Tan0013746 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAACTCACAAAACTGGCAGCGAGGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACAGCACTGGTAAGGCGATCGAAGCGTTGGCTGAGAAAGAAGGCCAGTTTTGGAATTTTGCATCAGCTTCCAATTTTACCATTTGCGCGCCCTCTTCCCGGTTTTCAGAATTCATCAGAAAACCAGGAAAACCCCCCACATTCTGCCTGCTATCTTCTTCCCCGAAGCGTCGAAGAGAGTTACTGAGTCATTCGATGGCGGAGAAGCAGTTGATAGTGGTCGTTGAAGGCACCGCAGCCATGGGTCCCTTCTGGCAAACCGTCGTAACAGATTACATTGACAAGATCGTCAGGTATTCCTCTTTAAACCTATCTGTTCTTACATCTCCTTCCTGTTTATTTTAATAATTTCTTGTTCGAATGGGAAAGGAAAGTCAAATTGCGTAACTATGCGTTTCTTATGTTATTGATTGTTTTTTAGGATTTTCTGGAATGTCTAGAAAGCTTCATCTGTCTCTTGACTCGGCAATAGGTTCTAGTTTAGCGAACGGGCTATTATGTGAACGATCATAATCAGTATTTTTCCCCCCAATTCGAAAATCAGACTTAGAGCCCACATTGAGTAACTGACCGAGTCTTCATTTTAAACCGGAACCATATCATACTTCTTGTTGTAACCTGCTTGTCTCGTGATTTCGATACAATTTTGACAATTGATGCTCGAGTCGCCTATTTATTTCTGTAGAACTCACTATTTGTTACCATGTTACCTGGTTTGGAGACATCGTGGTTCATTATTATTTCTATACAGTCGCTATGTACATCTTCTCATTTTGGATATTGGGTGCCCTCTGGTTTTGGTTGACTCAATTGTTTTCTCCTCCAATACTTCAAAATTTGTTTACGGGCTAGGTGTAAAGTTCCATTCTTGAAATTGGAATTTTTCTGGAGATTCATTGCTGTTTTAGTTTGTTAACTACGACATCTGTCTGTTCCATTGGGATGCAATTTTTCTTCCATATTTAGTTCATAAGATTATATCCCTCCCCCCCTTTTTATTGCCAATCTATCTACCTCCTTGTAATCACACAGAATATTATTATTCAAAGTTTGTATATAACATAGTACCAGGATCCTTTTCATTAGCACGTCTCACTTCCTCTCTGTTATCACGCTGTATATTATTCTCTGTGCACAAAGCTGGATACTACTTGAGATATCACTTCTACTGTCACCGTGTCATGGAGTTGTCTAGCATACTGAGAGTTGGTAAGCTGCTACGGAGAATCATATTGATGGTCAGGCATGGGAACTCCTCCTATGCTTGTTCCTCACTATTAGCTGTTGGGTAGAGGATTGGAAGTTATGGACATTAGTTCTTTCGAGTTAGGTTTTCTTATAGTATGTGCTTGTCAGAATGGGTTAGGCAATGCTCTGCGATGGGAGGAGGCTGTTTCTATCCATTTTGGTTGATGTGATATGATACAGTCGGCTACCAAGAGGTGGATTCCAAATCGTGCAAAGTAGTTGCCCGTGTAGACCTCCACATCTATTGTTTTGTATTTCTAGGAGTGGCCCTGGCCACAATGTAACTGGTATCAAGTAAATGTAAAAGAGAGAAAAATCATATGTCACACGGTAAAATAATTCCTGTATATCAACTCAAGGGTTTGCAAGTCTTAAGAATACAAATAAGAGTATCAGAAAAAACTGAACAAGAGTACTTGAGTTGTTTTAGCATTCTGTGAAATAAACTTTTGTGCAATGCATACACTGAAAGAAAGCATGTAGGTTGTTATAGAATATGTACTGTCAGACACCTATCATCGATGCAAACAGTGCTGAAGATTTTATCTTTACAGCTTCATTTGAAAGTTCAGAAATGTTTATTCTTTTATTTTTACTGTTACTTTCTGATGTTAGATATAACTCATTGATAATCACTTTGATGATAATAAGAATATGTTAAATTTAACTTTCTATTTGTGCAGATGTTTCTGTGGAAATGAATTATCTGGGCAGGTATGCCTCTTTCTTTTTGAGGAGACTCGAATATTTAATCCCTAACATTTCATGTATGGAATAATTCTATTTGTTCAGGTTTTGAAATATAGAGAATATCCCAATACCTTTTGAATTCAGCTATTAATCCAGGTTCATAACAGAGGATACTGTTGTAGGAATACTGCAATTGATATATGGTCCTTCCATTTAGATTGATACCCGGTACCTCCATGTTGATACTGGATGAAACTCTTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTGTAGACATCAAAATTCAGGCCTTTATCATTTGTAGGATTTATAGTTAAAGCCGATGTTTCATTGAGATGTGTGATAATTTGATAATATTATGTTTAGTCACTTGGTGAAAGTGTGGGTAAAGGATTTTTAGTTTTCTGTTTTTATAGACGGAAAGCAGACTTACCTGCTTCATGGGAAAAAGCAATACACCGACCAAGATTGCCTTCCTTCCAAATCAGAAGAGTTTCTTTCCGGCCCTTGTCGTGATTCCTCCTCCACACACCACTTTCTCACCGTCCCCCTCCCCTTTCTTCCATCCCCCATTTCCTTTTCACAGACAAGCCTAGCCTTGACCCTCAACCTTTACAACGTTGACTTTAACCCCATTTCTCCACCGTTATTGATCAACAACAAAATTGGGTGATTGTTTTTTTTTTTGAACAAGCATTAGAAGGAATTGAACAAAAGGGGGACGACATGATCGAAGATGATGATATAATCCGCCCTGATATGAGAAAACTAGCCCCTTTGCTTTGGAAGCTTGGTCTCTGTATTACAACCATTCAATCCAAATCAAAGAAAGGAAAATCAACAGCTAAGACAACCAAACTTGTTTGTGAGCTGAAGAATCTAACGTCCATAGTTCAATATGACAGGCCCCCCTCCACCCTTGTCATCGAAGTGTCAACGTAACCTTTATGTTAATCCTCTCTTGGAATGTTCGTGGCCTGGGCTCCTTGAAGAAACGAGCCCTCATCAGGGATTTTCTCCTTGATAACAACCCCACAATTGTCATCCTTCAGGAAACGAAATGTAGCAATATTGGCAGGCATTTTATTAAAGCTGTGTGGAACTCACGACATATTGCTTGGGCCTCCTTAGATGCTTGTGGATCCTCGGGAGGCATCCTCATTATGTGGAATGAACCTTCGATAGATGTTGTGGAGGTTATCGAAGTTACTGCTATTCTTACCCTACACATTTCTCTATCTAATGGATACAACTTTTGGCTTTCTGGTGTCTACAGACCCTCCCGTGCAGCTGATAGAGGTTGTTTTGGAAGGATTCTTGGCTCAATTGTGGACCTTGTGCATTGGCTTTCCCTCGTTTATTTCGTCTCACTTCTGATCCAGATAGCTTGGTGGTTAATCTTTGGAATGAAGCTACTGATGCTTGGGATTTGCAACCTCGTTGTAATTTAAATGAACTGGAAATAGAGGAATGAGCTACTTTATCTCAACTCTTGTCTCCAGTTAGGCTTTGAAATATCCCTGATACTTGGTCATGGCCCCCTGATCCCTCCGGTTCCTTTTCGGTTAGTTCGCTTATGGATTTTCTGGTAGGCGAGTTTGATCCCCTGTTAAAAGATTTGTATACTGTCATTTGGAAGGATCGGTATCCAAAAAAGGTTAAAATATTCCTATGGGAGCTAAGTTTGGGAGCAATAAATCTAACGGACAGACTTCAACGAAGATTGCCTCATATGTCTCTTTCACCATCATGGTGTGTTATGTGTTGCTCTGATACGGAAAGTGCTGGTCATCTCTTAATGCATTGTCCCTTTGCTTCACGGTTCTGGTCTTATATGCTTGAAGTTTTTGGTTGGTGTCAGCCGTTTCCAACCACAACTCCGGAGCTATTATCTTTAGTTCTTGTGGGACATCCCTTTCATGGTCTTAAACAAAGACTTTGGCTTGCCTTCACTCGTTCTTTCTTTTGGACTTTATGGATTAAACGAAATGGTCGGATTTTCAGGGGGGTTTAATCTACTTTTGATAAGTTTTTTGAATCTGTTCTTCTTAATGCTTTCCTCTGGTGTAAATCTGAGTATCCCTTCTCGCTTTATAGTTTATCTTTTTTATTCTCTAATTGGAAAGTCTTCATGTAATTCATCTTTGGTGATTGGAGTTTTCTCCTTTATTTTATCTATCAATGAAATTGTTTCTTGAACAAAAAAAAGATAGAGGTGCCTTATGGGAAGAACTCTATGACCTCTCTCATCTTTGTACTGACCACTAGATCTTGGGTGAAGATTTAATGCTACCAAGTGATCCTTTGAGAAATCCAGCGGCAAGCCAATCACTAAAAGCATGAAACTCTTCAATAATTTTATTAAGGACAGTGGTTTGATTGGGTTCCCTCTATCTAACGGTAAATTCACTTGATCCAATCTCTGCGAAAGACCAGTTTTATCCCTCATAGACTGCTTTTTAATCACTGGCCAATGCATTGATAAGTTCAATTGTGCCCTGGTTAAGCGGCTCCCTCGTGTAACCTTTGACCACTATCCGATTCTCTTGACCCTCGGTCAACAAAGAGGGGGCTTAGTTACTTTAACTTTGAAAATATGTGGATGAATCATCACTCATTTGAACCGCTATTGAGAAATTGGTTGAGCAGCTACGGGGATGGCCTGGTCATGGTTTCATTCAAAAGTTGAAGGTTCTAAAATGTATTCTCAAAGAATGGAACTGGGATACTTTCGGGTGCAACAAGATTAAAAAAGTTGATTTGGCTAATGAGCTTGTTAGGATCGACAAACTGGAGGAATCACAAGGCATCGATAACATCCGTCTTGAAAGGCGAATTGGGATTAAAACCAAACTTTTGGAAATATCCGGTAGAGTGGAAGCCTCTTGGCGACAAAAGTGCAAGCTGAAATGGGCCTTGGAAGGAGACAAAAACAATAGT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BLAST of Tan0013746 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Tan0013746 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Tan0013746 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWR7 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467555 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1352.0 bits (3498), Expect = 0.0e+00 Identity = 751/842 (89.19%), Postives = 771/842 (91.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013746 vs. TAIR 10
Match: AT1G25540.1 (phytochrome and flowering time regulatory protein (PFT1) ) HSP 1 Score: 815.1 bits (2104), Expect = 5.3e-236 Identity = 530/861 (61.56%), Postives = 640/861 (74.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013746 vs. TAIR 10
Match: AT1G25540.2 (phytochrome and flowering time regulatory protein (PFT1) ) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 1.7e-186 Identity = 458/757 (60.50%), Postives = 550/757 (72.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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