Tan0021830 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTAGAGTCAAATTTAAAACATTCGCCAGAGGGAGTCTTCGAGTCCGTGAGCCGCGAGGAGACACAATTCAACTTACTCATTTCATTGTTCGAGACTTCAAGTTGTTGTCGTTGATTCGTTTCATCATCCAAGTCGTAAAAAAAATTTAAAAATGGCTATGGCGGGATTGTATAGGCGGATTCTTCCTTCTCCTCCAGCAGTCGAATTCGCTTCCTCCGAAGGAAAGGTATACGTATACTTGCCTGCATGTTATCTTCCACTGGTGCCATTACTCTCCCTTCCCTTGTTAAAATTCAGTGTTTAAGTCCCTATTTTTCTTTTTCTGAAATGTGTTTTCTTCATTTAACTTCGTAACAGTGTTGATTATGTTCGGTAATTCGCATCACTTTGTAAAATAAATTCAATCTAATGCTTTTGTTAATCGGTTGCCACTTTCCAGGTGGATAAACTTGCTGGTCGTAGGCTGCTTTTTGAAATCATGAATCCATACTAATGCTAACTGAATTTAAGTCTCAAGAAACGAATGTGATGCACCCAAATAGCGAATGAAGCTCTTGCTTTCTGGAAACAGTATTATTTTGATTGACCGATTACAAGTTATTTTAATGAGACGAGGGTTCGGATTAAATTTAAATTGTTATACTAGTAGAGTAGGGTTTTATTTCTGTAGCCATCATGTGTATAAATCCTCGTCTTTAGATATTGTGAAGCCTACTGGATTGCCAATGAATATATTTCTGAAGTACGAAAAATAATTTAATCACTTGGTCATTCCCTTGATACTCTTGCTTCAATTCTCTTATAGTACATGGTTTGTAAATACTACATAATAGAAACCCTTGTGTATATATAGCAATCTGAACACAGAGTTTATATGCTTATGATTTAAATGCGATACCAAAGCATGTATGAAAACAATACCTCTTTATTAAAATCTGCCCTTTACAACTTAAGTTCTACTATGAATATAGTGAGTTCAGGATTAACCAACTAACTGACATTAACAAAGCTAACAAACCAGAAAATCTCCCAACGGCTAGAATGGTAAACGACTAAGAAAGTACTCGATTATATACAAAGAGCCATTGAAGAGTTACATCAATTCCATCCCCCCAAAAAAGAAAACTCTTCCTTGAGTTAAGGTGCCAAAGAAAAAGTGTCTGGTGCATGGTAGTCTGAAAGGTTGCATTAAAAGTGGGGGAGATCCACCTTGTACGCATTTGCACCAATCCTCTCTAGGATTCGAAAAGGTCCTGTCTTCTTTGGATGAAGCTTATTGTAAGTGCCATCCAGAATTTTGTTCTTTGATCTTTCGAAGGTGCACTATGACTAGGTCCCCAATCTCAAATGTCTTCTCCCTTCTGTGTTTGTCAACCTGCGCCTTGTAGAGTTAGTGTCTCCAAATGATCTTGGGCTTCCTTCTGCAGCTCCACAATTCTTTCTGCCATAGCCTATGCTTTCTAGTTAATGTCATCATTAGATGGAAAATTAGTAAGGTACATGGTTAATCTAGGGAGCTTGATATAAACAATTTCAAATATGACTTCCTGGCGGACCAGTTGCACATATGGTTGTGGGCGAATTTAGCTTCTGCTGAGGCTAGTTTCCATAGCTTCGGTCTGTGACCACTAAGGCTGTGGATGAGGTTCTCAAGTGAGTGATTCGTGATCGAGTACATTCCAAACATCAAACACCATGCAAGACTGATTCGTAGCCAACTTGTAAAGATGAGGAAAAGCAGAAGCAATTGGTCCACAACTCAACCAAGAATCAATCCAAAAGGATGTAGTAGATCCATTTCCAAGCCGACGATGTGCTCTAGAAGCAGTTATCTCCTGAACATTGCTAATAGATTTCCAAGGTAATTTACGAGAAGCCAGTCTAATGGGTTGAGGCCAACCAACACTATGCATCAAGTCATAATATTTATCAGCAATAAGTTGTCTCCATAAAGAGTCCGTTTCATGGCATAACGCAAGATCCATTCGGCAAATAATATTGTGTTACGATTTTGAAAGTTACCTATGCCCAAACCACCCATTAGCTTAGGAAGTTGTGTCGTTTCCCAATTCACATTATGTACACCTCCATCACCTCGAGATCCTTCCCATAAAAAATCTCTAGTGATCTTGTCTAAAATCAACACCACTTTGGAAGGAATTTTAAAAACAGACATATAGTCAATTGGCATGCTAAAGAGAGCCTGGATTAAAGTGTGTCTACCACCATTTGAAATAAAAGCATATTTTCAATTGTGTAATCTCTGCTTTATCCGCTCAATAACAGACTGCCAAAAAGATAAAAAGCTTGGATTCCCTCCAAAGGTAAACCAAGATAAGTATTAGACCAGTCCTTGTTTGCAACCAAAAAAGCCAACATCCAATCCATGTCAGAAGAATCAATGTGTATCCCCATAAGTTCACTCTTGTTCAAGTTAACCCTCAAACTAGAAGCACATTAAAAAAATTTAACCACTTGATAAAGACGAATCAGAGCATCCCCATCAAAAATAGAGAGAAGAAGCGTATCATCAGCAAATTGCAAGTGATTTATGGGCAAAGAGTGTGAAACAATGACCCAAACTTTCGTTGTGTGCCAAAAGGAGACTCAAGCAATTAGATACTAGGATAAAGAGAAAAGGTAAAAAAGGATCACCTTTTCTTGCGATAGAAGAAAAACTTCCATCGACAATTCAAATCTTTTCATTCAAATACGAAGGAGAGTATGAGTTAAAAAAAATGAGGGGAACTAGTCATATGATCAAAAGCTCTGGAATCTTTGATCCACAGAGACGAATTACTACTAGAGAAGGCCTTAGGATAAATACCTATTTGTGCCAATGATACACATGAATTATTAGAAGGTAAATTGGTCCATAGTAATTTCGATAGTTTACGAATCTGCTCCATACTAAAGAAGCTTAACCTGAAAAATGAACTGAACCAGATTCTTAGCTAACCCAATCATGACTCAAACTAGCTAGTGAACCAAATTGAACCGAACTGGTCAAAAAGGACAAAAACCAAGAACATGAACCGACCCAAACAAAACTGTCTCCAACGTTACCACAAACAAACCAGTGAACTCGTCAACAAATCCCTTTCGTGAAGAAGTCGACGCACAGTACAAAGGCTCGAGCAAGGAATATTCCTTCAGCGAACACTAATGCAAATGCCGATTAAGTTGACTATGGGTTATGGTTGAAGACGAATACGAGACCTGACGCTGGGAATCTCCGGCGGAGAGAGAGGTTAACGGTGATGAACTCACCGGTAGTTGATGACACAACAGACCATCGACACAGATAGTGTGGGTTTGTGGGTTGTGGGTCGTGGTTGTGTTTACCAGGTGTTCGCATGATTCCTCTTCTCTTTGCATCGGGTTTTGTTTATCGACAAGGATCAGAGATGCGCCGGGAAGGGTTGAGTGGTCAACAACTAAGGTTATCGACGACAACAGAATGCACGTGGAAGAAGGGAACCCAGTGGCCTTTGATCCTATTTGTAGATGGTGCTGGGTAAGTTGTGCAATCGACAATGGTCTCCTTTGGATTACAGGGAGCGGATACTAGAAGAAAGGGGTAAAAAATACCGTTCTTCAAATTGCAATTTCACTCTTGCCACTGAAGCCAAAAGCAAAGAGCTTCCATGAAAACTGGTTTCAATTGATGATCCAACAAAACAACCGCTTAAAGGCGAGAAAAAACGATTAGATTCATGTCTATATTGGAGAAGCCTCGGTTGTTGTGATCGACCAGTGAAGAAAACACAATATCAGAAGAAAGAGGAGATAGTGCCTGCGTCGGAAGGCGGCGACGACGTTAATAAGGTTAGGGTTTTGAAAAATTAGAGTTGCTCTAATACCATCTTAGTCTTGAGATCATAAATCTATATTGCAATACAAATATGTGGAATATAGGTCCTCTTCTATATGAGAAAGACCTATTACAAATATGGAAATAAATAAAGACAAAATATTTTACACTTAATATTTATACACACACATTCCTAAAATAATAGAAATTCCAACACCCTTATTAGAAGCTTGATTTCACAATCTTAAAACTTTAAGAGTCTGTTTGGAGCACAAGTTGTAATAACCCGTGTTATTATAACCTGTGGAATACTCTGCACCCCAAACACATACTATTATAACCCCAGACTATACTACTCTGCATTTTAAATAATATTATATGATTCTACAAATTATAATAACCCACATACTATTATAACCCCCTGTTATTATAACCCACTCAACGCCCCAAATAACCCCTAAATTTCATTTATTTTGTTCTTGAGTTTATTTTTTGTATTTAATTTCTTTAGCAGTTCAAGATGTTAATGAAAAAAGGATGTGAAAATATTTAAAATGAAAAATTCATGTGGGTTATAAAATGACAAAGACAAATAGAAATACACTGGCCTAGTTTGGATTTGGGGTTTCTGGTTTTTCTATTGGAAGCTCGAACAAAATTCTAGGAACCCAACACTTGCTAGAACATGATTTCTGGGTGAAAGGCACGGTCTGTTGTGATTTTCTTTCTTCATCATCAGAACTTTCTGAAGGTAGATGTTGTAGATTGTTATATTAATTACGATGATAAGGAGATGGAGAAATTGACAAATATTTGTTTACTGGGGACCAAGTCAGTATTTCATACTGCAAAGTCTTCTCTTATAAAAAAAAGATGCTGCAAAGTTTTGAGTCTGGTTCCGTGGGATGCTTAAAGTAATTTTTTTTTGATAAAGCAACAAGAGAATTCATTGTTATAATGAAAAGAGTCTAACGCTCAAAGTACAAGCTCCATAAAGGATATAAGGAAAATAATGGAAAACCATATGCAAAAGCACACCAAATCAAACGATGTTTAACAAAGACACAAACATAAATTCCCCAAATAAACTGAAGCTCCCCCAAAACCTTCAAACTCAATGACTATCCACTATTGACAGTTCCACTGAAAGAGCCAAGGCTGCCACAGAAAACCAAGCACT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MAMAGLYRRILPSPPAVEFASSEGKQLFIEAVQRGTMEGFYRLVSYFQTQSEPAYCGLASLSMVLNALAIDPGRKWKGPWRWFDESMLDCCEPLEKVKARGISLGKLVCLANCAGAKVQAFRTNQSTIDDFRKYILRCSTSDDCHIISSYHRAAFKQTGTGHFSPIGGYHVGQDMALILDVARFKYPPHWVPVKLLWEAMEYLDEATGQQRGFMLISRLHREPGLLYTLSCKHEGWVNIAKYLIDDVPLLLKSEDLKDTQDVLTVIFASLPLNYSDFIKWIAEVRRTEESCQGLSPEEKARIALKEEVLNQVQETDLFKHVGEFLSLESACCKMLTPSHEDNLPEIAASVCCQGAEILNGNAGTSAGYCCRETCVRCFSANGDKPVTVVCGMVVNGNNEQEFDMLVPSSSQVRSGCCYSGTKNGIGIHPAANDVLTTLLLALPAETWVGIKEEKLLRELQKLVCTESLPTLLQEEVLHLRRQLHLLKKYQENKVDQDLSAPLS Homology
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TSC7 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1 OS=Lotus japonicus OX=34305 GN=PCS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 744.2 bits (1920), Expect = 9.7e-214 Identity = 357/503 (70.97%), Postives = 410/503 (81.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S7Z3 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 672.9 bits (1735), Expect = 2.7e-192 Identity = 321/501 (64.07%), Postives = 402/501 (80.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SWW5 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1 OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=PCS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 629.8 bits (1623), Expect = 2.7e-179 Identity = 304/501 (60.68%), Postives = 378/501 (75.45%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZWB7 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCS2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 5.0e-178 Identity = 307/501 (61.28%), Postives = 382/501 (76.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2QKL5 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 3 OS=Lotus japonicus OX=34305 GN=PCS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 586.6 bits (1511), Expect = 2.6e-166 Identity = 281/478 (58.79%), Postives = 360/478 (75.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. NCBI nr
Match: XP_022953841.1 (glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 962.6 bits (2487), Expect = 1.3e-276 Identity = 466/501 (93.01%), Postives = 484/501 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. NCBI nr
Match: XP_023548578.1 (glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 960.7 bits (2482), Expect = 5.0e-276 Identity = 464/501 (92.61%), Postives = 483/501 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. NCBI nr
Match: XP_022992018.1 (glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 6.6e-276 Identity = 464/501 (92.61%), Postives = 483/501 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. NCBI nr
Match: KAG6576091.1 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 959.1 bits (2478), Expect = 1.5e-275 Identity = 464/501 (92.61%), Postives = 483/501 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. NCBI nr
Match: XP_038874485.1 (glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase 1-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 947.2 bits (2447), Expect = 5.8e-272 Identity = 460/503 (91.45%), Postives = 479/503 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GP77 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456254 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 962.6 bits (2487), Expect = 6.4e-277 Identity = 466/501 (93.01%), Postives = 484/501 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JXW2 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488495 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 3.2e-276 Identity = 464/501 (92.61%), Postives = 483/501 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TDZ7 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold122G001580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 930.2 bits (2403), Expect = 3.5e-267 Identity = 446/500 (89.20%), Postives = 475/500 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBD2 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498912 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 929.1 bits (2400), Expect = 7.9e-267 Identity = 445/500 (89.00%), Postives = 475/500 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9D9 (Glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G088130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 923.7 bits (2386), Expect = 3.3e-265 Identity = 442/500 (88.40%), Postives = 473/500 (94.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. TAIR 10
Match: AT5G44070.1 (phytochelatin synthase 1 (PCS1) ) HSP 1 Score: 672.9 bits (1735), Expect = 2.0e-193 Identity = 321/501 (64.07%), Postives = 402/501 (80.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0021830 vs. TAIR 10
Match: AT1G03980.1 (phytochelatin synthase 2 ) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 3.6e-179 Identity = 307/501 (61.28%), Postives = 382/501 (76.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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