Tan0015429 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCGAAATATGAATTTCCAAGGCTTCCACGGGCAGATATTGCGTTGCTACTAGCACAATGTCAAATTGCTGCTGTAACAGAGCGGGACCTCCTTCACCCCTCACCAGATTTGGTTTCAGATCTTTACACACGTTTGATGATATACCTCGACTTTCTCCATGAGTAAGTCCTCGACTTATAGCCTTTCCATCAACAAGTATTTGAAATGATTTTGATAGACCCCAATTACGTAATTGTACACCCGTTAGAGAGGGAAGAAGGGTATGGGTATGAATTAAGTTTGTTTGAGTGTGGGGCCCAAGTTTGTGTTAGTTAGAGGGGCCAAAGTGTAGGGTTTTTTAAGGGAGGTTGGTTAGAGGAGAGGAGTGTCGTTTTGCTATTCTGTTATTTTGGTATTCTCTGAGAGAATTGGGAGAGGTGGGAAGCTCTCAAAACTCCCCTTTACACTAGTTACCGTCATAAATAAAATTGCTAAGGCTAGCCTATCAGATTTCTGAAAGAAAGGAGAAAGATCAAAAGTTAATCTGTATGTTACTTGTTTTCTAAGAATTCAAATTAGAGATTCCGATGTTGAAAAATTAAAAATGCGTTAGTTTAGACATGATTCATAGGCCTTCTTATAAGCACCCTTTATGACGTTCTTTTATAACTTCCATTGGAGCAAAAAAGTGGTTTATTTATTTACTTAGAGAAGGAAATTATGATGTAATCATTATGTAAAAGTTCTCTGCTTTTTTTCATCGTTATGGTTGTTATTTTGGTTCAATAGTTGGTTAAACCAATAATTAAGTGCCCCCAACTTCTTGCTGGTGAAGGAATAAAATGACGCTAGACTTCAGGGTGCTATACTCAACTTATAGCAACTTGTTGTATCAATCAATATAATTTTGTATCAATCAATATAATTTATGATCACGTGACCACAATTTAACATACCTTTGCAAGCCTACCAGAGTCACGAGGTCCTCCCCCTACAAGAAATGTATGGAACTCAATTAAAACCAACTCCTAGATCAAATAACCTATTGGAAAAGGGAGGGGGTGAGAAGAAGGAAGTATTTAGCTTATGGTAATGTATTAATCTAACATGAAATTCACTGTAACCCATCCCTTTAAGCTTTTGGCTCTAGTGAGGTTATATGGTCAAACTCTTGTAATGTCAGTTCTTTCCCCATTAATGTTGATATCCACTTGTTGGGTCTTCTACAAATTTTTAAGCTCACTAGTGAGGAGTTTTAAAGTATCTATATAATTTAAATTACCATAACCATCCATTAACTTAAACTTTTGAGTTGAATGATGATTTAATAAAAAGGATACAACCTACATTTTCCTTGGACGTTCTTGAGGTCTGTTATTAGAAAGGTACACTCAAAATTTTAGTAAGGAAAGACATATCCATTAGTCCTAGTTTGTTTTATTTGCCACAATGAAAGATATGATAAAAAAGTTTGTCGTTTGGATTTCCTCCCCGGTGGTCTTCGTTTGTTCTGTCTTGCTAGGGTCTACTCTTTCGATTGTTTTACTAGGATATGTTTATTCGATTGACATCGACAGGGTTGTGCGGCTTTTTCTATTGAATTTCACAGGAATATCAGGTAGCTGTGGTAACACTACCGGTTAGTTTCGTCTTGGGGTCCCTTCGTATTCGTGTTCGTTGATAGTATCTGCATCTATTTTCTAAGAGTTGAATTCCAAGTAGGTGTTTAAAAGCCTCTCTCCTCTCCTCTTCCCTTCCTCGGTTTTCCCCCTTCGTTTGCCTTCTACGGTGGTACTGCGGCCTGCGGGGCTGCCTTTCCCCCTTCGATTCGCTCTGGTTTAAGTAAGTGGCTCGGATTATCTCCACTTATGGATGCTAGAAGTTGTCATGTGGATAGATCCTCCTTTAGCATGTGGAGTAATGGTAGTTTAATATTTATCGGGGATTCTTCAAAGGGACTTTTGTTACCTCTGACTTGGTCATATCTTAATTGGTTTGCTAATGCTTTTGAAACTCTGGTTAGCTCAACATTTGAATCCTTTGATCGTGACAAGTTCAGGGACAAGGACGATACTCTTGGTCTCTTTAGGATCCGCCAGTCCCTTCAGCCGGTGGTTCAGTGTGTTGTTTGGCATCCATGTGGGGGGAGAACTTGTCTGGAAGTTGTTTTGGGCCCCTTTGGTAAAGGGTGGATGGTTTTTCGGGACATGTTGGTGGATTTCATCAAATCTAAGGCTGAGTTGGGCCTCCCCCAGGCCGGTGGGCAACCTTGCTTCAAGGAAGGCGGGACAAAATCTGCAGTTAAAGAGTTTAATAAGGAGTTTTCCGTCGATTCATCCATGGCCGAAGTCAATCCTCGGAGGGCCCTTACTGATCATTCCTTTTGGGTAAGAAAAAATAAGGAGGTGATTAAAGTAGATTTCAAGAGTTAGTTAGTTATTTCTCGCATGTTTGCTCATACTGCATGGATGGAGATTAAGGAGGTTGTCGAAAGCCATTTTTGTGTCAAGTGTCAAATTAACCCGTTTGCGGCTAACAAGGTTTTACTTCTGATTGAGGGAAATATGAAGAAGGTGAAAGGTTGCTCGATTGGAAAATGGATGCAGGTGGAAGATTTTTATCTTAAATTAGAAGAGTGGTCGGATAGTAAGCATTGTTTGCCGGAGTTTATTGCTGGTTATGGAGGTTGGATTTCGGTTTTGAACTTGCCTATTAAGTACTGGTCAAGGGAAGTCTTCGAGGCCATTGGGTTGCATTTTGGGGGTTTAGAGGAAATTGCCTTGGACACTTTGAATTTCACAGAGCTTTCTTCTGCCAGGATTAAAGTTAAAAAAAATATTTGTGGTTTCTTGCCAACCTCTATTGAAGTCAGGGTTGCTCCCCTTGGGACCTTTTATCTCACATTCGGAAATATTGAATTACCTTTAAATTCAATTCGGCGCTTGGTGAGGGGGTGGGAAGAAGAAGGAGTCCCTGGGTCTCTCCTGTCTCTTTGACCTGTCTCTTTTTCCCAAGAAGCTTTAATGAATGTCCTGAATTCTGTGGATGATCAAATTGAGGAGTGATAAAGGCAATGAAGTCTCCATTACTTCTCAATCGATTGATTTCCTTTCCTCTCCGGTGCCTTCTTCGGTTAAGGAAGTCAAGGCTAATTTATGTGCAAAATACTACTCGAGGAAATCGGTAAAGATGTTGAAAGGGAACGTTTTGGCTGAACCACTTTTAGTCAGTAAGGATTTCCTAGAAGAGCCATATCAACTTCTTTTGGGACAAAAGATTGCGTTGCAGCAATTTGGTCGGGCTGATAGGCAGGGTGGTTCGAAATTAAGAAGTCTGGAGGAGGTTTCTTGCAGACCAGAGGCTTCTAAGTTCTTAAAAGTGGTGTTTAGTTTTGCAGTTAAAAAAACATTGAATCCTTTTGGTTCTCCCTTCATTGAGCAGTCGGCTGGTGATTTTAACTCCGAGGTAAGCTTGAGTAGTCCGGAATTTGTTTAGGATTCCTTGGTAGATGACAACGTTCAAGAGGATTCTCCTTTGGGGGATTTAAATAGGCTCTTCTCTCCATCTTGTGGTCGCAATTCACAGGACTATCCAGTGGTTAATTTGGAACGTCTCTTTGCTTCTCCTTCTGATAATTTGTCATTGGTGGGTGAAAAGGAAGGGTGTGCCATTGATGTTCCAAGTGAATTGGCTCGGTTTGAATCCCTTATAAAGCCAAGTGGGTTGCATTTAAAGAAGTTGCAGTTGGTGGTCGCTCGTCCACGGTGTGTTGAGGAAACTTCTTGGGATACAAAGAAAGAGTAAGTTTGACAAGATTTTTGTAGAAAGTTTGTCCGGATGTGGTGTTGTTCAAGGAAACCAATTTGGAAGTAGTTATCGTTATGGTGACCAATTCTTTTTGGAGCTCGAAAGAGGTTGGGTGGGTTCAGGTGCAAGCCTTTGTCAGGTCGGGAGGATTGCTTTCTTGTGGGGTTGTGGTTAAGATATCGGTGGAGGTAGTGTTGTTAGGGGCTTTTCCTTGTATGGGGTTGTGCGCTCCTTCTCTGTTGGGTTGCATCTGGAGGCAGATCCGGGTTGATTCACCCTGATTTGAGCAAGTTTGTTGTTTTGATTAAAGTTAGGAGCGTTCGACAAGGGTGGTGGTTATTGGGGTTGTTTAGATGCTTTAATTTTGGTTCTTTTGGACATTTTCTGTTTGTTGTATTTTGAGCATTAATCTCATTTCATTTTATCAATGAAATTTTGTTTGTTGCCTTGTCAAAAAAAAATCAAAGATATGATAATTTTCTTAGAACTCAAGGATACAATTGTACAACCTACCAACATAGCCTGTTCAAGTAAGTTCGTAGGAAAGATCTGATAATTGTGTGAAGTGCTGCCTAGTATGAAAAGTATCTAAAGGACAGTAGGTACTGGTTTGTACTCAGTCATCAGCAGCCCTAGAAGGTATAGAAGAAGATCTTTCCATGCGCAACGTTGTTGGGTTACCAAGGACTCATTGTAGTGTACATTGGGTCTTTATAGTGGTGGATCATTTTAGCAAACAATCACATCTTATTTCCCATTAGCTGGTCATTTGGTCTTGCGGTAAGACATCAGATGCTATAAATATTGCCAATCTATTTGTGATTTGGCTGGACTTCATGGTTTTCCTAGGTTCATCACAATGGATAGAGATGATAAATTCTTGAGCTACTTTTGGAAAATATTGTGGCATAAGTCTTATATTACAAGGTCAACGCTACTTGTTATCTTCACTTGCATGGACCAAATGGAAGTGACAAATGGCTTTGGCGATTCTATCATAAACCCGACACTTTATGGCACAAGGTCATAGTAAGTGTGGCCCCCACCCTTTGAGTGGACTGATGGGGGGATTCAAGGCACTTCTAGTAACCCGTGGAAAGAGTTTTCTTCTGAGTTTCCTATTACGTCTCAGTTTGTTCAGTGTGTTGTGGGGGACGGGAAGAACACTTATTTCTGGGAGGACCAGTGGGTGGGGGATAGCTTCC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BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXJ0 (Kinetochore protein NUF2 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUF2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 8.4e-99 Identity = 204/437 (46.68%), Postives = 295/437 (67.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10173 (Kinetochore protein nuf2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=nuf2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 4.2e-05 Identity = 89/420 (21.19%), Postives = 181/420 (43.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CP41 (Probable kinetochore protein NUF2 OS=Cryptococcus neoformans var. neoformans serotype D (strain B-3501A) OX=283643 GN=NUF2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 4.6e-04 Identity = 89/445 (20.00%), Postives = 172/445 (38.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CP40 (Probable kinetochore protein NUF2 OS=Cryptococcus neoformans var. neoformans serotype D (strain JEC21 / ATCC MYA-565) OX=214684 GN=NUF2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 4.6e-04 Identity = 89/445 (20.00%), Postives = 172/445 (38.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6C3V4 (Probable kinetochore protein NUF2 OS=Yarrowia lipolytica (strain CLIB 122 / E 150) OX=284591 GN=NUF2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 4.6e-04 Identity = 80/413 (19.37%), Postives = 171/413 (41.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. NCBI nr
Match: XP_022989268.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita maxima] >XP_022989269.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 8.2e-200 Identity = 378/439 (86.10%), Postives = 400/439 (91.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. NCBI nr
Match: XP_023529466.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023529467.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023529468.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 8.2e-200 Identity = 378/439 (86.10%), Postives = 401/439 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. NCBI nr
Match: KAG6588803.1 (Kinetochore protein NUF2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 706.4 bits (1822), Expect = 1.4e-199 Identity = 377/439 (85.88%), Postives = 401/439 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. NCBI nr
Match: XP_022927739.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >XP_022927740.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >XP_022927741.1 probable kinetochore protein NUF2 [Cucurbita moschata] >KAG7022576.1 NUF2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 706.4 bits (1822), Expect = 1.4e-199 Identity = 377/439 (85.88%), Postives = 401/439 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. NCBI nr
Match: XP_022157479.1 (probable kinetochore protein NUF2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 669.8 bits (1727), Expect = 1.4e-188 Identity = 365/439 (83.14%), Postives = 386/439 (87.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNW1 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 3.9e-200 Identity = 378/439 (86.10%), Postives = 400/439 (91.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIG6 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434552 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 706.4 bits (1822), Expect = 6.7e-200 Identity = 377/439 (85.88%), Postives = 401/439 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWL1 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024175 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 669.8 bits (1727), Expect = 7.0e-189 Identity = 365/439 (83.14%), Postives = 386/439 (87.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KNL7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G488740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.4e-176 Identity = 349/439 (79.50%), Postives = 372/439 (84.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5E4 (probable kinetochore protein NUF2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503319 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 627.9 bits (1618), Expect = 3.0e-176 Identity = 348/439 (79.27%), Postives = 373/439 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015429 vs. TAIR 10
Match: AT1G61000.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: mitosis; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinetochore protein Nuf2 (InterPro:IPR005549); Has 50972 Blast hits to 29793 proteins in 2070 species: Archae - 902; Bacteria - 7404; Metazoa - 23628; Fungi - 4156; Plants - 2312; Viruses - 158; Other Eukaryotes - 12412 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 6.0e-100 Identity = 204/437 (46.68%), Postives = 295/437 (67.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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