Tan0018650 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCAAGGAAGAGGTTGGTTTGGCAGATGAATCAGACAATTACAAACGAATTTCCCTCAAACCTGACCTCTATTCCCTCATCATTTTGGAGACTCGTTCTTATACACAAAGATGTAAAAATGCTTGGTTATTAGAGAGAGATGAGAATTTGGCTTTCTTCCATAAGGGTTGCACTGCCCGTCGTCATTTCAATTTTGTGGCAGAAATTATTGATGTTGCTAGAACTAGTCAGATAACAGATTCGACAATTGAAAATGAATTCTTAACTTATTTCTCTTTGATTTATAGAGGTGGCTCTCCTGTAAGTCCTATTGTTTTGAATCTTCAATGGCGTACCATATCACTTTCCCAAGTTGAGAATCTTACCAAGAATTTCACTGAAGATAAAATACTAATGTGCTTAAAAGGTATTGGTCGTAACAAAGCTCCTGGTCCTGATGGCTTTACTATCGAAGTCTATAAAAAATGTTGGAACATCTTCAAGCGCCAAATATTGGATTTGTTCCACGATTTTTTCAAAACTAGCATAGTGAACAATGCAGTTAATGAGACCTACATTACCCTCAAACCTAAAGTTGTTAGGCCAACTAGAGTGACTGAATTTCAGCCAATTAGTCTCACCACTAGTGTATACAAAATTCTCGCTAAGGTCTCATCAATATGCTTTTATCAAGAATCATCAAATCACCGACTCTATTGTTATGGCCAACGAGTTACTTGATCATTAGCGATGAGTAGCAATGTACTCATCAGAAAATGGTGGTTATCAAGCTTGATATTCAAAAAGCTTTTGACATGCTCAATTGAGATTTTCTCCTTATGGTTCTTAGACAAAAAGGCTTCAATGACACTTGGATCAGATGGATCAAGACTTGTATATCTAATGTTAGCTACTCTATTATTCTAAATGGTAAACCAAGAGGAAAAATAAAAGCATCCAAGGGCTTACGACAGGGAAATCCTCTTTCTCCTTTTCTTTTCCTTATTGTTATGAATTATTTAACGAACTTTATTGAAGATGCATAAAACAAGGAGTTAATACAAGGTTTCTTTTTCCCTAATAATTATGTTCACATATCTCACATTTTGTTAGTTGATAATATTCTTCTTTTTTCAGCTTTTGACCAGAGAAAGTTAATTAATTGTCTCTCGGTGATTCACTCTTTTGAAAAGGCGTCAGGTCTCAACATCAACCTAAACAAGTCCTCGATATCAGGAATTTAATCCTTCTGTTGGAGAAACCAGTCTAGTGGAAAATCTTTGGGGTTGTCCTGCTACTTGTCTGCCAATTCTATACTTAGGAATATCGCTCGGTGGTAAACCTTCTACTTATTCATTTTGGGAGCCTACTGTTGAGAAAATACATAACAATCACATACAATTCTCATATTTATCTAAAGGTGGTCATCTCACTTTAGTTCAATCACTTCTGAATAGCCTTCCTACCTATATGTTATCTATTTTAAGGCTCCCAATTTGGTTTACAAGAACATAGAGAGGCTTATGCGTAATTTCCTATAGGAGGACATTGACCTAAAAGGTGGAGCACATTTTGTTCGTTGGGATATTGTGACTCTCCCCACCGATCAAGGTGGTCTTGGTATCGGTCGAATAAAAGATACCAATTTTGCTTTACTCTGCAAATGGTTATGGTGGTTTTACTTAGAGGGCGACAGTTTGTGGAAGAAGATCATCCAAGCTCGTTATTCCTCAAGCTCTCCCGGGGGCCTGCCTGATATATGCAAACACAATAGTTCCAAATCCCCTTTGCCACAATATCATTAAGCTCAAGAATTTCTTTATGAACAACGTTCGATGGCAAATTCAAAGTGGAGTTTCAGTTGTATTTTGGCATCATAATTGGGCCATTTCTAGCATTCTCAAATACACTATTCCTCATTTTTACACTTGATCGTCTAATAAGCTCCTCACAGTTTCAGAAGCTTGGAATGATAATTTGAGAAGGTGAGATTTTCTCCCACGAAGACTCCTTTTCCAACGTTAAGAGGATATGTGGTCCAACATCCAAATCGAATGGGATTCGCCTTTACTCAACGAGGGTAAGGACGTGTTAACATGGATGGGAAGCAACGATGGATCTTATTCAGTAGGCTCTACCAAATCTCTGCTACGTTACTCTCCACAATATTTTTCTAGATATCTCTTACATATGGAAGCTTTATCTCCCCCAAAAATGTAAGTTTTTTTTATGGACTTTAATGCATAGAGGGCTTAATACTGTGGATATCCTTCAACGACATCTTCATAATCATTGTTTGTGCCCTAGCTGTTGTGTTCTCTGTTTTGGGCAGTGATGAGACTATCGATCATCTTTTCCTCCATTGCGCTTATGTTGTCTATCTCTGGCGCCACTGTAGTGATGGCACCCACCAACCCATCCCAGCTTATGACAGAATTGACTGCTTTCTCAAAGATGCCATGAACATCAACCACAAAGTGACTAGTCAAATTCTATATTCCAATTTAATGGTGCTATTATGGGTGTGTTTGGCTACAACGCAAGGATCAGATTTTTAATGATAAAGCCAAGGTCGTCTCTACTCTTTTTTATGACATTTTTACTCTTGCTTTTGGGAGTTAAAGATCCTCGCCTTTTGGTGCTTACAACATATCCACTATCGTCTTAAATTGGCGAGTTTTCTTTCGAACTAATTATCGATCTCTGTTATAGGGTTGATCTGCATTGTTTTTTCCTTGTCGCCTTTTGTTGTTCTTCCATTTCTTGTTGTTTTTTTTGTTTGGATTGGCGAGCTTTTTCTTGGCTCCATTTTTCTCTCTTGCTTTGTATGTCCCTCACATTGTAACGCCCCAGAACTTCAAGTATCTTTTAATTTTTGTTTTTGAATTAATTTATTGGGAATTAAATTAATTGGACCTTGGGGCTTTGTGTTTTATTGAAAGGTTCTGTAAATTAAGGATTTTGTGTAATTAAAGATATTTTAAGAACATATAATTTGGTTTAAGAGCATGCTTGTGGTTAAAAGGTAGAGGGAAGAACATTTTCGTAATTTTTAAAGAATAAGTCAAATTAGGGTTTTAATCTTTGAATCACGCAAGTCGAGGCATCTTCATCTTCTTCTCCTTCTTCCCTCAGACGCACGACTGCCGCCCAACCCAACCGAGCTTGTTGCTGACGACGTCTTCAGCCACTACTCGCCAACATCGTCTTCTTCTCATCGTAGTGCGCCGACCCTATGCATGTGGAGCTGCATCATCTTGCCGTCACGTCCGACTGCATCTCGTGTGGATCTGCATCCGTCAAGATGCCTAGATCTGTCGTTGTGAGTCGCGCCGTTTCACAGCCACCAGTTGTTGAAGGTTGTGCCGGTGAGAGACTCGTGCTACGTAGAAGTTGTAGACAAGAAGATGCCCTCGCTGGACGTGCAACCCTCGACAAACCACCGATTTGTGCAGGTTTGAAGTCAAACTGCCGCGTAAGGCCTGTCAGTTCACTGTCTTTCTGGTCGGTTTCGGGTGAATGGTGATTGGTTCCGAGTAGATCGACAAGTGGGCATTCCAGATCTACCCTCCACGCGTCGCCATCACGTCGCCGCTCGTCGGTCAACGACCATCGCGCCGGTCAATAGTCAACGGTCAACTCCACTTTTCGAAATTGCTCAGTTCGATTAATTCGACCCTCCGAGCGTGTTTTGACACTCCGTTGTGGTAATTTAGCCTAACTATTATTGGATTCGAAAATAAGTTTATTTATATGTGTTCGAATGAGGAAAATGAATTGAATTTAGAGAGTTAGGAGCGAAACCTTAGGAGTTTCAAGCTAAGAGGAGGTAACAGATTTTATATAAATGATTTTGAAAACGGGAGTAAACATGTTTTATGAAAGATTTATTTTAAGAGATGAAATTCAAAAGTTGATTCCAAAAAGAGGAATCTCAGGGATTTATTTCAAAGAATGATTTTTCCATATTTATTCATAAGACTTGAATTTAGAAAAGGAATATTCCGAAGGGTTAGAGAGGACCCTGAATGAATGATTTTCAAAAAGATTTAGAAAGGAACATCATCTTGGAATTTGAGAGGATTCCAGATGAATTAAGGGTCTCAAAGGACCCGAACAGAAACGATTTTAAGTATCTGAAAAAGAGTTTTGACACAGTTTATCAGATTTACATATATTGAGATTTTTACTTATGCTATTGCGTTGAATACGTATTTTAAATTATAAATGTATTTATGATTTATGATTGATTGACTCGAGTTTAATGTTATGTAAGTTATGTTGGGATTATATGATTGATATGGTTGTTGCATCATTATGAATGCATATGTACATGTGATTGATGAATGAGACCTCATGCATATTGTATGTATATTAACATGTTTATGATGGTTGTGGCAATTGGTCTCCTGAGGACTTATGCATGGTCAAACATGCATCAGAGACCCTATGGGTCAAACTTGTAGGAGTCTGTGAGGGACTCAAACTTATAGGGGTCTGTGAGGGACTCATCCCTCACAACCTACAAGGGTCTGTGAGGGACTCAACATGAAAAGACACAGGTAGATTCAATTGACCACATAAAGACGAAGAGAAAGTCATGATTTTATGAAATGCAGTTTTAGGTCCCACTACAGAAAGTTTTATGATTTTAAAAGTCACGATTAACAGTCATGTTTAAAAGTCATGTTGCATGTGTTTGCATTTCCCGACCCCCACTTACTGGGTATTATTATAATACTCATCCTACCTTTATTTTGTTTTTTTTTTCGTTTTTAAAAATGTTTTTAGGTAAAGGTGAGGGCATACCAGGCGAGTGATAGAGATGCGCTACAGAAGCCATGGGAACCAAGTCATAGTTTTCTGCACACATGTCTTAGAAAGTAATTTTAAAATATTACCGTTTTTCGCTTATGTATTACAGAGATTTGAAACCAGAGGTCAAACTTATTTATGTTTTAAATGTTCTGTATTTTTATGGGATCCTAAATTAAAATGAATTTAATTATCAAG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BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LPT3 (Membrane protein of ER body-like protein OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MEBL PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 1.4e-14 Identity = 52/135 (38.52%), Postives = 75/135 (55.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4P8 (Membrane protein of ER body 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MEB1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 2.4e-11 Identity = 55/142 (38.73%), Postives = 72/142 (50.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KFS7 (Membrane protein of ER body 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MEB2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 4.6e-10 Identity = 40/118 (33.90%), Postives = 68/118 (57.63%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. NCBI nr
Match: XP_023548918.1 (uncharacterized protein LOC111807425 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 2.2e-38 Identity = 115/280 (41.07%), Postives = 153/280 (54.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. NCBI nr
Match: XP_023548919.1 (uncharacterized protein LOC111807425 isoform X4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 2.2e-38 Identity = 115/280 (41.07%), Postives = 153/280 (54.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. NCBI nr
Match: XP_023548916.1 (uncharacterized protein LOC111807425 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023548917.1 uncharacterized protein LOC111807425 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 2.2e-38 Identity = 115/280 (41.07%), Postives = 153/280 (54.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. NCBI nr
Match: XP_023548920.1 (uncharacterized protein LOC111807425 isoform X5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 2.2e-38 Identity = 115/280 (41.07%), Postives = 153/280 (54.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. NCBI nr
Match: XP_023548921.1 (uncharacterized protein LOC111807425 isoform X6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 2.2e-38 Identity = 115/280 (41.07%), Postives = 153/280 (54.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQF8 (uncharacterized protein LOC111456533 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456533 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 3.5e-37 Identity = 112/276 (40.58%), Postives = 150/276 (54.35%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQA4 (uncharacterized protein LOC111456533 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456533 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 4.5e-37 Identity = 112/277 (40.43%), Postives = 150/277 (54.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQF7 (uncharacterized protein LOC111456533 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456533 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 4.5e-37 Identity = 112/277 (40.43%), Postives = 150/277 (54.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JQG4 (membrane protein of ER body 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488012 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 134.4 bits (337), Expect = 1.1e-27 Identity = 77/127 (60.63%), Postives = 97/127 (76.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SK09 (Membrane protein of ER body-like protein isoform X4 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold19G00870 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 2.0e-21 Identity = 65/129 (50.39%), Postives = 86/129 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. TAIR 10
Match: AT4G27870.1 (Vacuolar iron transporter (VIT) family protein ) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 9.7e-16 Identity = 52/135 (38.52%), Postives = 75/135 (55.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. TAIR 10
Match: AT4G27860.1 (vacuolar iron transporter (VIT) family protein ) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 1.7e-12 Identity = 55/142 (38.73%), Postives = 72/142 (50.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. TAIR 10
Match: AT4G27860.2 (vacuolar iron transporter (VIT) family protein ) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 1.7e-12 Identity = 55/142 (38.73%), Postives = 72/142 (50.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. TAIR 10
Match: AT5G24290.2 (Vacuolar iron transporter (VIT) family protein ) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 3.2e-11 Identity = 40/118 (33.90%), Postives = 68/118 (57.63%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0018650 vs. TAIR 10
Match: AT5G24290.1 (Vacuolar iron transporter (VIT) family protein ) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 3.2e-11 Identity = 40/118 (33.90%), Postives = 68/118 (57.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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