCTGACTTTTTCTCAGCTAGTAGAGACTGCCCTACATGTTGAGCAGACTATAGTAGAGGAGAAGTCAGTAGTGAAGCCTAGTTGTGAGGCTTCGACAACAAGCAGTTTCCAAGGTCATGAGCAGCAGAGGTTCACACCCGGAGTAAATATTTCCAAGTCAATAAGACTTTAAGAATCGAGCTAGTAGTCGGGCATCGAGGCAGATGAATGTGGGTAGTGCCTATCAAAGGCAGTGTTAAAGAGGACCTAGTTAGTTTGTTTGATTAGCAACAAGTTTGCAGAGAGGGCAAGAGTCTATTGCCAGTATAGCAAGGAAAACTCCATGTGTGATTTGTTGCAAGAATCATCGAGGTCATTTTCTTGTGAGTGTTGGTACCTGCTACCAGTGCGGACAACCAGGACATGTCAAGAGGGATTGTCCACAGCTGTGAAAAACCGCACAGAGGGACTAGGGAGTTGAGTCCCAGATAGTTGAGCAGCCGAGAGTTTCAGTAGCTGCAAGAGAGGGCACCAGCTGTGTTAGACTAAAGAGAGTTGTAGAGAGACCTAGGCAACACGGAAAGCTCTACGCTATGACTCAGTAAGAAGCAGAAGATGCACCAGATGTCATTACTGGTACGATTACTATTTGTAATGTACCTGCACGTGTTTTAATAGATCTAGGTGCTACACATTCCTTTGTTTTTAGTATGATCTTAACTATTATTGAATGGGAAGCTAGAACCTTTATGTAAAAGGTTAGTTATATACACTCCAGTTGGTGATGTGTTACTAGTCAATGCAGTGTTGCAAAACTTTGAGGTCTTAGTAGAAGATCTCAATATGTTAGTTGATCTTCTTCCACTAGAGTTGCAGGTATGAGATGCAATCTTAGGGATGGATTTCTTATTTACTCATTATGCTTCCATGGATTGCCATGAAAAGGAAGTGATATTCAGGAAACCAGGGTTAGCTGAAGTGGTTTTCAGAGGTGAAAGAAAGATTATCCCTACGAGTTTGATTTCAGCATTAAAAGCTGAAAAGTTGTTGAGGAAAGATTGCACGACGTTTCTTGCACATGTGGTGGAGGTGCAGGAGGAAAAGCTAAAACTAAAAGATGTTCTTGTTGTGAATGAATTTCTTCATGTTTTTCCAGCAGATCTGTCAGGGTTACCACCTGATAAGGAAGTTGAGTTCACTATTGAATTGTTACCAGGAACAACACCTATTTCGCAAGCGCTGTATAGAATGTCTCCAAACGAATTTAGAGAGCTGAAGATGCAGTTACAAGAACTAGTTGACAAGGGATACATCAGACCTAGTGTATCACCTTGGGGAGCTCCAGTGTTATTTGTAAAGAAGAAAAATTGTACCCTTAGATTATGCATTGATTATAGACAGTTAAACAAAGTCACGATACGTAACAAGTATCCTTTGCCCCGTATAGATGACTTGTTTGACCAGTTACGAGGAGCATCAGTGTTTTCTATGATTGATTTAAGATCAGGATACCATAAGTTAAAGATAAGGGAATCAGATATTCCTAAGACAACATTCAGAACGAGGTACGGGCATTATGAGTTTTTAGTAATGTCATTCGGTTTAACGAATGGACCAGCAATTTTCATGGACCTCATGAACAGGATATTCCATCAGTATTTGGACCAGTTTGTAATAGTATTTATTGATGACATATTAGTTTATTAAGTTGACAGGAAAGCCCATGAGGAACATTTAAGGATTATTTTACAAACACTACGCAATAAACAGTTGTACGCTAAACTCACCAAATGTGAGTTTTTGTTGAATCAGGTAGTGTTTGGGGTAAGTTGTTTCAACAAATGGAGTTTGTATGGATCCACATAAAGTAAAAGCTATGGTCAACTTAGAGAGACCAGCTAATGCGACAGAGGTACCTACTTTCCTAGGCTTAGCAGGATACTACAGATGATTTTTTGAGGATTTCTCACGATTAGCATTACCCTTAACAGCTTTAACAAGGAAGAATGCTAAGTTTGAATGGTCAGATGAGTGTGAATGAGTTTTTCGTGAGATTGAAAACAAGGTTGGTGATGATGTACCTATTCTAACACTTCACAGAATGAAAAAGAGTATGTGATTTACTGTTATGCTTTGGGACAAGGATTAGGGTGTGTGTTCATGCAAGAAGGAAAAGTAATAGCTTATGCGTCAAGGCAATTGAAAAAGCACGAGTGTAATTGCCCCACTCCAGTTCTTGAGCTAGCATCAGTTGTTTTAGCATTAAAGATCTGGAGGCATTATTTATTTGGTGAGAGGTGTCACATTTTTACAGATCATAAGAGTTTGAAATATATCTTTGATCAGAGAGAGTTGAATATGAGACAAAGAAGATGGTTAGAACTGATTAAAGATTATGATTGTACCATAGAATACCATCCTGGTAAGGCGAATGTGGTAGCAGATGCATTGAGCAAGAAGTCAAGACTTCCTAGGGATGCCTTGTTGAAGGGAATGAGAATCCCCGCGCAGCGGAAGACGATCGAATCGTCGTGGTAACATTACGCAACTTGGTTTTGTTAAAACGATCTACTAAAGATCTAGGCTAATCATGCTGGAAAAAGGAAGAAAAACAACAAGTTTAGAGATACTTACTTGTTGAAGACACTCTTCAAGGTTTCTTCCTCAGATCACGAACTCTTCGTGCTTCTCGATCTCAACGAACTCTTCCCACGAACGGAACTCGAAAACCACCACATGGAGTCTCGGTTTTCTCTTTTGGAAGAACGAAAGTTATGTGGGAACTTTAGTGTTTTGGAGAGGGAGGAGAATTGAGAGAGAATAGAGAGAATTCTTCCTCTCTTGTTTGATGAAAATCAAAAAAATGAGAGAATGGTTACCTTTCTTCTTGCAAGAAGGGATTATATAGTGGAATAATGGAGTTAAAATCTCCACATTATTACCACTTTACCACAACCATAGGTTATGCAAATCTCATTTGCATAACCACATAATATAAGATATCTCATATCTCATATTGCAAATCTCATTTGTATTAATTGTGGATTAATTAAATTGAATCACATCCAATTTAATTGCTCTCAATTAATTTCTCCATTTAGCCCTAATTCAACAATTAAGCTAACCTATAGTTTATTATGAATCTCATTCACATTAAACTATATATTATATCATTCATATCTCATATAAATGACATAAATGCCCTTAAAGTGAAATTGAACACTTCAATTTCATACCAAAACCTTAACCCTTCTTTTAACC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Match: TYK27998.1 (reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.3e-09 Identity = 49/102 (48.04%), Postives = 55/102 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. NCBI nr
Match: KAA0066851.1 (reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.3e-09 Identity = 49/102 (48.04%), Postives = 55/102 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. NCBI nr
Match: TYK06355.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold163G00340 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 6.5e-09 Identity = 47/100 (47.00%), Postives = 53/100 (53.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. NCBI nr
Match: KAA0062407.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold154G002090 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26574.1 uncharacterized protein E5676_scaffold313G001830 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 1.5e-08 Identity = 46/114 (40.35%), Postives = 57/114 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CU23 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold15G00050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.0e-11 Identity = 46/99 (46.46%), Postives = 54/99 (54.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DX39 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold384G002140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 6.4e-10 Identity = 49/102 (48.04%), Postives = 55/102 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VMG9 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold271G002220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 6.4e-10 Identity = 49/102 (48.04%), Postives = 55/102 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C4P7 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold163G00340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 3.2e-09 Identity = 47/100 (47.00%), Postives = 53/100 (53.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022533 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V638 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold313G001830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 7.0e-09 Identity = 46/114 (40.35%), Postives = 57/114 (50.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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