
Tan0019185 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGCAGTTCGAGAGAGCAATCTCCAGATTGGATGCGATCTTTCCAAGTAATTTTGTCTACTTGATAGTTTTGTTTCACTGTTATAAAACACTCTCTTCACGTGGATTTGAGTTTAGGCCGATTTGATTTTTTTTTTGATAGGAAACAAAAACATTTCATTGATGATATGAAATTGATACAAAAAATCCTATCAGAGAGAGCTACAAAAAGGAGGTCCAGTGAGCTATAAGAATAGTTAGTCCATAATTACAAAAGGGAGGTGACAAAATACTCCATCACAAAGCAAGAAAGGATGTAGATTTGATAAACAATTGGAAATTCTGCGTATTTTCTTTGAAAATCCGTGCATTTCGCTCAAGCCATAGGTTCCATATGAAGGCATAGATGAAATTAAGCCAAAGTGTTTTCTTCTCATCCTTAAAAAGGTGTCCCATTAGGCTGATTTGATTTTGTCTACTTGATCTTTCCAACTCCACGTTCTTGCTTTTCAAAAGGCCGATTTGCTGTTGTGAGAGCCATCATACTCATTCTTCCCAAAAGTGATCGAAACAGTTGTCTTAAAGAAGAGAAAGGAAAATTCATGTATTATATAACAATCTAAAAGAAAACTGCATTTGGATCATCCCTCAAACTCGGAATCTTCAATATTACTCATTAATTTCTAGTTACGTTATACAGTCTCTCTCGTCTAGTACTTCCTTTGTTTCATCCCTGCCTTCTCCCAATAATTTCTTTTATATTTATTTTGATTTAAGTCCTTATTGCTTAAAAAAAAAGTATTCTTTCATAAATGATTCTATTTATTGGTCTCAGATTTCATTGACATAAACTGAAACTCTACCGTATAGGTTTTCTCTTTGTACAAAAACAATAAAATATAAATACAACTTAAATTATTAAGCTAAGAAATTGCCCTCCTGGATAAATAAGATTAAGATGCTAGGTTTCAGTCATGATTTCTATAGTTTTTTTATGTTTAAATTGTCTTTAAAGGTTTGAGATAGTGAATGAGCGATTGCTGAGTTATTTAGTTGTGTATGTCTTCATCTGCAATATCAATCCTGCACTGTGAGATATCACTTCTAAAGTTTTGTTTTTTTTTTTATAAAAGATATCACTTTCAAAGTTCATAACCTTTTCATGATAATTGATGCCAACAAGAACAATTTACTTTGTTGAATAGGCACCAACTGGTGTTGCCCTATCCTCTAATTCTGAATCTTCAAAGAATGGTAGCTCATCAATGGACAATGCAATTGATCAAAAGGATCCATCTTCACATAAAACCACACAAGTTTTAGATGGAGATCAGGTTCAAGGTATATTAAAGTTAAACTTAAAAGTTTCAGTTCTCATCTTGTAGGAACATTGTCTGGCACACAAGAGGAAATGGGATTAAAGGCAAGAGAGAAATCATATTTAAAGAAGGCTCTGGGTTCTATTTTTGTGTTACTCTAATTATTCTAAGCTGGAAACTTTAATTACTTTATGCGGATTCATAACTTCTAGGACTTGGATCATCATCCTTTAGGAGTTGTTTGGTGCAAGGAGTAGGAGTTAGAATGTATGGAGTTATTTTATATTGGGAGTTGGAGAAGGAGTTAATAAGTTTGTGGGGCCCACAAGATGGAGTTGAATTAAGAGTAAATATGTTTGTGGAGCCCACAATAGGAGTTAAAAATGCTTGGGCCAAACAAGGAGTTGGAGGAGTTTTTAACTCCCTCCCTACTTTATCCCCAATCCAAACACCCCCTGATGATCTATATACTTTCTGGATCAATAACTCTTTTTATCTGATTGTTATAAAGCAGGGGATAGTGGCAACCCTAATCTGGCAAAGGAAGTGAAACTTGAGGAACATACAGGCCATGAAGTGAGAGACTTTACCTCTGGATTTTTACTTGTGCGTGCGTGTGTATTATTAAGGATATTAGTGATCTTCATCTAATTTATTTCAAGAGTTCAACATACATATGAGATGGTTGGGATACCTTTTTTTAATATTCTAGTCTAAATTATTGTAGTAAAATCTAGTTTGCTGATGGGAGAATCTTATTTTTCATTTGTCAGAATTCAAGGCACTCAGTTTGGATGTTATCATCGGATTCAGAGTCATGTCCTGATAAGAGTTTTATAAAGGAGGATTATAGTCATCATGAAGAATTATCTGAACTTACGACATCTCAATTCCAAGGTAGAGGGAAGGATGAAAATGCAGGTCGCAAATTCATCGATGGAAAATCTAAATCAAGGAAAGTATCAAATAAAAAGTCTCCAAAAAAACAAGTGAAATCATGCACTTCGACCAAAGAGAAGATGGTCAATTCAGATACAAATAAAGGCCTTATTTTGGAAGGTAAGAGAGTAGTACAATAATAATACATAACATTAAAAGGTAGAAGCTCTAGTGATTCATGAAGAAAACACTAAATTACCTGACTACCTGAGCATTGATCTTGCATGCTGCATCATGAATGAAAGCTACTGCCTGCTATGTATGATTTTATAATGGAATATTTTCTGAAAAGCTTTCGTCCATTCAGGTTCTGAATGCTGCGTAAAAAATGGTGGCGATGTGGAGATTATAGAAAAAGATGCATTGGATGACTGCAATGGGCCTCCTGTAAGATTTAAGCTCAAACTAAAAAGAATAGACCTATATAGTTCATTATACTCTGACCACTCATTTGCTTTAACAATTCAATTTACAGGTTTCCTCCTCAAGGTTGCCATTGGTGCTGTCTGACAAAGTTCATAGATTGAAGGTAGTGTTGCAACATAGATTACGATAAATGAGTTCTTTTGGCAGCCTCCTCTTGTCTTGATTTAGGTTTTAAAGCTTTCTGCTTCATTATATATATATATTCTGTTTATAATGAGCCAATTCCCAAGCACTCCCTGTTCTTCTTTCTTCTAAATTCCACACCCGCTCAAGAGTTGAGGATTGTAGGTTTGGAAACAGGAGATGTCCTCCCAGCTAAATCAAGAGGCATCGTTGAAGTCAGGGGACCTCAAGTGATGAAAGGTTACTACAAGTGGTGCAGCTTGATATTCAATGTTTTGGAAACATGGAGGCGAAAAGTTGGAAAATTTTGAATGCTTATTATTGTTTTTGGCGTGATAACAAGGGATTTTGGTTTAAAGATGTGATGGCACGTTTTTCAATCTTTCTTTCTCTTTCTCATTTGCAATGGCTTGAGCAAGCGCTTGTTGAGATTCTCCATTAGTCGATTATGAGTTTTTTCTGCAAACAAATCAAGGATAAATCAGGTTCAATCCATCTTGGAAAACTTTGAGGGCCCTCAGGTTGGTTTCTTAGGTGTGTGGTTTGGCCAAGGAGTGGTGGGAGAAACGTCATTCATGTGCCGATTGGAGATTACAAGGAAGGTTGTTTGCACTTTGGGAGCATATCTCTCCGTCTTTCAAGTCTATTGAAGCAAGAGATAGTGAAGAAGGTGCCACCAATTAGAGCTTCAAGGGCGATTTCTTTAAAAAAAAAGCTATATAGAGGCTTTATCTTATGTTCTAAAAGTGCTGGGTTCAAGGGGTACTGATGAATTGGTCAAGTTCCCCATTTTGAAAACATCAAAGGGGCTGAATCTGGGCAATCAACAAAACATTTTAGGGAGAAACTTTAATTCTAATAGCTTTTGGGTTAGAAAGAATACTGAAGTTCTAAAGTTGAATTTTGAGGAGACTTGGGTAGTTACACGTCTTTTTGCTCATAATTAGTGGAAAGAGATTGCACTAGTTTTGGAATTTATTTCAATTCCAAAATTATGATTAGCCCTTTGTTTGATGATAAGGCTTTGATTAAGTTTTCAGAGGACTTTGATTTTTTGTTTTTTGTAACACAGTATTGAGAGAAAATGTTCATTGTATTCATCACATTAGAGTCACTAACACATATATATAGGTATACAAGAAAACCATATTACTAAAAGATGTACAATTACTATAAAGGACAAATATACACAATAATATACATTATAATACTCCCCCTCAAGTTGGAGCAAGTATGTCAAACATGCTCAGCTTGTTGCAGAGAAAATTTATTCTTGCTCCATTTAAGGCTTTGGTAAGGATATCTCCCAATTGTTCTCCAATCTTTACATATCTTGTGGACACCAACCCTCGTTGCATTTTCTCGTGAATGAAATGACAATCCACTTTAATATGTTTAGTCCTCTCATGAAACCTGGATTAGATGCAATGTGAAGTAATCTTATGCAAGGCGAGTGGGCTGCAGTTTAAAGAAGTTGTTGTGGGTGGTAGGGCGTCTTCTTTATGTTGAAGATTTTTCTTGAATTTTGAGAGGAAACAAACTGACGGTTTGGTTGATGAGGTAATCTTATCCTTATGGAGTTTGAGAGTAGTTGGGTGGGGGCTTGTGATAACCCTTGGCAGAGCAGTAGGCATGCTAGTTTTGTGAGTTGATTTATAGTTTTCAGCCTCTGTTGGGTTCGCAGCGGTCTCCTTAAGCTCGCTTGCTGTGGAGATTTGCTTGGCAAAACCTTGTTTTTAGATCTCTGGGTTATGTGATACCAAACACTGTTTTGAGGAAAAGGCAGGGTTTTGGGTTAGGTGTCTTCACTCAATTCGCTTGAAAGCTTTTACCTGGTGTGGTCTCTCCAAGGATTAGCTTGTTGTTCTGTTTCTGATCTATCTTTCTTGTTGCATGTTCTCTTCTTGTGTTTGTTGGGTTGAAGATGCTTTGTTTTCAAGGGGTGGGTGTTTGGTTTTGATTCTCTTTTGGCCTGGGGCTTCTTTCAGCTTTTTCTCTGGTTGTATTGGCTTTTCTATTTTTCTCTTTCTCTTTGTATTTTGAACGTTAATCTCATTTCATTTTATCAATGAAGTCTCTTTTGTTGCCTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGATAATGTGAAGTGCAACTTGATTATCACACCACAATTTAGCTGGCATAGTCATATTAAATTCAATCTCAGTCAAAAATTGATGTATCCATACTATT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Match: Q9FLU1 (DNA-binding protein BIN4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BIN4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 7.4e-30 Identity = 151/459 (32.90%), Postives = 223/459 (48.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. NCBI nr
Match: XP_038894663.1 (DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 543.9 bits (1400), Expect = 1.1e-150 Identity = 310/393 (78.88%), Postives = 331/393 (84.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. NCBI nr
Match: XP_038894608.1 (DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894616.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894623.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894633.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894639.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894649.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894657.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 537.7 bits (1384), Expect = 7.6e-149 Identity = 310/409 (75.79%), Postives = 331/409 (80.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. NCBI nr
Match: XP_008460815.1 (PREDICTED: DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 531.9 bits (1369), Expect = 4.2e-147 Identity = 305/393 (77.61%), Postives = 328/393 (83.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. NCBI nr
Match: XP_004147326.1 (DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011649447.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN62298.2 hypothetical protein Csa_016942 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 531.2 bits (1367), Expect = 7.1e-147 Identity = 305/393 (77.61%), Postives = 330/393 (83.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. NCBI nr
Match: XP_022140827.1 (DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 1.3e-145 Identity = 301/393 (76.59%), Postives = 323/393 (82.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDA8 (DNA-binding protein BIN4 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 531.9 bits (1369), Expect = 2.0e-147 Identity = 305/393 (77.61%), Postives = 328/393 (83.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CI66 (DNA-binding protein BIN4 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011402 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 6.5e-146 Identity = 301/393 (76.59%), Postives = 323/393 (82.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDB0 (DNA-binding protein BIN4 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.9 bits (1343), Expect = 2.1e-144 Identity = 305/408 (74.75%), Postives = 328/408 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BS94 (DNA-binding protein BIN4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold680G00060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 500.4 bits (1287), Expect = 6.5e-138 Identity = 289/377 (76.66%), Postives = 312/377 (82.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LJZ5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G338790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 497.3 bits (1279), Expect = 5.5e-137 Identity = 285/372 (76.61%), Postives = 310/372 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. TAIR 10
Match: AT5G24630.3 (double-stranded DNA binding ) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-31 Identity = 146/454 (32.16%), Postives = 219/454 (48.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. TAIR 10
Match: AT5G24630.4 (double-stranded DNA binding ) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-31 Identity = 146/454 (32.16%), Postives = 219/454 (48.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. TAIR 10
Match: AT5G24630.5 (double-stranded DNA binding ) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-31 Identity = 146/450 (32.44%), Postives = 219/450 (48.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. TAIR 10
Match: AT5G24630.1 (double-stranded DNA binding ) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 3.1e-31 Identity = 151/456 (33.11%), Postives = 223/456 (48.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019185 vs. TAIR 10
Match: AT5G24630.6 (double-stranded DNA binding ) HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 5.2e-31 Identity = 151/459 (32.90%), Postives = 223/459 (48.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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