
Tan0016947 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGACGACGGCCGCTCAAGCAAAAAGCGCAAGAGGGCGAAGCGTCGTGGAGCAGACAAAAGCAAAGATTTCGCCAATAATATAGCGGATGCTACTAAACCCAATAGCGAAGACATCGTTGTTTCCGGTTCTTCCGACGGCAGAAAATGTCGGAGGGTTTCTGGTTCGTCTAGTTTTCTCGATAAGGTTCGTTTTCTTTTAGAAACTAACCTCGTTTTGAAACCAATTGTTTTGGGGAACTTAAAAGGATTAATTGAATGCATTGTGGTTGGGTGATGATGCAGATGCGAGCTCGTTTGTCAGGAGGGCATTTCAGGATGCTTAATGAGAAGTTGTATACCTGCACGTAATGATTGTTTCTTCTATTCTTTTATTTTTCATCTCGTGTTTCTGGTTTTTACTGCTGGGTTTGTGTGTTGCTATATGTATGCACTAAATTTTGAGTCAGATTGCCCATATTGTTAATATATGATCTTGAAATTTTTACTTAAAATTTTCAGTTTCCTATCAGTTGTCTTAAAACTGACTCTTAAACTTAAGTTTTATTTGTTTATTTCATAGTCAGACCCGATTATTTGAAGCCAATTGATCCTATTTTTCGTTTATATGTTTCAGAGGGGAAGAGGCTCTTAATTATTTCAAAGAAGACCAGGTTCTGTTTGATGTTGTAAGTTCTGCCTGTCTGTTCCTACTTCCTAAACGTAGATTCTGTTACTATTCAAGACTGTTGAAGTTCATCTATTTATTTTCAACAAAGTATTTTCAATAGATGAAACTTTAACATTGAGTATATAATCATGAATATGGAATTTCTTTCTGTACATTGATCGTTGAGGAAGTTTTTGGTTGTTTATTGGTGTGAATGCTCTCTACTCTTAGCTATAATTCTCTCTTTTCCAATTGAAAAGGTTTTATGTAATCCGTTGGATGGGGGCTTTGTCCCTCTTTTGTAAGTTCATACCATCAATGAAATTATTTCTTATTCAAAAGAAAAAGATCGCTGTGGAAGTTTTTAGACACTGAATTTCATTTACAGGGCCTAGGACAAGGGTTAACTAACATTTTGATGGCTAGTATCATACAGGATACCAAGAGCAAATGTCGCATTGGCCTGAGCTGCCCGTGAATTTAATCATAAAATGGCTGAAAGAGCACGATCCCTCATTTATTGTGGCAGATTTTGGCTGTGGTGAGTGTTTGGAAAAAAAGTTTGTGCTCCTATGATTCCTTTAACTAAATATTGATTTAAGAATTTTTCTCTTCTTTTTCTTTTTTTTCCTCCTTCAAATTGAATTACAGGGGATGCACGCCTAGCAAAGAATGTGAAGAATAAAGTTTTCTCATTTGATCTGGTTTCCAAAGATCCTTCTGTTATTGCTTGTGATATGGCCAATGTACGCATTGTATTTGAACTTAATGTCGTAAGATGCATTGAGACATACAACTTTATTTCTTGCATGAAAGTTAGCCATATTGATGTTATTTTTCTCTTGCCGGAGATATTGTAGCTTTCTTATATATATATATACACGCACACACACATATATAATTTTTAAGCTAAAGCTCAGTTGTTACTTTTTATTTTTCAACGACTAGCAAGTTGTTTAAAAAATTTTACATTCCCCCCCAACATTTGGTGATTTATTAGTTAGGTTCATCCGGGAAGAATAAGTTATGGCGAAATGCTATTTAGTGATTGGACGGACATAAAAAGATCGATAGCTATAAACGTCAACAATCACAATCATTATTACAAACAGCTATATTTAGAGTAATTGGATGTACAAATCTATTTTATCGCACAGTTGCAGTTTTCAAATGACATTAGGTATCAATATTTAGAAAAATTTGAGGACTTGGTAAGATTGATCGGATATTTGATGTAGCAGTGCTTTGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGCTTTCTGTTTTCCAATCATGTTATTTGAGCTGTTATTGTTGCTGTTGCTATCATTTTCGCAATAATCCCTGCTATTGATGAGTATAGAATATGCCCATAGAAGCATCACATCATACCCATCTCTTTCATTTGTCTGTTCATAAAATTTATATTAGATTCCTTGGCTGTTGTCTTCAAGTAAGAAACAACCTCTGAACGACGCTGGTTAATGTTTATGACCCCTGGCAGACACCTCTTGACTCTTCATCTGTAGATGTTGCCATCTTTTGCCTTTCACTTATGGGGGTCAATTATGAAAGTTACTTGGCAGAAGCACAAAGAGCACTTAAACCACGGTTTGTGGGCTACTTTTTTGCTTTCTATCAGTGTTAGAACCTTATAATAATTGTCTTTCATCTGGGCGGCTGAACTTTCTGTTTCTACATGCAGTGGATGGCTTTTAATAGCAGAAGTCAAAAGCAGATTTGACCCAAGCAATGGAGGAGCCGACCCCAAAAAGTTCATAAAGGCTGTTTGTGAGCTAGGTTTCGTCTCAGCTCTGAAGGTACATTTATTTTCTATTATTTAGCTAGCATTGTTATTTTCTTTCTTGCTGCTAATTTATAAGTATCATGTGCAGGACTTCTCAAATAAGATGTTTATCTTGTTATACTTCAAGAAAAAGGTTTGTAAATGTTCAAAGTGACAAAATCCTCACGCACTGCTTTTTGTATTTGTACTCGTTCAACACTGGGTTTCATCTATCTTTTGCCTCTTTTATGCAGGATGAGAAAAGTTCTAAGGGGAAAGATATCGATTGGCCCCAGCTAAAACCATGTTTATACAAACGTCGTTGAGTTTGCGATTATTATTTTTTTCCTATGTTCAAAAAAAATTCCTACACAAGTACTTGCTAATAGCTTCTTTATTATATAATCTTATTGGAAATCATTTTGTAGTTCATTGATGTAGTCAAATGAAATATTGGTCTTGGTTGAGCAATTACTGAAGCCTGAAGCTTTCTTTGGGTGGTTCATCTCTCCAAAGGGTGTCAGCTAAACATGGTGAGAATTAATTGGTTTCTGAATCAATCAATCAGAGGTTGGTTTTTGAAATAGAAAATTGAATAATTTTGGTCAATTTTATCGACTCGGTCGGTTTAAACAGGATCAATCTGTTTGTGTTTTCTTGAATGGTTTAACTCGAGTTAGGTTTATGTTGATATATTATAGGTGTTGTAAATCATGTCACTGGATTTCATATTAACATTGTGAAATTTTTATATGTATTGTAATTGTTAATAATTGTTGAGCATAGATTTCTTGAACTCAAGGAAAATTTAGATGTTTATCCATGTTTCTTTACATTGAAGAGGATCACAATATTAGGGAAGGCAGAAACAGCCCCACCCATTCTATAATAGAAGGGGTGGTCAGTGGCAGGTTCATCATTTGTTTTTTGGTAATCAGTTTTAGATTGAGTTTGACATGACTATGACTTTTGAATTAATGAATTCGTTTTTATCCAATCAAAAGTACTTTCTAAATTTAGCATTATGTTTATCTAATGGAGAAAAACACGTTTATATTTCTTTTGAAGAAATATATAGTGAGTTCGACATAATTTTTTTTAATTTCAAGTTTTAATCATGATTGACTATATTGTTAAAAGGGTTTTTGAAAATTTCATCAATACTTACATAATTACATTTGAATAAGTAATTATTTAGTGTTTTCCCCTCTAACAATATCCATGAAAAAATGTTTTACTCACAGCACTACAAAAATTTTATAGCAAGAGAGTCTTCAATGTTTTTAGAGTAAATATATAATTATGACCCATTTGGTTCACGATTTGTATTTGTTTCTTAAAAAACATACAAGAAAAATGATAAAATTACGTTTTGTGAACTTTTTTCAATTTTTTTTTAAACTTCTAAAACAACATTTTTTTTTTAAAAAAAAAACATCATTTTCTTTGTTTTTAATTTTATTTTGAAAAGTATGAAAACAAGGGATACATTCTTTGAAAACATGTTTATATTAAACAACAAATAGAACGTTACTATTTTTCATTTTTCTTCAAAACCTAGAAGCTCACTTCTATTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTGAAGAAATCAAGGAAGCAAAATTAGTTAATTTAATTGGCATAATGTCGTATTAACATTAGTCCTAAAAGTTCATCATATATTTTTTTTCAATAAATGATTTATTTTCCCTTCTCTTTTTCCCTCTTATAAATTACTGCTTGTATTAAAAAACCAAAAATCCTTTCTCGAGGAATCTTCCCTTCAATCATGGCTACTATCTTTCTTTCTCTGGTCTGGAAGAGCATATTCAAATTCACTATAATAAGAAATAATTATAATAATCTTTTTCTTAAATAATTAATTTTATCAAACACATATTAATCTTTTCCAACAATTTCAAATTACAGTCAACACATGGTTGGAAGTTTGGAACCAAACATGTTTTAAGATATAGTAAAATAAGAAATTTGTTTGTTGTTTTTCATTGAAATATTTGTTGTCAAAACCTAATTTTTGAATCAGGAATCAAATGGGACTAATGTTTTCGGTTCAATAGTATTACTCTTCAAAGTCATCTTAAATTAATTTGTAGTCTTTTTTCTTTATTGTTGTACTTCGTTCTCATTTAATTTGAAGTTTCCTTCTTCTCTGCCGAATTTGTCATACATTCAATGACACTTTTTCTTAACTACATTTTTAATTTATTACCTTCACTACATGATCTAAAATTGAATTAGAATAACAAATCTTGACATTTAGGAGTTATTTGGGGTCCTGAGTGAGTTATAATAATATAATTTATAATAGTTTGTGGAGTTATATTAATCTAGGTTTAGGTTGCACAGTCGTTTAATCTAAGTTATACTAATATGTATTTATGATGCAGAATATTCTACAGACTATTATAACATACCTTCCGATCCTTATTGTTTAGGAAACACGCAAGGATTAGCTTAGGAAAAATAAAGCGGTTGCTAATTCACAATATATTAACATAGGAGGATTTTTGAATTTTAAAG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BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84JC0 (Ribosomal RNA-processing protein 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g40530 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 2.3e-97 Identity = 178/283 (62.90%), Postives = 214/283 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NQK2 (SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOG1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 1.9e-72 Identity = 177/449 (39.42%), Postives = 234/449 (52.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M0F8 (NAC domain-containing protein 75 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC075 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 3.9e-57 Identity = 113/203 (55.67%), Postives = 143/203 (70.44%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HY61 (NAC domain-containing protein 10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC010 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 7.6e-53 Identity = 115/226 (50.88%), Postives = 141/226 (62.39%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49459 (NAC domain-containing protein 73 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC073 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 209.9 bits (533), Expect = 1.3e-52 Identity = 110/221 (49.77%), Postives = 143/221 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. NCBI nr
Match: KAF2292276.1 (hypothetical protein GH714_018368 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 1154.4 bits (2985), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/996 (59.74%), Postives = 701/996 (70.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. NCBI nr
Match: KAF2308452.1 (hypothetical protein GH714_009732 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 858.2 bits (2216), Expect = 6.9e-245 Identity = 443/699 (63.38%), Postives = 519/699 (74.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. NCBI nr
Match: KAF5740414.1 (serine/threonine-protein kinase HT1-like [Tripterygium wilfordii]) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 2.6e-236 Identity = 426/725 (58.76%), Postives = 525/725 (72.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. NCBI nr
Match: TKY50484.1 (NAC domain-containing protein 8 [Spatholobus suberectus]) HSP 1 Score: 786.2 bits (2029), Expect = 3.3e-223 Identity = 411/702 (58.55%), Postives = 492/702 (70.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. NCBI nr
Match: KAG5624447.1 (hypothetical protein H5410_009665 [Solanum commersonii]) HSP 1 Score: 781.9 bits (2018), Expect = 6.3e-222 Identity = 404/698 (57.88%), Postives = 494/698 (70.77%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6KW68 (Ribosomal RNA-processing protein 8 OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_018368 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1154.4 bits (2985), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/996 (59.74%), Postives = 701/996 (70.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6M487 (Uncharacterized protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_009732 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 858.2 bits (2216), Expect = 3.3e-245 Identity = 443/699 (63.38%), Postives = 519/699 (74.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J7D258 (Serine/threonine-protein kinase HT1-like OS=Tripterygium wilfordii OX=458696 GN=HS088_TW11G00483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 1.3e-236 Identity = 426/725 (58.76%), Postives = 525/725 (72.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q7FZU2 (Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 3.5e-218 Identity = 404/704 (57.39%), Postives = 494/704 (70.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1R3GMR3 (Uncharacterized protein OS=Corchorus capsularis OX=210143 GN=CCACVL1_24925 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 759.2 bits (1959), Expect = 2.1e-215 Identity = 400/702 (56.98%), Postives = 491/702 (69.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. TAIR 10
Match: AT5G50180.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 387.5 bits (994), Expect = 3.2e-107 Identity = 189/265 (71.32%), Postives = 214/265 (80.75%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. TAIR 10
Match: AT3G27560.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 386.0 bits (990), Expect = 9.4e-107 Identity = 193/268 (72.01%), Postives = 218/268 (81.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. TAIR 10
Match: AT5G40540.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 379.0 bits (972), Expect = 1.1e-104 Identity = 192/266 (72.18%), Postives = 219/266 (82.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. TAIR 10
Match: AT5G40530.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 1.6e-98 Identity = 178/283 (62.90%), Postives = 214/283 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016947 vs. TAIR 10
Match: AT5G40530.2 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 2.4e-86 Identity = 166/284 (58.45%), Postives = 198/284 (69.72%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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