Tan0015233 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTTATCTTCATTGGTAGTCTTGGAGTTGGAAACGTTCTGGTCTCCCGCTCCTGCCTTGTTCTGGTTGCTTCCCCGAGAATGGTCGTTCCTCTCTTTAATCTTGCTGCGGATCTCATAGTTTCAAGGCTCTGCTTCGGTTCGACCTCGGTTCATTTCGAATATATCCCTTGCTTCTTACTTTGCAATCCTCTAGTTCCCTACTACCTAAATATTCATCATTGCATTTTCACAGGTACCATGACATTCGGCGAGCAGAACTCTTTATTTCAGTCATTTCGCCTCCTCGACCAAGCTTTCGATGCCGGCGTCAACTTCTTCGATTCAGCCGAGATGTATTTTGGCCCCGCCCTCTTCTTCTAGTCGAATGGAATCTATGATGTCTACACTTTTCATTGCTATAGATTCTCTAGAAAAACATTTTTCATTACTATAGAATTCTACTTCCAAGTTTTTGTTTGTTCGTTCTCTATATGCACGCTATGCGCAGGTACCCAGTGCCTCAACGTTCTGAGACTCAGGGGAGGAGCGAGGAGTACCTTGGCCATTGGATCAGAAGCCGGAAAATTACTCGAGATCGAATTGTTTTGGCTACAAAGGTTTGTCTGTGTGTGTGTGTGTTTTCCGTATCGCTATATCTCTGCCATTTGGCGAAGGCTACTTAGGCAATTGATTTTATTTCTTTATTTATTGTTATTTTTTATTTTTTATTATTGTCGTTGTTGTTGTCTGTTGTTTGCTTCGTGATTGGCAGCAATTCCACCATTCTAGAGATTAATTATGGATTTAGCTTTTGTAACCATCCTTTGGTCAATGTAAAGGCATAGAAACTGTGAGCTATTGAGCTGTTTCTTAGTGTGTTATTTCCTTTTAGTTTGTCTGTTAATAATATACAACTAACTCCGTTGAGCTCAGTGTAGGTAGTTCATAGGTTGTTCAACTTTAGTTCTTTCTACAGAATAGGTACTTAATAGCACAAAGAAAAGGTAGAGAGAGATTGTACAATCTCTGTGATATTTTTCATCAAGAAAATCACAGAGAGCTCTTTTATAGAGCTTAATACAATCTGCTTGACAACTAATAAACTGAAGCAACAATATTAGTTAACTAACTTAAAGTAGTTATATTAGAACAGGCTCTATTACACCCCCTCAAACACATGATGGGAGAAAGCCACGAGTTTGCCTCTTGTAGATAAAAAAGCCTGAGTTGGCAGGGCTTTAGTAAACAGATCAGGAAGTTGGTTTTTCGAGGAAACAAATTGAACACATATATATCCTCATGAACAACTTTTTCATGCCTAGAATGATAGTCTATTTTGATATTCATTATCCAAGCATGGAACACAGAGTTACTGTCGAGATATCGTACAGATGTTATCACTCCACAAGATAGGAGGATCCTTTAAGAACACATTTCTTCAATTTCGGTGCCCAACCCTCCTTCCTCCGTCTGTCTCCTTGGCTCGCGCCGATACCCTACCTTCTCCGTTCCGCCTCCCGCCCCTCGCCGGAGTCCCCCTCTCTGGCTTCGCCCTTGGTGTTTGATTCCGTTTCGTTTTTCTGATGAGAATGGGCAGCTGTCGTATTGGGAAGTCGGAATTTAGTATATGGGGTGACTCGAATTCCTTCTTTCTTCAAGAGGGGACTTGCAACCAACCGATTCCGTTGTCTATCGACCATGTGAATTGCTTCCATGGCTGGTTTTTGGCTTTGCGTATGATATAAGGTCTTTCTTTCAAAGGAGAAAGTTCAAGGATGACGCTGCTACACTTGGATTGTTCAAGGCTAGAAAAAGGTATGGTTGGGCTGCAATGGGTATGCTTTGGCCTCCTCCGTCAGAGGTCGATGGGTCTTCACGGTGCCCCTTGGCTCCTTCTCTACGGGTTGGTTGGTGTTTCGAGACATGTTGGGTGATTTTCTTCGGATGGTTGCTACCCCCCACCCACCTTGAATCTGTCTGTTGCGGGTGTAAACACAACCTCTAGGCTCGACTGCCTCATTGGATCTCCCCCTTCCCTAGGTGTCGAGATGGCCTACGATGCGGCTCAGGTGGAGCAGTGGATCTGTAAGGCTCAGGAGATAGTTCAGGTGGATTTTGGCAGAATTTGGTTCGTGACTAGACTGTTTGCCCATGTCAGTTGGAAGACTATCAAGTATGCCTTGCATTCTCATTTCAAATCCAGTATACAAATAAATCCTTTCATGAGCGATAAGGCTTTGGTTCTCTTTGGGGAGGACCCTATTGCGGTTATTGAAGGTCAATGGCAAATTATCCATTGCCTTCACCTCAAGATTGAAAAATGGGATGACAATCTTCATAGTTCCCCTTCAGTTATGATCAGTTATGGAGGGTGACTTGCAATTGATAATCTTCCTTTGAGATTATGGAGGAGAGAGGTATTCGAAGGGATTGGATTCCATTTTGGAGGTTTAGAAGATATTTCTTTGGACACTTTGAATTTCCTGGAACTTTCAAGGGCAAAAATCAAGGTTTCCTCAAATTTCTGTGGGTTCTGGCCAAGTATGATATTGTTCACTTTGGGTATCAACCCTCATGACTTTGCTTTTGGTTCTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGATAATTGTCCTCACTTATATACCCATGATCAATCTCTTCCCTAGCCAATGTGGGACTTTTGTTTGCACACAACTTCAGTTTGTCAACAGGAACGGTCTTGGTAAACATATCCGCTGGATTCTGACTTCCTGGAATCTTTTCAAGTACCAACGCTCCATCTTCCAAAACTGATCTGATAAAATGATACCTCACCTGTATGTGTTTCGTTCTCGAATGAAACACTGGATTCTTTGCTAAATGAATAACACTCTGACTGTCACAATGCAAAGTCCCCTTTCCCAGTTTCAAGCCAAGTTCTTCTAAAAAAGACTGAAGCCATATCATCTCTTTACTTGCTTCAGTGACAACAACATACTCAGCCTCTGTAGTAGACAAAGCTACTATCTTCTGCCGTTTAGAAACCCAGCTAATAGCAGTATCACCCAAAGTAAAAACATACCCGATAGTACTTTTCCGGCCATCTGTATCACCTACCATATCTGCATCTACATAACCCTGTAGTTTAAAATCTGACTTCTTAAAGTGCAGAGCATAATCAGTTGTCCCTCTTAGATATCTGAAAATTCACTTCACAACCTCCCAATGCTGCTTCCCTGGATTAGTCATATACCTACTTACAACCATGACGTACATTAGGCTACCTATAGCTGAAGCATATGACACTCTAGCTATGTGATCTCTTTCCTGCTCAGTAGTGGGTGAGTGCTCCTTAGATAATTTAAAATGACAAGCTAAAGGAGTACTCACAGGTTTTGCATCTTCCATGTGAAATCTGTTCAAAACCTTTTTCACATATTCTTCTTGTGACAATGTCAATGTACTATCTTTTCTCTTAATTCTCATTCTTAAGATTTGTTTTGCAACTCCCAAATCTTTCATATCAAATTCTTTAGATAATTCAACCTTTATCTTCAGAATTTCCTGCACCTGCTACCAAGATATCATCAACATATAGCAGTAAAATAATGCATGAGTTACATTGGGACCTTATGTAGCAACAGTGATCTGCCACTGTTGCACATAAAACTATCAAACTTCTTGTACCACTGTCTGGGAGCCTGTTTGAGACCATACAGGCTTCTCTGAAGTTTGCAAACCATTTTCTCCTTCTCCTGTACTGTGAAACCCTGTGGTTGTACCATGTAAATTTCTTCCTCCAAATCACCATGAAGAAAAGCTGTCTTTACATCCATCTGTTCCAGAAACAGATCATCTTCTGCCACTATTGACAACACAGTTCTAATAGGAGAAAATATTTCATTAAAGTCAATACCTTCTTTCTGTTGAAAGCCTTTGACTTCAAGCCTTGCTTTATACCTTTTGCAACCATCAGACTCTTGCTTGATTCGATAAACCCATTTGTTCTGCAAAGCTTTCTTACCTCTTGGTAACTCAGTCAGTTCCCATGTCTGATTCGTCATAAGAGAATCCATCTCATCCTTCATGGCCAACTCCCACTTGACAGAGTCTTCCAGTTGAACCGCCTCATCATAACATTCAGGTTCACCTCTGTCAGTCAATAATATATAGTTCAAAGTAGGGGAATACCTCTGTGGTGGTCTGATAGTCCTGATAGACTTCCTGACTGTTGTAGGTGGCGTTCTCTGGACTTTATCAAGCTCTACAGTCTGCTCATTTGGTTCTACAACTGGTTCCTTAGATTCCACAACTGTTTCTTCAAGAGTAACTGTATTCTGATTTTCAACTCTCACTGTCCTGGTCTCAACTTTAGGAGGACCTATCTACTGAGTCTTCTCTTCTATACTTTCATCTGACTCTGTATTAACTGTTGTTCTGTTTTTGTTCAGAACTTCTTCATTGAAGATCACATTCTTGCTTCTGATCATCTTCTTATTTTGGTCATCCCAAAATTTATAGCCTATCTCAGCTCCACCATACCCAAGAAACTAACACTTCTTGGATTTGGCATCTAGTTTACTCCTATCTGCAACATCAATGTGAATGTAAGACAAACAACCAAAAACCTTTAGATGAGAAAGGTTTACAACCCAAAACCTTTAGATGAGAAAGGTTTACAACCCAAAACCTTTAGATGAGAAATGTTTACCTGTTTACAGCTCCAGACTTCTTCAGACAACTTGAAATCTAGTGATGTGGTCGGACTCCTATTGATCAGATAGGTCGCCGTGCTGATTGCCTCTGCCCAGAACATCTTAGGCAATCCTGCATGTAATCTCATGCTCCTGGCACGCTCATTCAGTGTCCTCTTCATTCTCTCAACCACACCATCCTGCTGCGGTGTCCCTGGAATAGTCTTTACCATCACAATTCAATTGTCTGCACAGTATCTTTTGAAATCCCCATCAACATATTCACCGCCGTTGTCTGATCTCAAGTTTTTAACTTTCAGACCTGTCTCATTCTCAACCATAAC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BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0A9T4 (Protein tas OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=tas PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 5.9e-72 Identity = 146/349 (41.83%), Postives = 222/349 (63.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0A9T5 (Protein tas OS=Shigella flexneri OX=623 GN=tas PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 5.9e-72 Identity = 146/349 (41.83%), Postives = 222/349 (63.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P40690 (Aldo-keto reductase (Fragment) OS=Babesia bovis OX=5865 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 6.6e-39 Identity = 104/286 (36.36%), Postives = 159/286 (55.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O05408 (Uncharacterized oxidoreductase YrpG OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=yrpG PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 141.7 bits (356), Expect = 1.6e-32 Identity = 102/344 (29.65%), Postives = 161/344 (46.80%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P77735 (1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase YajO OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yajO PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 3.5e-32 Identity = 113/354 (31.92%), Postives = 176/354 (49.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. NCBI nr
Match: XP_022934446.1 (uncharacterized protein LOC111441623 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 4.3e-197 Identity = 337/357 (94.40%), Postives = 346/357 (96.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. NCBI nr
Match: XP_023526181.1 (uncharacterized protein LOC111789740 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 4.3e-197 Identity = 338/357 (94.68%), Postives = 346/357 (96.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. NCBI nr
Match: XP_022983672.1 (uncharacterized protein LOC111482217 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 691.4 bits (1783), Expect = 4.0e-195 Identity = 335/357 (93.84%), Postives = 343/357 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. NCBI nr
Match: XP_038878182.1 (protein tas-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 5.3e-195 Identity = 334/357 (93.56%), Postives = 347/357 (97.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. NCBI nr
Match: KAG7017894.1 (Protein tas, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 686.4 bits (1770), Expect = 1.3e-193 Identity = 337/376 (89.63%), Postives = 346/376 (92.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1U5 (uncharacterized protein LOC111441623 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 2.1e-197 Identity = 337/357 (94.40%), Postives = 346/357 (96.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J005 (uncharacterized protein LOC111482217 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482217 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 691.4 bits (1783), Expect = 2.0e-195 Identity = 335/357 (93.84%), Postives = 343/357 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U2N4 (Protein tas-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold600G00900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 685.3 bits (1767), Expect = 1.4e-193 Identity = 329/357 (92.16%), Postives = 343/357 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CEZ5 (protein tas-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500122 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 685.3 bits (1767), Expect = 1.4e-193 Identity = 329/357 (92.16%), Postives = 343/357 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAL1 (Aldo_ket_red domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G257070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 683.3 bits (1762), Expect = 5.3e-193 Identity = 329/357 (92.16%), Postives = 342/357 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. TAIR 10
Match: AT1G04420.1 (NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein ) HSP 1 Score: 283.9 bits (725), Expect = 1.8e-76 Identity = 159/355 (44.79%), Postives = 226/355 (63.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. TAIR 10
Match: AT1G04690.1 (potassium channel beta subunit 1 ) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 2.4e-28 Identity = 107/343 (31.20%), Postives = 162/343 (47.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. TAIR 10
Match: AT1G06690.1 (NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein ) HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 2.8e-21 Identity = 95/356 (26.69%), Postives = 165/356 (46.35%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. TAIR 10
Match: AT1G60680.1 (NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein ) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 3.1e-20 Identity = 93/328 (28.35%), Postives = 146/328 (44.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015233 vs. TAIR 10
Match: AT5G53580.1 (NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein ) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.5e-14 Identity = 76/268 (28.36%), Postives = 121/268 (45.15%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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