Tan0022309 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGGGGCATCACGAGTTGACGAGTCCTATTCTGTATTAGCAATTCACAGACGGTTGACGACGAGCCAAATTGGGCGGAGGAGCGAGAGCTTGAAAGACACAGAAATGGCGAATCGCACGATCAACTGCAAGACAGAAGTAGGGAAACCCCTTGTAGCTCTGATTTGCGGTTCGTTGGTTTATTACCATTGCGCCTATCGAAATTCCAGTCTCCTCTCCCTCGTTGCTGACGTTTTCATCGTTCTTCTTTGCTCTCTCGCCATTCTTGGCCTTCTCTTCCGCCATATGAATGTCTCGTAAGCACACCCCCGTTTTCCTCTCTGTTTTGTCTTTGCGCCCAATTATGTGTTTTCTTCGATCGTTTATTGGATAACAGATGATCCTTTTTTCGTTGCTTGCCTTGTCCGTTCATGTGAAGCCTATGCTTGTAGGGTATTTTCTTGATTGGAGAACTTCTTGGAGATTATTTAAAATCGTTGGGATTTTGATAAGAATTCAATGTCAACGGACATATTAGTCGGTTTCAATTTTTATAGATTTCTTGAAAGAAATGTCGTTGAACTTAGGTCCTCCATCTGTATACATATCCTTGTCGTCGTAATGATCTTGAGTTGTAATCTGTAAACCAAAATTCAAATGATTTGCAGGGTACCGGTGGACCCACTTGAGTGGCAAATATCGCAGGATACTGCTAATAGTATGATTGCTTGGTTAGCCAATACCATAGGTGCGGCTGAGTCTGTTCTGAGAGTGGCAGCAACAGGACATGACAAGAGGCTTTTTGTTAAGGTATTCCTCTCATTAATTTGTACGTTTGTCCGCTTCTACACAGTTTTGCTCTCACTAACTTGTACGTTAGTCCGCTTCTTCACAGCTTTGGTATCTAATAACTAGACTCCCTTTTAGTGAGTTTTATGTTCTTGTAAGAACTCGAATAGGAGAATCTGAAATTGCATATTAGTAAGAAGCACACATTCACTTCTTTCTACAATCCAATATGCCCGGGACTTTTTATGGTCTTCTGATTAGAGAGGATCAAGTGTACCATAGTCAGCCTTGTGGCACGCCAAAGTCTTTTGACAACTTAACATTGGGTGAACCTTTACGTGAATAAAGTTTAGTACCTATTTCATAGGAAACTTAAAACCTTTTGTTCGTGGCAGGCTAAGAAGCACATACATGGATATGCAACACAAAGATGGCGAAGGCATATAAATCCAAATATTGTGCTTGCTTCTATCAAATTACTACGAGAGCCTTGGGCATGACATGAGTGAGGAAAATGGATAATTGAATTGTAGCAATGAACACAAGAAGGTTGATCCCCAAAAAAGTGAAGTTCTTTGCTTGGCAGGTGATGTGTGAGAGAGTGAACAACTTAGATTGTGTTAGGTATCCAAACTCAGAAAATACTAAGAATGCAAAGAAACTAATATATTGCAATATCAATGAAGAAAATTACAATATCGATAGCCTTTTGAGAGGGTTTTATCTCTCTCACAACCAATCCATTAAGGATTGACTCACCAAAAGATGACCTCCTTTCTACAAACCCTATTCCTTTTATTTATAACCAAAACTCTCTAGCTAATTACCCTTAATATCCTTGCTAATTACTACTATCTCCAAGATAACCCTATTAGTACTCTCACAATGCTCCCCTCTGATACCAATTTGTTAGGTATCCAAAAATAGAAAATATGAAAAAACACAAAGACTCTAATATATTGCAATATCATGGAACGTTACAATATAGCAATAGCCTTTCGAGAAGGCTATCTCTCTCCCAAAGTCCCACAATGGACACTCTACTAAAATGATTCCCACCAAATTAAGGATCCTAATACCCCTATTTATAACCAAGACACCCCTAGCTAAATTCCCACAATATCCCTCATTGATATACTACTAATCTCCCACATAAAACCCATACTATACCATACTAGTACTCTCACAATATCGAGCACTTCAAAACACACCTTGTCCTCAAGGTGTGGGTCAACCATTACAACAGTTAAACCAAAGATCCAACAAAAAAATAAAATAAAATGAAGACCCCAAATTAAAAAAGCATAACCCAACCCCAAATTCCCATAAAGCACTAGCAAACTTGCTGTCTCATTATTCCTTTTCAAAAAGAAATGGGTCTTGTCATGGCAATCTAGCCCATATGCCAAACCGGAGTTCATGCTGCAACTTTTTCTAACTCTTGGCCCCACCTCCTGCACTTCACGTGGTTAGGAATTTGGTTTTCCACTCTTCATGAAAATTGCAACACCTTCCCCAACCTTTCTTCTTCGTCCATTCGCAGGTGAACACTTGCATCACCTTTCCCAACCTTTTTTCTTCTTCGTCCTTCCCAACATTTGCATCACCTCGTCCTACGTTTTCTGGTGGTGATTGATCAATGGAGATGGCCGGCGACATCGATGTAAAGCAGGACACAATTTCGGCTAAGGTTATTTTCTTCAAATAGGTAGCGTGTTGCCATTTTGGGTCAAGTTTTAGGTTCAAAACAAAGAACAACCCAACCCAAAACCCATTGGGTGAAACCATCTTATTTTCTGCCATTGAAAAACAATGGGCCTCATTCAATCTAATTTACCACTAGCCCATTAAAAATCAGCTGGTAAAGCTTCAATTCAAGAAGCCCGAGGTCCCTTCTCTTCTAGAATCCTCCAATCCCACGTGATTAAGATTAGGGTTTATCACCCCCACATCCTCTTCTTCTTTTACGTGCTCGACCAACCTGGGACCCATCTGCGCACAAAATTTGTAATGACGTCGTCTCCACGAGTTCATCTCCAACACAAATGCCCTTGCTGCAGGTAATTGCTTCCATCAGTGATTTTTTTCACGATCTTCTCCTTATGATCCTTCTCCTGCAACTTCACAATCCTTGCGTCAATGCCCTCTCTGAGGTTTTGTCTTCGACCACACATGCCAACATTGTCGAAAATGGCCTTTATCGGTCTTTTCCCTTCTTTTTTTCGAACCTTGCTGGTACCGAAGCCTTCCCTCCCCCTTAATGGCCGATGGTCCCACCCTCGAAATCCAACCTTCGACATGCTGAATATTCCACCTCATTCGTGCGTGGTCTTCGAACTCTGATTGAATACATGTTGGTCTCCTCTCAATCGCCTCTCTCTGATCTACTTTTTTGACTGTCACGCAAGATTCGTCTTCCCACTAGCCTACTCTTCTTCTCAATCATTTTCACTAGCTTCTCTTTTTCTCCATCTTTCTTGCACAGAGAGGATTCATCTTCATCGGCGACCTTCCACGATTCTTCCTTCTCTTATACCATCTTTTGCGCTGTTATTGTGAAAGTGAATTGAACCTTGCCATTGGAAATTTCAAACAATATAGTGGTCATGGCTCTTTGACTCTCTATTTCTGCCACCAATCGATCCATGATCTCGACTATCCTCTGTAAAGCTTCTTTCATTTCAACCACATCCTTCTCTATTCTCGCCAACAAGAGCATAGCTCAACTGGCATCAAGTATGACTCATGATCAAGAGGTCATGGGTTCGAATCCCCCCACCCCCAATTGTTGATGTACTAAAAAAAACCACATCCTTCTCTATTCTCTCTTTCGATTGTTTTTGTGCCATTCTCTAGGATGAACGCCCTCTAATACCCATTTGTTAGGTATCCAAACTCAAAAAAATACTAAGAACACAAAGAAACTAATATATTGCAATATCAATGAAGAAAATTACAATATCGATAGTATTTTGAGCGAGCTATGTCTCTCCGCAACCAATCCACTAAGGACGTACTTACCAAAATATGACTTCCTTTCTACAAACCCTATTCCTTCTTACTAATTACTATTCGGAGCCCTTCGGAAAAGTCTCCTAGTGGCCGGGAAACGAGATCTATGTGGACGTTTAATAAACTTATTGGGAACTGCTCCCTGTTTGATCTTCCCCTAGGTAATGGACGTTTTACTTGGGCAAACGCAAGGGCTAGGAGCTGTATTGATAGGGTTTTATTGTCCACAGGTTGGATGGATGCCTTCTTTAACGCTAGCCTAAGGCTAGGTCCTAGAATCACCTCTAACCACTGCCCGCTTTTTTTGGACTCTGGGTCTCCTAAGTGGGGCCCGTGTCCCTTTAGATTCGAGAACATGTGGCTGGAGCACCCTTCTTTTAAGGCCTCCCTCTCGGCTTGGTGGCAGAGGAGGGTGACTGGAAATTGGGAAGTGTATCGGTTCATGGGTAAGCTTAAGGCTCTTAAGGAGGTGTTGAAGCCTTGGAATTGCGATGTTTCTGGCGATGTGAGGGTGAAGAAGCAAGAGGTCTTAGGCCATCTTAAATCCTTGGATAGTTTGGAGGAGGAAGGGGGTTTGAGTGAGGCTCTCAAGGAGGAGCGCTACTCGGTTAAAAAGGAGTATGAGGAGTTGGTTTGGAAAGAAACGATGAGCTGGAGTCAAAAGACAAGATTAAGATGGGCTAAGCTTGGTGACGAAAATTCTGCTTACTTTTTCATAGAGTTGCGAGTGGAAGACGCAACAATAATGTCATCCTATCTTTAGAAAATGGATTAGGTGAGGTTGTGTGGGAGCCGAGGAAGATTGAGGAAGAGATTATCTCTTTTTATTCGAGCCTTTATGCCCCTCCTATGTGTAAGCGTGGGTTTCTGGAGGGAATAGAGTGGAGTCCTATCCCTGATGAGGCCTACTCGTCCCTTGTTAGCCCCTTTACCCTTGAAGAGATTCGTCAAGTGGTCTTCAGCTTTGATAGAAGCAAAGCCCCTGGGATTGATGGTTTCTCTCTGGATTTCTTCCAGGATGGTTGGGATACCATTAAAGAGGATCTTTGGAAGGTCTTCTGTGAGTTTTTTGAGCGGGGGATTCTGGATAGCTCCCTTTCCGACACTCTGGTTTGTTTGATTCCTAAGAAAGAAGGGGCTAGGAAGGTGGGAGACTTTAGGTCGTTTAGTCTGGTGACAAGTGTGTATAAGATTATCGCTAAGGTGCTTGCTTGTA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ATGGCGAATCGCACGATCAACTGCAAGACAGAAGTAGGGAAACCCCTTGTAGCTCTGATTTGCGGTTCGTTGGTTTATTACCATTGCGCCTATCGAAATTCCAGTCTCCTCTCCCTCGTTGCTGACGTTTTCATCGTTCTTCTTTGCTCTCTCGCCATTCTTGGCCTTCTCTTCCGCCATATGAATGTCTCGGTACCGGTGGACCCACTTGAGTGGCAAATATCGCAGGATACTGCTAATAGTATGATTGCTTGGTTAGCCAATACCATAGGTGCGGCTGAGTCTGTTCTGAGAGTGGCAGCAACAGGACATGACAAGAGGCTTTTTGTTAAGGTCGTTGTTTGCCTTTACGCCCTCTCAGTCCTTGGAAGATTGGTTTCAGGTGTTACAGTTGCCTACACTGGTCTATGCATGTTGTGTATATACATGGTGTTGGAGAATTCTGAGTCAATCGGTGCTTCTATTTCTCCTTTTCTTAGGAGAGGAAACGACCCTACTCCACACCAAGATACTATCTAA MANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTIGAAESVLRVAATGHDKRLFVKVVVCLYALSVLGRLVSGVTVAYTGLCMLCIYMVLENSESIGASISPFLRRGNDPTPHQDTI Homology
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWH5 (Reticulon-like protein B22 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTNLB22 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 219.9 bits (559), Expect = 2.2e-56 Identity = 114/165 (69.09%), Postives = 137/165 (83.03%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C941 (Reticulon-like protein B23 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTNLB23 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 2.3e-50 Identity = 100/138 (72.46%), Postives = 122/138 (88.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. NCBI nr
Match: XP_038889154.1 (reticulon-like protein B22 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 326.6 bits (836), Expect = 1.3e-85 Identity = 165/172 (95.93%), Postives = 168/172 (97.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. NCBI nr
Match: XP_022952032.1 (reticulon-like protein B22 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022973272.1 reticulon-like protein B22 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_023536692.1 reticulon-like protein B22 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG6585840.1 Reticulon-like protein B22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 5.9e-83 Identity = 163/172 (94.77%), Postives = 167/172 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. NCBI nr
Match: XP_008465703.1 (PREDICTED: reticulon-like protein B22 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 315.1 bits (806), Expect = 3.8e-82 Identity = 161/172 (93.60%), Postives = 166/172 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. NCBI nr
Match: XP_011655303.1 (reticulon-like protein B22 [Cucumis sativus] >KGN51194.1 hypothetical protein Csa_009004 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 8.4e-82 Identity = 160/172 (93.02%), Postives = 166/172 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. NCBI nr
Match: XP_022150304.1 (reticulon-like protein B22 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 1.1e-78 Identity = 151/172 (87.79%), Postives = 162/172 (94.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I734 (reticulon-like protein B22 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471842 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 2.8e-83 Identity = 163/172 (94.77%), Postives = 167/172 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJ96 (reticulon-like protein B22 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454742 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 2.8e-83 Identity = 163/172 (94.77%), Postives = 167/172 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPH6 (reticulon-like protein B22 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503325 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 315.1 bits (806), Expect = 1.8e-82 Identity = 161/172 (93.60%), Postives = 166/172 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KQM7 (Reticulon domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G487710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 4.1e-82 Identity = 160/172 (93.02%), Postives = 166/172 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9M0 (reticulon-like protein B22 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018504 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 5.5e-79 Identity = 151/172 (87.79%), Postives = 162/172 (94.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. TAIR 10
Match: AT1G78895.1 (Reticulon family protein ) HSP 1 Score: 219.9 bits (559), Expect = 1.5e-57 Identity = 114/165 (69.09%), Postives = 137/165 (83.03%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0022309 vs. TAIR 10
Match: AT1G16825.1 (Reticulon family protein ) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 1.7e-51 Identity = 100/138 (72.46%), Postives = 122/138 (88.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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