
Tan0018892 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATAGGTATGCATCAAAAGAAAATGATACTTGGATTCGTGCCCTTGTGAAGGATTTCACCATTGAGGCTGGTTCTGGTCTAGTTATTCTTGACCCAGTTGACGTTTCTGGGGGATATACATCTGTCAAGGACAAAACTAATATGTCTCTTGTAACAACCGATATCTGCATCCATCTCTCATTAAGTGCCATTTCTCTCATACTTAATCTGCAATGTCAAGCTGTTGAAGCAATGATGTTTGGAAATGCAGTACCTCTTGTTGCCTGTACCAATTTTGATAAGCTTTGGGTGTCCCCAAGAGGTTCTTATTTAACTGGAATAATTAGATTTTTGCTCCCAATATAATTTGTTTTGAAGTTAACTTTACTAACTAGTAACCATTTAGTTAACCAAAAGTTGTTGGTTAACTGGTTCTTTGAACCATAATGAATTCGTTACTCCTCTCATTCTTACAATGGTTGGGATATCTATGCAGAAAATGGGTCCTCTTATAACCTTACCTTCTGGCGTCCTCGAGCTCCATCAAATTATGTTATTGTAGGAGACTGTGTGACTTCACGGTAGGTTTTCTAACCTTCGTATGAGATTTCTTTTTAATAAGTATTTGCCCAGGTTTGCTATCCATTTATACGTGTATATTTTCATTCTGATTATCTCTGTTACATCCTGTTCATAATGTCGTTACTTCACTTGGTAGCCCATTATCTGGTAATTAGGGGAATGGTTAAAGTGCCTCAAGAGTTTTGAAATTTGTTTTGGTTGCAAGTTGTAATAGTTACTTGGTTGGTGTCGATGCCAGTTTTATTTATGTTTAGCAGTAATCTAGGCAATCAAACCAAAAGCTTAATTATGGTAAATTTAATTATATGAATACTCTTACACTCCCGCTCACGTGTGGGCTTGGAAATTTGTAGAAAGACCCAACAAGTGATGATCAATATTAATTGGAGAGAAAACGACTTCATAGGGGTTTGAACACAGGACCTTCTAATACCATGTTAAATTACCAATCAATCCAAAAGTTTAAGCGGACAGGTTGTGGTAAATTTTACACAAACACTCGGCACTCCAACATGCATCAAAATCCCAGAGAACTTTTGACCTTCTTCCTGCCATGTATTAGTAATAGTGGAAGTAGATGGATCTGTTCAAAGGGTTAACTGGCAATATTGTATATACCTACTTTTACAATGGCAGCACGATGCATGTAGCAATATCAAACATCTAATTGCAGTACTAATACTTGTCTGAAGTCATCAAGGTTGAAAATCAACTCCATGGTCGTCCATGGCCATGATTACCTATTTGTGCAAAGGAAACACTAGGATTACCCAAGATGAATTAGTCTTTTTCAACTTCAAGTGTTAATCATCTTGCTCTTTATTGGCTGGAAAGCTAGCCAACTCTTTACTGCCTTCTGTCGGATTTTTCACTTCTACTTCCAGCTCTCCCTCTTCACTTGCCATAATGCCACCTCTTCCTGTTCAACCGAACTGTTCTTCTTCTTTTCTTTAATACCCCATCCATTTTGTTTTCCTACAACTTGTTTTCTTCAAAATCCAACCTTCCAGCTGTGTAATGAGTGCCTCTTTTTTGGAGGAAACCACACTTAGCCGCCGATTAATATTCCTTCCCATACTTTTTTATGAGTTCATACTTCCAACAACTTAGACATAACCCTCCAACACTCTTTCTTTAATTTTAATCTGATCGTTCAGAAAGTTCCATCCAAATAGAGAGCATCCAAGGTGTAAGAATTTTCATGGAAAGCCGAGGCTGCTTTGTCAGAAAAGATTCCATGAACATAACATTTTCTTCCAGCCAACAATCTTAAATTCAGTTGGTAGAAAACTACAAAAATTACCTTTAATTTAATTTCTTCACTTCTTCTTAAATTTCCTTCCATCCAACATTCTTAATTACAATTTGAACTGCAGAAGTCCTTTCCTTTGGATGGTCAATGATAACTTCAGTTGGTATAAAACCACAAAAACGACCTTTATTCTCTATGCATGCTTACAAACATCAAATTTTTTTTTTTTTTTGACAAGGCAACAAAAGAGATTTCATTGATAAAATGAAATGAGGCTAATGCTCAAAATACAAAGAGAATTTGAAAATCAGAAAAAAAAATCAGCATAACCAGAGAAAAAGCTCCATATCCAAACCATATACAAAAGAAAACCAAAACCAGACGCCCACCCCCTTGTAACCAAAACAAAAAACCAGAAGACACCCTACAACCCAACAAAACATCTATCCCAATCCAATGCATATCCTCAAACAGCCTATGGTTTCGCACAAACCAGAGATCAGATAACAAAACTTTGATATCATTTTCCATAATATCAATGGTAAATTGCTCAGCTTAATCCATCCCTTGCAGCTAAAAGTAACCTCTGCTTTACTGAATTTTTTAACGTTATTTCTCTAATCTTAGCTTATTTCTTTTGATGTCATTGCTAGAAAGCATTGGTTTTAATTATTATTTCAGTTAAATATTTCCCAAAAATGGTTGCTCAATGTAATAAATCACCAATTAACCCAAAAACTTAAGCTTATAGGTTATGATAAATTTAATTATATCAACACTAACACTACCCCTCACTTGTGGGCTTGGAAATTTGAACAAAGGCCCAACAAGTGGAAATCAAACATTCCTCCACACTTGTGGGCTTAGAAATTTGAACAAAAGCCCAACATGTGCAAATCAATAATTGGGAAAAACGACTTCACCAGGGTTCGAACACAAGACCTCCTGCTCCAATACAATGTAAATCACCAATTAACCCAAAAGCTTAAGCTCATACGTTATGGTAAATTTAACTATATCAACACTAACACTCAACTATTGATAGAGTTAACTTAGGTGGAATGGCATCTAAACCGAGGAAAATTCCAAATTTTACCGTTGAATCATTTAGCTTGAAAGAAATAAAGGATATTTGAGAACAATGTTGAAGATGTGGATTCTATTGACCTGAAATTAAATATTCTAATTATTTTTGGTCGAAGAATGTTTGATCTTCAAAATTTGGCATCATGTTTGCATACATGTTCTTTTTGATACAGTTCCTTTTAATATTTTACTAAATTTTTGTTTAATCTTCGGAAAAAGGATGCTTTATCCTCATGTTGCCTTTTAATATTCTACTAGATTTTTGTTTCCTGTTACATATTGATGGAAACATCATTATTGATCGTAGGTGTTTTATAAAAGCTTTTATAACTTTTTTTCTTCATTGTGGTTTTCATATGTATCAGGCCAGTTCCTCCCTCACAGGCAGTAATGGCTGTTAGTAATACATATGGACGTGTGCGGAAACCTCTTGGTTTCCATCTCATAGGTGTATTCTCAAGGATTCAAGGATTTGAATCTGATGAGAAATCTGATATTGATTGTTCCATTTGGATGCCTATCCCACCTCATGGATACACAGCAGTGGGTTGTGTTGCACATGTTGGAAATCAGCCACCACCAACCTATGTTGTTTATTGCATACGCTCTGACCTCGTTTCCTCAACAACTTATTCAGAGTGTTTGCTTAATTCTCCGTCAAATTCCTGGTATGCATCTGGGTTTAGTATCTGGCGTATGGACAATGTTATTGGATCATTTATTGGCCATGCTTCAACTAGTTGCCCAGAGATAGACAATGCTTGTGATTTGAACTATCTTCTTAAGTGGAATTCAAATTCTGATTACACTTCCTCTAAAGAAGCTTCTTCTAATTCTACATCTGGTCATGTTACTTCAAGTCATCGTTCAAGCACCCCGAGTGCAACTTCCTCAGGTTGGGACATTTTAAGATCTATTTCAAAAGCAAATAATTGTTACCTGTCAACTCCCAACTTTGAGAGAATATGGTGGGACAAGGGTAGTGAAGCCCGCTGTCCAGTTTCAATATGGAGACCTATGGCACGCCCTGGTTATGCTATATTAGGAGACTTCATAACTGAAGGGTTAGACCTCTTCGTAAATAAATTATTTGTTTTTAGTTCACATTAATGCCCTTTTTTGAATATTTCTCTTGTTTCATAGTCATTACACATTTTTATGAGCTTTTGTAAACCTTCGTTATCAACTCATCCTTTCAGCTTAGAACCACCAGCTCTAGGGTTAATGTTCAAAGCTGACAATGCTGAAATTTCGGCAAAACCTCTCCAGTTCACTAAAGTGGCTCACATATTTGGGAAAGGATTTGATGAAGCTTTCTTCTGGTACCCCATTGCTCCTCCTGGTTATGCTTCCTTGGGATGTGTTGTTTCAAGAACAGATGAAGCTCCTCGTCTTGATTCTATTTGCTGTCCAAGGATGGATCTTGTCAGCCAGGCCAATATTTTTGAGATGCCCATTTCAAGATCTTCAAGTTCAAGGGGATCGCAGTGCTGGAGCATTTGGAAAGTTGCAAATCAGGTGGATATAGTACTCTGATCTAGGGTTCTCATACCAAACTGGTGGTTTCATATTTTGTGGAGGTTGAAAATAATAGGCTTATGAATTTAATTCCTAAACTTTTGGTGGTTTCATATATCTAAATTTTGCTCATGTTTTCAAAATTCTGTTTTCAGATTTCCTATCAAATAGGCCCTTAAGAGCCTATAGATATTTGTTAAAGTTTAAAGACCTATTAGATACAAAATCAAAAGTTCAGAGACGTATTAGACACCTTTTAAAGTTCAGAGACCAAATAGACACAAACCTAAAACTTTAGGACTAAACTTTTTATTTAACCCAAATAATATTAGTAATAAATAGCAACTTATAATTGTTCCCCTAAACTAGAAGGGTACTTTCATTGTGTGTTTTTGTAGGCATGCACCTTCCTTGCACGTGCTGATCACAAAATACCATCTAGCCGGTTGGCATACACTATAGGTGACGCTGCTAAACCGAAGACTCATGAAAATGTAACTGCTGAGATGAAGATTCGGTTTTTCTCTCTGACTGTTCTTGACAGCTTACATGGAATGGTATTATTCTCCTTAAA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MNRYASKENDTWIRALVKDFTIEAGSGLVILDPVDVSGGYTSVKDKTNMSLVTTDICIHLSLSAISLILNLQCQAVEAMMFGNAVPLVACTNFDKLWVSPRENGSSYNLTFWRPRAPSNYVIVGDCVTSRPVPPSQAVMAVSNTYGRVRKPLGFHLIGVFSRIQGFESDEKSDIDCSIWMPIPPHGYTAVGCVAHVGNQPPPTYVVYCIRSDLVSSTTYSECLLNSPSNSWYASGFSIWRMDNVIGSFIGHASTSCPEIDNACDLNYLLKWNSNSDYTSSKEASSNSTSGHVTSSHRSSTPSATSSGWDILRSISKANNCYLSTPNFERIWWDKGSEARCPVSIWRPMARPGYAILGDFITEGLEPPALGLMFKADNAEISAKPLQFTKVAHIFGKGFDEAFFWYPIAPPGYASLGCVVSRTDEAPRLDSICCPRMDLVSQANIFEMPISRSSSSRGSQCWSIWKVANQACTFLARADHKIPSSRLAYTIGDAAKPKTHENVTAEMKIRFFSLTVLDSLHGMMKPLFDTTVTNIKLATHGSLEAMNAVLISSIAASTFNPQLEAWEPLIEPFDGIFKFETYDTNVDQPPKLGKTIRIAATSIFNINVSASNLETFTGGTLSWRRQLELEEREAVDYLRHGKDATFSALDEDDLQTAVVENKLGCEIYLKRCEQNLDIVDKLSLGDSVSVWIPPPRFSDRLNVADESREPRYYVAVQIVEAKGLPVTDDGNSHSFFCALRLVIEGQVPGQQKLFPQSARTKCVKPSIPENNLFDEGMAKWNELFIFEVPRRGSAKLEVEVTNLAAKAGKGEVVGALSFSVGHGSSVLKKIASVRMVHQMNDVYNIVPYTLKKRQNNPEDMVDCGILLVSTSYFERRTNAKFQRDVGNENFIDRDTGFWVGLQADGEWQSIRSLLPLSTAPIVLQDDYIAMDVVMRNGKKHAILRGLVTVVNDSDVKLDISICHVSLIQGHDASLGTGSFNIVVEEIFENQRYHPNSGWSDQLVDFRHDDPGHWSTRDFSHSSKDFFEPPLPSGWQWTTTWTIDKTQYVDNDGWGYGPDFHCLKLPSTSFKTCKSSSSDVVRRRRWVRTRQRLPDQGVNSLKTDLASINPGASASLPWRSTIKDSDQCLLVRPSTDQLMTQYTWGRASFVGSVYAYGKDQAFIDQSFLGKQATSKQENKISNLAFKLNQLEKKDMLLCCNSGNKQFWLSIGADASVLNTELNAPVYDWKISINSPIKLENRLPCSAEFTIWEKAKDGKCIERQNGIILSRGSEQVYSADVQKPLYLTLFLQGGWALEKVVIQRLRLSVERVMGGTSAGPKIIRFHVPYWISNDSSLSLAYRVVELEPPESVDSESLALSRAVKSAKMALRNPINSLDRRYSSVRRHAQVLEEIEDTTPVPSMLSPQDYAGRSGAAPFTSQKETHVSPRVGISIAMRNSDIYSAGISLLELENKERVDVKAFSSDGSYYKLSTLLSMTSDRTKVVRFQPHTLFINRVGCSLCLQQCDSQLSTWFHPSDPPKPFGWQSYAKVELLKLRVEGYKWSTPFSVYSEGMMRICLKKDGGNDPLHLRVEVRSGAKCSRYEVIFRPNISSGPYRIENRSVFLPIRFRQVDGTNDSWKMFLPNTSVSFLWEDLGRRRLLELLIDGSDSSKTDKYDIDEISDHQPVSVTGGPSKALHVTIVKEEKINVVLIRDWMPENEPGRFLGGRHLSPLSNPPRFDFYSSESASISNCEYHVIIELAELGISLVDHTPEEILYLSVQNLLLAYSTGLDSGISRLKLRMSGIQVDNQLPLTPMPVLFRPQRIGLETDYILKFSMTTQSNGSLDLCIYPYIGFHGPESYAFSINIHEPIIWRLHEMIQFVNLSRLQDTGSTAVSVDPVIQIRVLHISEVRFRLSMAMSPSQRPRGVLGFWSSLMTALGNTENMPIRINQRFRENVSMRQSSMVSNAISSIRKDLLSQPLQLLSGVDILGNASSALGHMSKGVAALSMDKKFIQSRQRQESKGVEDLGDVIREGGGALAKGLFRGVTGILTKPLEGAKTSGVEGFVQGVGKGIIGAAAQPVSGVLDLLSKTTEGANAVRMKIASAITSDEQLLRRRLPRVISGDNLLRPYENYKAQGQAILQLAESGSFFVQVDLFKVRGKFALSDAYEDHFLLPKGKILVVTHRRVVLMQQPSTIIGQRKFSPAKDPCSVLWDVLWGDFLTMEFSHGKKDHPKSPPSRLILYLQARSTELKEHVYMVKCNRGTDQALRVYSSIERAMNTYGPNQSKEMVLMGVRKPYSPIADGAIGEYIPKGPVDLSPQQVPASVPFSIGSAFGSSSY Homology
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54LN2 (Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13D OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=vps13D PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 1.9e-38 Identity = 199/879 (22.64%), Postives = 354/879 (40.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54LB8 (Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13A OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=vps13A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 1.0e-36 Identity = 167/772 (21.63%), Postives = 321/772 (41.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BX70 (Vacuolar protein sorting-associated protein 13C OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps13c PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 2.3e-28 Identity = 78/234 (33.33%), Postives = 126/234 (53.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q709C8 (Vacuolar protein sorting-associated protein 13C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS13C PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 128.6 bits (322), Expect = 8.9e-28 Identity = 74/205 (36.10%), Postives = 115/205 (56.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96RL7 (Vacuolar protein sorting-associated protein 13A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS13A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 116.3 bits (290), Expect = 4.6e-24 Identity = 71/203 (34.98%), Postives = 110/203 (54.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. NCBI nr
Match: XP_038883957.1 (uncharacterized protein LOC120074826 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 4330.4 bits (11230), Expect = 0.0e+00 Identity = 2143/2343 (91.46%), Postives = 2218/2343 (94.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. NCBI nr
Match: XP_038883956.1 (uncharacterized protein LOC120074826 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 4325.4 bits (11217), Expect = 0.0e+00 Identity = 2143/2345 (91.39%), Postives = 2218/2345 (94.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. NCBI nr
Match: XP_022979642.1 (uncharacterized protein LOC111479314 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 4275.3 bits (11087), Expect = 0.0e+00 Identity = 2124/2346 (90.54%), Postives = 2210/2346 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. NCBI nr
Match: XP_023527636.1 (uncharacterized protein LOC111790806 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 4264.1 bits (11058), Expect = 0.0e+00 Identity = 2119/2346 (90.32%), Postives = 2207/2346 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. NCBI nr
Match: XP_008438979.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483912 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008438980.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483912 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 4252.6 bits (11028), Expect = 0.0e+00 Identity = 2110/2343 (90.06%), Postives = 2192/2343 (93.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IP98 (uncharacterized protein LOC111479314 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479314 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 4275.3 bits (11087), Expect = 0.0e+00 Identity = 2124/2346 (90.54%), Postives = 2210/2346 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AXM1 (uncharacterized protein LOC103483912 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483912 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 4252.6 bits (11028), Expect = 0.0e+00 Identity = 2110/2343 (90.06%), Postives = 2192/2343 (93.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVL3 (uncharacterized protein LOC111457570 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457570 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 4248.4 bits (11017), Expect = 0.0e+00 Identity = 2112/2346 (90.03%), Postives = 2202/2346 (93.86%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTG7 (uncharacterized protein LOC103483912 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483912 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 4246.0 bits (11011), Expect = 0.0e+00 Identity = 2109/2343 (90.01%), Postives = 2191/2343 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C8M0 (uncharacterized protein LOC111009309 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009309 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 4227.2 bits (10962), Expect = 0.0e+00 Identity = 2104/2342 (89.84%), Postives = 2190/2342 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. TAIR 10
Match: AT1G48090.1 (calcium-dependent lipid-binding family protein ) HSP 1 Score: 2758.0 bits (7148), Expect = 0.0e+00 Identity = 1421/2347 (60.55%), Postives = 1715/2347 (73.07%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. TAIR 10
Match: AT4G17140.3 (pleckstrin homology (PH) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 761.1 bits (1964), Expect = 2.5e-219 Identity = 626/2335 (26.81%), Postives = 1042/2335 (44.63%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. TAIR 10
Match: AT4G17140.2 (pleckstrin homology (PH) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 754.6 bits (1947), Expect = 2.3e-217 Identity = 630/2358 (26.72%), Postives = 1047/2358 (44.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. TAIR 10
Match: AT4G17140.1 (pleckstrin homology (PH) domain-containing protein ) HSP 1 Score: 753.8 bits (1945), Expect = 4.0e-217 Identity = 622/2349 (26.48%), Postives = 1047/2349 (44.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018892 vs. TAIR 10
Match: AT5G24740.1 (Protein of unknown function (DUF1162) ) HSP 1 Score: 98.6 bits (244), Expect = 7.0e-20 Identity = 181/896 (20.20%), Postives = 330/896 (36.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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