Tan0016035 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0016035
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionMADS-box protein AGL42-like
LocationLG07: 5370438 .. 5406404 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0016035
SyntenyTan0016035
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

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Homology
[Close]
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           DMQK+IERYRKY KD +T+   S+ ++QQLKQEA     KIE L+  ++KLLG+G+ SCS
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Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
            + +     +   +    +++T+LFIGLP
Sbjct: 181 TDQQQEKYKVIDLN---LEVETDLFIGLP 206

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64645 (MADS-box protein SOC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOC1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 208.4 bits (529), Expect = 8.0e-53
Identity = 120/211 (56.87%), Postives = 158/211 (74.88%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK +MKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDAEVS+IIFS KG+LYEF+SS
Sbjct: 1   MVRGKTQMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVSLIIFSPKGKLYEFASS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           +MQ +I+RY ++ KD  +    SE  MQ LK EA    KKIEQL++S++KLLG G+ +CS
Sbjct: 61  NMQDTIDRYLRHTKDRVSTKPVSEENMQHLKYEAANMMKKIEQLEASKRKLLGEGIGTCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE+++IE+QL  S+  IR RK+Q+FKEQ ++L +K K L  EN KLS K G+   +  +
Sbjct: 121 IEELQQIEQQLEKSVKCIRARKTQVFKEQIEQLKQKEKALAAENEKLSEKWGSHESEVWS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            +++        +S   S+++T+LFIGLPCS
Sbjct: 181 NKNQESTGRGDEESSPSSEVETQLFIGLPCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XJ60 (MADS-box transcription factor 50 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS50 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 5.6e-46
Identity = 112/213 (52.58%), Postives = 149/213 (69.95%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK +MKRIEN TSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDAEV++I+FS +G+LYEF+S+
Sbjct: 1   MVRGKTQMKRIENPTSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVALIVFSPRGKLYEFASA 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
             QK+IERYR Y K+   N    +  ++Q+K +AD  AKK+E L++ ++KLLG  LD CS
Sbjct: 61  STQKTIERYRTYTKENIGNKTVQQD-IEQVKADADGLAKKLEALETYKRKLLGEKLDECS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPA- 180
            EE+  +E +L  SL  IR RK++L +EQ  KL EK   L ++N +L  KC  +P   A 
Sbjct: 121 IEELHSLEVKLERSLISIRGRKTKLLEEQVAKLREKEMKLRKDNEELREKCKNQPPLSAP 180

Query: 181 ---AAEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
               AEDE    ++ + +    D++TELFIGLP
Sbjct: 181 LTVRAEDENPDRNI-NTTNDNMDVETELFIGLP 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT93 (MADS-box protein AGL71 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL71 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 1.5e-43
Identity = 105/215 (48.84%), Postives = 147/215 (68.37%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK+E+K+IEN TSRQVTFSKRR+GL KKA+ELSVLCDA+V+ I+FSQ GRL+E+SSS
Sbjct: 1   MVRGKIEIKKIENVTSRQVTFSKRRSGLFKKAHELSVLCDAQVAAIVFSQSGRLHEYSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTF------RSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGR 120
            M+K I+RY K+     +N F      + E Y+Q+LK E D   KKI+ L+   +KLLG+
Sbjct: 61  QMEKIIDRYGKF-----SNAFYVAERPQVERYLQELKMEIDRMVKKIDLLEVHHRKLLGQ 120

Query: 121 GLDSCSFEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTK 180
           GLDSCS  E++EI+ Q+  SL  +R RK++L+ +Q KKL EK + L+ E  +L  +    
Sbjct: 121 GLDSCSVTELQEIDTQIEKSLRIVRSRKAELYADQLKKLKEKERELLNERKRLLEEVNMH 180

Query: 181 PWQPAAAEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
               +    EGG      +++  S+++T+LFIGLP
Sbjct: 181 --HSSKGNTEGG-----HRTKHSSEVETDLFIGLP 203

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82743 (Agamous-like MADS-box protein AGL19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL19 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 1.3e-42
Identity = 108/213 (50.70%), Postives = 142/213 (66.67%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK EMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDAEV+++IFS + +LYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKTEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVALVIFSPRSKLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            +  +IERY++  K+   N  R++   QQ + E     KKIEQL+ S++KLLG G+D+CS
Sbjct: 61  SIAATIERYQRRIKEIGNNHKRNDN-SQQARDETSGLTKKIEQLEISKRKLLGEGIDACS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE++++E QL  SL+RIR +K QL +E+ +KL  + + L++EN  L  K     W    
Sbjct: 121 IEELQQLENQLDRSLSRIRAKKYQLLREEIEKLKAEERNLVKENKDLKEK-----WLGMG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSD----MQTELFIGLP 210
                   S  S S    D    ++T LFIG P
Sbjct: 181 TATIASSQSTLSSSEVNIDDNMEVETGLFIGPP 207

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match: KAG7017119.1 (MADS-box protein AGL42 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 351.7 bits (901), Expect = 4.5e-93
Identity = 183/211 (86.73%), Postives = 200/211 (94.79%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRKYGK G+TNTF+SEGYMQQ++QEA+MTAKKIE+L+ SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKYGKGGETNTFQSEGYMQQMEQEAEMTAKKIEELEKSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRERK+ LFKEQK+KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRERKALLFKEQKEKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQEG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match: XP_022969948.1 (MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 350.5 bits (898), Expect = 1.0e-92
Identity = 182/211 (86.26%), Postives = 200/211 (94.79%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRK+GK G+TNTF+SEGYMQQ+KQEA+MTAKKIE+L+ SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKFGKGGETNTFQSEGYMQQMKQEAEMTAKKIEELEKSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRERK+ LFKEQK+KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRERKALLFKEQKEKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQEG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match: XP_023549807.1 (MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 1.3e-92
Identity = 182/211 (86.26%), Postives = 198/211 (93.84%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRKYGK G+TNTF+SEGYMQQ+KQE +MTAKKIE+L+ SQ+KL+GRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKYGKGGETNTFQSEGYMQQMKQEVEMTAKKIEELEKSQKKLMGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRERK+ LFKEQK KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRERKALLFKEQKDKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQEG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match: XP_022928910.1 (MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 1.7e-92
Identity = 182/211 (86.26%), Postives = 199/211 (94.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRKYGK G+TNTF+SEGYMQQ++QEA+MTAKKIE+L+ SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKYGKGGETNTFQSEGYMQQMEQEAEMTAKKIEELEKSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRE K+ LFKEQK+KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRETKALLFKEQKEKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQGG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match: KGN49884.2 (hypothetical protein Csa_000572 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 340.9 bits (873), Expect = 7.9e-90
Identity = 185/218 (84.86%), Postives = 199/218 (91.28%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 65  MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 124

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRK+GKDGQ+N FRSEGYMQQLKQEA+MTAKKIEQL+ SQQKLLGRGLDSCS
Sbjct: 125 DMQKTIERYRKHGKDGQSNPFRSEGYMQQLKQEAEMTAKKIEQLEKSQQKLLGRGLDSCS 184

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEEIREIERQL+LSLTRIRE K+QLFKEQK+KLIEKGKLL+EEN+KLSAKCGTKPWQ   
Sbjct: 185 FEEIREIERQLVLSLTRIRETKAQLFKEQKEKLIEKGKLLLEENLKLSAKCGTKPWQEEG 244

Query: 181 AEDEGGI---MSLCSQS--RQGSD--MQTELFIGLPCS 212
            E +GGI    +LCSQS   Q SD  MQT+LFIGL CS
Sbjct: 245 VEGDGGINMMSNLCSQSTNSQASDHHMQTDLFIGLSCS 282

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2F0 (MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468993 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 350.5 bits (898), Expect = 4.8e-93
Identity = 182/211 (86.26%), Postives = 200/211 (94.79%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRK+GK G+TNTF+SEGYMQQ+KQEA+MTAKKIE+L+ SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKFGKGGETNTFQSEGYMQQMKQEAEMTAKKIEELEKSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRERK+ LFKEQK+KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRERKALLFKEQKEKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQEG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EST4 (MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435678 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 8.3e-93
Identity = 182/211 (86.26%), Postives = 199/211 (94.31%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNG+LKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGILKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
            MQK+IERYRKYGK G+TNTF+SEGYMQQ++QEA+MTAKKIE+L+ SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  IMQKTIERYRKYGKGGETNTFQSEGYMQQMEQEAEMTAKKIEELEKSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEE+REIE+QLILSLTRIRE K+ LFKEQK+KLIEKGKLLIEEN KLSAKCGTKPW+   
Sbjct: 121 FEEVREIEKQLILSLTRIRETKALLFKEQKEKLIEKGKLLIEENKKLSAKCGTKPWEQGG 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            E EGGIMSLCSQSRQGSD+QTELFIGL CS
Sbjct: 181 IEAEGGIMSLCSQSRQGSDIQTELFIGLSCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KL39 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G172800 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 340.9 bits (873), Expect = 3.8e-90
Identity = 185/218 (84.86%), Postives = 199/218 (91.28%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRK+GKDGQ+N FRSEGYMQQLKQEA+MTAKKIEQL+ SQQKLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  DMQKTIERYRKHGKDGQSNPFRSEGYMQQLKQEAEMTAKKIEQLEKSQQKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
           FEEIREIERQL+LSLTRIRE K+QLFKEQK+KLIEKGKLL+EEN+KLSAKCGTKPWQ   
Sbjct: 121 FEEIREIERQLVLSLTRIRETKAQLFKEQKEKLIEKGKLLLEENLKLSAKCGTKPWQEEG 180

Query: 181 AEDEGGI---MSLCSQS--RQGSD--MQTELFIGLPCS 212
            E +GGI    +LCSQS   Q SD  MQT+LFIGL CS
Sbjct: 181 VEGDGGINMMSNLCSQSTNSQASDHHMQTDLFIGLSCS 218

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BSU4 (MADS-box protein AGL42-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004515 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 337.0 bits (863), Expect = 5.5e-89
Identity = 180/215 (83.72%), Postives = 194/215 (90.23%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGKVEMKRIEN+TSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDA+VSV+IFSQKGRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKVEMKRIENSTSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAQVSVLIFSQKGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQKSIERY KYGKDGQTN FRSEGYMQQLKQEA+MTAKKIE L++SQQKLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  DMQKSIERYHKYGKDGQTNAFRSEGYMQQLKQEAEMTAKKIEHLENSQQKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQP-- 180
            +E+REIERQL LSL+RIRERKSQLFKEQK+KLIEKGKLL EEN KLSAKCG +PWQ   
Sbjct: 121 LKELREIERQLELSLSRIRERKSQLFKEQKEKLIEKGKLLTEENAKLSAKCGAEPWQAEE 180

Query: 181 --AAAEDEGGIMSLCSQ-SRQGSDMQTELFIGLPC 211
                + EGGI+ LCSQ S+  SDMQTELFIGLPC
Sbjct: 181 GGGGGDAEGGIVGLCSQSSKSNSDMQTELFIGLPC 215

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K3R0 (MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490892 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 325.9 bits (834), Expect = 1.3e-85
Identity = 177/214 (82.71%), Postives = 195/214 (91.12%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRG+VEMKRIENAT+RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSV+IFSQKGRLYEFSS+
Sbjct: 1   MVRGRVEMKRIENATNRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVMIFSQKGRLYEFSST 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           D+ KSIERYR YGKDGQTN  RSE YMQQ+KQEADMTAKK+EQL++SQ+KLLGRGLDSCS
Sbjct: 61  DIHKSIERYRCYGKDGQTNALRSEVYMQQMKQEADMTAKKMEQLETSQKKLLGRGLDSCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQ-PA 180
            EEIREIE QLILSLTRIRERKSQLFKEQ+ KLIEKGKLLIEENIKL+AKCGT+PW+   
Sbjct: 121 LEEIREIETQLILSLTRIRERKSQLFKEQRMKLIEKGKLLIEENIKLAAKCGTQPWEAEG 180

Query: 181 AAEDEGG-IMS-LCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
             EDEGG IMS LC+Q+ Q S + T+LFIGLPCS
Sbjct: 181 GGEDEGGWIMSLLCTQNGQPSHINTKLFIGLPCS 214

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.1 (AGAMOUS-like 42 )

HSP 1 Score: 228.8 bits (582), Expect = 4.1e-60
Identity = 126/209 (60.29%), Postives = 163/209 (77.99%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK+EMK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDA++S+IIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKIEMKKIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAQLSLIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRKY KD +T+   S+ ++QQLKQEA     KIE L+  ++KLLG+G+ SCS
Sbjct: 61  DMQKTIERYRKYTKDHETSNHDSQIHLQQLKQEASHMITKIELLEFHKRKLLGQGIASCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE++EI+ QL  SL ++RERK+QLFKEQ +KL  K K L+EEN+KL  K    PW+ ++
Sbjct: 121 LEELQEIDSQLQRSLGKVRERKAQLFKEQLEKLKAKEKQLLEENVKLHQKNVINPWRGSS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
            + +     +   +    +++T+LFIGLP
Sbjct: 181 TDQQQEKYKVIDLN---LEVETDLFIGLP 206

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.2 (AGAMOUS-like 42 )

HSP 1 Score: 228.8 bits (582), Expect = 4.1e-60
Identity = 126/209 (60.29%), Postives = 163/209 (77.99%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK+EMK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDA++S+IIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKIEMKKIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAQLSLIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRKY KD +T+   S+ ++QQLKQEA     KIE L+  ++KLLG+G+ SCS
Sbjct: 61  DMQKTIERYRKYTKDHETSNHDSQIHLQQLKQEASHMITKIELLEFHKRKLLGQGIASCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE++EI+ QL  SL ++RERK+QLFKEQ +KL  K K L+EEN+KL  K    PW+ ++
Sbjct: 121 LEELQEIDSQLQRSLGKVRERKAQLFKEQLEKLKAKEKQLLEENVKLHQKNVINPWRGSS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
            + +     +   +    +++T+LFIGLP
Sbjct: 181 TDQQQEKYKVIDLN---LEVETDLFIGLP 206

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.3 (AGAMOUS-like 42 )

HSP 1 Score: 228.8 bits (582), Expect = 4.1e-60
Identity = 126/209 (60.29%), Postives = 163/209 (77.99%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK+EMK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDA++S+IIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKIEMKKIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAQLSLIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRKY KD +T+   S+ ++QQLKQEA     KIE L+  ++KLLG+G+ SCS
Sbjct: 61  DMQKTIERYRKYTKDHETSNHDSQIHLQQLKQEASHMITKIELLEFHKRKLLGQGIASCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE++EI+ QL  SL ++RERK+QLFKEQ +KL  K K L+EEN+KL  K    PW+ ++
Sbjct: 121 LEELQEIDSQLQRSLGKVRERKAQLFKEQLEKLKAKEKQLLEENVKLHQKNVINPWRGSS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
            + +     +   +    +++T+LFIGLP
Sbjct: 181 TDQQQEKYKVIDLN---LEVETDLFIGLP 206

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match: AT2G45660.1 (AGAMOUS-like 20 )

HSP 1 Score: 208.4 bits (529), Expect = 5.7e-54
Identity = 120/211 (56.87%), Postives = 158/211 (74.88%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK +MKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDAEVS+IIFS KG+LYEF+SS
Sbjct: 1   MVRGKTQMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVSLIIFSPKGKLYEFASS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           +MQ +I+RY ++ KD  +    SE  MQ LK EA    KKIEQL++S++KLLG G+ +CS
Sbjct: 61  NMQDTIDRYLRHTKDRVSTKPVSEENMQHLKYEAANMMKKIEQLEASKRKLLGEGIGTCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE+++IE+QL  S+  IR RK+Q+FKEQ ++L +K K L  EN KLS K G+   +  +
Sbjct: 121 IEELQQIEQQLEKSVKCIRARKTQVFKEQIEQLKQKEKALAAENEKLSEKWGSHESEVWS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLPCS 212
            +++        +S   S+++T+LFIGLPCS
Sbjct: 181 NKNQESTGRGDEESSPSSEVETQLFIGLPCS 211

[Close]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.4 (AGAMOUS-like 42 )

HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 1.7e-53
Identity = 117/209 (55.98%), Postives = 152/209 (72.73%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVRGKVEMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVSVIIFSQKGRLYEFSSS 60
           MVRGK+EMK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDA++S+IIFSQ+GRLYEFSSS
Sbjct: 1   MVRGKIEMKKIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAQLSLIIFSQRGRLYEFSSS 60

Query: 61  DMQKSIERYRKYGKDGQTNTFRSEGYMQQLKQEADMTAKKIEQLQSSQQKLLGRGLDSCS 120
           DMQK+IERYRKY KD +T+   S+ ++QQLKQEA     KIE L+  ++KLLG+G+ SCS
Sbjct: 61  DMQKTIERYRKYTKDHETSNHDSQIHLQQLKQEASHMITKIELLEFHKRKLLGQGIASCS 120

Query: 121 FEEIREIERQLILSLTRIRERKSQLFKEQKKKLIEKGKLLIEENIKLSAKCGTKPWQPAA 180
            EE++EI+ QL  SL ++RERK               K L+EEN+KL  K    PW+ ++
Sbjct: 121 LEELQEIDSQLQRSLGKVRERKE--------------KQLLEENVKLHQKNVINPWRGSS 180

Query: 181 AEDEGGIMSLCSQSRQGSDMQTELFIGLP 210
            + +     +   +    +++T+LFIGLP
Sbjct: 181 TDQQQEKYKVIDLN---LEVETDLFIGLP 192

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9FIS15.7e-5960.29MADS-box protein AGL42 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL42 PE=1 SV=1[more]
O646458.0e-5356.87MADS-box protein SOC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOC1 PE=1 SV=1[more]
Q9XJ605.6e-4652.58MADS-box transcription factor 50 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MAD... [more]
Q9LT931.5e-4348.84MADS-box protein AGL71 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL71 PE=2 SV=1[more]
O827431.3e-4250.70Agamous-like MADS-box protein AGL19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL19 PE=... [more]
BLAST of Tan0016035 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7017119.14.5e-9386.73MADS-box protein AGL42 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
XP_022969948.11.0e-9286.26MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita maxima][more]
XP_023549807.11.3e-9286.26MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_022928910.11.7e-9286.26MADS-box protein AGL42-like [Cucurbita moschata][more]
KGN49884.27.9e-9084.86hypothetical protein Csa_000572 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Tan0016035 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1I2F04.8e-9386.26MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468993 PE=4 SV=... [more]
A0A6J1EST48.3e-9386.26MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435678 PE=4 S... [more]
A0A0A0KL393.8e-9084.86Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G172800 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1BSU45.5e-8983.72MADS-box protein AGL42-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC1110... [more]
A0A6J1K3R01.3e-8582.71MADS-box protein AGL42-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490892 PE=4 SV=... [more]
BLAST of Tan0016035 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G62165.14.1e-6060.29AGAMOUS-like 42 [more]
AT5G62165.24.1e-6060.29AGAMOUS-like 42 [more]
AT5G62165.34.1e-6060.29AGAMOUS-like 42 [more]
AT2G45660.15.7e-5456.87AGAMOUS-like 20 [more]
AT5G62165.41.7e-5355.98AGAMOUS-like 42 [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 87..107
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR11945:SF341MADS-BOX PROTEIN SOC1coord: 1..208
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR11945MADS BOX PROTEINcoord: 1..208
IPR002100Transcription factor, MADS-boxPRINTSPR00404MADSDOMAINcoord: 38..59
score: 58.51
coord: 3..23
score: 68.28
coord: 23..38
score: 86.34
IPR002100Transcription factor, MADS-boxSMARTSM00432madsneu2coord: 1..60
e-value: 4.9E-41
score: 152.3
IPR002100Transcription factor, MADS-boxPFAMPF00319SRF-TFcoord: 10..57
e-value: 2.4E-26
score: 91.0
IPR002100Transcription factor, MADS-boxPROSITEPS00350MADS_BOX_1coord: 3..57
IPR002100Transcription factor, MADS-boxPROSITEPS50066MADS_BOX_2coord: 1..61
score: 32.477909
IPR036879Transcription factor, MADS-box superfamilyGENE3D3.40.1810.10coord: 14..109
e-value: 1.9E-29
score: 103.5
IPR036879Transcription factor, MADS-box superfamilySUPERFAMILY55455SRF-likecoord: 3..80
IPR002487Transcription factor, K-boxPFAMPF01486K-boxcoord: 88..171
e-value: 2.7E-19
score: 69.1
IPR002487Transcription factor, K-boxPROSITEPS51297K_BOXcoord: 87..177
score: 12.969662
IPR033896MADS MEF2-likeCDDcd00265MADS_MEF2_likecoord: 3..78
e-value: 1.56593E-42
score: 136.143

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0016035.1Tan0016035.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0009838 abscission
biological_process GO:0080187 floral organ senescence
biological_process GO:0010150 leaf senescence
biological_process GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
biological_process GO:0009909 regulation of flower development
biological_process GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005634 nucleus
molecular_function GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity
molecular_function GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
molecular_function GO:0003677 DNA binding
molecular_function GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity
molecular_function GO:0000977 RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding