Tan0015680 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GATTAATTTATTGTGAAGTTGAATTATTCTCAATAATCTTCCTCATGGTCGTCCTTTTCAACTCTGTCGTAGTTTTTTTTTTTTTGGTCAGAATATCCCATTAATACGATGGCTATCCCAATCTCTTGAATTTCAGCATTGCCTTCAAAATTTTCTACTTTCTCATCCTTGGTTATTTCTGTTGGATGCACTGTGACTACATATTAATCCTCCCTCCATAATCCTATCTGTAACTGATCAAGCTTGCAATTTCCATGTCCATGGCGTATTCGTCTTTAGGTTTCATCTTTGCTCTTTGTGCCATTGCTTCCATCTTCACCCACCTGATTGTTTTGTCTCAAGCTCAGAATTCAACTCAACCCATCACTGATCCTGATGAAGGTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTTTTCTTTCCCACCTTCATTGTGTTCTCAGAGGAAAAATTTTGACCTGAAAGAAAAGCTGCTCATCTCTGGTCTCTTGGATCACGTTACAGCACAGTTCACTTTTCTTATACACAACCAAAAAACCCACTTTGAACCTCTGATTTCACACACCAGAATTAAGAAACAGTATTCAATTCAATTAACCTCTTTTGTTCTGTTCTTGAATTGGGTTTATATTCATCTCTGTGAGGATCACCAACCAGTAGATATAAGTCTGAAGAATTTACTCAAACAACTGCATTGGAATTGATTGATTCTGACTTCGGAGTGAACTTTTTTGCGTGCAGCAAGAGCTCTAAATTCCATATTTAGACAATGGCGTATATCGGCGCCAGCAGGGGCGTGGAATATAAGTGGGAATCTATGCAGTGGGAGGGCAGTCGACACTACCACCAACGTCGATGTTGGTGGAAACCTCAATCCTCTTATAAAATGCGATTGCTCAGCCAACAACGGTGCCACTTGCCACATTACTCAAATGTATTTGTCTCTCTCTGTCTCTTTCTGCATCTGTCACATTGCATTTGACGATTGTTTTCTTTTCGCTTGCCTTAAGCATTCATGTTCCATATGTACCATTATTATGGCAGCTTGAGTTTCAGTTGTGGAAATCCTGAATCAAATTGATGAATAAAACTAATCTATAGGTGGGACGTTCGTTTTTGACCACTTTTTAGTGAACCCATTCACTCAAGTATTGACATACATGGACCGCTAGAAAAATAGGAGGTGAAATGCAGGAAAATATTTTGTATATCAATAATTTTGCTATAGTCATCGGATAGAAAGAATCAGTTTTTACAGAAGACTAATCCCGCCATATTGCTTGCTTGTTTAGCACCTAGACAAACCTGGTTGATCGTAAGTGTATAAAATCTGTTTGAAAGAAAAGATCAGAGAAGGCCAACAAGAGCATAGCTCAACTGGTATTAGTATAACTCATGATCAATAGGTCATGAGTTCGAATCCCCCACCCTCATTGTTGATGTACTCAAAAAAAGAAAAGATTAGAGAAGAGCATATTTGTTCTCATAGCAAACTAGTGTTTTTTGTTTTCTTTCATATTTTTGTTGGAAATTCATTATATATATATGATTTTGCAGGCACGTGTATGCAATAAATGTTGTTGGTGTACTCCCACCAGAGCTATGGACATTAACTTCCCTCACCTATTTGTATGTTTTCTTCCTTGTACACGCACACCCATAAATTTTTTAATTTTTTTAATAGAATATTGGAGTGAATAATTTGAATCTAAGAAGTAGAGATGCCTTAACTGCATGCCTATGCTCATGTTGACGTATATAGTGGAGGGTTTTTACTGTTAGCTCACGCAATTAAATTGAACTGGATTTTTTTTCTTCAGGAAGTTGGATCAAAATTTCTTGACAGGAACGCTATCTGCATCTGTTGGTAATCTCACACAATTACGAACCTTGTAAGACGATCCATACCTTTTTCTAGAGACCTCAATAGAGATGATATTATATCAAAGATCAACATTAAGAAGTTTCATCCTTTTTCTAATTTTAATCAAATTATGATTAGGAGCCTTGGCATTAATGCACTATCAGGGGAACTTCCGAAGGAACTTGGATCTCTTACTAATCTGACTCTGTTGTAAGTTATCTGTTTCTTTTCAACTCTTGAAGGCGTCTGAATGGCTAGCTGATCGTGTTACTTTTTATTAAACCTATGAAGCTGACCTTTTCACTTAATTTGTTAATTACATGAGATATTTTCTATGCCTCAAGAACCTAAATTCGCACAGATGCTTCTGTTTTTTCTTATTTATGAACGGGATTGATGAAACTGGAGTGGAACTTTCAGTAGTGCAGATGCAGATCATTAGCATCATATGTCATGCAGCTGTATATATTTCATATATTTAACTGTTGTATCTTGACTGATATTGTAGGGCATTCGGGTCCAATAATTTCTCTGGTTCCTTACCACCAGAACTTGGAAATCTTTCTATGCTAAGGGAACTGTAAGCTTTTCATTTTCATTTTGGTTTTTGGTTTTTTGAATTCTCATACCTTTTTATATCTATCATGCGTAACTTATGCTTATGGGGATGCCTCCACTAGACTGCAACAACTAAATCTGAATTTTTGGTATCAAACCTTTTAACAAATGGGATAAAAGTTATTTCTCAGTTTTTATATTCAGAATATTGTTTTTTTACGTAAGAAACCGAACTTTAATTGAACAAATGAAAAAAATGAGAGCATACAAAAAACACGCTTGAAATAAGCAGGAGTCCAAAACTAACTACAAAAACGTTCTCAAATCCAAAAGAACAAGACCAAGGTCATAATTACAAAAAAGCCTAGTGACAACGCCCATAAAGAGGTATTGAATCTAATAGTTTCCCAAAAATCCTCACACAATTTCTCTTTATCTCTAAAAATCCTATTGTTACTCTCAAGCCAAATACCCTACAATGCTGCAAAGAAGCTGGCTTGCCACAATACTTCACCTCTCTTCCTAGAGGGAGGATGCAAAAGCATCTCCTCCAATATGGATCACTGATCTCTATTGCACACCCCACTGACTTTGTATTAGCTCCTCCAACGATCCCAATGGTTGTTAGCAAATTAGCACTCCCATAGAAAAATGAGATATTCATTATATTGTTGGATATTCCGTTGCCATAACTCAAGATTTTGATGATTGCCATACGCCCGAACCAAATATACCATGATCTTTTTATGTTTACCAGACATGAAGAAAGACGACTTGCTATTATTGACAGAATGCTCATGTTAAAACTAACTCTTGTACAAATACTAGGAATTACCCTCAAGGAGCAACCCCGTTGGCGTTGGTAAGGGCTTTGAGTCTCTTGGTCATATCAGCTTAGAGATCTCAGGTTCGAGTCCTCGAGCAAGCTTAATAAATAGAAACCCTTGATGTATTTTGGGTCCGGGCGCCTCCGAGTATAGGGAAGCGAAGCTCCGACACTCGGTTATAAAAAAAAGTAGGAATTATATCCCATTTGACATTCATCAATTTAACACTGAAAAAGTTTGAAATAGAATCTCACATGTTGAATTTTTGCATACCTAAGTAGATGTTTGAGAGCCAAACTTACCGTTAATAACGTTGGAGACATAAAAGAAAGAAAAGACTGAAAACTAAAACAACGTTCATGAAAGAAAAAACTCATCAATCTTGGGTTTAACTTGTTGGGAGAAAAAATAATAATTATAATAATAATCACAATAAATTATTATAATATTAAATCTCCCTTTTCACAGGAGAAGCCAACCAAATCAGAGTCACAAATAATAATAAAGAGATAGGAAAAATAGAACGACATCGGAGTTTATAATGGTTTGTCCCAAACTTGGGACTATGTCAGTTATCTGCAACTGTAGGTTCTACTATAATAGGAGATTACAAGAAGCCTTCAATTCTGCGCTACAAGCTAACCTCCAATAGCCCAACAAAGACTACTGACTTGAAGTACCACGAACCAGTAGCTTGGAATAAGCAAAGGAAAATCCTTCAAACCCACAAAGGAAAAAATACTCCTTCTCTCTTGATGCACCGTCACACTGCGCAATTACACACTAGTGTAAACTCTCGGGTTTTCAACAAAAAAAACTGCAGCGACCACACTAGAGAAATACATTATAGTTTATATATGACCTTGAAGCAACCTAGGCACAAATGGGCTTTGGCCCATTTGTCTTCGACTCCTTTTTTTTTTCTTTCATGCGTCAAACTAGGGGTGAAGAATGAAGTTATTTTGGCTTCACTTGAACAAAAACCTAACATGACTCATAGTACTTGCCCATTTGTGATCATGATCATGATCATTTTATTTTAATTGTGAGTTTGTTGATGCAAGAATCTTAAATTGTAATTTGACTTTGGGTTCCTTTATCTTGTGATATGTATGTATGACTTGTGAGCATGCTGAAATGTCTAAATGAATAGATTTGTCCTGAGTTGCAGTCTTTTATTATAACTTGGGTTTTGATACACTTGGTTGTGGTGATCTACCTTTACTTTGCCTTGCACTGTTTCATTATACTGATAATTTGTTAATCTTGTTTGTCTCAATAGATACATTGATAGCTCTGGAGTTTCTGGTGATATTCCTCAATCATTTTCAAGTCTTATAAACTTGCGTACATTGTAATCCATCTGTCTTTACTTTTTCCTAACTTTTATCAGCCGAGAATGAATCATTTAGATATAAAGCTCTCTTCTGAACAGATGGGCATCAGACAATGAATTAACTGGCAGAATACCTGATTTCATCGGAAGTTGGACAAGTCTTACATCTTTGTAAGACAATTATATTAACCTGTTCCTTCTTACCTCTCCCCCCACACACAAAAAAAGAACAAATAATGATGTCTGTTTGCCTAAGCAACGGCTGAAGATTTCAGTATGATGAAAAATCTCATTAAAGACTATTTTATTTACTATGATATGCAAAAGGTTGGGTTTACTTGCAATTTCTAGTAAAGTTGAAGATCTGTCCATTTAAGTTATCTACTTACTTTTGT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Homology
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGH3 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g56140 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1264.2 bits (3270), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/1017 (63.42%), Postives = 780/1017 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGH2 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g56130 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1259.2 bits (3257), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/1013 (63.28%), Postives = 781/1013 (77.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG8 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53430 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 733.4 bits (1892), Expect = 3.5e-210 Identity = 423/975 (43.38%), Postives = 591/975 (60.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGE0 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g07650 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 728.8 bits (1880), Expect = 8.7e-209 Identity = 412/933 (44.16%), Postives = 576/933 (61.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG9 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53440 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 728.0 bits (1878), Expect = 1.5e-208 Identity = 411/949 (43.31%), Postives = 583/949 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. NCBI nr
Match: XP_023553977.1 (uncharacterized protein LOC111811393 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1855.9 bits (4806), Expect = 0.0e+00 Identity = 926/1037 (89.30%), Postives = 976/1037 (94.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. NCBI nr
Match: XP_022147911.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 926/1028 (90.08%), Postives = 971/1028 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. NCBI nr
Match: XP_022952108.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 921/1032 (89.24%), Postives = 971/1032 (94.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. NCBI nr
Match: XP_038888006.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1844.7 bits (4777), Expect = 0.0e+00 Identity = 922/1035 (89.08%), Postives = 980/1035 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. NCBI nr
Match: XP_022968871.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1843.2 bits (4773), Expect = 0.0e+00 Identity = 918/1028 (89.30%), Postives = 969/1028 (94.26%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3S4 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016727 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 926/1028 (90.08%), Postives = 971/1028 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJJ5 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454871 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 921/1032 (89.24%), Postives = 971/1032 (94.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HW24 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1843.2 bits (4773), Expect = 0.0e+00 Identity = 918/1028 (89.30%), Postives = 969/1028 (94.26%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HYE4 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1840.1 bits (4765), Expect = 0.0e+00 Identity = 919/1029 (89.31%), Postives = 970/1029 (94.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGN1 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489643 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1805.4 bits (4675), Expect = 0.0e+00 Identity = 901/1035 (87.05%), Postives = 964/1035 (93.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. TAIR 10
Match: AT1G56140.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1264.2 bits (3270), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/1017 (63.42%), Postives = 780/1017 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. TAIR 10
Match: AT1G56130.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1259.2 bits (3257), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/1013 (63.28%), Postives = 781/1013 (77.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. TAIR 10
Match: AT1G56120.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1238.4 bits (3203), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/1008 (62.50%), Postives = 762/1008 (75.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. TAIR 10
Match: AT1G56145.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1219.5 bits (3154), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/1010 (60.59%), Postives = 771/1010 (76.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015680 vs. TAIR 10
Match: AT1G56145.2 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1205.3 bits (3117), Expect = 0.0e+00 Identity = 613/1037 (59.11%), Postives = 770/1037 (74.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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