Tan0016290 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0016290
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG01: 103693245 .. 103700845 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0016290
SyntenyTan0016290
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGAGCGAAGGTTTGAACACAGACGCTTTGACGACTATGGAGAATCAATTGAGTAGGGATCCTTCGTCGACCATAAATGCTCAATTGAATCCTTTTCTCCTCCATCATTCTTTTGCACCTACAACAAATTTAGTTACTCAACCATTACTTGGAGCGAGTAATTACAATTCATGGAGTCGTGTCATGTTAATGGCTCTTTCTGGCAAAAACAAGGCAGGTTTTGTGAAAGGAACGATTGAGAAACCACAAACCAGAGGAAATCTGTTGTCGGCATGGGAGTGCAATAATGACATCATCGCCTCATGGATTCTCAATTCAGTATCCAAAGAGATCGCCGCTAGTATTGTTTATGCTGGATCTGTGAAGGAAGTTTGGGATGAACTTCGTGATCACTTCAAACAGAGTAATGGACCACGCATCTATCTACTCCGAAAGGAATTGGTGACCACACAACAAGGTAACATGTCTGTTGAAGCTTATTACACAAAATTAAAAACCATATGGCAAGATTTGAACGAATTTAGGCCCATTCAAGACTGTTGTTGCGGCGGATTGAAACCTTTCTTGGCACATATGGAGTCGGAATATGTCATGATTTTTCTCATGGGCTTAAATGAAGCATATGCCTCTGTTCGAGCGCAAATTTTACTCATTGATCCAATTCCACCTGTCACAAAGGTTTTTTCCCTTATAATTCAAGAGGAACACCAGCGTTCTGTCGGACATGTAGTTCCTTCTCTTGATTCTGTGGTTTTAGTTGCTTCTGATTCTTCAAAGAAGTCATCGCCCCCTGTTGATTGTTCCAAAAGGAAAGAGAATCCACGACCTATATGTGCTCACTGTGGCATTAAAGGGCATACGGTTGATCGGTGTTATAAGCTTCATGGATATCCACCGAGCTATAAATCTCGTACTCCGAATAATATTTCCACTATCGCTGAAGGTTCTGTTTCTCCGGCTCAACCGCACACCACTGTTGGTGTTAATACTGTTGCTCAATCGAATTTCTTCGCAAGTCTGAGTTCCAATCAGTACACACAGTTAATGGATATGCTTTCCTCTCATCTCCAAGCTGCTAAAGTTGAGCCCATTACTACTACTCCTACAGTTTCTCATGCTGCAGGTATATACTCATTAGCTTCTCTGCCTAATGCGCTCTCTATTGGTTCATGGATACTCGACTCAGGTGCTTCTAGGCATATCTATTATTCTCACCATTTATTTCATAATTGGCGTCGTGTCCATGGCATCTCTGTCATTCTCCCAACACGTTTTCGCGTACAAGTCAACTTTATTGGTGATATTCGGCTTTCTGAACACATTTTGCTGCGTGAAGTTCTTTTTGTCCCTCAGTTCCAATACAATCTGATTTCCGTGAGTTGCTTATTACAATCAGGCCATTTTTCCCTCAATTTCTCTGGTGATTATTGCCTAATACAGGACAGGTTGCATTCCCTAACGATTGGCAAGGCTAATTGTGTGCATGACCTTTATCTGTTCTCGACACCTAATTGTTTGAAGCCTCAATTGGCTTCAGTTGCTGCTGTGACTTCGACAACATCTTCAACTGTCTGGCATCGTCGTTTAGGCCATCTTTCTCCTAAACGTTTGCATTTGTTAAAGGATGTTTTGTCTTTGCCTGCTCATTTTCCTTCTGATTGCAACATTTGTCCATTAGCTAAGCAACGACGTTTATCTTTTGATTCTAATAATAAAGTTGCTTTAAATGTCTTTGACCTTGTTCATTGTGATGTTTGGGGCCCTTTCAAATTACCTACTTATGGAGGATTTCGATATTTTATCACCTTGGTCGATGACTGTTCACGGTTCACATGGGTTTATCTCATGAGGAATAAGTCAGATGCTCTCACCATAATACCTCGTTTTTTTCAGCTGATAGAGACACAGTTTTCTAAGGTGATTAAGAATTTCAGGTTTGATAATGCTCCCGAACTTTGGTTTGTGGAATTTTTTGCCAGCAAAGGAACTCTTCATCAACACTCGTGCGTTGGTCGACTTCAACAAAACTCTGTTGTGGAGCGTAAACATCAACATCTCTTGAATGTCGCTCGAGCTCTATATTTTCAATCCAGAGTGCCACTTCGTTTTTGGGGTGATTGCGTTTTGACAGCATATATCTCATCAATCGTACGCCTATGCCCTTACTCTCCAACAGGTCTCCATTTACTGTTTTATATAATAACCAGGTAGACTACTCTCGATTACGCGTGTTTGGCTGTCTTTGTTATATGTCTACATCCGACGTTCATAGATCTAAATTTGATCAACGTGTTGTCCCCTGCATATTTCTTGGTTATCCTGCTGGTATAAAGGGCTATCGGGTATATGATATTCTCAAGCGCCAAATTCATATATCTCGTGATGTTGTGTTCATGGAAAACACGTTTCCTTTTCATACGCTTCCTGACATTGATGATGGTTGTAGTCCTGATGATATGTTTTCCACTCATGTTTTGCCTTGTCCCATACTAGATGCTGACATTCCTACTTGTATGCCTGAGGTACCAAATTATTCTGCTGAGGAACCAGTGGCTATACGTGATGTTGTGCCAAATTCTTATGTTGATGCAGATTCACCCTTTAGCCCCTCGGCTCCCATTGATCACAGTTCCGTTGACAATAATGATGTTGAACATCCTGTTTTGGTTCCTGTATGTCGTTCTACTCGTCCCCATCACCCCCCACATTTTTTGCAGGATTATCATTGTCAATTATTGACACATGACTTCTCTACTGCATTAGTGGGTCCGACTGTTTCTTATCCAATTGCTGACTATTTGGCTTATCAAAGTCTTGCGCCTTCACATCAGAATTTCATTCTTAATATTTCTACAGTTTTTTAGCCTTCCTTTTTCCATCAAGCGGTCAGTACCCTCAATGGCGCCATGCCATGGATGATGAAATAGCTGCTATGGAAAGAACCAAAACTTGGACACTAGTGCCACTTCCCAAGGGACATCGAGCCGTTGGATGTAAATGGGTGTATCGACTCAAATATAATACCGATGGATCGGTTGCTCGCCATAAGACACGATTGGTGGCTAAAGGCTACAGTCAACAAGAATGTATCGATTTCACTGATACTTTTTCTCCTGTTGCAAAGATTGTTACCGTAAGACTTTTGTTGTCTATTGTGGTGTCTTTTAATTGGTCTATTGTCCAAATGGATATTAATAATGCTTTTTTGAATGGAGACTTATTTGAAGAAGTTTATATGTCTCTTCCCCCTGGCTATTATTCAAATGTTACCCATTCTTCTGGTACATCCATTGTTTATAAGCTGAATAAGTCCATTTATGGCCTACGTCAAGCGTCTCGACAGTGGTTTTCCAAATTTTCATCTGTATTGATAACGAGTGGATTTTCACAGTAAAAAACTGATTATTCACTTTTTACACGTGGGCATGGTTCTTCATTTGTTGCTTTATTAGTATATGTTGATGATATACTACTTACGGGCCCTTCTCCAACAAAAATATCGATTGTCAAAGGCATTCTTAGTTCCAACTTTCTATTAAAAGATTTGGGGGATGCCAAATATTTCCTTGATTTGGAATTATCTCGATCTTCTCGTGGTTTATATGTTTCTCAGCGCAAATATTGTTTGCAAATCTTGGAAGATTCTGGTTTCTTAGCAGCTAAGCCAAGGGCTTATCCGATGTCACCAAGCTTACGATTATCTGCATCTGGGAAGTTGTTAAATGATGCTGATGCAACATCTTATAGGAGATTGATTGGTAGGCTCCTTTATTTGCAAATTTCTCACCCTGATATTTCCTTTTCAGTACATAAGTTGAGTCAGTTCATTTCTCAACCTTGTGCTGAACATTTGGAGGCTGCACATCATTTGTTGCGATATTTAAAAGGGACTGTTGGGCAAAGTTTCTTGATTCAACCGACCTCCACTTTCCAATTGAAGGCCTTTGTGGATTCCAATTGGGGTTCATGTCTTGATACAAGGCGCTCGGTTACTTGTTTTTGTGTTTTCTTAGGTTCTTCTCTTGTTTCATGGAAGACTAAGAAACAAGCAACCGTTTCTCGGTCCTCTGCAGAGGCCGAGTATCGTGCCCTTGCTAGCGTTGCTAGTGAGTTGTCATGGATCAATTATGTTCTCACTGATTTGCACATTTCTCATCCTGGTCCTGCTTTGGTGTATTGTGACAATCAAGCTGCCATTTCCATTGCTTCTAATCCTACTTTCCATGAGCGGACTAAACACATCGAAATAGATTGTCATTTTGTGCGTGATATGGTTAACCGAGGTCTTTTGAAGTTGTTGCCCGTTCGAACTACTTCTCAACTTGCAGATATGTTTACCAAAGCTCTTCCTGCGTCGAGTCTTCAGACTTTTATGCCCAAGATGACCATTTTCAATTTACATAGTCCATCTTGAAGGGGGATATTAGATATAGTGGTTTCAAATTTGTCATTTGAATTCTGATGAGTTATTCTGAGTTATCATTTTGTTATTCCAGTATTTCTCTTTGTATTTATTAATGACTGTATTACTCTTTAATCTTCAATGAGAAGTATCACGATTCTCATAACTCTAATATTAGTTAAGATATTATATCTTCTACCAAAATCATACAATAAAATTCTCATTTAACTAAAAAAAGGTGAATTATGTATGTTTAAGCTGGCTCCCATCAACATTTATCATTTATACGTACTCTTCATAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGAGAACGATATTGATGAAGACATCATATATGACCTCATAAAATATAAAATAACGTCAACAATTCGGTACATTTATTTATTTTTATACAAAATTCGGTATAATATATATATACTATATTTGTTTTCACCTGAATGATACAACGTTTTTATTACCTTTCCGACAACGACATTTAAAGAGGGTGTTTGCTTAATTTTCCATTCATGTAACAAAGTTGTATTTTAAATTTTATAGTTTTTCATTACAATTGAGATGGTGGGATTTAAACTACAGATT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mRNA sequence

ATGGCGAGCGAAGATGCTGACATTCCTACTTGTATGCCTGAGGTACCAAATTATTCTGCTGAGGAACCAGTGGCTATACGTGATGTTGTGCCAAATTCTTATGTTGATGCAGATTCACCCTTTAGCCCCTCGGCTCCCATTGATCACAGTTCCGTTGACAATAATGATGTTGAACATCCTGTTTTGGTTCCTGCTCGTTCAACCGACATTCGCCCCAGCCCAGCGCCACCGCGACAAAAGACTCGGTCAGAATTGGGGCTGAAGAACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGAGCGAAGATGCTGACATTCCTACTTGTATGCCTGAGGTACCAAATTATTCTGCTGAGGAACCAGTGGCTATACGTGATGTTGTGCCAAATTCTTATGTTGATGCAGATTCACCCTTTAGCCCCTCGGCTCCCATTGATCACAGTTCCGTTGACAATAATGATGTTGAACATCCTGTTTTGGTTCCTGCTCGTTCAACCGACATTCGCCCCAGCCCAGCGCCACCGCGACAAAAGACTCGGTCAGAATTGGGGCTGAAGAACTAA

Protein sequence

MASEDADIPTCMPEVPNYSAEEPVAIRDVVPNSYVDADSPFSPSAPIDHSSVDNNDVEHPVLVPARSTDIRPSPAPPRQKTRSELGLKN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 34..89

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0016290.1Tan0016290.1mRNA