Tan0020838 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAGGAGGTAAGCTCCTAAATGCTCCACACCTGAGAAGAATGTACTGTTGTAGTGCTGCAGGGGTTGGTACCATCCTAGAGCCACTCTCTGCCGTTCCTTTAAACGATGAGTTGCAACAAGCAAAGGCATCAGTGGCAAAAGCTGAGAAAGATGTTCTCTTTATGCTAACTGAAAAAGTATGGGTGAGATGGTTCAAAAATAATAGGTGATCATAAATAATGTCAAAAGTTCATCAGAGTTAATTTTGTAAATGACGTGGTTTTTTATACACCATTATACTTCTGGTGATTTTAAAGTTTAAACTTTTCATTTTGAAGTCAAGATAAATTATAATATTTATATTTATGTTAAATCACACATGAACCCAAAGGCTTAAGCTAATGGGTTACGGTAAAATTTAATTATATCTAAACTTTAACAATCCCTCTCACTTGTAGGCTTGAAAATTTGTAGAAGGTCCAACAAGTAGAAATTAATATTAATGCAGAGGAAATGATATTATTAGGAGTTCAAACATAGGATTTCCTACACTAGTACCATGTTAAATCACTATTCAACTCAAAAACTTAAACTAATAGGTTATGGTAAATCAAATTATATCAAACTTCAATAATTTATATTTAAAGTATTTTGGTTGATGATATGATATCGTATATAATCCTAAAACTTTAAGCTTTTAGGTAAGAATTAATATAACGACCTTACTTGCCCAAGATCTATTCTATAGGTTGTGCATTTGTGTCCTTGAGATTTATTTAATATCAACTAATACTATCTTATTCATGTTTTGTGGCAGGTGAAAATGGATCTTGAAGACGTTAAAACGCTCATCGACTGTATAATTGAATTAGATGTGGTGAGTAATTATTGCTACACCCTCAGTCCCCCTCCTTCTCTCCCTAACTTAACTATTCTGGTGAATTATGTTTAATCCGCTTCCTTCCCCATCCGTTCTTTGGCCAATCTAGGATGTTCCCAATTTTATGTACTCTCCTATTTGTGGAAGACTATTATCAAAAACAAATATGGCCAGAAAGTTTTTGGATCCCCAATTCGCAGAAAAAGAAAAGAACTCAATGTGTTTGCTTTGTTTTCAGAATGAGGAGTCCTTGAAGAAAGATGAACGGGAAGAAACCCTCCCCCGTCTCTCCTCCTCCCCTTGCCTTGCCCCTAAGTGACGCCTCCGATACCCCTTCTCTTCCTCCGATTTTCTCCGGTGACCGGAATTCGTGGCGTCTCCGATACCTTTTCCCTTCCTTTGATCTTCTCCGATGATTGGATTATCGATCCTTCGTCGGTGACTGGTACTTTCGTCCTAAACCCCCGAATCGAAGCGTCTTCTCGATCTGATCCTAGACTCCTGAGTCGAATCGTCTCCTTGATTCGAAGAGGTCCCCTCTCAATTTAGATGGGTAACAACAGTCGATCATGCTTTTTTCAGTCTCGTTTCAGCCTCTAGTCTTTTCGAACCATCATTGGCGAACGGATTTGCCGCTTCCGAATCGTCACTCCTAGACGTCGTCCGTCTCTTCCGTAGCCGTCTGTATCAACTGTCGTCTGCTATAGTATCCCTTCGTTGTAGTCTGCCTCTGTGAGAAGTCCTCTTGACTTGACGATCGAACTTCCCCCTTGTTGGTTTATCTATTTCCTTATCTAGATAATTACCATTTATTGTATTATATTATTTTATATTGTATTATATTATTTTATTTGATTTGTTCCCTTATTTGTATATTCCATATATGTAAATGGGTATCTCTTTATAAGAACCCTAATTCTGATCCAATCAATAAGAAATATTAGATACACTATTTCTTCATGTATTGTAGAGTGCAACAGAAAATGATCTTGAAACTCAATTTCAGACTAAAATTAGCATTTCTGTTGCACTATGCTAATTTTAGTCTGCAATACCTTTCCTATGTCAAGAATGCTTTTCTCAATGGGGAACTTGAAGAAGAAGTATTTATGGATTTACCACCAGGTTTTGAGAAAAATCTTGGGGTTGACAAAGTATGCAAGCTAAAGAAAAAGCTTGCATAAGAACCCTAATTTCTATACGGCCTTAAAGTATGCAAGCTAAAGAAATCTCTATACGACCTTAAACAATATACTTCCTTTGATTAACAAGGATACCATCTTTTGACAAAGTATGCAAGCTTAAGGATCTCGGAGTCTTGAAATATTTCCTGGGAATGGAATTTGCTAGATCAAAAGATGGTATCCTTGTTAATCAAAGGAAGTATATTCTTGACTTACTTAAAGAGACAGGATTACTTGGTTGTAGAGCAACGCAGAAACTCCCATTGAACCAAATTTAAAATTGCAGTGCAAACAAAAAATGAAGTAAAAGACAAAGCAAGATATCAAAGACTTGTGGGAGATTGATCTACTTGTCTCACACACGCCCGGACATCTCCTTTGCGATCGGTATGGTAAGCCAATTTATGCACGCTCCAGACTAACTCATTTTGAAGCGATCTATAGAATTCTAAGGTACTTGAAAGGTACTCCGAGCAAAGGTGTATTGTTTAAAAGGTATGGTAACCTACAAAGTTGAAGTTTACACCGATGCCATCATTGGGCGAAGACGATAGATAGATAGACGATCCACCTCTGGTTCTTTGTTCCTTTGTTGGAGGAAATTTAGTTACATGGCGGAGTAAAAACAAAGTGTGGTGGCAAGAAGCGATCTGAGGAGTGAGTATAGGGCCCTAGCTCGGGGTATTTGTGAGGGTATATGGATAAAGAGACTATTGGAAGAGTTGAAATTTTGTCCGAACAACCCATACATATTTTTTGTGATAACAAGGCGCGATCTCAATTGCTCACAATCCGATTCTCCATGACAGACAAAGCATATTGAAATTGATAAACATTTTATAAAAGAAAAGATTGATGCAGTGTTATATGCATTCCATATCCACCAACAGACAGAGCAAATTGCGGATGTATTAACGAAAGGGCTTCCAAAGACACGGTTGACAAGATGATCGAAGTGGCAATAGAAGACATCTTCACACCAAATTGAGGGGAGTGTTGGTTTATCTATTTCCTTATCTAGATAATTACCATTTATTGTATTATATTATTTTATATTGTATTATATTATTTTATTTGATTTGTTCCCTTATTTGTATATTCCATATATGTAAATGGGTATCTCTTTATAAGAACCCTAATTCTGATCCAATCAATAAGAAATATTAGATACATTATTTCTTCACCCCTGAATTGAGTTGTCTGTCTATTTCGGGACACTGAGTTATGCGAATGGAGAAGTTTAGTTGCAGTGTCGACTCTCGGAATTATCAGATTTGGCAAGATGAGGCAAAAATTCTCCTATGGGATGGATCAGTACATGGCTCGATTCGACTTTCCCTTGGTCAAGTGGTATGGTTTCGTGATTCTTTTGCTGATATGACGATGAAGGTAACTTCCTATTTCAGGCATAGGAAATTTAGAGATTTGGAATCTACATTAGGGATCTTTAAGACTAAAAAGGAAGAAGGTTGGTTTGTGGAAGGAATGATATGGCCTTCTTCGGGAGGTAGAAAACTGTTTACAGTTCCCTTGGGGAGATATGAGATTGGATGAGCTGTGTTTAGAGATCTCTTAAGTGATTTCATCAATTCTGTGAACCCTCCTCGAAGAATTTTGGAATCGGAGGTGTCTTCAGATGTTCTGGTTCCATTTGAAGGTAATAATGAGCGACCTTTGGAAACACCAAAGACAGTGGCAGTGGACTTCTCAAAGGTTTGGGTGGTCACTCGGTTATTTGCACATGTTCAATGGTTTTCCATTTTGAGCGTATTGGAATCCTATTTTGAATGCAAGGTGCAGATCAATCCGTTTATGAGTGATAAAGCCTTGTTTCTTTTTGACAATGAATTGAATCAGTGCCCTAAGGAAGATGTAGATTTCAGTAGCCGGAAATGGAAAGTCATTGGAAATCTTCATCTTAAAGTCGAAAGATGGGAGGATAAACTACATGGACGACCGACGGTAATGGAAGGATATGGGGGATGGATAGCGGTTAAAAATCTACCTCTTAGGTTATGGAAGAAAGAGGTATTTGAGACCATTGGATTGTATTTTGGGGGGGCTGTTGGAGATTGCTTCAGATACACTAAACCTCATTGACTTATCAATGGCCAAAATCAAAGTTGCACCTAATCTTTGCGGATTCTGCCTAGCTTTTATACCAGTTTAAGATCCAATATCAGGGAGTTTTTGGATCAATTTTGAGAATATGGAGGAGATTAAGGTGCCTACCGAACTCAATGATCCTTTGACTTTGAAAGACGTCAAGAACTTGGTTGACCTGGAACGAATTAAACAAGTGTTGATGGATGAAATTGGGGGTGAAGAGCAACAAGGATCACTGATTGAAGCAGATGAGGTCGATGTGCAAAATAGAAGACCAGTGACAGAGAATTTTGCCCTTAGTAGCAATGATTTAGAAGGATTGGTGGTTGAGGTGCAACAAGGAAGACCCGTGACTGTGAATATTGCTCCTAGTAATGGTTATTTACAAGGAATGACACCTGTAACGATTGATAATCAGCAAGTAATGGATGATCCTAACATTTTTGCATTAATGAAGCAGAGAGAAGATTTAGTTGAAATAACTGCTGTCCCTCTGAATTCCAAAATAGATTTAATTGATTCTTTGATTGCAGATGAATTAAACACTCTGAACGGTCATGTGAAGAAGAAATCGAAAAGGCAAGGTAATCAAGAGGCATCATTTGCTGTGGGAACTCTTAATGAGCAACCGATTGAAGGGGAGCAATTAATAGTGAAGCCCATTTAGCCAAGGAAGCCGAGACTGACTTCGACATTTTTTCAATTTTAGAGCCTGAAAGTGTAAAGGTTGTGAAAGACACTTTTTGTGAGAAGTATTATGTCAGAAGAGGTGGAAAGATGCAAGTATAGAGGCTAGAAACCAAGAGTCAAACGCTTTCCCTGATTTCTTGGAGCGATCCGA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ATGAAAGGAGGGGTTGGTACCATCCTAGAGCCACTCTCTGCCGTTCCTTTAAACGATGAGTTGCAACAAGCAAAGGCATCAGTGGCAAAAGCTGAGAAAGATGTTCTCTTTATGCTAACTGAAAAAGTCAATGCTCGAGCATCTTATAGTCTTTCATTTGGAGGGACATGTCCCAATTTAGTTCTACCAGAAGGGCGCAACTCTTCTATTGCTAATGTCTGCTCATCAGGAGACCAAACATCTGAGGCATCGCACCCAAATAAGAATGAACGGGTTCTCTATTTACCAAATGCCCATCACCCTTTACTACTTCAGCAATACAGAGAAAATTTGGAGAATGCCAAGCGAGATGTCAGAAATGCTTTTACTGAGATAGGGAGAAAACTTCCTGGGGGGACTATGCCATGGAAAGAAAAAAATGTTGTTGATATTTCATTCTTAAGAATGAAGGTTGAAGAATTGGAGAAAGCTTGTCCGATTTCGGTTGATTTTTCAATATCTCAAAGAGTTCGAGTTTTAGTTATAACTGGCCCTAATACTGGGGGTAAGACAGTTTGTTTGAAGACCATTGGATTGGCAGCCATGATGGCGAAATCAGGTCTTCATGTTTTAGCTTCAGAGTCTGTACAAATCCCTTGGTTTGATTCTGTTTTTGCTGATATCGGTGATGAACAGTCCCTAACCCAATCTTTGTCTACTTTTTCTGGACATTTGAGAAAAATAAGCTTCTTAGCTACTCATGTCATGTGGGGGTTAGTACCTTTTTGTGAGTTGATAAGGGGCTTTGGAAGTAATTCTATTTTTGTAATTATCTATTTTACTTGGAGCCTCTTTGTCTTTCCATCTAGCTGCCTCGATCTGATTACTGATTTTCCTTGTTCTCTAAAACTCTTTGATTGCAGTATAGTAGAGAAGGCCCAAAAAGTAGATGATGTTACGGTGAAACAAGATATGAGAATTCTTATTCCATTCTATACAATAGAGTCGAATATATATAGGCATACATGGAAGCTCTAA MKGGVGTILEPLSAVPLNDELQQAKASVAKAEKDVLFMLTEKVNARASYSLSFGGTCPNLVLPEGRNSSIANVCSSGDQTSEASHPNKNERVLYLPNAHHPLLLQQYRENLENAKRDVRNAFTEIGRKLPGGTMPWKEKNVVDISFLRMKVEELEKACPISVDFSISQRVRVLVITGPNTGGKTVCLKTIGLAAMMAKSGLHVLASESVQIPWFDSVFADIGDEQSLTQSLSTFSGHLRKISFLATHVMWGLVPFCELIRGFGSNSIFVIIYFTWSLFVFPSSCLDLITDFPCSLKLFDCSIVEKAQKVDDVTVKQDMRILIPFYTIESNIYRHTWKL Homology
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P73625 (Endonuclease MutS2 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 4.8e-23 Identity = 61/135 (45.19%), Postives = 85/135 (62.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5WEK0 (Endonuclease MutS2 OS=Bacillus clausii (strain KSM-K16) OX=66692 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 1.0e-20 Identity = 54/104 (51.92%), Postives = 72/104 (69.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0Z9F1 (Endonuclease MutS2 OS=Brevibacillus brevis (strain 47 / JCM 6285 / NBRC 100599) OX=358681 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 1.3e-20 Identity = 67/180 (37.22%), Postives = 93/180 (51.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8D298 (Endonuclease MutS2 OS=Halothermothrix orenii (strain H 168 / OCM 544 / DSM 9562) OX=373903 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.7e-20 Identity = 50/106 (47.17%), Postives = 70/106 (66.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9KYW4 (Endonuclease MutS2 OS=Thermomicrobium roseum (strain ATCC 27502 / DSM 5159 / P-2) OX=309801 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 2.2e-20 Identity = 49/101 (48.51%), Postives = 72/101 (71.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. NCBI nr
Match: XP_038894074.1 (endonuclease MutS2 isoform X11 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 420.2 bits (1079), Expect = 1.6e-113 Identity = 212/239 (88.70%), Postives = 224/239 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. NCBI nr
Match: XP_038894019.1 (endonuclease MutS2 isoform X8 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 408.3 bits (1048), Expect = 6.5e-110 Identity = 212/259 (81.85%), Postives = 224/259 (86.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. NCBI nr
Match: XP_022985054.1 (uncharacterized protein LOC111483140 isoform X5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 407.5 bits (1046), Expect = 1.1e-109 Identity = 206/239 (86.19%), Postives = 220/239 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. NCBI nr
Match: XP_038894013.1 (endonuclease MutS2 isoform X7 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 407.5 bits (1046), Expect = 1.1e-109 Identity = 212/261 (81.23%), Postives = 224/261 (85.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. NCBI nr
Match: XP_022922845.1 (uncharacterized protein LOC111430703 isoform X5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 3.2e-109 Identity = 204/239 (85.36%), Postives = 220/239 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JC76 (uncharacterized protein LOC111483140 isoform X5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 407.5 bits (1046), Expect = 5.3e-110 Identity = 206/239 (86.19%), Postives = 220/239 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E9Z0 (uncharacterized protein LOC111430703 isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430703 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 1.6e-109 Identity = 204/239 (85.36%), Postives = 220/239 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JCF6 (uncharacterized protein LOC111483140 isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 2.1e-106 Identity = 206/259 (79.54%), Postives = 220/259 (84.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J709 (uncharacterized protein LOC111483140 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 2.1e-106 Identity = 206/259 (79.54%), Postives = 220/259 (84.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J3U0 (uncharacterized protein LOC111483140 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 3.6e-106 Identity = 206/261 (78.93%), Postives = 220/261 (84.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. TAIR 10
Match: AT5G54090.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 209.5 bits (532), Expect = 4.1e-54 Identity = 123/266 (46.24%), Postives = 164/266 (61.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.2e-22 Identity = 46/83 (55.42%), Postives = 63/83 (75.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.2 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.2e-22 Identity = 46/83 (55.42%), Postives = 63/83 (75.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. TAIR 10
Match: AT4G25540.1 (homolog of DNA mismatch repair protein MSH3 ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 1.2e-05 Identity = 40/121 (33.06%), Postives = 59/121 (48.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020838 vs. TAIR 10
Match: AT3G24320.1 (MUTL protein homolog 1 ) HSP 1 Score: 46.6 bits (109), Expect = 4.6e-05 Identity = 33/91 (36.26%), Postives = 49/91 (53.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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